BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-013D02
Chromosome2 (Build37)
Map Location 62,305,254 - 62,476,408
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGcg, Fap, Ifih1
Upstream geneTank, Psmd14, Tbr1, LOC100039274, Slc4a10, Dpp4
Downstream geneGca, Kcnh7, EG667257
LinkOpen Mouse BAC browser

no map image available.



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-013D02.bB6Ng01-013D02.g
ACCDH848074DH848075
length9751,036
definitionDH848074|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-013D02, 5' end.DH848075|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-013D02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(62,305,254 - 62,306,230)(62,475,371 - 62,476,408)
sequence
gaattctacttaaaatcaacattcatcagtgaaattaatctctgtgattt
tctttatgttctcctctttgctatgttttgtatcaattgttagttatata
cagtacttgtgttacagctataatatttaaaatattccttaaaaaaaaaa
caacaacaacaactggctctagaataatttacagagccacattcacctat
ttcacttggaaactatttggacctggtgcctttctcacaaaacagtgttg
gttgtttcgtggttgtggtctggggaaccctgggctccaacatgctgggc
aggtgctctgcctctgagctaaccctccagccccatcttgaggcttccat
ttaatctataaaattggtttactcttaggtcttttttaaaagtctctact
gtgccatctaaaaataattctattatcttaaacatcttacaaatttcatc
tagattttcaactatctcctttatcttaattcgtacttaaaaacacaaga
aaatcaagaagaaggaagaccagcgtgtggatacttcattcctccttaga
atagggaacaaaataccaatggaaggagttacagagacaatgtttggagc
taagatgaaaggatggaccatccagagactaccccacccggggatccatc
ctataatcagccaccaaacctagacactattgcacatgccagcaagactt
tgctgaagggaccctgatataggtgtctcatgtgaggctatgccagtgcc
tggcaaacacagaagtggatgctcccagtcatctatagatggaacacagg
gcccccaatggagaagatagagaaagtacccaaagagctgaagaggtctg
caaccctataggtggaacaacaatatgaactaaccagtacccccagagct
cgtgtctctagctgcatatgtagcagagatggcctagtaagccatcattg
ggaagagaggccctaagtcttacaa
gaattccttgttaacaactgggatcaacaagggctccaactaagattcac
ttaatcttagaagccagggtcaagagcttcatgcccttgccatagttcct
gttttagtctattgtatagtccaccttccccttaggccattgtaatacgt
gtgtatgggtgtgactcagctatagtcttagaagccaggtgtgaggtctt
tactctcctagggcaagggctttcacacccaagtcctggttctaactagg
gagttctattctagctaaccatctcatgaataatgcaatactctaaaacc
acagcctgctgaccacgttgggtgtctgtcctcttatacctggtctggga
taggctgtctttgttattctctctgcataccccaggctggctcccccaca
gactccctgcaatctcctcctatctttctaggaacataacagacatgctc
taccctttcctgcctccagtgggttcttgggatttgaactcaggtcttca
cactttcgtgtcaagttccttgtccactctcttgaccaggaagtagcaac
ctcctcgggtcaatttagagggatggcagaggagtggttgtgtttctccc
tgctcagttatggtaaaatggaaaagaaaataaagaatcattaatcaaaa
tagagaagatctggagaaattttatcttatgctgcgattgtggattttta
agatgaggagcaaaaccaagcatcttcctttgtttatcactgaggacacg
gtgagaaagaggggtatgctaaacacctgggctatggtatgtcgccatgg
tagaggaccccaggcttgaaatccaaatgcttatgtgctcctgcctcttt
ccctggacctgtgacctttgttcagctactagacctccttggggtttcac
cttacttgtctgtgaaatgggcacattaatatcccttacccgcctgatca
ttctgaagagtaaattcttcaagtatgaacaggatttgtggaagctaaaa
atggactagttttatttatagactattttatctatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_62305254_62306230
seq2: B6Ng01-013D02.b_48_1022

seq1  GAATTCTACTTAAAATCAACATTCATCAGTGAAATTAATCTCTGTGATTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACTTAAAATCAACATTCATCAGTGAAATTAATCTCTGTGATTT  50

seq1  TCTTTATGTTCTCCTCTTTGCTATGTTTTGTATCAATTGTTAGTTATATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTATGTTCTCCTCTTTGCTATGTTTTGTATCAATTGTTAGTTATATA  100

