BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-037L01
Chromosome2 (Build37)
Map Location 114,786,531 - 114,932,359
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneGja9, A530058N18Rik, Actc1, Aqr, Zfp770, Atpbd4, LOC100043219, LOC100043222
Downstream geneLOC100043232, LOC100043236, BC052040, Mrg1, G630016G05Rik, 2810405F15Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-037L01.bB6Ng01-037L01.g
ACCDH865474DH865475
length980743
definitionDH865474|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-037L01, 5' end.DH865475|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-037L01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(114,931,381 - 114,932,359)(114,786,531 - 114,787,273)
sequence
gaattccaatgaagcaagcattacaggattaaaataaaattattatgacc
cataaaacttcattcaaagcatctaattcacaaggtctgctggtgcagga
ccctggatttatgaaaggatccatcagtgtgcactggtcatctcacctgc
tgctctggaccccacactgttagagtcttcatttacctcctagatgaacc
ttggacatctgtcttcatcatgtaatcttccactgaaaagctataaaaat
aaatatgtgctggttggaaagggtgatggtgttgaatgatatgccaacca
tattctgggcatctgaatatgtggtccctatttgatgacattgcttgagt
atgcttaagaggtgtggctttgtgggaggaaatacgccactggggcaggc
ttggaggtttcaaattctatgcacagtctccagtgcatttcctctgattt
atatttgttatttgagacacaagctctcgtttttcaactttagctgccat
gtctgcctctcatcccatcattaaggatcctaaccctctggaattataag
ccccatataaactcttttctgagttgcctgattgggtggtgtgtgtggat
gtcactgagcatctttctctagctaatattttgaggcagagtctcttact
aaagttggggcttacggacagctagagaggctggcccaacgagttctgca
catagagtatctctcttgtgtctgcatccatcacttaggtactaggttgc
aaaaccaatttgggctttcccatgagcactagaaattcaaagtgtgggtc
cttatgcttctgcaaagggcatttgattaactgaaaactctccttaatgc
ctttcagttagattcctgtagttaacttccttgcgcctctaactttcccg
ctaattatgtactcaagcagttgctccatctgaaacagccattgggtatg
gacccaactcttccttcaggaaacctgcag
gaattcctccgaagcccagactggctttcagctagagatcccccagcctc
agccttctgggtgtttggattataggcatgcaccactacatccagcaaaa
cagtgttgtcagccataaagcaaagcctttttgagaaagtccacactcaa
aaaaaaataagacttagaagattatgatctcccagttttatggatagcaa
acacttgcttgtgaagctagtgtttgctgacttcccattgaatagagcag
aaacagggaagaacttggaaagcattcactttccctatcttgtctttagt
tggtatttctctctctttatcgctctttcttctgaagtctgggaccatta
cttgtcttccagatgcacaggcttcagccttggcattatagctgctcctg
taaccaaccatgccctctccctcatctgtggcttgacttcctctgcatct
tacaagacaatcctccattgcctatacctctaatccttaaaccttgcagt
gcagtgatcaaaaaaccaaacctcctgctatctacctgtcttaggtactc
tttattgctgtgaggagacaccatgaccaatgaaagtaataaagtacagc
cttttgtttaaagcttcagtttcagaggatggcagttcatgccagatagg
cagacatgatattgtagtagctgagagcttacattctgatcaacagatgg
ggagagaaagagagagagagagagagagagagagagagagaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_114931381_114932359
seq2: B6Ng01-037L01.b_44_1023 (reverse)

seq1  CTGCATGGTTTCCTGAAAGAAAGAGATGGGTCCA-AACCAATGGATGTTA  49
      ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||| |||| 
seq2  CTGCA-GGTTTCCTG-AAGGAAGAGTTGGGTCCATACCCAATGGCTGTTT  48

seq1  CAGATGGAGCAACTGCTTGAGTACATAATAAGCGGGAAAGTAAGAGGCCC  99
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
seq2  CAGATGGAGCAACTGCTTGAGTACATAATTAGCGGGAAAGTTAGAGGCGC  98

seq1  AA-GAAGTTAACTACAGGAAACCAAATGAAAGGCATTAAGGAGATGTTTC  148
      || ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||  ||||
seq2  AAGGAAGTTAACTACAGGAATCTAACTGAAAGGCATTAAGGAGAGTTTTC  148

seq1  AGCTAATAAAATGCCCGCTGCAGAAGCATAAGGACCCACAC-TTGAATTT  197
      || |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  AGTTAATCAAATGCCCTTTGCAGAAGCATAAGGACCCACACTTTGAATTT  198

seq1  CTAGTGCTCATGGTGAAGCCCAAATTGGTTTTGCAACCTAGTAACCTTAG  247
      |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||
seq2  CTAGTGCTCATGGGAAAGCCCAAATTGGTTTTGCAACCTAGT-ACCTAAG  247

seq1  TGATGGATGCAGACACAAGAGAGATACTCTATGTGCAGAACTCGTT-GGC  296
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TGATGGATGCAGACACAAGAGAGATACTCTATGTGCAGAACTCGTTGGGC  297

seq1  CAGCCTCTCTAGCTGTCCGTAAGCCCCAACTTTAGTAAGAGACTCTGCCT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCTCTCTAGCTGTCCGTAAGCCCCAACTTTAGTAAGAGACTCTGCCT  347

seq1  CAAAATATTAGCTAGAGAAAGATGCTCAGTGACATCCACACACACCACCC  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATATTAGCTAGAGAAAGATGCTCAGTGACATCCACACACACCACCC  397

seq1  AATCAGGCAACTCAGAAAAGAGTTTATATGGGGCTTATAATTCCAGAGGG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAGGCAACTCAGAAAAGAGTTTATATGGGGCTTATAATTCCAGAGGG  447

