BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-007P10
Chromosome2 (Build37)
Map Location 117,743,474 - 117,868,737
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043557, LOC241621, Spred1, LOC624574, 2610510H03Rik, Rasgrp1
Downstream geneThbs1, Fsip1, Gpr176, 1700054M17Rik, Eif2ak4, Srp14, LOC668859, Bmf, LOC640461, Bub1b, Pak6, Gm1337, Plcb2, LOC100043272, A430105I19Rik, Disp2, D2Ertd750e, Ivd, Bahd1, Chst14, LOC677379, Ccdc32, Rpusd2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-007P10.bB6Ng01-007P10.g
ACCDH844382DH844383
length1,006946
definitionDH844382|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-007P10, 5' end.DH844383|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-007P10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(117,867,737 - 117,868,737)(117,743,474 - 117,744,396)
sequence
gaattcactcaggaaaacatttcaacactggttaaaaagcagttctaacc
tggttgttttgtgatgtcaaccacccctcagggaagagcaaagaaacggg
cttttctaagacaaagtaactttgtccaccctgagtcacacagtgtactt
ggattcccttattaaggaaaccagtttgtttccaaacacttcctctctaa
gaagtacagtctgccaatatttgataaaagaattaagatttgagttgctg
ctgtgccttgtaggattggaagttataaagtaactttgggaatttcagac
ttaagtagaagtggaaagggtgtgtgaataaactcacacatgtgccagca
gctttgaacctcactgagaatcgagaggactttggcctctctgagaatgg
agagaaggactttgtccgtttagtctggcaggagtggcctctgagctatg
ggacacttactttaatgaagattctggcctcctcatctccatgcctccta
ggcaatgctgcagtggctccaccatgtgcaccttgctacacccacccaca
tggaaggaatagcatgattcttatggaaacacgccaaacacctattcctt
gtgaagactcagttgatggtatagagttccccttttcttccttatttatt
tatttaacattccaatcatagcctctccctactctcctcccagttgcacc
cttgaaaactccttcccccattacctttttccccttctcttcagagaagg
ggaagccccaccacagacaccaaccctccctggcacatcaagttccaaca
ggattaagcacatcccatcccactgagacaagacaagacatcccaagcca
ggataaaggatccatgggcaggcaacagaatttagatacaacctttgttc
caattgttaggagaacccacatgaagttgtgcattggctccaatgtgtag
ggggtctaggtccagctccatacatgctctttgttggtgggtttagtctt
tgtaat
gaattccttagagtagaatcctatacttattcctatgaataccatacttt
cagaagttctgactttaaaagtcaattttgactcttaagggttttagaaa
ttatttgcaaaaacatgtgataactcaaagacaataagatggtattagtc
atcatcaaagtgttaaagtagtccccagagtaaaactaagaatcacttga
agagaaagaggattcattccagacacagagctaaacttcttgaagaccca
ttttctacatggctgttaagcctgccttccctgggaagctgttcttcctc
cttgtctttggagtgcaaacctctgtgaagatataggcacatcaggcccc
tcaccatttctgtttcgcctagagaagcacatagagtaactgctctccta
acagagctcatctgggtgcagctgaatgccctgctctgtgatccacagtc
atttgcaatccatggacaattatccatgattggggacattgggaggcccc
atggatcatagctggcccatcagcttcatcagctgggaagcccagctagg
tgaggatagtgttggttgctttggtctcatctttacttgggccacttcac
ttcacctctgtgatcttcagccaaacaagactgttcttcagccatgtgac
tttacttacctatggaagttaggctattagagtcaagagggagattttcg
ggttgctatcttaaccccttatcaagaaaggcagcgaggttttagagact
ttaagagacatgtgtaaatttctttagcttgattttaaaaaatgtaaata
atcttatttgtcttatctatcacttacattatcttgtttgccccttggag
tttcccagggggacatttgctggcagatcttagaaagtcatggctcttgt
ccattactcttggacttcattaatagaccctgaaaaaaaaacaagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_117867737_117868737
seq2: B6Ng01-007P10.b_43_1047 (reverse)

seq1  TTACAAAGACTAAA-CCACCAACCAAAGAGCATGTAT-GAGCTGGACCTA  48
      |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TTACAAAGACTAAACCCACCAA-CAAAGAGCATGTATGGAGCTGGACCTA  49

seq1  GACCCCCTACACATTTGTAGCCAATGCACAACTTCATGTGGG-TCTCCTA  97
      ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  GACCCCCTACACA-TTGGAGCCAATGCACAACTTCATGTGGGTTCTCCTA  98