seq1  CAGTACTTGTGTTACAGCTATAATATTTAAAATATTCCTTAAAAAAAAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTACTTGTGTTACAGCTATAATATTTAAAATATTCCTTAAAAAAAAAA  150

seq1  CAACAACAACAACTGGCTCTAGAATAATTTACAGAGCCACATTCACCTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAACAACAACTGGCTCTAGAATAATTTACAGAGCCACATTCACCTAT  200

seq1  TTCACTTGGAAACTATTTGGACCTGGTGCCTTTCTCACAAAACAGTGTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACTTGGAAACTATTTGGACCTGGTGCCTTTCTCACAAAACAGTGTTG  250

seq1  GTTGTTTCGTGGTTGTGGTCTGGGGAACCCTGGGCTCCAACATGCTGGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTTTCGTGGTTGTGGTCTGGGGAACCCTGGGCTCCAACATGCTGGGC  300

seq1  AGGTGCTCTGCCTCTGAGCTAACCCTCCAGCCCCATCTTGAGGCTTCCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGCTCTGCCTCTGAGCTAACCCTCCAGCCCCATCTTGAGGCTTCCAT  350

seq1  TTAATCTATAAAATTGGTTTACTCTTAGGTCTTTTTTAAAAGTCTCTACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCTATAAAATTGGTTTACTCTTAGGTCTTTTTTAAAAGTCTCTACT  400

seq1  GTGCCATCTAAAAATAATTCTATTATCTTAAACATCTTACAAATTTCATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCATCTAAAAATAATTCTATTATCTTAAACATCTTACAAATTTCATC  450

seq1  TAGATTTTCAACTATCTCCTTTATCTTAATTCGTACTTAAAAACACAAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATTTTCAACTATCTCCTTTATCTTAATTCGTACTTAAAAACACAAGA  500

seq1  AAATCAAGAAGAAGGAAGACCAGCGTGTGGATACTTCATTCCTCCTTAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAAGAAGAAGGAAGACCAGCGTGTGGATACTTCATTCCTCCTTAGA  550

seq1  ATAGGGAACAAAATACCAATGGAAGGAGTTACAGAGACAATGTTTGGAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGGAACAAAATACCAATGGAAGGAGTTACAGAGACAATGTTTGGAGC  600

seq1  TAAGATGAAAGGATGGACCATCCAGAGACTACCCCACCCGGGGATCCATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATGAAAGGATGGACCATCCAGAGACTACCCCACCCGGGGATCCATC  650

seq1  CTATAATCAGCCACCAAACCTAGACACTATTGCACATGCCAGCAAGACTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAATCAGCCACCAAACCTAGACACTATTGCACATGCCAGCAAGACTT  700

seq1  TGCTGAAGGGACCCTGATATAGGTGTCTCATGTGAGGCTATGCCAGTGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGAAGGGACCCTGATATAGGTGTCTCATGTGAGGCTATGCCAGTGCC  750

seq1  TGGCAAACACAGAAGTGGATGCTCCCAGTCATCTATAGATGGAACACAGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAAACACAGAAGTGGATGCTCCCAGTCATCTATAGATGGAACACAGG  800

seq1  GCCCCCAATGGAGAAGATAGAGAAAGTACCCAAAGAGCTGAAGAGGTCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCCAATGGAGAAGATAGAGAAAGTACCCAAAGAGCTGAAGAGGTCTG  850

seq1  CAACCCTATAGGTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTACCCCCAGAGCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCCTATAGGTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTACCCCCAGAGCT  900

seq1  CGTGTCTCTAGCTGCATATGTAGCAGAAGATGGCCTAGTAAGCCATCATT  950
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGTCTCTAGCTGCATATGTAGCAG-AGATGGCCTAGTAAGCCATCATT  949

seq1  GGGAAGAGAGGCCCCTAAGTCTTACAA  977
      ||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GGGAAGAGAGG-CCCTAAGTCTTACAA  975

seq1: chr2_62475371_62476408
seq2: B6Ng01-013D02.g_68_1103 (reverse)

seq1  AATAAATAAAATAGTCTAATAAATAAAATTAGTCCATTTATAGCTACCAC  50
      |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||
seq2  AATAGATAAAATAGTCT-ATAAATAAAACTAGTCCATTTTTAGCTTCCAC  49

seq1  AAATCCATGTACATACTTTGAAGAATTTACTTCTCAGAATGATCTAGCCG  100
      |||||| ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||  || |
seq2  AAATCC-TGTTCATAC-TTGAAGAATTTACTCTTCAGAATGATCAGGCGG  97

