BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-410D11.T7 (MSMg01no410_d11.b1) | MSMg01-410D11.TJ (MSMg01no410_d11.g1) |
ACC | AG507516 | AG507517 |
length | 746 | 1,680 |
length of high quality (start - end) | 553 (74 - 626) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no410_d11.b1 PHD_FILE: MSMg01no410_d11.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:26:53 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no410_d11.g1 PHD_FILE: MSMg01no410_d11.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:26:53 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNNAACTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXC
GCGGAATTCCTAGTTTACCTATCTGTGATCTTCCTAGTCTATTCCAAAGA
TTTTCAACTAGATTCCGTCTCTATTCTTGAATATACTTCGAGTGGATACT
GAGTCACATATCTAGTTCATGAAACCATTCAACACTTTATTTTGTTTTTT
TTTTCAGCCTTCTGCTTAACTTTTCAACATCCCTCCCTAGCTAGTTCTAG
AATCTGGAAAATAGCCTCAACACAAAGCTAGTCATGTGCTACCCCCATAG
CCCAGAACTAAACTCTGCCTTATTCTCCATTCACTAGAAGTTGATACAAA
TCTCAGAATCCAAACCTCTTGTCAAAGGCCAGGATCTCTAACTGGTATCA
AAGAGAAAATGGTTGCAAAATCCAGCTCATCTCTGAGGTCCTCCCTTTCC
AGAGTCTCAGTACCTTTGGGACTCATGGCCTCCACAGCTACCCTACACCA
TTAAACAAGTGAGTACTGTCAATTTCTTGACATTTTAAACTATCCACCAT
GCAATACAGCTATGATACTAGCTATTCCAACTACCCAAAATCCCACATCC
TTCCAGGACCTTTGGGTAGTGCTGATTGGTCAGTCCCCACAGAGAGCATA
GCTTTCACTTAGACCAATATCCTGGCAGAAAAGAAGAAACTTCTTTTGCT
TCCAGAAAACTCTAAGCTTGCTTTTTAGTGTTTCTCAAACCAAGAA
| AATAAGAATAAGAGACAGGTTAGGAAAAGTNAGAGCAGAGGAGAGGGTTC
GAGCTTATACTAATAATATATGAAGGTAGGGAGATTCAGACAGATGGAGT
ATACACATGCGTATAGTATAATAAGACTACCATCGTGGCAACATAGTATA
TGTATGGTTTTTGTTTGTTCTTTTGTAGTTGATATTTAATAGAGTAGAAC
AGCATAAATGCGGTTGAGTGGAGTAGGGGGCGTTATAAGGGACTAAGAAG
CTGCAGTGATGGGACCATAACAACGTGATGAGATGTTCACAAAGTTATAG
AGGGTGACACAGCAGAGTGGCGTAAACGCGTTGTTGCGAGAAATCGGGGC
TACGTGCGTAGATCAGAGTGCAACATAAGGAGTGATGGAGGACGCGATAT
AGCAGATATGATACGTGATCGCCGAGGTGTAGAGTATTAAGTAGAAACTA
AGCAGGGACATGGCCGTTCTATCTTATAGCAGTATAGTAGTGGAATGGAA
TACATAATCCAAGTATTACGGCATGTCGAATAAGCTGCATGACTTACACG
ACAGTGGGCTTTCGCGCNCATCCGCGCTATACTATGCTTGACGGGTATGT
ATCTACAGACATAACTACTACATGGATTGCAATTACTTCTCGTCGCGCGT
CGGCATTAGATGCGTAGACATAGTGTGTATAGTGTGACGCTATGTAATAC
TATAGCGATGTAGACGCGCTGCGGTTAGCGCATGCTTGTGCGACGATGTT
TCAATAGAACGTTCGCTCGNATGAGGAGAAGCATATCATCGTTTGAGAGT
GGTATATCGAAGACGTACACGAACGAGCATANTATTGCGACGTGCGTAGG
TAGGGCGAGGGCGATAGTAAGGAATATATTGGTTGTACTGCTGTATACAC
GCGAGCACGCGGAACTCGCTGAGTGCTATTACTTGTGAACTGCACCATTT
NAGCTGAACCTGACTACTCTCGTCTGTTACAGTTATCGTATGAAANTATA
TTACGTTACGTTTAATGATTTTGATNGTAGATGACGACGAGACGTGTGCG
AGATTGATATAGTTAGCGAGTATTCAGTATTATTAGCATGCATTAGTCTA
TCGGACGCGCACTGCGTGTTATTACAGCGTCTANTAACGCGTCGCGCGTA
TAATGTATATATCTCCNCGATGTGCGTCATACTCTCGCATGTATATACGT
CACCCGACGNCATCGCTGACATGATATATGAAGCGCGATGTACACGTGAT
GCCGCACATACGAGGCGTGTGTGCGATATTGATACGAGNCGCCGGCTACG
CGTCNATATACGAGAGTATTTTGATACGTAATATAATACGAGATCGTTTG
AGCGTGCGACANCNGGATTGACTACAGTCTTTGACGATGTATAGTTGGGN
TANANTTATGTCGCTGANATTGTAAGACATATACTGCGTCGACTGACATT
CTTTATGAGACACACGCGCTGTTATTAGCGACCAGTTTCCTTACTGCGTC
GCGAGTGTTAANCGGCGATATTCAACTATAATCGCGCTTCATCATNCGTT
ATCTGTTCATTACCTAGCGGCTACGCGANATACTGACTCGCAGACNCATA
GATATATGGTACGACACATGTAGCGATATACGNCGCGTATANTACTGTGA
