BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-394E04.T7 (MSMg01no394_e04.b1) | MSMg01-394E04.TJ (MSMg01no394_e04.g1) |
ACC | AG495359 | AG495360 |
length | 758 | 751 |
length of high quality (start - end) | 249 (76 - 324) | 507 (83 - 589) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no394_e04.b1 PHD_FILE: MSMg01no394_e04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:39:35 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no394_e04.g1 PHD_FILE: MSMg01no394_e04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:39:35 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TTATCCTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCCAGAGAAT
CCGCGGAATTCAATTCCTTCCCCCCAGTCAGGAAGCCCATTATACCTAGT
GCTCAAGCTTCAGGGGACTCAGCGCCCTCTTCTGGCCTCCTCAGATACCT
GCATGCACTGGGACACACACACACACACACACACACACACACACCCCTGT
CTGTTACCTGGATGCCCTCAGGAAGCCATCATCAGCGCCCTCTTCTGCCC
TCCTCAGATACCTGCATGCGCTGGGACACTCACACACACACACACACCCC
TGTCTGTTACCTGGATGCCCTCAGTAATCCATCAGTTCCAGAAACTTCCA
AACCATGATCCACAATCTTCCTGAAGACCCATCATAGAGGATGAAACCGT
GAACTGAACTTTTCAGGGAGAACAAAAGGCCACTCCTCTGCTGAAGGTGT
CACAGAGCTCATCAACTGCTCATGATTTCTGCGACTGGAGCTGGATAGAT
TGCGTCACGGCTAAGGCCACTTGCTGTTCCTCGCGTTGACCTGATCTAGT
TTCTTAGCACCCACCTTGGTGGTTCACAGCTGTTCGCCTAATACTCCTTT
AATAACACACCGCTCGCTATTCCTTCTCACTCCATGCCTATGCCTGCAAC
TCCCATTGCCCGTCCCCCTCCCCCATATTCTCCACTACACTCTTTCCCTT
TCCCCCCACCAACTCTAACTCCAATCCTCTCTCCACTTTTTTTCCTCCTA
AATCTATC
| TTTCCCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAACGATTACAACATCGGA
AAAGAAAGACTTTTGAAGATAACCTAAGACCAAAGAGGACTGCAACTGGA
TAAAATACGCACAATGGGAGGAAAGCCTGAAGGAACTTCAAAGGGCTCAA
TCCACATATGAGCGCGCTTTAGATGTGGACTACCAAATTGTTACACTCTG
GCTGAAATCTGCAGAAATAGAGATGAAGAATCGCCATGTGAAGCATGCCT
GGAACATCAAGGACGGTGCCATAACAACTCTGCTACGAGGCGACCAGTTC
TGATACAAGTACGCATGCATGGAGGAGATATTGGGCAACGTTGCTGGTGC
TCGGCAGGTGTTTGGGCGCTGGATGAAATGGCAGCCTGAGGAGCAGGCCT
GGAACACTTACATCAACTTGGAGCTGAGATACAAAGTGGTGGATTGGGTC
CACACCATTTATAAACGCTTTGTGCTCGTGGACCCTGCTATAAAGAACTG
ATTCAAGTATTCTCGGTTTGAAGAGAAACATACTTCGTTTGCTCCTTCTC
GGACAGCCTATGAGAGAGCAGTGGAGGTTTTCTCCCATCCCCCCCCAGGT
TCCCTCCCCTTACGCGGCCCCTGGTAATCTTGATCCGACATCCCACCCAC
TCTTCTTAAATCTCCGCCATCTTCGAATTTTCTCTGGATCGAACTTTTCA
C
|
quality values | Open.Hide. 6 8 8 8 8 6 6 6 7 12 13 9 9 12 22 22 22 14 15 19 21 21 11 14 25 30 30 48 30 30 25 21 9 15 13 13 8 10 8 8 7 6 6 6 8 8 8 8 10 15
17 30 30 41 47 31 31 31 31 33 33 33 28 21 22 11 11 10 12 12 14 15 14 23 23 24 24 24 24 30 32 33 47 53 47 48 57 57 57 57 57 57 57 59 48 47 47 59 59 59
59 54 54 54 50 50 48 59 50 48 54 47 48 42 50 50 42 41 40 46 37 39 28 34 30 37 43 47 57 57 54 47 47 59 59 48 47 57 44 57 38 38 28 43 43 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 54 43 44 43 42 50 36 38 36 54 54 50 52 52 52 52 52 57 52 54 57 57 52 52 52 59 57 57 54 52 52 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57
57 57 59 57 57 57 57 57 57 38 38 12 27 24 43 38 38 18 18 11 27 27 38 32 37 37 50 50 38 44 27 16 18 26 34 59 47 27 27 15 15 20 34 34 32 32 27 37 28 42
42 57 57 44 44 35 35 28 41 32 47 43 44 59 59 34 23 12 9 9 12 25 25 48 27 21 21 20 30 44 44 54 48 48 47 48 59 47 47 43 43 43 43 43 48 48 57 48 48 48
48 48 48 48 57 57 48 48 48 48 39 39 39 43 43 39 39 48 47 47 32 22 13 11 10 11 13 11 11 11 12 16 22 12 21 30 28 34 37 35 39 39 59 43 48 43 47 39 35 35
39 40 59 59 57 57 57 57 57 57 34 34 14 14 14 28 30 43 43 47 43 47 30 30 18 18 18 32 32 43 43 27 25 11 11 11 17 16 23 36 44 36 36 37 36 30 19 19 11 11