seq1  GTAAGGGATATTATTGTGCCCATTTCACAGACAAGTAAGGTGAAA-CCCA  149
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GTAAGGGATATTAATGTGCCCATTTCACAGACAAGTAAGGTGAAACCCCA  147

seq1  AGGAGGTCTAGTAGCTGAACAAAGGTCACAGGTCCAGGGAAAGAGGCAGG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGGTCTAGTAGCTGAACAAAGGTCACAGGTCCAGGGAAAGAGGCAGG  197

seq1  AGCACATAAGCATTTGGATTTCAAGCCTGGGGTCCTCTACCATGGCGACA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACATAAGCATTTGGATTTCAAGCCTGGGGTCCTCTACCATGGCGACA  247

seq1  TACCATAGCCCAGGTGTTTAGCATACCCCTCTTTCTCACCGTGTCCTCAG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCATAGCCCAGGTGTTTAGCATACCCCTCTTTCTCACCGTGTCCTCAG  297

seq1  TGATAAACAAAGGAAGATGCTTGGTTTTGCTCCTCATCTTAAAAATCCAC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAAACAAAGGAAGATGCTTGGTTTTGCTCCTCATCTTAAAAATCCAC  347

seq1  AATCGCAGCATAAGATAAAATTTCTCCAGATCTTCTCTATTTTGATTAAT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCGCAGCATAAGATAAAATTTCTCCAGATCTTCTCTATTTTGATTAAT  397

seq1  GATTCTTTATTTTCTTTTCCATTTTACCATAACTGAGCAGGGAGAAACAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCTTTATTTTCTTTTCCATTTTACCATAACTGAGCAGGGAGAAACAC  447

seq1  AACCACTCCTCTGCCATCCCTCTAAATTGACCCGAGGAGGTTGCTACTTC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCACTCCTCTGCCATCCCTCTAAATTGACCCGAGGAGGTTGCTACTTC  497

seq1  CTGGTCAAGAGAGTGGACAAGGAACTTGACACGAAAGTGTGAAGACCTGA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTCAAGAGAGTGGACAAGGAACTTGACACGAAAGTGTGAAGACCTGA  547

seq1  GTTCAAATCCCAAGAACCCACTGGAGGCAGGAAAGGGTAGAGCATGTCTG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAAATCCCAAGAACCCACTGGAGGCAGGAAAGGGTAGAGCATGTCTG  597

seq1  TTATGTTCCTAGAAAGATAGGAGGAGATTGCAGGGAGTCTGTGGGGGAGC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGTTCCTAGAAAGATAGGAGGAGATTGCAGGGAGTCTGTGGGGGAGC  647

seq1  CAGCCTGGGGTATGCAGAGAGAATAACAAAGACAGCCTATCCCAGACCAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCTGGGGTATGCAGAGAGAATAACAAAGACAGCCTATCCCAGACCAG  697

seq1  GTATAAGAGGACAGACACCCAACGTGGTCAGCAGGCTGTGGTTTTAGAGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATAAGAGGACAGACACCCAACGTGGTCAGCAGGCTGTGGTTTTAGAGT  747

seq1  ATTGCATTATTCATGAGATGGTTAGCTAGAATAGAACTCCCTAGTTAGAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCATTATTCATGAGATGGTTAGCTAGAATAGAACTCCCTAGTTAGAA  797

seq1  CCAGGACTTGGGTGTGAAAGCCCTTGCCCTAGGAGAGTAAAGACCTCACA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGACTTGGGTGTGAAAGCCCTTGCCCTAGGAGAGTAAAGACCTCACA  847

seq1  CCTGGCTTCTAAGACTATAGCTGAGTCACACCCATACACACGTATTACAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCTTCTAAGACTATAGCTGAGTCACACCCATACACACGTATTACAA  897

seq1  TGGCCTAAGGGGAAGGTGGACTATACAATAGACTAAAACAGGAACTATGG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTAAGGGGAAGGTGGACTATACAATAGACTAAAACAGGAACTATGG  947

seq1  CAAGGGCATGAAGCTCTTGACCCTGGCTTCTAAGATTAAGTGAATCTTAG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGGCATGAAGCTCTTGACCCTGGCTTCTAAGATTAAGTGAATCTTAG  997

seq1  TTGGAGCCCTTGTTGATCCCAGTTGTTAACAAGGAATTC  1038
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAGCCCTTGTTGATCCCAGTTGTTAACAAGGAATTC  1036