CGAGTCGCAACACGTATATGCGACTGCTGN
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 3 3 7 11 11 11 17 17 27 35 37 37 37 39 36 37 41 23 23 20 20 19 26 34 43 26 24 24 20 20 15 23 9 9 9 9 12 10 11 11 10 10 10 12 15 18
32 34 43 23 17 17 21 29 29 59 44 28 21 11 8 8 8 8 8 10 17 25 21 28 20 19 30 37 33 36 38 47 53 57 59 59 59 57 57 57 53 53 37 37 24 24 24 40 44 54
54 48 51 47 42 42 42 42 48 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51
50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57
43 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 48 48 48 57 57 53 53 59 59 59 59 41 59 24 21 12 12 11 12 21 26 26 28 34 34 41 48 50 53 53 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57
59 68 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 59
59 59 59 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 54 54 54
54 54 57 68 68 68 57 57 48 48 48 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 41 41 41 41 41 59 44 41 41 44 59 59 59 59 59 41 43 43 47 47 48
48 48 48 59 48 48 48 48 48 57 48 48 43 43 40 40 40 37 37 48 43 39 39 39 41 37 37 32 31 25 30 32 35 28 32 37 41 41 41 40 40 39 39 30 35 35 39 37 43 43
50 47 46 39 39 31 31 23 20 20 31 36 39 29 24 34 34 36 28 28 20 23 17 19 10 12 10 16 14 24 10 11 11 16 13 16 28 32 28 28 28 28 19 24 15 15 14 12 21 11
11 11 12 21 14 17 17 19 17 15 9 9 9 9 9 9 12 13 14 21 17 21 16 15 11 14 9 10 11 17 17 9 9 9 12 12 15 25 19 30 19 16 12 12 12 17 15 19 19 16
17 21 21 12 14 16 16 10 10 10 10 10 12 12 10 10 10 16 17 14 14 14 17 14 10 10 9 9 9 12 22 17 23 13 13 9 9 8 8 10 10 10 10 10 10 10 | Open.Hide. 7 7 8 7 9 9 6 6 6 6 6 8 8 11 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 3 0 3 8 8 8 8 8 9 9 11 9 8 8 6 6 8 6 9 9 10
9 7 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 10 6 6 8 6 6 8 8
6 7 8 10 6 6 8 6 6 6 6 6 6 7 6 6 8 6 6 8 8 10 17 17 13 10 9 7 7 7 7 8 11 11 11 13 9 9 9 9 6 8 6 6 8 7 8 9 8 8
8 8 8 8 6 6 6 7 7 8 9 9 9 12 9 10 8 8 8 8 8 8 12 6 6 6 6 6 6 10 10 7 6 6 6 13 6 8 8 10 8 8 10 8 6 7 7 7 6 6
8 9 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 11 8 9 10 10 8 6 6 8 6 6 6 6 7 9 7 8 8 8 8 9 10 10 9 10 9 10 10 12 6 6 6 7 7 7 10 8 17
9 8 7 7 6 8 7 8 10 8 9 9 9 8 8 6 6 6 6 6 12 15 9 9 9 11 11 8 10 7 7 8 8 8 6 6 13 13 13 10 9 7 6 6 8 8 8 10 15 17
10 6 6 6 7 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 10 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 8 7 7 7 9 8 8 6 6 8 8 6 7
7 7 9 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 13 9 9 9 8 7 8 6 6 6 6 8 10 8 8 8 6 8 6 7 11 8 9 8 8 8 8 8 9 10
10 9 9 9 9 6 8 6 6 8 8 12 8 7 9 8 8 8 8 10 6 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6
6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 9 7 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 6 8 6 8 10 10 9 9 6 6 6
6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 15 19 10 10 10 8 6 6 6 10 10 8 11 6 6 6 6 6 6 6 6 9 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 7 7 6 6 6 7 10 10 10 16 11 3 0 3 6 6 6 6 9 10 9 9 9 11 11 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 9 9 6 6 6 6 8 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 6 7 6 6 6 6 8 9 9 9 6 6 7 6 6 6 6 8 6 10 16 11 10 10 11