12 24 32 44 43 23 25 10 10 10 20 24 28 28 18 18 16 16 23 28 28 42 40 48 43 43 28 36 23 23 23 28 41 30 41 41 43 34 27 15 8 8 8 8 12 18 21 19 13 17
20 34 37 35 35 35 35 22 30 21 18 13 12 11 15 12 13 12 19 12 21 15 20 21 11 11 11 22 17 15 10 10 10 15 24 31 15 15 12 15 9 9 8 8 8 8 11 10 13 28
19 21 13 13 10 8 8 10 6 6 6 6 6 6 8 6 7 8 8 12 15 18 15 14 18 18 17 14 21 8 10 8 10 8 8 11 16 18 23 23 28 24 17 12 9 9 12 7 9 9
10 12 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 12 14 10 10 10 8 8 8 10 10 10 14 14 21 15 11 11 11 11 8 10 10 8 8 8 12 8 8 8 10 10 8 8 8 10 8 10 9
9 9 11 12 19 12 8 8 8 8 8 10 13 13 14 10 10 8 8 8 13 8 10 9 9 8 6 8 6 7 10 12 6 6 8 8 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 11 11 10
17 13 16 13 10 11 10 10 8 8 8 8 8 10 14 15 17 21 12 13 10 13 8 8 8 8 6 6 8 6 10 8 8 8 8 6 8 8 8 11 11 11 10 10 12 24 24 25 27 26
27 22 18 11 11 9 10 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 10 8 8 8 11 12 13 15 18 15 18 11 11 12 10 9 9 9 10 14 14 11 13 10 11 8 8 6 6 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 6 6 | Open.Hide. 7 7 7 7 7 6 6 7 8 8 8 8 9 9 9 21 33 48 37 39 39 39 39 42 48 43 38 36 36 33 33 33 33 37 37 23 25 11 11 9 9 9 10 10 17 19 30 31 33 33
44 48 53 50 47 47 47 47 47 47 50 59 57 57 43 34 23 10 11 16 19 26 28 41 40 42 41 42 37 37 36 34 34 42 42 57 57 57 48 48 47 47 47 41 41 41 41 48 57 57
68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 51 51 50 50 48 43 43 43 43 44 44 44 43 43 43 37 57 57 68 68 57 57 54 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 68
68 68 51 51 50 50 50 47 52 52 52 52 54 57 57 51 57 57 57 57 57 68 57 57 57 52 52 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 52 45 59 59 59 59 57 57 52 57 52 59
52 52 52 57 57 57 59 57 68 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 68 62 62 52 62 62 62 62 52 52 62 62 68 68 68 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 43 43 52 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 43 52 52 52 52 52 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52
62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 43 62 44 43 43 43 52 62 62 52 43 43 39 43 35 43 43 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 41 62
62 62 62 62 52 52 52 57 57 59 52 57 52 52 57 59 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 52 52 57 57 57 52 59 59 59 59 59 59 59 59 44 44
43 57 43 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 52 52 52 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 43 43 35 35 43 44 44 68 57 57 50 50 43 59 50 43 43 46
57 57 57 46 46 54 54 54 59 47 43 43 42 42 37 44 44 59 59 59 59 57 48 48 47 48 48 57 57 48 48 43 43 43 43 43 43 43 57 59 50 48 48 54 48 46 43 41 37 35
43 42 48 43 47 43 43 43 57 57 48 48 48 48 48 48 48 48 48 59 59 48 46 34 32 28 32 25 25 31 31 30 32 32 39 39 37 37 37 37 37 37 59 59 39 32 28 32 35 39
34 29 23 19 15 25 22 35 20 25 16 17 14 10 13 9 12 12 25 34 34 19 24 12 17 12 14 12 12 15 18 23 34 28 25 15 12 12 20 23 16 18 12 12 12 10 15 15 10 10
8 8 7 7 9 10 9 9 10 18 23 25 12 12 12 15 16 11 11 11 12 12 13 14 13 17 11 10 10 14 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 12 12 11 11 10 9 9
9 9 10 19 19 22 28 24 19 17 10 10 12 10 10 10 10 12 10 10 12 10 8 8 10 12 8 8 11 15 12 10 11 8 8 8 8 8 10 8 10 10 9 8 8 8 8 10 8 8
8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 10 10 12 9 10 10 9 9 9 8 8 8 8 11 10 10 10 10 10 10 12 12
12 |