BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-021A10
Chromosome2 (Build37)
Map Location 21,595,285 - 21,727,933
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGpr158
Upstream geneEtl4, Arhgap21, LOC433408, LOC675912, C130046B21Rik, 4933434I06Rik, Thnsl1
Downstream geneLOC637235, Myo3a, LOC100041703, Myo3a, Gad2, Apbb1ip
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-021A10.bB6Ng01-021A10.g
ACCDH853653DH853654
length8301,020
definitionDH853653|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-021A10, 5' end.DH853654|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-021A10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(21,595,285 - 21,596,116)(21,726,907 - 21,727,933)
sequence
gaattcaagataggggttatagaggtgactcagtggttaagagcactggc
taattttccagagaacctagttttgaatcccagccaccacatggcagctc
acaaccatctgtaactctagttccacaaggtttgacacccttggtgggta
ccatgcacacacatggtgcatggacatacctgttggcatattccttctta
catattcaataaattatatgtatatatttgtaaataaatatttgaattgt
cagccagctatgcagatggtagcaggacaaatggtgttagaataagctgc
caaagactctgatagaatcatgtgaccaaatctgtatatgtgtgtggtgt
ggtgtgtgtgtaaaccagagtgttgcttaagagcttctggagacacacat
attaaagcaattgttttctgagaggcttaacactctagctagtgaacacc
tgtgagcacttagtgatcaatattgggctttatagtgtggaggttaaggg
tatggctgtgctatccatgacctgtaaactggaatggtagattctatgag
aactgaatgcctatatacaatgctcagagcactgcttgtcacatcttcca
ggttttgcaaggtgctttatttaaagtaacatgctatagggtagcaactc
tccatcttcagccagcatcttatgtgacatatgagcacagttggctggcc
tcacccctcacctgctacatcagtagtccatgacagagttgttgactttt
gtatgctagaagctccaaggagatgctgaggaacctctttgaagactcca
atgcttttcaaagcatgtgtggaggagtgg
gaattccaccatggaaaatcatatttaaaaacacaagacaaaataaaatt
tctaataatagctaagttaaacattaaaatcatttcattagcaatatcaa
acaatacactctcaatgaaaaacaatttattattcaaagtaccaattaaa
ctaaatgtgatatataaaagatgtgcttaggtaaaaaaaaaatcagtttt
atataattaacttcagactaacactgcaattagtagagaaaatatgcaga
tgttaccaaattctacagatattacgtgggagttgaaatatgtgttgggc
ttctgctttcaaaaatagtttcttgtgttaaattatctctacaggaggaa
ggagtgtagtttaaaaaggaattgcctctacatttaaagacccaaatatg
gtttaaagaaaaacgatgtgttttattttcaatctataagggataatgat
attgaagtaccatggtcctttaaaattaacaattaaggatgaagattatt
ccaagttatatttcaaaaggctagggaaagcatgaagaattagtataagt
tctgagacactaaagatgtcctttgtgatacaaggactcccaccaagctt
aaaagcagagcttcaaagtctaaacaccattcaaactgtggtgcctctta
ccaagggactgaggtacctatgttaacaacctgctacccctgttggctac
atcaaggaacttcaaatagaataaatacatatattattaataacacatct
agtgttttactgtttttcaagtgtttattttaatgccctctttcctcttg
aaattcagttcacttagaatcatttatgatcaaattagaaagcattttat
gactataccagggaggagcccagagtcgacagctcagagagcattgtaag
tatactttcaaacagcataagtcatgtttgtgattagatggggagagggt
gcattcattatgcactgctaccagcaaaggacgcagctgttctgattctc
taaatgtcttgtaggtgtga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_21595285_21596116
seq2: B6Ng01-021A10.b_51_880

seq1  GAATTCAAGATAGGGGTTATAGAGGTGACTCAGTGGTTAAGAGCACTGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGATAGGGGTTATAGAGGTGACTCAGTGGTTAAGAGCACTGGC  50

seq1  TAATTTTCCAGAGAACCTAGTTTTGAATCCCAGCCACCACATGGCAGCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTTCCAGAGAACCTAGTTTTGAATCCCAGCCACCACATGGCAGCTC  100

