| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-507O13.T7 (MSMg01no507_o13.b1) | MSMg01-507O13.TJ (MSMg01no507_o13.g1) |
|---|
| ACC | AG581945 | AG581946 |
|---|
| length | 760 | 1,284 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 383 (337 - 719) | --- |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no507_o13.b1 PHD_FILE: MSMg01no507_o13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:36:37 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no507_o13.g1 PHD_FILE: MSMg01no507_o13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:36:37 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | NACTCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCAAAATCCGCG
NGAATCTGACGACAGATGCCAACAAAATCAGATATCTGGCTTCATGCAAA
TATTGTCAGAAATAGACAATGATAGAGCTACAGAGGAAGTACAACCGACA
CATAAACCTTGTTTCTAAAACGAAATTCTAGGCCGCCCACAGGCATGAAG
TGAGCCTCCAGGAGTGTGAACCAGAAACAGTCTAATATGCAAACACAGCC
CTCAGCTGCTTAAATCATACCTCATTAGAGACAGCAAGAAGTTCTTCCCG
TTCTCAAACACATGGGTTATGCTAGTATCATGNTTCCTTGAAACTTCATA
ATTTCAGATTCAATCCTTTGGACTATGTCCTCTGCTCCATTTTCCAAAGT
TGAGGCACAGATGCCCTTCCTAAGCAACACAAGATGCTAAATTAAATCAC
ACAAAAAATTAGGTAACCAAGCCGGGGGTGGTGGCGCACGCCTTTAGTCC
CAGCACTCGGGAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCAAGGCCAGCCT
GGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTG
TCTCGAAAAAAAAAATTAGGTAACCATAAATAATAGTGTGTCATGCTGGT
ATGCTATATTGCTGCTTCCGCATTCCCTGAATAGTGTGTAGAATGTGTAA
CATTTATCTGTTTTACAGATAAGCAAGAAAGTTCGAATTCAACAAGTTAA
TGACTTAGCN
| TGTTGTTGGTGTTGTGTGGGCGGGCGGGCTGGCGCGTGCTGGTCCTGTTT
CAACATACCAGTGGCGNATGAGTAAGAAGAGTATATTTCCCCCAATACAC
AGTGCTGCCTCATCGCCGATACACAACGCACTACAAATCACACACTGCGA
GCAGCATATTGTACATAGTCTTAAATATACAATCATAGTCGACGTTGCCT
CTACCGCGCGCCGTGACGCAGAGCGGTACGGCCTACTTGCGATCTTAGAC
GAGATCGCGCGCCCTGCTAGCCACNCATCCGAAGTGCAGCGCATCAGATA
TCGACATCACATACATCTAAGTATCTACATACACGTTAGAATACTATACA
CAATGAGACTCTAACCCTACTCCTCTCTCATACTCAGTGTTGTATGCGAG
TGTTAGAGGACTGTGAGTACCGCTAGCTGTAGTGCTGGAGTGCGCCGTCG
CCGCGCGCCCCGCCGTGGCGTGTTGCATCGTGAATGTTGTCTGTGTTGGT
GAATGAGAGTGTGTGCGCGCGCTGAGAGAGAGAGAGAACGAGAGTCGCCA
CGTCGTGCCTGAGCAGCAACTACACGCCGACAATCACGCATGAGAGTAGG
GTGTGACTGTCAGATATATCTGCTTATTCTCAGAGCGGACACTCATAACT
CCTCCTGCGCGTACGCGTTGGGGAGAGTTTGCGACTCTGTAGCGTCTCTA
TGTATCGTGTAGTCCACGTACAGACTAGAGCGTGCTACTGATATGTCAGT
CAGGTGTGATGGCGACGCCGTGCGCTATCGACGATATATTATGTGCCCGC
GCGTACGACTCTGCTGAGTCGATGACGACGGTAGCCGCCGTCAGCTACTC
GAGACACGACGCGTATTAGTACTTGTGTCGAGCTACTCGTGATCGCGCTG
ACCGCCATGACCGTGTATGCCGCACCGACGCCGCGTAGTAATGACTCTGT
AGCTCCTGCGCAGNGCACCTATACTGTATGGTACGATCTCGCCACTCTAT
AGTCNTCTCGCATGAGTCGCTGCTATGCAACGCTACNGTCTAATATATAC
CTCAGTCAGACTCACCTCCGTGTCTCTGTGTTTNTATGTTGCGTCGTCGC
TTGCCGCGAGTGGACTGGTGTTCAATTCGATCGCTACGCCCGCTCTGTTA
TATGATCNGCGCCTGCGTCCATTTATCATTCTCGCATAGTANACTCGCGC
CGTCTGACTCATACATAGTGANGTACGTCTGTCGCTCGNCTATGATCGCG
CTATTGAGNTCGNCTTGTCACCTCGCCATATCTN
