BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-006P07
Chromosome2 (Build37)
Map Location 124,247,330 - 124,382,181
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene4930517E11Rik, LOC100043360
Downstream geneSema6d, LOC100043367, LOC100043369, Slc24a5, Myef2, LOC100043375, Slc12a1, Dut, A530010F05Rik, LOC100043698, Fbn1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-006P07.bB6Ng01-006P07.g
ACCDH843671DH843672
length1,1491,092
definitionDH843671|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-006P07, 5' end.DH843672|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-006P07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(124,381,025 - 124,382,181)(124,247,330 - 124,248,436)
sequence
gaattccatgttccagatctgtgacattgttgttgagacattaacattgt
tgataagccctccagtgtatggagcgttgttactgtcacccaagtgggct
gaggcctctttgtgcaatgctatagggatatgaacatatagcccaacaca
ggcttcaccaccatgtaattgaacaccgtttgcaaaattgttccatgtga
tcatttactgtttcagaaattcaagtccttgtttcagttgtccatgcctt
acaactgaccagcctacagtttggtggcattttcatatgctcacatattc
tgtggctctggcatttgaatagggcttgacaccagtagtttttgtgttcc
ataattccaagtgcttcaactggagagacacgaagcctgggcgtgacagg
aatcctctggctgcctctttatccccttgtcagatataggagttaagagg
attccaaggctcaacttagatcaggcttctgactggatctcctgggaaca
actcacacatgtggcttaggctagctcccaggatggctgtccctcagggt
gattgagcttgtctctgttgtagtctgtttaggatggcataaaaccatag
aagagatatgagaatggtgacaaacttggagagcaattttctttcaaaca
ctgaaagtgtattaatatgtagacgcttcacttgctgcttgtgtgatgag
cacaaagtctggatggaaaaaagtatggaggatcacttcttggacttttg
gctaagaccaagtgtgaagaaatatggaagaaaaagaagaggtttgggaa
attctcataccagtcatggaaaggagtagccgagtttaattcagcaccat
tctctgcacactgagtggcgcatgcgtatattgccattgcatatccctgc
acttcctacacagttcccattctgaagagatgccatcaagcctagaggac
ttgcttcattcagaagcattttgtacgctgcatccctcccgattctttta
acagaaatgaaggacagccaactgagcacaggttatcccttcatgccaca
gggatgctctcagtcaagctgtttctaatataataccccatgattacttc
caagaaggcttctatgatgctgcctcatcatgggcaccagacttgtctg
gaattcttctcaaccataatcactgtaaaaacaatttaaaaatctccatg
catataaattaacatctcagcaatataattttctgaaatatctctgatat
tcctagaaattctctgtcccctctccctgtccttctaggttttttgcatc
attaatctctgctgtaatgtgttctattcttgaaacagcatgagttttca
ctaaaccttattggtcccagctcgtcattgcctttacttatgtggacttc
taaagatattacggtccttatattggcctcaaatgttcatcaaatatcag
ggttgaacctttccttgctttaacaggtttctcagctcaaatctttagaa
gagtttatttgggctggaaagatggctcagcctttaaaggctaggctcac
aaccaaaaatagacgggtctatttaactggctgatgagtatgtggactga
ttcctgctgggtctcttatctttcttcttgactcaatccacattatctgg
tagtagacctgcatatagatgtgttcttcaaggctattatctgtgaaaga
agaaatgagaaggaaacctgaccaatcgactacctcagtgcaactgaaat
cttttggtaggctgtattttgtgaatggttgtattccaaatgcaaagaca
aataaattccataaaatttaccatatgtacactttaatgttctcattgtc
cattgggtcattgaagatacagagatagataatggtgcatttctcacaca
attgcaccctgatttcgtcatgtgctagcaattcttgatgaagatttaaa
cagtgaggaaggatactgatgagaatgtttcacctacatatcaactggtt
tagagatcacatttgcaagtaaattttttaaaatgtcctcataggctatt
aatattttaagtgctgctgaggataacccatatatggctataataaaaat
tgagacttccttagtgtctaattctttatcttgaatatgttcccttccta
cctgcttgtgagtctgtagatactagacttaaactgatgagctgcctgaa
atttcaatgacaacctgattttaggcaaagtctgggatggtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_124381025_124382181
seq2: B6Ng01-006P07.b_46_1194 (reverse)

seq1  CAGACAAGTCTGTGTG-CCATGATGAGGCCAGCATCCTATGAAAGCCTCT  49
      |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || |||  | |||
seq2  CAGACAAGTCTG-GTGCCCATGATGAGG-CAGCATCATA-GAAGCCTTCT  47

seq1  GGGAAGTAATCCATTGGGGTATTATATTTAGGAACAGCCTGACTGAGAGC  99
       ||||||||||   |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||
seq2  TGGAAGTAATC--ATGGGGTATTATA-TTAGAAACAGCTTGACTGAGAGC  94

seq1  ATCCCTGTGGCATTGAAGGGATAACCTTGTGCTCAGTTGGCTTGTCCTTC  149
      |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
seq2  ATCCCTGTGGCA-TGAAGGGATAACC-TGTGCTCAGTTGGC-TGTCCTTC  141

