BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-015L06
Chromosome2 (Build37)
Map Location 124,227,855 - 124,382,181
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene4930517E11Rik, LOC100043360
Downstream geneSema6d, LOC100043367, LOC100043369, Slc24a5, Myef2, LOC100043375, Slc12a1, Dut, A530010F05Rik, LOC100043698, Fbn1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-015L06.bB6Ng01-015L06.g
ACCDH849889DH849890
length1,0841,039
definitionDH849889|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-015L06, 5' end.DH849890|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-015L06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(124,227,855 - 124,228,944)(124,381,139 - 124,382,181)
sequence
gaattcttcatggagtctccaggcaggcttactggtcaggacacagcaga
acctggctggctgcctctgaccttgcctcccccaccctgcctaagaagcc
ctgagttgtcccacagcctaggcaaccaactccttctctctgtcccctct
ccagtggagaatttcagagccagaaaagaactcattccaccccttgtaag
ggaagaagaaaacctgaatttctctattttgtttaagactgttagaaaat
tcagggagccacagcctagaaagacaaaacattttcctcccacccccacc
ccactccaagacagcaagcaacaggcaactgcagacatcagacaggtgag
cattcaaatcggagctttatttttgataaagctaattagagaatatcatg
ttgccttgatgcaccaccaaatagaccaaatacttgtcttaacatagcct
ctaaactaagctagcccctactgtcaccatgaccagagagatgatgtcta
tataactgtctcctcagacaagtctcccagtatgaaataaaggagaaagg
ctacctgaggcatgctcagacacagcctcaacttctccagctgcttcagt
ttgattgcttttgtgttccacttgaggagaggactgggcattcccttgct
gtgagctggggcaggcctggagcaggaaaggttttccctaggaggagaat
gtgtatctttgctgtaatctcagctaggacacactgaggtcaccaggcag
aggcatggaggaaaggcaggcttccagtggtcgagcacactagcggccag
gaaaatgaccaatcatttcagaaaaaaggatctgggcaactttacctgtg
agcacgagggcactaagacacggggaaaggaaagggcatgagtctggatg
aatgaagcactgcaaggcaatcagctgtgtgtcacactattaggatgcgc
agcatcttcagtgtatgttgtgagggcagaataggctcttaagcctatac
cacagcattgcctatgagaaaggagttcacacaatcaacatgaagtcaca
caaatgcgaagccatggatacttaattaaatagt
gaattccatgttccagatctgtgacattgttgttgagacattaacattgt
tgataagccctccagtgtatggagcgttgttactgtcacccaagtgggct
gaggcctctttgtgcaatgctatagggatatgaacatatagcccaacaca
ggcttcaccaccatgtaattgaacaccgtttgcaaaattgttccatgtga
tcatttactgtttcagaaattcaagtccttgtttcagttgtccatgcctt
acaactgaccagcctacagtttggtggcattttcatatgctcacatattc
tgtggctctggcatttgaatagggcttgacaccagtagtttttgtgttcc
ataattccaagtgcttcaactggagagacacgaagcctgggcgtgacagg
aatcctctggctgcctctttatccccttgtcagatataggagttaagagg
attccaaggctcaacttagatcaggcttctgactggatctcctgggaaca
actcacacatgtggcttaggctagctcccaggatggctgtccctcagggt
gattgagcttgtctctgttgtagtctgtttaggatggcataaaaccatag
aagagatatgagaatggtgacaaacttggagagcaattttctttcaaaca
ctgaaagtgtattaatatgtagacgcttcacttgctgcttgtgtgatgag
cacaaagtctggatggaaaaaagtatggaggatcacttcttggacttttg
gctaagaccaagtgtgaagaaatatggaagaaaaagaagaggtttgggaa
attctcataccagtcatggaaggagtagccgagtttaattcagcaccatt
ctctgcacactgagtggcgcatgcgtatattgccattgcatatccctgca
cttcctacacagttcccattctgaagagatgccatcaagcctagaggact
tgctccattcagaagcattttgtacgctgcatccctccgattcttttaaa
cagaaatgatgacagccacctgagcacaggttatccctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_124227855_124228944
seq2: B6Ng01-015L06.b_45_1128

seq1  GAATTCTTCATGGAGTCTCCAGGCAGGCTTACTGGTCAGGACACAGCAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCATGGAGTCTCCAGGCAGGCTTACTGGTCAGGACACAGCAGA  50

seq1  ACCTGGCTGGCTGCCTCTGACCTTGCCTCCCCCACCCTGCCTAAGAAGCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGGCTGGCTGCCTCTGACCTTGCCTCCCCCACCCTGCCTAAGAAGCC  100

seq1  CTGAGTTGTCCCACAGCCTAGGCAACCAACTCCTTCTCTCTGTCCCCTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTTGTCCCACAGCCTAGGCAACCAACTCCTTCTCTCTGTCCCCTCT  150