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 3 6 7 7 12 9 14 14 14 28 25 29 30 31 31 29 34 16 17 17 20 20 22 25 23 3 0 3 9 14 9 7 7 6 6 6 6 7 6 6 8 10 10 11 11 11 12 6 3
0 3 10 11 30 30 28 50 50 42 30 21 21 9 9 9 9 9 7 7 7 7 8 8 12 10 10 13 12 14 14 23 32 41 48 50 53 59 59 59 36 38 38 42 42 42 53 53 53 57
59 57 57 57 48 47 47 47 48 48 68 51 51 51 51 51 50 50 43 27 26 11 11 11 18 28 44 43 39 39 42 44 57 57 57 68 51 51 51 68 68 57 59 59 57 59 57 57 57 57
57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 50 47 47 50 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
59 59 59 68 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 54 54 48 57 48 59 59 48 48 48 57 57 57 59 57 57 57 53 53 53 50 50 57 59 59 59 59 59 59 59 48 48
59 59 59 47 41 30 18 18 15 17 17 16 16 22 30 34 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59
59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 50 46 34 25 18 8 6 8 6 6 6 6 3 0 3 8 10 15 28 31 37 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 41 32 35 35 39 39 44 47 48 48 48 48 48 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 30 28 13 13 9 9 9 9 12 16 34 41 41 41 41 48 48 48 48 48 59 59 59 59 59 57 57 57
59 48 48 48 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 44 57 48 48 48 48 48 54 54 57 54 54 54 54 57 57 57 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 59 59 57 57 54 57 57 68 68 57 57 47 43 43 44 44 48 57 48 48 48 57 57 57 57 57 47 54 47 57 46 54 54 57 57 57 57 57 46 43 43 43 43 43 48 57
59 47 43 43 44 43 43 43 43 48 59 59 59 59 59 59 43 43 43 43 43 48 48 43 43 43 43 40 43 39 39 43 43 37 37 35 35 39 37 39 36 36 35 34 31 41 41 39 39 40
34 34 33 31 31 30 34 41 41 41 41 46 41 41 41 37 37 32 28 28 25 30 30 30 33 33 35 35 35 37 30 33 29 32 30 30 28 21 21 12 12 12 28 30 59 43 32 23 19 24
20 23 22 39 39 37 37 35 31 31 41 43 47 47 30 32 20 18 14 14 14 15 28 28 28 28 23 23 19 24 18 25 28 30 33 28 28 24 25 15 16 16 20 21 13 11 11 13 13 18
30 28 30 30 33 37 30 24 24 19 19 22 32 31 28 22 20 28 20 23 23 14 17 15 15 15 27 27 13 13 9 9 9 12 8 8 7 7 10 10 11 13 33 28 16 15 9 9 9 11
16 28 25 28 20 23 12 9 3 0 | Open.Hide. 8 8 6 8 10 13 10 11 8 8 8 10 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 15 13 10 10 10 10 10 8 10 8 10 11 10 10 10 12 11 9 14 14
9 9 9 6 6 6 6 6 6 8 9 6 6 8 8 3 0 3 8 6 8 6 6 6 7 15 15 14 9 9 9 9 9 9 9 11 14 12 18 14 8 8 7 10 8 8 8 8 8 8
8 8 8 9 9 10 10 10 8 8 8 6 6 6 6 6 8 10 10 9 10 8 8 7 6 6 6 6 10 12 8 8 8 8 10 8 10 9 6 6 8 8 8 9 9 10 11 15 10 10
6 6 8 8 10 6 6 6 7 6 7 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 10 10 8 8 15 13 13 11 10 10 9 9 10 10 10 9 9
9 8 8 8 8 8 10 8 8 6 7 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 9 9 8 8 10 10 8 11 9 8 8 8 7 7 9 9 11 11 12 11
12 10 10 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 10 6 6 3 0 3 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9
