BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-509E09.T7 (MSMg01no509_e09.b1) | MSMg01-509E09.TJ (MSMg01no509_e09.g1) |
ACC | AG582990 | AG582991 |
length | 742 | 757 |
length of high quality (start - end) | 560 (73 - 632) | 619 (74 - 692) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no509_e09.b1 PHD_FILE: MSMg01no509_e09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:38:27 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no509_e09.g1 PHD_FILE: MSMg01no509_e09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:38:28 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | AAATCAAAAATTTGCGGTCGCNAAAAGAANCACAATCAAAACAGGATCCG
CGGAATTCATAGTCCTCCATACAGCCCTTTTTTTTCTATATGTGCTAAAT
TTCTTACTTTAGTGTTTATGCAGTATAGATACTTATACATATCTATAAAA
GAAAGAACACTCACCATATAGTAGTCAGTCCAAAATGATGAAACCATCTA
TGGAATGTTGGATAGGTACCTTCTGAGGAGCACTTAGCGTCAAAAATTCC
AAACAGTGTGGGAGAAGCTAAATAAGAAAATCATATTTACATAAACCAAG
GTCTACAGTTATTTATTANTTTTCTATACCTTTGTAAGAGTTACTTACTT
CTTTCATATTTGTAAAATTAACAAAGTAAAAAAATCACATCTCTCATTCA
ATTCCCACATTCTGTCTATAAACGACAAACTACAGTAGCCTGTATCATAT
CATTTGAAGGTTATTAAGTGTGATTTTCATTTTTAGCTCTTTACCTTAAT
CATATTTGCAGGCTGATAGCAAATCCTGAGGCAAGAGTGACTGCCCTTCA
AAGGTATGAATGATATTCAATGGGCATAGAGTGTTCTTTCTACAGTGAGA
TGCTGTGGAGTTAGGCTGGTGTTTTAGGATAGAGATTGGGACAGAGATTT
GTAGATATGGATATCTCTAGAGAGTTTTCTTCTGAGAATACCTGAAGCTC
TTCATCATGCCTTCCTAGGGAAGAAACTATTATTGGTCTTTA
| NAACGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXTTGCTCCACGGGATTATTTTGTGTCGGAAGGAATTTCT
TTTCTGGTCCAGTCTATTTGGAGGTCTGTAGGCTTCTTGTATGTTCATGG
GCATCTCTTTCTTTAGGTTGGAGTTTTCTTTTATAATTTTGTTGAAGATA
TTTACTGGTCCTTTAAGTTGAAAGTCTTCATTCTCATCTGTACCTATTAA
TCTTAGATTTGGTCTTCTCACTGTGTCATGGATTTCCTGGGTGTTTTGAG
TTAGGATCTTTTTGTATTTTTTATTTTCTTTGATTGTTGTGCCCATGTTT
TTTATGGAGTCTTCTGCACCTGAGATTCTCTCTTCCATCTTTTGTATTCT
GTTGCTGATGCTCACAACTATGGTTCCTGATTTCTTTCCTAGGATTTCTA
TCTCCAGAGTTGTATCTGTTTGTGATTTCTTTATTGTTTCTACTTCCATC
TTTAGATCCTTGATAGTTTTGTTCAATTCCATCACCTGTTTGGAAGTGTT
TTCCTGTATCTCTCTAAGGGATTTTTGTGTTTCCTCTTTAAGGGATTCTA
GCTGTTAACCTGTGTTTTCCTGTATTTCCTCTTTAAAGTCCTCCATCATC
ATCATGAGAAGTGACTTTAGATCCATGTCTTGCTTTTCTGGTGTGATGTA
TCCAGGACTTGCTATGGTGGGAGAAGTTGGTTCTGATGTTGCAAGTAACC
TTGTTTN
|
quality values | Open.Hide. 7 8 7 7 8 8 8 10 10 15 19 19 25 12 12 12 11 11 11 11 3 0 3 7 7 9 7 7 3 0 3 6 6 6 6 6 7 9 10 11 9 11 11 10 10 9 9 9 12 30
41 50 33 33 33 30 33 21 21 9 9 9 9 10 9 12 10 12 12 11 11 15 17 20 25 32 47 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 53 57 57 57 57 57 59 59 59
59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 46 46 40 43 46 50 54 54 48 44 39 37 37 43 48 59 68 68 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 50 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 50 43 43 35 35 43 47 50 57 59 59 59 59 59 57 57 54 57 57 57 59 54 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57
57 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 57 57 57 59 59 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 46 46 42 32 32 22 19 24 18 15 13
13 18 32 34 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 48 57 54 54 54 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57
59 59 48 48 48 47 47 41 41 21 21 10 8 6 6 6 6 3 0 3 25 27 44 47 47 50 50 50 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59