seq1  ACAATTGGAACAAAGGTTGTATCT-AACTCTGTTGCCTGCCCTTGGATCC  146
      |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||
seq2  ACAATTGGAACAAAGGTTGTATCTAAATTCTGTTGCCTGCCCATGGATCC  148

seq1  TTTATCCTGGC-TGGGATGTCTTGTCTTGTCTCAGTGGGATGGGATGTGC  195
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCCTGGCTTGGGATGTCTTGTCTTGTCTCAGTGGGATGGGATGTGC  198

seq1  TTAATCCTGTTGGAACTTGATGTGCCAGGGAGGGTTGGTGTCTGTGGTGG  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCCTGTTGGAACTTGATGTGCCAGGGAGGGTTGGTGTCTGTGGTGG  248

seq1  GGCTTCCCCTTCTCTGAAGAGAAGGGG-AAAAGGTAATGGGGGAAGGAGT  294
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTCCCCTTCTCTGAAGAGAAGGGGAAAAAGGTAATGGGGGAAGGAGT  298

seq1  TTTCAAGGGTGCAACTGGGAGGAGAGTAGGGAGAGGCTATGATTGGAATG  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAGGGTGCAACTGGGAGGAGAGTAGGGAGAGGCTATGATTGGAATG  348

seq1  TTAAATAAATAAATAAGGAAGAAAAGGGGAACTCTATACCATCAACTGAG  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATAAATAAATAAGGAAGAAAAGGGGAACTCTATACCATCAACTGAG  398

seq1  TCTTCACAAGGAATAGGTGTTTGGCGTGTTTCCATAAGAATCATGCTATT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCACAAGGAATAGGTGTTTGGCGTGTTTCCATAAGAATCATGCTATT  448

seq1  CCTTCCATGTGGGTGGGTGTAGCAAGGTGCACATGGTGGAGCCACTGCAG  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCATGTGGGTGGGTGTAGCAAGGTGCACATGGTGGAGCCACTGCAG  498

seq1  CATTGCCTAGGAGGCATGGAGATGAGGAGGCCAGAATCTTCATTAAAGTA  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGCCTAGGAGGCATGGAGATGAGGAGGCCAGAATCTTCATTAAAGTA  548

seq1  AGTGTCCCATAGCTCAGAGGCCACTCCTGCCAGACTAAACGGACAAAGTC  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTCCCATAGCTCAGAGGCCACTCCTGCCAGACTAAACGGACAAAGTC  598

seq1  CTTCTCTCCATTCTCAGAGAGGCCAAAGTCCTCTCGATTCTCAGTGAGGT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCTCCATTCTCAGAGAGGCCAAAGTCCTCTCGATTCTCAGTGAGGT  648

seq1  TCAAAGCTGCTGGCACATGTGTGAGTTTATTCACACACCCTTTCCACTTC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAGCTGCTGGCACATGTGTGAGTTTATTCACACACCCTTTCCACTTC  698

seq1  TACTTAAGTCTGAAATTCCCAAAGTTACTTTATAACTTCCAATCCTACAA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTAAGTCTGAAATTCCCAAAGTTACTTTATAACTTCCAATCCTACAA  748

seq1  GGCACAGCAGCAACTCAAATCTTAATTCTTTTATCAAATATTGGCAGACT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACAGCAGCAACTCAAATCTTAATTCTTTTATCAAATATTGGCAGACT  798

seq1  GTACTTCTTAGAGAGGAAGTGTTTGGAAACAAACTGGTTTCCTTAATAAG  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTTCTTAGAGAGGAAGTGTTTGGAAACAAACTGGTTTCCTTAATAAG  848

seq1  GGAATCCAAGTACACTGTGTGACTCAGGGTGGACAAAGTTACTTTGTCTT  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATCCAAGTACACTGTGTGACTCAGGGTGGACAAAGTTACTTTGTCTT  898

seq1  AGAAAAGCCCGTTTCTTTGCTCTTCCCTGAGGGGTGGTTGACATCACAAA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAGCCCGTTTCTTTGCTCTTCCCTGAGGGGTGGTTGACATCACAAA  948

seq1  ACAACCAGGTTAGAACTGCTTTTTAACCAGTGTTGAAATGTTTTCCTGAG  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACCAGGTTAGAACTGCTTTTTAACCAGTGTTGAAATGTTTTCCTGAG  998