9 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 7 6 6 6 6 8 8 16 7 6 6 6 6 6 8 6 8 6 7 7 9 9 9 9 12 8 8 6 6 6 7 6 6
7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 12 12 9 9 9 8 8 7 6 6 6 7 12 7 10 10 9 8 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 7 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8
6 6 6 6 6 10 12 10 6 6 6 6 8 6 6 6 8 6 3 0 3 6 8 6 6 8 8 10 10 10 10 8 8 9 8 7 7 6 8 6 6 6 7 7 22 12 12 6 6 6
6 6 6 8 10 13 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 9 9 9 10 3 0 3 9 7 8 8 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 7 7
6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 7 9 9 8 8 9 9 9 10 9 6 6 6 8 8 10 11 8 6 6 6 6 8 9 9 9 10 9 10 10 11
11 9 9 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 7 7 7 7 6 6 6 7 8 8 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 7 9 6 7 8 6 10 11 9 6 6 6 6 7 7 3
0 3 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 6 6 8 6 6 8 7 8 6 7 6 6 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 6 7 3 0 3 6 7 9
9 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 3 0 3 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 6 6 6 6 6 8 8 6 8 8
8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 10 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 8 7 7 7 9 11
8 8 8 6 6 6 7 10 9 8 8 7 8 8 10 12 9 7 7 7 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 3 0 3 7 7 7 6 6 6 6 8 9 9 11 11 10 8 8
7 8 7 8 10 11 11 12 7 6 6 6 6 6 9 3 0 3 9 10 8 8 8 8 8 7 6 6 6 7 7 9 9 7 8 10 10 10 10 8 6 6 6 6 6 8 8 9 9 9
10 9 6 7 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 7 7 7 7 8 9 14 11 9 9 9 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 10 10 11 9 8 6 6 6 8 10 10
8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 11 11 11 9 8 6 6 6 6 6 6 7 7 8 10 9 10 10 9 9 9 10 6 10 6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8
9 11 9 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 9 9 8 8 8 8 7 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 7 8 6 6 6 6 6 6 6 6
6 10 10 10 9 7 8 8 8 8 3 0 3 0 3 6 6 8 6 6 6 6 8 8 10 10 10 6 6 6 7 6 6 8 8 10 10 10 10 10 12 10 10 8 6 6 6 6 3 0
3 3 0 3 0 3 6 6 6 6 8 12 8 8 8 8 3 0 3 8 8 11 16 13 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 10 16 13 11 8 8 8
8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 10 10 8 8 8 7 7 7 7 6 6 6 6 6 6 6 9 6 6 6 6 8 6 6 6 6 7 7 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 9 7 7 7 8 8 3 0 3 8 10 10 10 14 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 8 8 9
14 6 7 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 10 10 13 3 0 3 8 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 3 0 3 6 6 6
7 8 13 15 6 6 6 6 6 6 8 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 9 9 9 9 9 9 3 0 3 6 6 8 6 6 6 3 0 3 7 7 8 10 16 10 14
9 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 9 9 9 3 0 |