seq1  ACAACCATCTGTAACTCTAGTTCCACAAGGTTTGACACCCTTGGTGGGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACCATCTGTAACTCTAGTTCCACAAGGTTTGACACCCTTGGTGGGTA  150

seq1  CCATGCACACACATGGTGCATGGACATACCTGTTGGCATATTCCTTCTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCACACACATGGTGCATGGACATACCTGTTGGCATATTCCTTCTTA  200

seq1  CATATTCAATAAATTATATGTATATATTTGTAAATAAATATTTGAATTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATTCAATAAATTATATGTATATATTTGTAAATAAATATTTGAATTGT  250

seq1  CAGCCAGCTATGCAGATGGTAGCAGGACAAATGGTGTTAGAATAAGCTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCAGCTATGCAGATGGTAGCAGGACAAATGGTGTTAGAATAAGCTGC  300

seq1  CAAAGACTCTGATAGAATCATGTGACCAAATCTGTATATGTGTGTGGTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGACTCTGATAGAATCATGTGACCAAATCTGTATATGTGTGTGGTGT  350

seq1  GGTGTGTGTGTAAACCAGAGTGTTGCTTAAGAGCTTCTGGAGACACACAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGTGTGTAAACCAGAGTGTTGCTTAAGAGCTTCTGGAGACACACAT  400

seq1  ATTAAAGCAATTGTTTTCTGAGAGGCTTAACACTCTAGCTAGTGAACACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAGCAATTGTTTTCTGAGAGGCTTAACACTCTAGCTAGTGAACACC  450

seq1  TGTGAGCACTTAGTGATCAATATTGGGCTTTATAGTGTGGAGGTTAAGGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGCACTTAGTGATCAATATTGGGCTTTATAGTGTGGAGGTTAAGGG  500

seq1  TATGGCTGTGCTATCCATGACCTGTAAACTGGAATGGTAGATTCTATGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGCTGTGCTATCCATGACCTGTAAACTGGAATGGTAGATTCTATGAG  550

seq1  AACTGAATGCCTATATACAATGCTCAGAGCACTGCTTGTCACATCTTCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGAATGCCTATATACAATGCTCAGAGCACTGCTTGTCACATCTTCCA  600

seq1  GGTTTTGCAAGGTGCTTTATTTAAAGTAACATGCTATAGGGTAGCAACTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTGCAAGGTGCTTTATTTAAAGTAACATGCTATAGGGTAGCAACTC  650

seq1  TCCATCTTCAGCCAGCATCTTATGTGACATATGAGCACAGGTGGCTGGCC  700
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TCCATCTTCAGCCAGCATCTTATGTGACATATGAGCACAGTTGGCTGGCC  700

seq1  TCACCCCTCACCTGCTACATCAGTAAGTCCATGACAGAGTTGTTGAC-TT  749
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||
seq2  TCACCCCTCACCTGCTACATCAGT-AGTCCATGACAGAGTTGTTGACTTT  749

seq1  TGTATTGCTAAGAAGCTCCAAGGAGATGCTGAGGAACCTCTTTGAAGACT  799
      |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTA-TGCT-AGAAGCTCCAAGGAGATGCTGAGGAACCTCTTTGAAGACT  797

seq1  CCAATGCTATTCAAAGCATGTGTGGAGGAGTGG  832
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGCTTTTCAAAGCATGTGTGGAGGAGTGG  830

seq1: chr2_21726907_21727933
seq2: B6Ng01-021A10.g_68_1087 (reverse)

seq1  TCACACCTACCAGACATTTAAGAGGATCAGAACAGCTGCTGTCCTTTTGC  50
      |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||
seq2  TCACACCTACAAGACATTT-AGAGAATCAGAACAGCTGC-GTCC-TTTGC  47

seq1  TTGTGTAGCAAGTGCATTAATGAATGCACCCTCTCCCCATCCTTAATCAC  100
      |   ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||
seq2  T--GGTAGC-AGTGCA-TAATGAATGCACCCTCTCCCCATC--TAATCAC  91