seq1  ATTTCTGTTTAAAAGAATCGGGAGGGATGCAGCGTACAAAATGCTTCTGA  199
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCTG-TTAAAAGAATCGGGAGGGATGCAGCGTACAAAATGCTTCTGA  190

seq1  ATGGAGCAAGTCCTCTAGGCTTGATGGCATCTCTTCAGAATGGGAACTGT  249
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGCAAGTCCTCTAGGCTTGATGGCATCTCTTCAGAATGGGAACTGT  240

seq1  GTAGGAAGTGCAGGGATATGCAATGGCAATATACGCATGCGCCACTCAGT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGAAGTGCAGGGATATGCAATGGCAATATACGCATGCGCCACTCAGT  290

seq1  GTGCAGAGAATGGTGCTGAATTAAACTCGGCTACTCC-TTCCATGACTGG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GTGCAGAGAATGGTGCTGAATTAAACTCGGCTACTCCTTTCCATGACTGG  340

seq1  TATGAGAATTTCCCAAACCTCTTCTTTTTCTTCCATATTTCTTCACACTT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAGAATTTCCCAAACCTCTTCTTTTTCTTCCATATTTCTTCACACTT  390

seq1  GGTCTTAGCCAAAAGTCCAAGAAGTGATCCTCCATACTTTTTTCCATCCA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTTAGCCAAAAGTCCAAGAAGTGATCCTCCATACTTTTTTCCATCCA  440

seq1  GACTTTGTGCTCATCACACAAGCAGCAAGTGAAGCGTCTACATATTAATA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTTGTGCTCATCACACAAGCAGCAAGTGAAGCGTCTACATATTAATA  490

seq1  CACTTTCAGTGTTTGAAAGAAAATTGCTCTCCAAGTTTGTCACCATTCTC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTCAGTGTTTGAAAGAAAATTGCTCTCCAAGTTTGTCACCATTCTC  540

seq1  ATATCTCTTCTATGGTTTTATGCCATCCTAAACAGACTACAACAGAGACA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCTCTTCTATGGTTTTATGCCATCCTAAACAGACTACAACAGAGACA  590

seq1  AGCTCAATCACCCTGAGGGACAGCCATCCTGGGAGCTAGCCTAAGCCACA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCAATCACCCTGAGGGACAGCCATCCTGGGAGCTAGCCTAAGCCACA  640

seq1  TGTGTGAGTTGTTCCCAGGAGATCCAGTCAGAAGCCTGATCTAAGTTGAG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGAGTTGTTCCCAGGAGATCCAGTCAGAAGCCTGATCTAAGTTGAG  690

seq1  CCTTGGAATCCTCTTAACTCCTATATCTGACAAGGGGATAAAGAGGCAGC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGAATCCTCTTAACTCCTATATCTGACAAGGGGATAAAGAGGCAGC  740

seq1  CAGAGGATTCCTGTCACGCCCAGGCTTCGTGTCTCTCCAGTTGAAGCACT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGATTCCTGTCACGCCCAGGCTTCGTGTCTCTCCAGTTGAAGCACT  790

seq1  TGGAATTATGGAACACAAAAACTACTGGTGTCAAGCCCTATTCAAATGCC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAATTATGGAACACAAAAACTACTGGTGTCAAGCCCTATTCAAATGCC  840

seq1  AGAGCCACAGAATATGTGAGCATATGAAAATGCCACCAAACTGTAGGCTG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCACAGAATATGTGAGCATATGAAAATGCCACCAAACTGTAGGCTG  890

seq1  GTCAGTTGTAAGGCATGGACAACTGAAACAAGGACTTGAATTTCTGAAAC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGTTGTAAGGCATGGACAACTGAAACAAGGACTTGAATTTCTGAAAC  940

seq1  AGTAAATGATCACATGGAACAATTTTGCAAACGGTGTTCAATTACATGGT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAATGATCACATGGAACAATTTTGCAAACGGTGTTCAATTACATGGT  990

seq1  GGTGAAGCCTGTGTTGGGCTATATGTTCATATCCCTATAGCATTGCACAA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAAGCCTGTGTTGGGCTATATGTTCATATCCCTATAGCATTGCACAA  1040

seq1  AGAGGCCTCAGCCCACTTGGGTGACAGTAACAACGCTCCATACACTGGAG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCCTCAGCCCACTTGGGTGACAGTAACAACGCTCCATACACTGGAG  1090

seq1  GGCTTATCAACAATGTTAATGTCTCAACAACAATGTCACAGATCTGGAAC  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTATCAACAATGTTAATGTCTCAACAACAATGTCACAGATCTGGAAC  1140

seq1  ATGGAATTC  1157
      |||||||||
seq2  ATGGAATTC  1149

seq1: chr2_124247330_124248436
seq2: B6Ng01-006P07.g_68_1159

seq1  GAATTCTTCTCAACCATAATCACTGTAAAAACAATTTAAAAATCTCCATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCTCAACCATAATCACTGTAAAAACAATTTAAAAATCTCCATG  50