seq1  TGAATTC  1001
      |||||||
seq2  TGAATTC  1005

seq1: chr2_117743474_117744396
seq2: B6Ng01-007P10.g_66_993

seq1  GAATTCCTTAGAGTAGAATCCTATACTTATTCCTATGAATACCATACTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTAGAGTAGAATCCTATACTTATTCCTATGAATACCATACTTT  50

seq1  CAGAAGTTCTGACTTTAAAAGTCAATTTTGACTCTTAAGGGTTTTAGAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGTTCTGACTTTAAAAGTCAATTTTGACTCTTAAGGGTTTTAGAAA  100

seq1  TTATTTGCAAAAACATGTGATAACTCAAAGACAATAAGATGGTATTAGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTGCAAAAACATGTGATAACTCAAAGACAATAAGATGGTATTAGTC  150

seq1  ATCATCAAAGTGTTAAAGTAGTCCCCAGAGTAAAACTAAGAATCACTTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATCAAAGTGTTAAAGTAGTCCCCAGAGTAAAACTAAGAATCACTTGA  200

seq1  AGAGAAAGAGGATTCATTCCAGACACAGAGCTAAACTTCTTGAAGACCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAAGAGGATTCATTCCAGACACAGAGCTAAACTTCTTGAAGACCCA  250

seq1  TTTTCTACATGGCTGTTAAGCCTGCCTTCCCTGGGAAGCTGTTCTTCCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTACATGGCTGTTAAGCCTGCCTTCCCTGGGAAGCTGTTCTTCCTC  300

seq1  CTTGTCTTTGGAGTGCAAACCTCTGTGAAGATATAGGCACATCAGGCCCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTCTTTGGAGTGCAAACCTCTGTGAAGATATAGGCACATCAGGCCCC  350

seq1  TCACCATTTCTGTTTCGCCTAGAGAAGCACATAGAGTAACTGCTCTCCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCATTTCTGTTTCGCCTAGAGAAGCACATAGAGTAACTGCTCTCCTA  400

seq1  ACAGAGCTCATCTGGGTGCAGCTGAATGCCCTGCTCTGTGATCCACAGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGCTCATCTGGGTGCAGCTGAATGCCCTGCTCTGTGATCCACAGTC  450

seq1  ATTTGCAATCCATGGACAATTATCCATGATTGGGGACATTGGGAGGCCCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGCAATCCATGGACAATTATCCATGATTGGGGACATTGGGAGGCCCC  500

seq1  ATGGATCATAGCTGGCCCATCAGCTTCATCAGCTGGGAAGCCCAGCTAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATCATAGCTGGCCCATCAGCTTCATCAGCTGGGAAGCCCAGCTAGG  550

seq1  TGAGGATAGTGTTGGTTGC-TTGGTCTCATCTTTACTTGGGCCAC-TCAC  598
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TGAGGATAGTGTTGGTTGCTTTGGTCTCATCTTTACTTGGGCCACTTCAC  600

seq1  TTCACCTCTGTGATCTTCAGCCAAACAAGACTGTTC-TCAGCCATGTGAC  647
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TTCACCTCTGTGATCTTCAGCCAAACAAGACTGTTCTTCAGCCATGTGAC  650

seq1  TTTACTTACCTATGGAAGTTAGGCTATTAGAGTCAAGAGGGAGA-TTTCG  696
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TTTACTTACCTATGGAAGTTAGGCTATTAGAGTCAAGAGGGAGATTTTCG  700

seq1  GGTTGCTATCTTAACCCCTTATCAAGAAAGGCAGCGAGG-TTTAGAGACT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GGTTGCTATCTTAACCCCTTATCAAGAAAGGCAGCGAGGTTTTAGAGACT  750

seq1  TTAAGAGACATGTGTAAATTTC-TTAGCTTGATTTTAAAAAATGTAAATT  794
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TTAAGAGACATGTGTAAATTTCTTTAGCTTGATTTTAAAAAATGTAAATA  800

seq1  ATCTTATTTGTCTTATCTATCACTTACATTATCTTGTTTGCCCCTTGGAG  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTATTTGTCTTATCTATCACTTACATTATCTTGTTTGCCCCTTGGAG  850

seq1  TTTCCCAGGGTGACATATGCTGGCAGATC-TAGAAGGTCATTGGCTCTTG  893
      |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||
seq2  TTTCCCAGGGGGACATTTGCTGGCAGATCTTAGAAAGTCA-TGGCTCTTG  899

seq1  TCCAATACTCCTTGTACTTCATCAATAGAC  923
      |||| |||| |||| ||||||| |||||||
seq2  TCCATTACT-CTTGGACTTCATTAATAGAC  928