8 8 8 8 6 6 6 8 8 10 14 15 10 8 7 7 8 7 7 8 6 8 10 8 8 6 7 10 10 16 21 13 12 8 8 8 6 6 7 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 15
13 9 9 8 8 8 8 10 11 8 9 6 7 6 6 8 6 6 8 7 9 10 10 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 6 6 8 6 10 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8
9 9 6 6 6 7 7 9 7 10 10 9 9 10 6 6 6 6 8 6 10 8 10 6 6 6 6 10 6 9 9 6 6 6 6 10 12 10 8 6 8 6 6 6 6 6 8 6 7 8
6 6 6 8 8 10 10 12 14 10 8 10 10 8 8 9 8 7 7 8 8 9 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 9 9 9 10 8 10 9 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 10 13 9 9 10 10 10 11 17 10 9 9 9 9 7 7 8 8 6 6 8 6 6 8 10 10 10 8 8 8 9 13 9 8
8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 7 7 7 8 8 11 11 11 11 10 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 10 10 9 7 11 7 7 8 10 10
10 10 10 9 7 10 10 9 8 10 9 10 10 8 9 9 7 7 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 6 8 8 10 10 10 10 10 9 9 9 10 10 12 12 10 12 10 8 11 8 9
11 11 10 10 10 10 11 10 10 10 12 9 9 9 9 14 10 6 6 6 6 6 10 10 6 6 7 7 8 8 9 10 8 8 6 6 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 6
8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 6 6 6 8 8 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 7 11 7 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8
8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 8 9 9 9 9 11 11 11 11 11 9 9 8 10 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 9 9 9 10 9 8 10 10 10 10 6
6 6 8 8 10 10 10 11 11 11 11 11 11 11 10 12 9 10 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 10 10 10 8 8 9 9 9 9 12 8 8 8 8 8 8 10 8 6
6 6 6 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 11 11 11 8 8 8 6 6 8 6 6 6 7 8 6 6 8 8 10 9 9 9 9
9 12 9 9 8 8 10 10 8 8 6 6 7 6 8 8 8 8 6 7 10 10 15 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 8
6 9 10 10 8 8 8 8 10 9 7 7 3 0 3 6 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 10 10 10 10 11 11 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 6 6
8 6 9 3 0 3 13 13 11 15 17 8 8 7 7 10 9 10 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 3 0 3 9 9 9 9 12 10 15 14 13 8 6 8
6 6 6 7 12 8 6 6 6 6 6 8 6 7 7 9 9 8 8 10 11 8 8 11 8 10 6 6 8 7 7 7 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 11 13 13 6 6
6 6 9 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 7 6 6 6 8 8 10 6 8 6 9 9 7 8 8 9 9 8 7 7 7 8 8 8 15 13 8 8 8 9 8 10 6 6 8 6 9
10 8 6 6 6 6 3 0 3 10 10 10 8 7 10 9 10 10 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 12 13 13 10 10 10 8 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 8 8 8 8
7 7 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 12 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 9 9 9 9 9 9 10 8 8 8
10 6 6 6 6 6 9 3 0 3 7 3 0 3 6 6 6 6 7 6 6 6 8 8 6 8 6 6 8 6 9 10 3 0 |
|---|
