BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-487M10.T7 (MSMg01no487_m10.b1) | MSMg01-487M10.TJ (MSMg01no487_m10.g1) |
ACC | AG566657 | AG566658 |
length | 756 | 744 |
length of high quality (start - end) | 542 (128 - 669) | 549 (76 - 624) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no487_m10.b1 PHD_FILE: MSMg01no487_m10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:10:29 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no487_m10.g1 PHD_FILE: MSMg01no487_m10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:10:29 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | NCCCACTCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAATTTCCGACCTGCGC
GGNAANCACNCTGTTTTCCAAAAAGGCGGCGAACTCAGAAATCCACCTGC
CTCTGCCTCCCAAGTGCTGTTATTCCAGGTGTGTCCCACCACTGCCTGGC
TGTAGGTTGTAATTTGAAGTGTCAAAAGCCCATCCCAGGCCAGTCTCTCT
CTTGGACTATGAATCAGGTTTTAAATATTAATTGCTTTACCAGATCCCTG
CTTTCCTGTGGCCATTTTCCTTGTGAAAATAGTGAACTAGATCACTGAAA
TATTAAGCAAACCTCTTTTAATTGCTTTATTTTATGAGACTTTCCATTAA
TCATGGTGTTTCTTCACAGAAATAGAACAGTGAATGAGACAAAGAGAGAG
AAAAACTGAGAGTTCAAGGCCCATCACATCATGTGATTTTAAAAAATATA
TTACAATACTGCATTTTAGTAAACTTAGTTGAGCACATGGGTACCACTAC
TTATTAATTGTATGTACATAACTTAGTCTTGAGATTTTTAGTATTCAGTC
TACTTGTTCTTCTCTGCACATCTGCTATATTCTAACACAACTAAAAATGA
TTTTCTTGAATAGCAACCCAAGTGGCATAGCACATACAGTTGGTTAGACT
TATTTGTGCAATCTTGGAGATAATTATAAGGGCTAAAACATATGTGGCTA
GAATAACAAAATATAATGACCNAAAATGAATAATCTATAGTGGGAATAAA
TGACAC
| CCGATTGCAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTAATGACTGCTTCTATTTCCTTGGG
GTTATGGGACTGTTTAGATGATTTATCTGATCCTGATTTAACCTTTGTTC
CTAGTATCTGTCTAGAAAATCACCCATTTCATATAGGTTTTTCTGTTTTG
TTGAGTGTAAACTTGTAGTAGGATCTGATGGTTTTTTTTTTTTAATTTCC
TCGAGTTTTGTTCTCATGTCTCCCTATTCATTCCCGATTTTTTAAAATTT
GGATACTGTCTCTGTGCCCTCTGGTTAGTCTGGCTAAGGGTTTATCTGTC
TTGTTAATTTTTTCAAAGAACCAGTTCCTAGTTTTGTTGATTCTTTTTCT
AGTTTTCTTTCTTTCTACATGATGGATTTCAGCCCTGAGTTTGATTATTT
CCTGCCATCGACTCTTCTTGGGTGTATTTGCTTCTTTTTGTTCTAGAGTT
TTCAGATGTGCTGTTAAGCTGCTAGTGTATGCTTTTTCCAGTTTCTTTAT
GGAGGCACTCAGGGCTATGAATTTTGCTCTTAACACTGCTTTCATTGTGT
CCCATAAGTTTTGGTATGTTGTGCCCTCATTTTCATTGAATTCTAAAAAG
TCTTTAATTTCTTTATTTCTTCCCTCATCAAGTTATTATTGAGTAAATAG
TTGTTCAAGTTCCACATGTATGTGAGCCCTGTGTTATTTTTCTT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 6 6 6 7 6 10 9 12 16 28 34 31 30 30 25 24 15 19 8 8 8 13 13 29 23 21 3 0 3 10 9 8 6 6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 11 11
8 3 0 3 3 0 3 17 3 0 3 9 9 9 7 8 8 7 6 6 8 8 9 8 8 7 10 11 12 12 12 25 34 37 37 39 44 44 36 36 50 53 53 50 57 57 53 59 59 59
57 57 59 59 59 59 59 59 36 36 33 41 39 33 59 33 25 9 10 8 9 10 10 8 8 9 9 12 16 27 37 37 42 48 50 53 53 57 57 57 57 53 53 57 57 57 57 59 59 59
59 59 59 57 68 68 68 68 68 51 51 50 32 42 33 36 36 40 40 48 48 48 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 53 53 53 53 59 59 57 57 57 57 57 57 57 50 53 50 50 59 59 59
59 27 27 12 12 12 12 15 15 23 21 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 57 53 53 53
57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 53 50 50 50 59 59 27 27 16 8 6 6 6 6 6 6 7 6 9 9 21 29 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57