seq1  CCAGTGGAGAATTTCAGAGCCAGAAAAGAACTCATTCCACCCCTTGTAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTGGAGAATTTCAGAGCCAGAAAAGAACTCATTCCACCCCTTGTAAG  200

seq1  GGAAGAAGAAAACCTGAATTTCTCTATTTTGTTTAAGACTGTTAGAAAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAAGAAAACCTGAATTTCTCTATTTTGTTTAAGACTGTTAGAAAAT  250

seq1  TCAGGGAGCCACAGCCTAGAAAGACAAAACATTTTCCTCCCACCCCCACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGGAGCCACAGCCTAGAAAGACAAAACATTTTCCTCCCACCCCCACC  300

seq1  CCACTCCAAGACAGCAAGCAACAGGCAACTGCAGACATCAGACAGGTGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCCAAGACAGCAAGCAACAGGCAACTGCAGACATCAGACAGGTGAG  350

seq1  CATTCAAATCGGAGCTTTATTTTTGATAAAGCTAATTAGAGAATATCATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCAAATCGGAGCTTTATTTTTGATAAAGCTAATTAGAGAATATCATG  400

seq1  TTGCCTTGATGCACCACCAAATAGACCAAATACTTGTCTTAACATAGCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCTTGATGCACCACCAAATAGACCAAATACTTGTCTTAACATAGCCT  450

seq1  CTAAACTAAGCTAGCCCCTACTGTCACCATGACCAGAGAGATGATGTCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAACTAAGCTAGCCCCTACTGTCACCATGACCAGAGAGATGATGTCTA  500

seq1  TATAACTGTCTCCTCAGACAAGTCTCCCAGTATGAAATAAAGGAGAAAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAACTGTCTCCTCAGACAAGTCTCCCAGTATGAAATAAAGGAGAAAGG  550

seq1  CTACCTGAGGCATGCTCAGACACAGCCTCAACTTCTCCAGCTGCTTCAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCTGAGGCATGCTCAGACACAGCCTCAACTTCTCCAGCTGCTTCAGT  600

seq1  TTGATTGCTTTTGTGTTCCACTTGAGGAGAGGACTGGGCATTCCCTTGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATTGCTTTTGTGTTCCACTTGAGGAGAGGACTGGGCATTCCCTTGCT  650

seq1  GTGAGCTGGGGCAGGCCTGGAGCAGGAAAGGTTTTCCCTAGGAGGAGAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGCTGGGGCAGGCCTGGAGCAGGAAAGGTTTTCCCTAGGAGGAGAAT  700

seq1  GTGTATCTTTGCTGTAATCTCAGCTAGGACACACTGAGGTCACCAGGCAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATCTTTGCTGTAATCTCAGCTAGGACACACTGAGGTCACCAGGCAG  750

seq1  AGGCATGGAGGAAAGGCAGGCTTCCAGTGGTCGAGCACACTAGCGGCCAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATGGAGGAAAGGCAGGCTTCCAGTGGTCGAGCACACTAGCGGCCAG  800

seq1  GAAAATGACCAATCAATTCAGAAAAAAGGATCTGGGCAACTTTACCTGTG  850
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATGACCAATCATTTCAGAAAAAAGGATCTGGGCAACTTTACCTGTG  850

seq1  AGCACGAGGGCACTAAGACACGGGG-AAGGAAAGGGCATGAGTCTGGATG  899
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACGAGGGCACTAAGACACGGGGAAAGGAAAGGGCATGAGTCTGGATG  900

seq1  AATGAAGGCACTGCAAGGCAATCAGCTGTGTGTCACACTA-TAGGATGCG  948
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AATGAA-GCACTGCAAGGCAATCAGCTGTGTGTCACACTATTAGGATGCG  949

seq1  CAGCATCTTCAGTGTATG-TGTGAGGGCAGAATAGGCTCTTAAGCCTATA  997
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATCTTCAGTGTATGTTGTGAGGGCAGAATAGGCTCTTAAGCCTATA  999

seq1  CCACAGCCAATGGCCTATGAGACAGGAGTCAACACAAATCAACATGAAAG  1047
      |||||||  || |||||||||| ||||||  |||| |||||||||| |||
seq2  CCACAGC--ATTGCCTATGAGAAAGGAGTTCACAC-AATCAACATG-AAG  1045

seq1  TCAACACAAATGCGAAAGCAATGGATACCTTTAATAAAATAGT  1090
      || ||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||
seq2  TC-ACACAAATGCG-AAGCCATGGATAC--TTAATTAAATAGT  1084

seq1: chr2_124381139_124382181
seq2: B6Ng01-015L06.g_65_1103 (reverse)

