BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-023B05
Chromosome2 (Build37)
Map Location 99,797,763 - 99,917,037
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC668702
Upstream geneLOC621386
Downstream geneLOC100042907, LOC241572, LOC668705
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-023B05.bB6Ng01-023B05.g
ACCDH855100DH855101
length5191,023
definitionDH855100|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-023B05, 5' end.DH855101|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-023B05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(99,797,763 - 99,798,282)(99,915,999 - 99,917,037)
sequence
gaattctcattgaaaatacatgaaatgtacagaaatttttatgcttcctg
aaatttccacatggaaaattaaaatattactattaacagctattttaata
ttgttattaaatttaattatataatagataacaatagttattatggaagt
gtccaacatttgtaaatatgaactcataaaacaaagtaagtaatatactt
tatgctgcttacaaggtggctcttttcatgtctctaaaataccttgaaat
atttactgtttattcaagtaattatttcctcaaaatatgattgcttttta
attttaactaagtctactcttttatgaatagttaactaactaaatatact
aaattaatatactacatcatagttggtacctattgagtgtagaaatggat
tctatccacactggtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtgcg
tgtgtatgtgtgtgtgtgtattaaatgtttcggtagtaaggaggagcact
aagattccaataggctgtg
gaattcaaggaaacagaagtctggtcagaggggagagttactggagtttt
ctagctttcaggccatctccaggttcaagaagagatttttgtctccagga
tgtaaaacagtaatagatcaggacacttgacatattctattggtctccca
catatacatacatgcatgtgtacatatacacacactcaaacacacttata
cattcactcacacatacacacaaacacacacacacacacacacacacatg
aatgcaggcacacacacaaactacacactcagatatatacatgattaatt
atacaattaaaaattaaagcaataatatttaagcaataaaacttatttta
ttgttacttttcacctcattgtttagggtgcaaaatatgcttggctttga
atggctcttcataagggtgctagatttttatgcttatacagcaagtactc
ttatttctatttgctatttctccacacctatatattatacattttgaatt
ctacatatatatgtatatatgtaaatacatatatatacatacatatatat
atatatatgttgtactgagaccacaatggttagtcaacagtgatttaatt
ctctttattcaagtgctctcctctactgaaaccaatattatttggccatg
aggatataactctccactgtcgtacaagtgtagtccatatgtttggaaag
tatgaataataactcatctctcattattttggcataattacagcattgtc
atttttgatctataaagacataaaagcttttaatgaaactagagacatca
tttgtcatggtgtaattgaaaagggtatgtgccattttggctatagaaat
tctaaggagtgtgccttgcctgtgatttaacagaagttaaacttttctat
tgattgatagcctctagagaaaagattgtcaccaactatagtgtagcact
ttaaaggagatataggacataattatggagataagtgataaagatataat
atagtagcaattataatataaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_99797763_99798282
seq2: B6Ng01-023B05.b_43_561

seq1  GAATTCTCATTGAAAATACATGAAATGTACAGAAATTTTTATGCTTCCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCATTGAAAATACATGAAATGTACAGAAATTTTTATGCTTCCTG  50

seq1  AAATTTCCACATGGAAAATTAAAATATTACTATTAACAGCTATTTTAATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTCCACATGGAAAATTAAAATATTACTATTAACAGCTATTTTAATA  100

seq1  TTGTTATTAAATTTAATTATATAATAGATAACAATAGTTATTATGGAAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTATTAAATTTAATTATATAATAGATAACAATAGTTATTATGGAAGT  150

seq1  GTCCAACATTTGTAAATATGAACTCATAAAACAAAGTAAGTAATATACTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAACATTTGTAAATATGAACTCATAAAACAAAGTAAGTAATATACTT  200

seq1  TATGCTGCTTACAAGGTGGCTCTTTTCATGTCTCTAAAATACCTTGAAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTGCTTACAAGGTGGCTCTTTTCATGTCTCTAAAATACCTTGAAAT  250

seq1  ATTTACTGTTTATTCAAGTAATTATTTCCTCAAAATATGATTGCTTTTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTACTGTTTATTCAAGTAATTATTTCCTCAAAATATGATTGCTTTTTA  300

seq1  ATTTTAACTAAGTCTACTCTTTTATGAATAGTTAACTAACTAAATATACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAACTAAGTCTACTCTTTTATGAATAGTTAACTAACTAAATATACT  350

seq1  AAATTAATATACTACATCATAGTTGGTACCTATTGAGTGTAGAAATGGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTAATATACTACATCATAGTTGGTACCTATTGAGTGTAGAAATGGAT  400

seq1  TCTATCCACACTGGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGCG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATCCACACTGGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGCG  450

seq1  TGTGTATGTGTGTGTGTGTATTAAATGTTTCGGTAGTAAGGTAGATATAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    | 
seq2  TGTGTATGTGTGTGTGTGTATTAAATGTTTCGGTAGTAAGG-AGGAGCAC  499