seq1  CATATAAATTAACATCTCAGCAATATAATTTTCTGAAATATCTCTGATAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATAAATTAACATCTCAGCAATATAATTTTCTGAAATATCTCTGATAT  100

seq1  TCCTAGAAATTCTCTGTCCCCTCTCCCTGTCCTTCTAGGTTTTTTGCATC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAGAAATTCTCTGTCCCCTCTCCCTGTCCTTCTAGGTTTTTTGCATC  150

seq1  ATTAATCTCTGCTGTAATGTGTTCTATTCTTGAAACAGCATGAGTTTTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATCTCTGCTGTAATGTGTTCTATTCTTGAAACAGCATGAGTTTTCA  200

seq1  CTAAACCTTATTGGTCCCAGCTCGTCATTGCCTTTACTTATGTGGACTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAACCTTATTGGTCCCAGCTCGTCATTGCCTTTACTTATGTGGACTTC  250

seq1  TAAAGATATTACGGTCCTTATATTGGCCTCAAATGTTCATCAAATATCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGATATTACGGTCCTTATATTGGCCTCAAATGTTCATCAAATATCAG  300

seq1  GGTTGAACCTTTCCTTGCTTTAACAGGTTTCTCAGCTCAAATCTTTAGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGAACCTTTCCTTGCTTTAACAGGTTTCTCAGCTCAAATCTTTAGAA  350

seq1  GAGTTTATTTGGGCTGGAAAGATGGCTCAGCCTTTAAAGGCTAGGCTCAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTTATTTGGGCTGGAAAGATGGCTCAGCCTTTAAAGGCTAGGCTCAC  400

seq1  AACCAAAAATAGACGGGTCTATTTAACTGGCTGATGAGTATGTGGACTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAAAAATAGACGGGTCTATTTAACTGGCTGATGAGTATGTGGACTGA  450

seq1  TTCCTGCTGGGTCTCTTATCTTTCTTCTTGACTCAATCCACATTATCTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTGCTGGGTCTCTTATCTTTCTTCTTGACTCAATCCACATTATCTGG  500

seq1  TAGTAGACCTGCATATAGATGTGTTCTTCAAGGCTATTATCTGTGAAAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTAGACCTGCATATAGATGTGTTCTTCAAGGCTATTATCTGTGAAAGA  550

seq1  AGAAATGAGAAGGAAACCTGACCAATCGACTACCTCAGTGCAACTGAAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATGAGAAGGAAACCTGACCAATCGACTACCTCAGTGCAACTGAAAT  600

seq1  CTTTTGGTAGGCTGTATTTTGTGAATGGTTGTATTCCAAATGCAAAGACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGGTAGGCTGTATTTTGTGAATGGTTGTATTCCAAATGCAAAGACA  650

seq1  AATAAATTCCATAAAATTTACCATATGTACACTTTAATGTTCTCATTGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATTCCATAAAATTTACCATATGTACACTTTAATGTTCTCATTGTC  700

seq1  CATTGGGTCATTGAAGATACAGAGATAGATAATGGTGCATTTCTCACACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGGGTCATTGAAGATACAGAGATAGATAATGGTGCATTTCTCACACA  750

seq1  ATTGCACCCTGATTTCGTCATGTGCTAGCAATTCTTGATGAAGATTTAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCACCCTGATTTCGTCATGTGCTAGCAATTCTTGATGAAGATTTAAA  800

seq1  CAGTGAGGAAGGATACTGATGAGAATGTTTCACCTACATATCAACTGGTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGAGGAAGGATACTGATGAGAATGTTTCACCTACATATCAACTGGTT  850

seq1  TAGAGATCACATTTGCAAGTAAAATTTTTTAAAATGTCCTCATAGGCTAT  900
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGATCACATTTGCAAGT-AAATTTTTTAAAATGTCCTCATAGGCTAT  899

seq1  TAATATTTTAAGTGCTGCTGAGGATAACCCATATAATGGCTATAAT-AAA  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
seq2  TAATATTTTAAGTGCTGCTGAGGATAACCCATAT-ATGGCTATAATAAAA  948

seq1  ATTGAGACTTCCTTAGTGTCTAAATTCTTTATCCTTGAAATAATGTTTCC  999
      ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||  |
seq2  ATTGAGACTTCCTTAGTGTCT-AATTCTTTAT-CTTGAA--TATGTT--C  992

seq1  CTTTCCTACCTGCTTGTGAGTCTGTAGATACTAAGACATTAAACTGATGA  1049
      | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||
seq2  CCTTCCTACCTGCTTGTGAGTCTGTAGATACT-AGAC-TTAAACTGATGA  1040

seq1  GCTGCCTGAAAATATCCAAAAGGACAACCTGAATCTAGGCAGAAAGTCTG  1099
      |||||||| |||| ||   || |||||||||| | |||||  ||||||||
seq2  GCTGCCTG-AAATTTC---AATGACAACCTGATTTTAGGC--AAAGTCTG  1084

seq1  GGATGGTG  1107
      ||||||||
seq2  GGATGGTG  1092