59 59 43 43 43 43 43 46 48 48 59 54 48 48 48 48 54 59 59 68 68 68 68 57 57 54 54 54 59 59 68 68 68 57 57 48 48 48 57 48 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54
57 57 59 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 54 57 54 57 57 52 52 52 57 57 57 54 54 52 52 52 52 52 57 52 52 52 50 50 41 41 43 43 41 42 42 57 43 57 52 52 52
52 52 52 59 59 59 59 57 57 52 52 52 59 59 57 59 52 43 43 37 37 37 52 52 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 48 57 44 44 43 44 44 57 57 48
48 48 48 48 48 48 57 44 43 43 43 42 42 30 42 28 36 28 41 37 43 42 36 36 30 37 36 44 28 35 35 37 37 43 43 43 43 39 39 39 39 40 40 43 43 34 28 21 14 14
28 28 43 43 43 43 43 43 48 43 43 39 39 39 34 34 28 23 23 32 34 34 37 41 41 37 39 39 35 36 23 25 15 16 16 24 19 28 33 35 31 31 23 15 14 14 28 28 28 17
22 22 32 32 37 36 29 29 24 19 19 14 14 14 23 28 37 37 37 30 35 35 37 34 37 30 26 22 30 28 16 16 10 10 9 14 11 12 18 24 15 17 12 15 12 12 13 28 21 25
24 19 15 15 19 24 24 37 37 37 37 39 35 35 35 32 26 19 13 13 15 18 20 28 24 30 28 24 28 28 28 25 18 23 12 10 10 11 13 13 16 17 27 17 16 14 16 22 24 23
21 18 17 17 21 22 25 30 32 31 27 34 24 20 12 12 11 13 13 17 17 8 8 8 10 8 13 17 17 17 18 15 15 17 17 10 10 10 11 11 16 13 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 7 8 8 8 6 8 8 8 12 10 16 16 35 34 41 32 37 37 37 31 31 21 16 11 10 6 6 6 6 6 6 9 7 8 8 8 8 10 8 10 8 11 14 21
39 30 30 30 33 33 33 23 23 9 9 9 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 10 16 22 30 37 39 48 47 53 53 53 53 47 47 47 50 50 53 53 53 50 50 50 50 50 42 54 54
54 54 68 54 54 54 48 40 33 33 33 33 40 57 57 57 68 68 57 57 57 54 54 54 57 57 68 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 51 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44
31 42 32 34 32 48 48 57 57 68 68 59 59 57 59 59 57 57 68 68 68 68 68 59 59 48 48 48 57 50 68 68 46 46 54 54 48 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 47 47 59 33 33 13 10 9 9 9 21 27 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 68 68 68 68 68 59 59 54 54 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 54 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 57 57 52 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 57 52 52 52 57 59 68 68 68 68 59 57 57 57 54 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 54 54 54 57 57 57 57 59 59 57 57 54 54 54 57
59 59 59 59 59 54 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 48 39 39 39 39 41 48 46 46 43 43 43 43 43 48 59 59 54 54 48 59 59 59 59 48 48 48 48 48 48
59 48 57 57 59 48 48 48 59 59 59 47 41 41 39 39 41 32 29 37 37 41 41 41 59 59 43 43 43 39 39 43 39 43 41 46 37 37 30 37 32 29 26 29 32 37 37 37 41 41
41 41 59 41 41 41 41 40 37 30 34 23 23 23 28 28 41 39 48 39 39 35 35 35 59 59 59 59 39 39 35 30 30 35 30 32 32 36 32 32 32 30 28 25 30 30 31 31 31 21
21 13 13 12 19 23 20 31 26 36 30 30 37 37 39 39 32 32 20 18 18 24 20 20 20 20 24 17 17 25 30 28 27 23 24 28 30 30 21 20 12 12 11 11 11 15 15 11 12 12
26 19 20 25 23 34 23 25 23 32 23 24 24 28 15 11 9 9 9 18 18 10 9 9 9 9 9 15 16 16 16 11 16 16 23 15 14 14 12 10 9 9 9 11 11 11 17 15 17 14
11 11 14 9 9 3 0 |