BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-023D21
Chromosome2 (Build37)
Map Location 70,342,989 - 70,511,891
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4933404M02Rik, LOC100040068, Gad1, LOC100039766, Gorasp2
Upstream geneLrp2, Bbs5, Kbtbd10, Fastkd1, Ppig, 4930578N16Rik, Phospho2, LOC433432, Klhl23, Ssb, Mettl5, 4930550G17Rik, Zfp650, Myo3b, LOC100040021, Sp5
Downstream geneTlk1, Mettl8, 4833418A01Rik, Cybrd1, Dync1i2, Slc25a12, LOC667528, Hat1, LOC100040177, Metapl1, LOC100040207, Dlx1, Dlx1as, Dlx2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-023D21.bB6Ng01-023D21.g
ACCDH855215DH855216
length1,1141,077
definitionDH855215|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-023D21, 5' end.DH855216|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-023D21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,510,776 - 70,511,891)(70,342,989 - 70,344,068)
sequence
gaattctaaaagaaataaacaaccctttctatttttccatttcatttgct
acaaacatctatttcatctgcttttaatggaccttgaaattaatttcttt
ctcaaatttatcatacaccattagagcccagcacaaattaaagcaagaag
atatcttaattatggctaggacaccagcagagggagctctgaaaatccat
ctctagttagtattccatttgtcgcagtacagaaaagaaggcctacaagg
tttagaatgtagcatggacattctacatgggtaggctcctcgtgcaatct
tatccactcacgagactcaccagcagccggtgactatttcagcactcgct
gttctttctaaggcctcgacttatcttttgcttctttcaagcctacctta
atcaaaacaaaacaaaaactgtatgtccctgattccaaagaccatttgac
acttattatagggtcaaatattatactatagtaatttaagataaataggt
taaatttgaaattttaagattgtttaaaatgtgtaataaaagataagagc
tttagattagacggagacagttgttttgttttgagacagaatctcactgt
gtaggcttgactgactggcctggaatagcccaaggctgggattagagaca
tgtgccactacccccagctagagctgacataactttaagccataaacgag
aaagatagaaaccacggatggtgaatgagggtgcacattcagaaagccca
agcactgctagtggggctccaaatagcaatttggcagtatttattaatat
tgaaaatatgtataccttttgacccaatattccactcttaaaagtgtgtt
accacagaaacaggtatgaaaatgttctccaaaaggagcaggatggtgtt
cctggcagtgcacatttgttttagacccaaacgaaagcttgtacaaatgc
ctatcaacagcagactaagaaaatctggcatattttcacagtactaagta
taattaaaaaaacacaatctagaataaagcaacattcgagggcgagaaga
catatagaaatgagtatatattaccataaattccagaataggccactatt
gccattgcttcaaa
gaattctgtgagctttctgtggcatgacagagcttccctgtgtgtctggg
gggacaactacacggcagcattgacgcacaagcatgaagacactgaattg
gaagtggtggcttattttaaagtcccgacaaagctaagagtcttgacagt
atgcccacagaaatggaagggaaacctacattgtgctctgaaaaaagaga
aagttttgcacacagctgaccccagtggaatgtcgggtctgggatcatgg
aagatccaggaacaatggaattctgcatggtcttactaagaagatgccca
gcttgcactaacagccagtcactttctggtcttttaagaagagattatag
aagcaaattgactttaaaatcattgctgttttacatatacaccagtgttt
aaactcatccacacatcaagaactggaagacaatcacaatttgtatgtct
gcaataataatcttttggctccaggctccctctactgactccaaaataat
aaataaacatttcactggcatcctcctgacaagactcaactgcatatgaa
agccaagacaaacaagcttgtgcaggaacaatggacgtccttagcaggag
aagcaggaagttcaacatttgaagaaaggtcaaaatgtaaactaatttgc
aaagtacccatataggcagaactatattcaattgccattattgaaccaac
tcttatccacaaatggcaactgcatgtggtttgacttaattttttaattg
tcagagagaggatggtgtcacctgaatcacaggtatatacaagtatgttg
acagcggtggttactgtcatcagcaaaaactctctgtaatgaaactcact
aacagcactaatcagttcacatgtttcttagctaaaactaaccacgggat
gtgttaagtgccatacaggagtgtgtatatgataattttggtgagaagag
tatgcctaagttagggtaaagatacaaagcgtcttcacatgagaaggtaa
tgaaagccatgctcagcagtcctcggtctacaagagggaagctgaaataa
acagtgcttttagctggtgaaagagga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_70510776_70511891
seq2: B6Ng01-023D21.b_44_1157 (reverse)

seq1  TTTGTAGCAATGGCAATTAGTTGGCCTATTCTTGGAATTTATGGTAATAT  50
      |||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAGCAATGGCAA-TAG-TGGCCTATTC-TGGAATTTATGGTAATAT  47

seq1  ATACTCATTTCTATATGTCTTCTTTGCCTCGAATGTTGCTTTA-TCTAGA  99
      |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||
seq2  ATACTCATTTCTATATGTCTTCTCGCCCTCGAATGTTGCTTTATTCTAGA  97