seq1  AAGGGATAACCTTGTGCTCAGTTGGCTTGTCCTTCATTTCTGTTTAAAAG  50
      ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||
seq2  AAGGGATAACC-TGTGCTCAGGTGGC-TGT-CATCATTTCTGTTTAAAAG  47

seq1  AATCGGGAGGGATGCAGCGTACAAAATGCTTCTGAATGGAGCAAGTCCTC  100
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATC-GGAGGGATGCAGCGTACAAAATGCTTCTGAATGGAGCAAGTCCTC  96

seq1  TAGGCTTGATGGCATCTCTTCAGAATGGGAACTGTGTAGGAAGTGCAGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCTTGATGGCATCTCTTCAGAATGGGAACTGTGTAGGAAGTGCAGGG  146

seq1  ATATGCAATGGCAATATACGCATGCGCCACTCAGTGTGCAGAGAATGGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGCAATGGCAATATACGCATGCGCCACTCAGTGTGCAGAGAATGGTG  196

seq1  CTGAATTAAACTCGGCTACTCCTTCCATGACTGGTATGAGAATTTCCCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAATTAAACTCGGCTACTCCTTCCATGACTGGTATGAGAATTTCCCAA  246

seq1  ACCTCTTCTTTTTCTTCCATATTTCTTCACACTTGGTCTTAGCCAAAAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTTCTTTTTCTTCCATATTTCTTCACACTTGGTCTTAGCCAAAAGT  296

seq1  CCAAGAAGTGATCCTCCATACTTTTTTCCATCCAGACTTTGTGCTCATCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGAAGTGATCCTCCATACTTTTTTCCATCCAGACTTTGTGCTCATCA  346

seq1  CACAAGCAGCAAGTGAAGCGTCTACATATTAATACACTTTCAGTGTTTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAGCAGCAAGTGAAGCGTCTACATATTAATACACTTTCAGTGTTTGA  396

seq1  AAGAAAATTGCTCTCCAAGTTTGTCACCATTCTCATATCTCTTCTATGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAATTGCTCTCCAAGTTTGTCACCATTCTCATATCTCTTCTATGGT  446

seq1  TTTATGCCATCCTAAACAGACTACAACAGAGACAAGCTCAATCACCCTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGCCATCCTAAACAGACTACAACAGAGACAAGCTCAATCACCCTGA  496

seq1  GGGACAGCCATCCTGGGAGCTAGCCTAAGCCACATGTGTGAGTTGTTCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACAGCCATCCTGGGAGCTAGCCTAAGCCACATGTGTGAGTTGTTCCC  546

seq1  AGGAGATCCAGTCAGAAGCCTGATCTAAGTTGAGCCTTGGAATCCTCTTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGATCCAGTCAGAAGCCTGATCTAAGTTGAGCCTTGGAATCCTCTTA  596

seq1  ACTCCTATATCTGACAAGGGGATAAAGAGGCAGCCAGAGGATTCCTGTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCTATATCTGACAAGGGGATAAAGAGGCAGCCAGAGGATTCCTGTCA  646

seq1  CGCCCAGGCTTCGTGTCTCTCCAGTTGAAGCACTTGGAATTATGGAACAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCCCAGGCTTCGTGTCTCTCCAGTTGAAGCACTTGGAATTATGGAACAC  696

seq1  AAAAACTACTGGTGTCAAGCCCTATTCAAATGCCAGAGCCACAGAATATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACTACTGGTGTCAAGCCCTATTCAAATGCCAGAGCCACAGAATATG  746

seq1  TGAGCATATGAAAATGCCACCAAACTGTAGGCTGGTCAGTTGTAAGGCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCATATGAAAATGCCACCAAACTGTAGGCTGGTCAGTTGTAAGGCAT  796

seq1  GGACAACTGAAACAAGGACTTGAATTTCTGAAACAGTAAATGATCACATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAACTGAAACAAGGACTTGAATTTCTGAAACAGTAAATGATCACATG  846

seq1  GAACAATTTTGCAAACGGTGTTCAATTACATGGTGGTGAAGCCTGTGTTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAATTTTGCAAACGGTGTTCAATTACATGGTGGTGAAGCCTGTGTTG  896

seq1  GGCTATATGTTCATATCCCTATAGCATTGCACAAAGAGGCCTCAGCCCAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTATATGTTCATATCCCTATAGCATTGCACAAAGAGGCCTCAGCCCAC  946

seq1  TTGGGTGACAGTAACAACGCTCCATACACTGGAGGGCTTATCAACAATGT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGTGACAGTAACAACGCTCCATACACTGGAGGGCTTATCAACAATGT  996

seq1  TAATGTCTCAACAACAATGTCACAGATCTGGAACATGGAATTC  1043
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGTCTCAACAACAATGTCACAGATCTGGAACATGGAATTC  1039