BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-009G22
Chromosome2 (Build37)
Map Location 173,632,683 - 173,784,239
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC620189, LOC664880
Upstream geneBmp7, LOC100043751, Spo11, Rae1, Rbm38, Ctcfl, EG619800, Pck1, Zbp1, Tmepai, 1700021F07Rik, 1700030G11Rik, LOC100043911, Rab22a, 1700010B08Rik, Vapb
Downstream geneLOC100043912, LOC664901, Stx16, Npepl1, Nespas, Gnas, Th1l, Ctsz, Rpl30-ps5, Tubb1, Atp5e, Slmo2, LOC664967, LOC100043757, Edn3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-009G22.bB6Ng01-009G22.g
ACCDH845374DH845375
length928266
definitionDH845374|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-009G22, 5' end.DH845375|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-009G22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(173,632,683 - 173,633,611)(173,783,974 - 173,784,239)
sequence
gaattctttcttgaagagactgatacctataacacagagccaccatgact
ctgagtgtctttaaggaagagtacatgatagtccctaccatcccaggctt
ccccagtgtccttagctgtccagcctagctttctcctagtccaagagatt
tgcggattctctcttttcccttacccagcagatcccacaaggccactctg
ccatgtggccttgtctttcactggttcttgtgctgactcttaggctggca
ctgtcaccccacatctattggaagagccatgcctggcacagcccctctgc
tctctgacccattccccacgcccttccacaccagccattaggtatctcct
tcctatttgcttttgtattttgacttttcatttttgggaacaattttagg
ctatgttgcagaagcagtagagttctggtataccctctgcctagctactc
tgaaggttctcatctaatctactcagacatccaatgatgatcaaaaccag
gaagtagagtgtagtcaacagcctgttccaggttcattctctgccatgtt
tatgacagttttagggtcaggcatttaattgtcatgtcttttctacatgt
ctttggttttatctttcccaaccttgacacttttggagaacactggacag
tcacttcacagagtccctttgtctggaactagtgttttctctttgattga
gattgacccattccttgtggcaagagtaatgagtgacttcacttcactgt
gtcaaaaggcgccgggttggccagtcaacagtttggacttcatttctatg
cccactgttgaggacgggtgtcttggtggttactaatagactcaaggcct
ccttgagacctggtaacatccttgcctacatttgtaatcctgacctatgt
gttttctgacctggaggcatcacttgtc
acatgtaggtagatgtatacacatgtggatagatggatacacatgtgagt
agatggatactcatttgggtagatggatacacatatgtgtagatggatac
atatgtggatagatggatgtgtatgttgtcgatgaaaaaattgagaaaca
tatctgggtgtatgcatacatatttgattatcttgatacaaactgtagta
gggggatacatatgtgggtagattaatatacatgtgagtatgtggataaa
tatgtgggtagatgaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_173632683_173633611
seq2: B6Ng01-009G22.b_46_973

seq1  GAATTCTTTCTTGAAGAGACTGATACCTATAACACAGAGCCACCATGACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCTTGAAGAGACTGATACCTATAACACAGAGCCACCATGACT  50

seq1  CTGAGTGTCTTTAAGGAAGAGTACATGATAGTCCCTACCATCCCAGGCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTGTCTTTAAGGAAGAGTACATGATAGTCCCTACCATCCCAGGCTT  100

seq1  CCCCAGTGTCCTTAGCTGTCCAGCCTAGCTTTCTCCTAGTCCAAGAGATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGTGTCCTTAGCTGTCCAGCCTAGCTTTCTCCTAGTCCAAGAGATT  150

seq1  TGCGGATTCTCTCTTTTCCCTTACCCAGCAGATCCCACAAGGCCACTCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGGATTCTCTCTTTTCCCTTACCCAGCAGATCCCACAAGGCCACTCTG  200

seq1  CCATGTGGCCTTGTCTTTCACTGGTTCTTGTGCTGACTCTTAGGCTGGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTGGCCTTGTCTTTCACTGGTTCTTGTGCTGACTCTTAGGCTGGCA  250

seq1  CTGTCACCCCACATCTATTGGAAGAGCCATGCCTGGCACAGCCCCTCTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCACCCCACATCTATTGGAAGAGCCATGCCTGGCACAGCCCCTCTGC  300