57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 41 41 30 18 15 18 21 23 28 36 32 32 25 29 44 48 54 68 54 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 59 59 68 59
59 59 57 68 68 68 57 57 43 43 43 57 59 59 59 59 32 26 10 10 10 15 18 32 43 59 52 54 54 54 52 52 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59
68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 57 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 59 57 59 59 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 47 47 47 57 57 59 59 59 43 43 59 57 59 59 59 57 57 39 46 46 57 59 59 57 57 57 57 54 54 54 54 54 54 54
54 57 68 59 59 57 57 59 59 57 57 57 57 57 43 59 43 43 43 43 43 57 59 57 57 57 57 48 48 57 48 48 50 43 43 39 39 36 39 39 41 43 41 37 37 32 41 39 39 35
31 31 39 59 59 59 37 36 31 26 32 30 39 35 34 34 39 43 37 36 36 37 32 31 41 44 59 59 36 35 32 34 34 41 41 41 47 39 35 31 31 36 31 39 39 32 32 31 31 25
31 43 43 37 37 33 24 24 15 15 15 24 30 34 37 22 22 15 15 14 13 13 14 14 14 18 19 15 10 9 8 10 8 10 10 11 11 14 19 31 30 31 31 32 25 22 20 25 28 28
34 26 30 32 18 18 14 14 14 24 23 22 22 22 28 30 34 28 18 7 3 0 3 7 7 12 14 14 19 22 22 14 16 10 10 10 13 19 17 10 9 9 9 8 8 8 9 11 16 18
24 22 15 12 12 12 | Open.Hide. 6 6 7 6 8 9 9 9 9 9 10 15 17 19 17 31 31 36 36 39 26 21 27 28 29 20 22 17 10 6 6 6 6 7 6 6 6 7 7 6 8 8 8 8 10 10 19 27 28 25
24 28 30 29 33 21 21 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 14 13 15 18 27 37 30 35 39 39 50 50 50 53 59 59 59 59 59 59 59 59 57 43 44 43 43 39 43 43 57 57
57 57 54 54 54 54 68 68 68 68 54 54 48 44 44 30 30 30 42 42 47 54 54 47 47 47 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 59 68 68 68
59 59 57 57 57 50 50 50 50 48 57 44 44 33 33 33 42 42 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 59 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 68 59 59 59 57 45 45 59 52 45 45 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62
62 52 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 68 68 68 68 68 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 47 43 39 19 17 17 27 27 39 39 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 59 59 68 57 57
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 52 52 44 44 43 43 43 38 43 44 44 43 52 52 57 57 57 57 59 59
59 57 57 52 52 52 57 57 57 59 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 43 43 43 59 59 59 54 54 54 32 32 20 20 20 32 41 42
59 32 30 12 15 11 23 15 32 32 39 41 30 30 30 41 18 18 18 32 32 39 39 35 37 37 43 43 43 43 43 48 48 48 57 59 43 43 37 35 35 40 43 33 32 35 37 59 47 57
39 39 30 30 30 29 26 22 22 16 18 14 23 34 29 33 37 32 32 39 39 43 48 48 39 39 35 32 28 19 19 11 11 11 22 24 37 30 32 28 37 28 28 23 24 29 18 18 28 30
33 29 17 20 14 19 19 23 36 32 34 40 37 25 29 25 33 23 28 23 23 23 28 24 24 13 13 11 16 18 34 22 14 10 10 14 19 30 28 28 39 37 36 36 36 39 34 28 16 11
11 15 25 29 39 32 25 30 25 30 17 17 17 26 17 20 20 32 31 36 39 32 29 13 13 10 10 12 14 14 14 24 26 36 30 32 28 28 28 21 23 11 10 8 8 8 8 10 9 12
12 15 23 24 25 25 12 12 11 15 15 24 17 20 20 23 19 19 10 10 10 14 12 12 10 8 8 9 9 8 8 10 11 16 14 16 16 16 19 22 22 25 11 11 |