seq1  TTGTGTTTTATTAA-TATACTTAGTACTGTTGAAAATATGCCAGATTTTC  148
      ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTTTTTTTAATTATACTTAGTACTG-TGAAAATATGCCAGATTTTC  146

seq1  TTAGTCTGCTGTTGATAGGCATTTGTACAAGCTTTCGTTTGGGTCTAAAA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTCTGCTGTTGATAGGCATTTGTACAAGCTTTCGTTTGGGTCTAAAA  196

seq1  CAAATGTGCACTGCCAGGAACACCATCCTGCTCCTTTTGGAGAACATTTT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGTGCACTGCCAGGAACACCATCCTGCTCCTTTTGGAGAACATTTT  246

seq1  CATACCTGTTTCTGTGGTAACACACTTTTAAGAGTGGAATATTGGGTCAA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACCTGTTTCTGTGGTAACACACTTTTAAGAGTGGAATATTGGGTCAA  296

seq1  AAGGTATACATATTTTCAATATTAATAAATACTGCCAAATTGCTATTTGG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTATACATATTTTCAATATTAATAAATACTGCCAAATTGCTATTTGG  346

seq1  AGCCCCACTAGCAGTGCTTGGGCTTTCTGAATGTGCACCCTCATTCACCA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCCACTAGCAGTGCTTGGGCTTTCTGAATGTGCACCCTCATTCACCA  396

seq1  TCCGTGGTTTCTATCTTTCTCGTTTATGGCTTAAAGTTATGTCAGCTCTA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGTGGTTTCTATCTTTCTCGTTTATGGCTTAAAGTTATGTCAGCTCTA  446

seq1  GCTGGGGGTAGTGGCACATGTCTCTAATCCCAGCCTTGGGCTATTCCAGG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGGGGTAGTGGCACATGTCTCTAATCCCAGCCTTGGGCTATTCCAGG  496

seq1  CCAGTCAGTCAAGCCTACACAGTGAGATTCTGTCTCAAAACAAAACAACT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTCAGTCAAGCCTACACAGTGAGATTCTGTCTCAAAACAAAACAACT  546

seq1  GTCTCCGTCTAATCTAAAGCTCTTATCTTTTATTACACATTTTAAACAAT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCCGTCTAATCTAAAGCTCTTATCTTTTATTACACATTTTAAACAAT  596

seq1  CTTAAAATTTCAAATTTAACCTATTTATCTTAAATTACTATAGTATAATA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAAATTTCAAATTTAACCTATTTATCTTAAATTACTATAGTATAATA  646

seq1  TTTGACCCTATAATAAGTGTCAAATGGTCTTTGGAATCAGGGACATACAG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACCCTATAATAAGTGTCAAATGGTCTTTGGAATCAGGGACATACAG  696

seq1  TTTTTGTTTTGTTTTGATTAAGGTAGGCTTGAAAGAAGCAAAAGATAAGT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGTTTTGTTTTGATTAAGGTAGGCTTGAAAGAAGCAAAAGATAAGT  746

seq1  CGAGGCCTTAGAAAGAACAGCGAGTGCTGAAATAGTCACCGGCTGCTGGT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGGCCTTAGAAAGAACAGCGAGTGCTGAAATAGTCACCGGCTGCTGGT  796

seq1  GAGTCTCGTGAGTGGATAAGATTGCACGAGGAGCCTACCCATGTAGAATG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCTCGTGAGTGGATAAGATTGCACGAGGAGCCTACCCATGTAGAATG  846

seq1  TCCATGCTACATTCTAAACCTTGTAGGCCTTCTTTTCTGTACTGCGACAA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGCTACATTCTAAACCTTGTAGGCCTTCTTTTCTGTACTGCGACAA  896

seq1  ATGGAATACTAACTAGAGATGGATTTTCAGAGCTCCCTCTGCTGGTGTCC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAATACTAACTAGAGATGGATTTTCAGAGCTCCCTCTGCTGGTGTCC  946

seq1  TAGCCATAATTAAGATATCTTCTTGCTTTAATTTGTGCTGGGCTCTAATG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCATAATTAAGATATCTTCTTGCTTTAATTTGTGCTGGGCTCTAATG  996

seq1  GTGTATGATAAATTTGAGAAAGAAATTAATTTCAAGGTCCATTAAAAGCA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATGATAAATTTGAGAAAGAAATTAATTTCAAGGTCCATTAAAAGCA  1046

seq1  GATGAAATAGATGTTTGTAGCAAATGAAATGGAAAAATAGAAAGGGTTGT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAAATAGATGTTTGTAGCAAATGAAATGGAAAAATAGAAAGGGTTGT  1096

seq1  TTATTTCTTTTAGAATTC  1116
      ||||||||||||||||||
seq2  TTATTTCTTTTAGAATTC  1114

seq1: chr2_70342989_70344068
seq2: B6Ng01-023D21.g_67_1143

seq1  GAATTCTGTGAGCTTTCTGTGGCATGACAGAGCTTCCCTGTGTGTCTGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTGAGCTTTCTGTGGCATGACAGAGCTTCCCTGTGTGTCTGGG  50