seq1  TCTCTGACCCATTCCCCACGCCCTTCCACACCAGCCATTAGGTATCTCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGACCCATTCCCCACGCCCTTCCACACCAGCCATTAGGTATCTCCT  350

seq1  TCCTATTTGCTTTTGTATTTTGACTTTTCATTTTTGGGAACAATTTTAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATTTGCTTTTGTATTTTGACTTTTCATTTTTGGGAACAATTTTAGG  400

seq1  CTATGTTGCAGAAGCAGTAGAGTTCTGGTATACCCTCTGCCTAGCTACTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTTGCAGAAGCAGTAGAGTTCTGGTATACCCTCTGCCTAGCTACTC  450

seq1  TGAAGGTTCTCATCTAATCTACTCAGACATCCAATGATGATCAAAACCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGGTTCTCATCTAATCTACTCAGACATCCAATGATGATCAAAACCAG  500

seq1  GAAGTAGAGTGTAGTCAACAGCCTGTTCCAGGTTCATTCTCTGCCATGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTAGAGTGTAGTCAACAGCCTGTTCCAGGTTCATTCTCTGCCATGTT  550

seq1  TATGACAGTTTTAGGGTCAGGCATTTAATTGTCATGTCTTTTCTACATGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGACAGTTTTAGGGTCAGGCATTTAATTGTCATGTCTTTTCTACATGT  600

seq1  CTTTGGTTTTATCTTTCCCAACCTTGACACTTTTGGAGAACACTGGACAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGGTTTTATCTTTCCCAACCTTGACACTTTTGGAGAACACTGGACAG  650

seq1  TCACTTCACAGAGTCCCTTTGTCTGGAACTAGTGTTTTCTC-TTGATTGA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TCACTTCACAGAGTCCCTTTGTCTGGAACTAGTGTTTTCTCTTTGATTGA  700

seq1  GATTGACCCATTCCTTGTGGCAAGAGTAATGAGTGACTTCACTTCACTGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGACCCATTCCTTGTGGCAAGAGTAATGAGTGACTTCACTTCACTGT  750

seq1  GTCAAAAGGCGCCGGGTTGGCCAGTCAACAGTTTGGACTTCATTTCTATG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAAAGGCGCCGGGTTGGCCAGTCAACAGTTTGGACTTCATTTCTATG  800

seq1  CCCACTGTTGAGGACGGGTGTCTTGGTGGTTACTAATAGACTCAAGGCCT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACTGTTGAGGACGGGTGTCTTGGTGGTTACTAATAGACTCAAGGCCT  850

seq1  CCTTGAGACCTGGTAACATCCTTGCCTACCATTGTAAGCCCTGACCTATG  899
      |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||
seq2  CCTTGAGACCTGGTAACATCCTTGCCTACATTTGTAA-TCCTGACCTATG  899

seq1  TGTTTCCTGACCTGGAGGCCATCACTTGTC  929
      ||||| |||||||||||| |||||||||||
seq2  TGTTTTCTGACCTGGAGG-CATCACTTGTC  928

seq1: chr2_173783974_173784239
seq2: B6Ng01-009G22.g_76_341 (reverse)

seq1  TTCATCTACCCACATATTTATCCACATACTCACATGTATATTAATCTACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCTACCCACATATTTATCCACATACTCACATGTATATTAATCTACC  50

seq1  CACATATGTATCCCCCTACTACAGTTTGTATCAAGATAATCAAATATGTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATATGTATCCCCCTACTACAGTTTGTATCAAGATAATCAAATATGTA  100

seq1  TGCATACACCCAGATATGTTTCTCAATTTTTTCATCGACAACATACACAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATACACCCAGATATGTTTCTCAATTTTTTCATCGACAACATACACAT  150

seq1  CCATCTATCCACATATGTATCCATCTACACATATGTGTATCCATCTACCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTATCCACATATGTATCCATCTACACATATGTGTATCCATCTACCC  200

seq1  AAATGAGTATCCATCTACTCACATGTGTATCCATCTATCCACATGTGTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAGTATCCATCTACTCACATGTGTATCCATCTATCCACATGTGTAT  250

seq1  ACATCTACCTACATGT  266
      ||||||||||||||||
seq2  ACATCTACCTACATGT  266