seq1  AAACATGACTTATGCTGTTTGATAGTATACTTACAATGCTCTCTGAGCTG  150
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATGACTTATGCTGTTTGAAAGTATACTTACAATGCTCTCTGAGCTG  141

seq1  TCGACTCTGGGCTCCT-CCTGGTATAGTCAT-AAATGCTTTCTAATTTGA  198
      |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TCGACTCTGGGCTCCTCCCTGGTATAGTCATAAAATGCTTTCTAATTTGA  191

seq1  TCATAAATGATTCTAAGTGAACTGAATTTCAAGAGGAAAGAGGGCATTAA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAAATGATTCTAAGTGAACTGAATTTCAAGAGGAAAGAGGGCATTAA  241

seq1  AATAAACACTTGAAAAACAGTAAAACACTAGATGTGTTATTAATAATATA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAACACTTGAAAAACAGTAAAACACTAGATGTGTTATTAATAATATA  291

seq1  TGTATTTATTCTATTTGAAGTTCCTTGATGTAGCCAACAGGGGTAGCAGG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTTATTCTATTTGAAGTTCCTTGATGTAGCCAACAGGGGTAGCAGG  341

seq1  TTGTTAACATAGGTACCTCAGTCCCTTGGTAAGAGGCACCACAGTTTGAA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTAACATAGGTACCTCAGTCCCTTGGTAAGAGGCACCACAGTTTGAA  391

seq1  TGGTGTTTAGACTTTGAAGCTCTGCTTTTAAGCTTGGTGGGAGTCCTTGT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGTTTAGACTTTGAAGCTCTGCTTTTAAGCTTGGTGGGAGTCCTTGT  441

seq1  ATCACAAAGGACATCTTTAGTGTCTCAGAACTTATACTAATTCTTCATGC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACAAAGGACATCTTTAGTGTCTCAGAACTTATACTAATTCTTCATGC  491

seq1  TTTCCCTAGCCTTTTGAAATATAACTTGGAATAATCTTCATCCTTAATTG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCTAGCCTTTTGAAATATAACTTGGAATAATCTTCATCCTTAATTG  541

seq1  TTAATTTTAAAGGACCATGGTACTTCAATATCATTATCCCTTATAGATTG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTTTAAAGGACCATGGTACTTCAATATCATTATCCCTTATAGATTG  591

seq1  AAAATAAAACACATCGTTTTTCTTTAAACCATATTTGGGTCTTTAAATGT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAAAACACATCGTTTTTCTTTAAACCATATTTGGGTCTTTAAATGT  641

seq1  AGAGGCAATTCCTTTTTAAACTACACTCCTTCCTCCTGTAGAGATAATTT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCAATTCCTTTTTAAACTACACTCCTTCCTCCTGTAGAGATAATTT  691

seq1  AACACAAGAAACTATTTTTGAAAGCAGAAGCCCAACACATATTTCAACTC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACAAGAAACTATTTTTGAAAGCAGAAGCCCAACACATATTTCAACTC  741

seq1  CCACGTAATATCTGTAGAATTTGGTAACATCTGCATATTTTCTCTACTAA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACGTAATATCTGTAGAATTTGGTAACATCTGCATATTTTCTCTACTAA  791

seq1  TTGCAGTGTTAGTCTGAAGTTAATTATATAAAACTGATTTTTTTTTTACC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGTGTTAGTCTGAAGTTAATTATATAAAACTGATTTTTTTTTTACC  841

seq1  TAAGCACATCTTTTATATATCACATTTAGTTTAATTGGTACTTTGAATAA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCACATCTTTTATATATCACATTTAGTTTAATTGGTACTTTGAATAA  891

seq1  TAAATTGTTTTTCATTGAGAGTGTATTGTTTGATATTGCTAATGAAATGA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTGTTTTTCATTGAGAGTGTATTGTTTGATATTGCTAATGAAATGA  941

seq1  TTTTAATGTTTAACTTAGCTATTATTAGAAATTTTATTTTGTCTTGTGTT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAATGTTTAACTTAGCTATTATTAGAAATTTTATTTTGTCTTGTGTT  991

seq1  TTTAAATATGATTTTCCATGGTGGAATTC  1027
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAATATGATTTTCCATGGTGGAATTC  1020