seq1  GGGACAACTACACGGCAGCATTGACGCACAAGCATGAAGACACTGAATTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACAACTACACGGCAGCATTGACGCACAAGCATGAAGACACTGAATTG  100

seq1  GAAGTGGTGGCTTATTTTAAAGTCCCGACAAAGCTAAGAGTCTTGACAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGGTGGCTTATTTTAAAGTCCCGACAAAGCTAAGAGTCTTGACAGT  150

seq1  ATGCCCACAGAAATGGAAGGGAAACCTACATTGTGCTCTGAAAAAAGAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCCACAGAAATGGAAGGGAAACCTACATTGTGCTCTGAAAAAAGAGA  200

seq1  AAGTTTTGCACACAGCTGACCCCAGTGGAATGTCGGGTCTGGGATCATGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTTGCACACAGCTGACCCCAGTGGAATGTCGGGTCTGGGATCATGG  250

seq1  AAGATCCAGGAACAATGGAATTCTGCATGGTCTTACTAAGAAGATGCCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATCCAGGAACAATGGAATTCTGCATGGTCTTACTAAGAAGATGCCCA  300

seq1  GCTTGCACTAACAGCCAGTCACTTTCTGGTCTTTTAAGAAGAGATTATAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGCACTAACAGCCAGTCACTTTCTGGTCTTTTAAGAAGAGATTATAG  350

seq1  AAGCAAATTGACTTTAAAATCATTGCTGTTTTACATATACACCAGTGTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAAATTGACTTTAAAATCATTGCTGTTTTACATATACACCAGTGTTT  400

seq1  AAACTCATCCACACATCAAGAACTGGAAGACAATCACAATTTGTATGTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTCATCCACACATCAAGAACTGGAAGACAATCACAATTTGTATGTCT  450

seq1  GCAATAATAATCTTTTGGCTCCAGGCTCCCTCTACTGACTCCAAAATAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATAATAATCTTTTGGCTCCAGGCTCCCTCTACTGACTCCAAAATAAT  500

seq1  AAATAAACATTTCACTGGCATCCTCCTGACAAGACTCAACTGCATATGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAACATTTCACTGGCATCCTCCTGACAAGACTCAACTGCATATGAA  550

seq1  AGCCAAGACAAACAAGCTTGTGCAGGAACAATGGACGTCCTTAGCAGGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAAGACAAACAAGCTTGTGCAGGAACAATGGACGTCCTTAGCAGGAG  600

seq1  AAGCAGGAAGTTCAACATTTGAAGAAAGGTCAAAATGTAAACTAATTTGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGGAAGTTCAACATTTGAAGAAAGGTCAAAATGTAAACTAATTTGC  650

seq1  AAAGTACCCATATAGGCAGAACTATATTCAATTGCCATTATTGAACCAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTACCCATATAGGCAGAACTATATTCAATTGCCATTATTGAACCAAC  700

seq1  TCTTATCCACAAATGGCAACTGCATGTGGTTTGACTTAATTTTTTAATTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTATCCACAAATGGCAACTGCATGTGGTTTGACTTAATTTTTTAATTG  750

seq1  TCAGAGAGAGGATGGTGTCACCTGAATCACAGGTATATACAAGTATGTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGAGAGGATGGTGTCACCTGAATCACAGGTATATACAAGTATGTTG  800

seq1  ACAGCGGTGGTTACTGTCATCAGCAAAAACTCTCTGTAATGAAACTCACT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCGGTGGTTACTGTCATCAGCAAAAACTCTCTGTAATGAAACTCACT  850

seq1  AACAGCACTAATCAGTTCACATGTTTCTTAGCTAAAACTAACCACGGGAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGCACTAATCAGTTCACATGTTTCTTAGCTAAAACTAACCACGGGAT  900

seq1  GTGTTAAGTGCCATACAGGAGTGTGTATATGATAATTTTGTTGAGAAGAA  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
seq2  GTGTTAAGTGCCATACAGGAGTGTGTATATGATAATTTTGGTGAGAAG-A  949

seq1  GTATGCCTTAGGTTAGGGTAAAGATACAAAGCGTC-TCACATGAGAAGGT  999
      ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GTATGCC-TAAGTTAGGGTAAAGATACAAAGCGTCTTCACATGAGAAGGT  998

seq1  AAATGAAAGCAATGCTCAGCAGCCCCGTGTTTACAAGAGGGAAGCTGGAA  1049
       ||||||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||||||||  |
seq2  -AATGAAAGCCATGCTCAGCAGTCCTCGGTCTACAAGAGGGAAGCTG--A  1045

seq1  ATTAAACAGTGC-TTTAGCT-GTGAGAAGAGGA  1080
      | |||||||||| ||||||| |||| |||||||
seq2  AATAAACAGTGCTTTTAGCTGGTGA-AAGAGGA  1077