seq1  TAAGATTCCAATAGGCTGTG  520
      ||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATTCCAATAGGCTGTG  519

seq1: chr2_99915999_99917037
seq2: B6Ng01-023B05.g_66_1088 (reverse)

seq1  TTTTATATTTATAATTGCTAGCTATATTTATAATCTATAATCACTTATTC  50
      ||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| | |||||||| ||
seq2  TTTTATA-TTATAATTGCTA-CTATA-TTAT-ATCT-TTATCACTTA-TC  44

seq1  TCCATAATTATTGTACCTATTATCTCATTTAAAAGTGGCTACACTATAGT  100
      |||||||||| ||| |||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||
seq2  TCCATAATTA-TGT-CCTA-TATCTCCTTT-AAAGT-GCTACACTATAGT  89

seq1  TGGTGACAATACTTTTCTCTTAGAGGGTTATCAAGTCAATAGAAAAGTTT  150
      |||||||||| |||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||
seq2  TGGTGACAAT-CTTTTCTC-TAGA-GGCTATCAA-TCAATAGAAAAGTTT  135

seq1  AACTTCTGTTAAAATCACAGGCAAGGCACACTCCTTAGAATTTCTATAGC  200
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCTGTT-AAATCACAGGCAAGGCACACTCCTTAGAATTTCTATAGC  184

seq1  CAAAATGGCACATACCCTTTTCAATTACACCATGACAAATGATGTCTCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATGGCACATACCCTTTTCAATTACACCATGACAAATGATGTCTCTA  234

seq1  GTTTCATTAAAAGCTTTTATGTCTTTATAGATCAAAAATGACAATGCTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCATTAAAAGCTTTTATGTCTTTATAGATCAAAAATGACAATGCTGT  284

seq1  AATTATGCCAAAATAATGAGAAATGAGTTATTATTCATACTTTCCAAACA  350
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATGCCAAAATAATGAGAGATGAGTTATTATTCATACTTTCCAAACA  334

seq1  TATGGACTACACTTGTACGACAGTGGAGAGTTATATCCTCATGGCCAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGACTACACTTGTACGACAGTGGAGAGTTATATCCTCATGGCCAAAT  384

seq1  AATATTGGTTTCAGTAGGGGAGAGCACTTGAATAAAGAGAATTAAATCAC  450
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTGGTTTCAGTAGAGGAGAGCACTTGAATAAAGAGAATTAAATCAC  434

seq1  TGTTGACTAACCATTGTGGTCTCAGTACAACATATATATATATATATGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGACTAACCATTGTGGTCTCAGTACAACATATATATATATATATGTA  484

seq1  TGTATATATATGTATTTACATATATACATATATATGTAGAATTCAAAATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATATATATGTATTTACATATATACATATATATGTAGAATTCAAAATG  534

seq1  TATAATATATAGGTGTGGAGAAATAGCAAATAGAAATAAGAGTACTTGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATATATAGGTGTGGAGAAATAGCAAATAGAAATAAGAGTACTTGCT  584

seq1  GTATAAGCATAAAAATCTAGCACCCTTATGAAGAGCCATTCAAAGCCAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATAAGCATAAAAATCTAGCACCCTTATGAAGAGCCATTCAAAGCCAAG  634

seq1  CATATTTTGCACCCTAAACAATGAGGTGAAAAGTAACAATAAAATAAGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATTTTGCACCCTAAACAATGAGGTGAAAAGTAACAATAAAATAAGTT  684

seq1  TTATTGCTTAAATATTATTGCTTTAATTTTTAATTGTATAATTAATCATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTGCTTAAATATTATTGCTTTAATTTTTAATTGTATAATTAATCATG  734

seq1  TATATATCTGAGTGTGTAGTTTGTGTGTGTGCCTGCATTCATGTGTGTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATCTGAGTGTGTAGTTTGTGTGTGTGCCTGCATTCATGTGTGTGT  784

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTATGTGTGAGTGAATGTATAAGTGTGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTATGTGTGAGTGAATGTATAAGTGTGT  834

seq1  TTGAGTGTGTGTATATGTACACATGCATGTATGTATATGTGGGAGACCAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGTGTGTGTATATGTACACATGCATGTATGTATATGTGGGAGACCAA  884

seq1  TAGAATATGTCAAGTGTCCTGATCTATTACTGTTTTACATCCTGGAGACA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAATATGTCAAGTGTCCTGATCTATTACTGTTTTACATCCTGGAGACA  934

seq1  AAAATCTCTTCTTGAACCTGGAGATGGCCTGAAAGCTAGAAAACTCCAGT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCTCTTCTTGAACCTGGAGATGGCCTGAAAGCTAGAAAACTCCAGT  984

seq1  AACTCTCCCCTCTGACCAGACTTCTGTTTCCTTGAATTC  1039
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTCCCCTCTGACCAGACTTCTGTTTCCTTGAATTC  1023