seq1  TTAGGATCCTTAATGATGGGATGAGAGGCAGACATGGCAGCTAAAGTTGA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGATCCTTAATGATGGGATGAGAGGCAGACATGGCAGCTAAAGTTGA  497

seq1  AAAACGAGAGCTTGTGTCTCAAATAACAAATATAAATCAGAGGAAATGCA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACGAGAGCTTGTGTCTCAAATAACAAATATAAATCAGAGGAAATGCA  547

seq1  CTGGAGACTGTGCATAGAATTTGAAACCTCCAAGCCTGCCCCAGTGGCGT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGACTGTGCATAGAATTTGAAACCTCCAAGCCTGCCCCAGTGGCGT  597

seq1  ATTTCCTCCCACAAAGCCACACCTCTTAAGCATACTCAAGCAATGTCATC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCCTCCCACAAAGCCACACCTCTTAAGCATACTCAAGCAATGTCATC  647

seq1  AAATAGGGACCACATATTCAGATGCCCAGAATATGGTTGGCATATCATTC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAGGGACCACATATTCAGATGCCCAGAATATGGTTGGCATATCATTC  697

seq1  AACACCATCACCCTTTCCAACCAGCACATATTTATTTTTATAGCTTTTCA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACCATCACCCTTTCCAACCAGCACATATTTATTTTTATAGCTTTTCA  747

seq1  GTGGAAGATTACATGATGAAGACAGATGTCCAAGGTTCATCTAGGAGGTA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAAGATTACATGATGAAGACAGATGTCCAAGGTTCATCTAGGAGGTA  797

seq1  AATGAAGACTCTAACAGTGTGGGGTCCAGAGCAGCAGGTGAGATGACCAG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAAGACTCTAACAGTGTGGGGTCCAGAGCAGCAGGTGAGATGACCAG  847

seq1  TGCACACTGATGGATCCTTTCATAAATCCAGGGTCCTGCACCAGCAGACC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACACTGATGGATCCTTTCATAAATCCAGGGTCCTGCACCAGCAGACC  897

seq1  TTGTGAATTAGATGCTTTGAATGAAGTTTTATGGGTCATAATAATTTTAT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGAATTAGATGCTTTGAATGAAGTTTTATGGGTCATAATAATTTTAT  947

seq1  TTTAATCCTGTAATGCTTGCTTCATTGGAATTC  979
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATCCTGTAATGCTTGCTTCATTGGAATTC  980

seq1: chr2_114786531_114787273
seq2: B6Ng01-037L01.g_69_811

seq1  GAATTCCTCCGAAGCCCAGACTGGCTTTCAGCTAGAGATCCCCCAGCCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCCGAAGCCCAGACTGGCTTTCAGCTAGAGATCCCCCAGCCTC  50

seq1  AGCCTTCTGGGTGTTTGGATTATAGGCATGCACCACTACATCCAGCAAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTCTGGGTGTTTGGATTATAGGCATGCACCACTACATCCAGCAAAA  100

seq1  CAGTGTTGTCAGCCATAAAGCAAAGCCTTTTTGAGAAAGTCCACACTCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTTGTCAGCCATAAAGCAAAGCCTTTTTGAGAAAGTCCACACTCAA  150

seq1  AAAAAAATAAGACTTAGAAGATTATGATCTCCCAGTTTTATGGATAGCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAATAAGACTTAGAAGATTATGATCTCCCAGTTTTATGGATAGCAA  200

seq1  ACACTTGCTTGTGAAGCTAGTGTTTGCTGACTTCCCATTGAATAGAGCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTTGCTTGTGAAGCTAGTGTTTGCTGACTTCCCATTGAATAGAGCAG  250

seq1  AAACAGGGAAGAACTTGGAAAGCATTCACTTTCCCTATCTTGTCTTTAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGGGAAGAACTTGGAAAGCATTCACTTTCCCTATCTTGTCTTTAGT  300

seq1  TGGTATTTCTCTCTCTTTATCGCTCTTTCTTCTGAAGTCTGGGACCATTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTATTTCTCTCTCTTTATCGCTCTTTCTTCTGAAGTCTGGGACCATTA  350

seq1  CTTGTCTTCCAGATGCACAGGCTTCAGCCTTGGCATTATAGCTGCTCCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTCTTCCAGATGCACAGGCTTCAGCCTTGGCATTATAGCTGCTCCTG  400

seq1  TAACCAACCATGCCCTCTCCCTCATCTGTGGCTTGACTTCCTCTGCATCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCAACCATGCCCTCTCCCTCATCTGTGGCTTGACTTCCTCTGCATCT  450

seq1  TACAAGACAATCCTCCATTGCCTATACCTCTAATCCTTAAACCTTGCAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAGACAATCCTCCATTGCCTATACCTCTAATCCTTAAACCTTGCAGT  500

seq1  GCAGTGATCAAAAAACCAAACCTCCTGCTATCTACCTGTCTTAGGTACTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTGATCAAAAAACCAAACCTCCTGCTATCTACCTGTCTTAGGTACTC  550

seq1  TTTATTGCTGTGAGGAGACACCATGACCAATGAAAGTAATAAAGTACAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTGCTGTGAGGAGACACCATGACCAATGAAAGTAATAAAGTACAGC  600

seq1  CTTTTGTTTAAAGCTTCAGTTTCAGAGGATGGCAGTTCATGCCAGATAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGTTTAAAGCTTCAGTTTCAGAGGATGGCAGTTCATGCCAGATAGG  650

seq1  CAGACATGATATTGTAGTAGCTGAGAGCTTACATTCTGATCAACAGATGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACATGATATTGTAGTAGCTGAGAGCTTACATTCTGATCAACAGATGG  700

seq1  GGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  743
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  743