BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-042E07
Chromosome2 (Build37)
Map Location 168,793,815 - 168,931,702
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043909
Upstream genePtpn1, 2310033K02Rik, Pard6b, Adnp, Dpm1, Mocs3, LOC100043908, Kcng1, LOC668952, Nfatc2, Atp9a, Sall4, Zfp64
Downstream geneEG668954, Tshz2, LOC100043737, LOC100043910
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-042E07.bB6Ng01-042E07.g
ACCDH868695DH868696
length1,097831
definitionDH868695|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-042E07, 5' end.DH868696|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-042E07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(168,793,815 - 168,794,919)(168,931,026 - 168,931,702)
sequence
gaattctgcacgcctcctggccttctgcccttggcacctatgaggtgatg
agccgccaagtgcttcgcagatgggaacacaagtctctctggaactcaca
tttcaatagttcttacctaggaaggtctgttcatttggatttgcttttga
attgaacccagtaccacgtggtggaggaaccaaccagccccactagcgcc
ataatttgaggcaggtgagatcttggacttctggcctctgggtctgtcac
acaactgcaaatgtgtattgcttcaagcctctgtgttcagagttgtttgt
tatagtacttaacaaatgaagaaaccaaaagccaaaacaaacccggggtt
actctggggactagagagagggctcctcagttaggagcccctgctgttct
tccagcagaccagagtttggttccagctccaaggaatctgactcctccct
ccgggctccaggggcaccagcattcacatgtatatatgcatacaaacaca
catgtgcaagaatgaagtttcaaggtaattggggtagcccacactggtag
gatatgctggagaggtagacacaagaggatcgtaagtttgaggctagcct
ggaaattaccttaaaggactggagagatgactcagtactcagtactcagg
agccctttctcatggtgctgcacacctttaatcctagcacttgggaggca
gacacaggcagatctctgctttcgaggccactctggtctacaaaaccctt
tccaggatagccagggccacatgagaaaactttgttttaaaaaaaaaaat
caaaagaactaaagtgggagggaaccaaaccaaccaccaacaacaataaa
aacccaaagcaataaaatagaaaagagcccttgccgctcttccagaagac
ttaagttagattcccagcacccatgtggctcactcagtaatgtatacaca
cacacacacacacacacacacacacacttacatactcacacacactcaca
caaaacactcaaacacactagactttccacatttcgatcagcaatcattc
aataaaagtaaataagttcagatggggagtggtgcccactgtctttc
gaattcataactgaatgtgcctgacgtcctgcctccaccttcatggtgag
atcacaggtgtgagtgctcatacctcatttatacagtgaccagggctcat
gtagtccagtaaactgctctacccactaggctacatcctcaaacctatag
ttcaatgaggaaaagcaggagttaggagggctggagagatgactcagtgg
ttaagagtactggatgctcttccaggggaccagagttcagttcccagcat
ccacaagacagatctaatcaatcccatgtttgcttctgacctctacagcc
aatgcacgaacatgtacatatgtttatacacacacatatacacacataca
catatacatacacacatacaccacacatacacatatacacacatacacat
attcacacatacacacacacatacacctacacatacacacacacatacac
acatatataaacacacatatacacacacatacacatatacacacatacac
atacacacacacatacacacacacctacacatacacacacacatacacac
acatataaacacacatatacactcacatacacacacacatacacacacac
acatacacacacacacatacacacgctcacacacacacacatacacacac
atacacacacacatacacacacacacacatacacatatacacatacacac
atacacacacacatacacatacatacacacacatacacatacacctacac
acacacacacatacacacacatacatacacatacacacacacacacacat
acacaatgcaggaaaacactcaaacgcgtaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_168793815_168794919
seq2: B6Ng01-042E07.b_42_1138

seq1  GAATTCTGCACGCCTCCTGGCCTTCTGCCCTTGGCACCTATGAGGTGATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGCACGCCTCCTGGCCTTCTGCCCTTGGCACCTATGAGGTGATG  50

seq1  AGCCGCCAAGTGCTTCGCAGATGGGAACACAAGTCTCTCTGGAACTCACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCGCCAAGTGCTTCGCAGATGGGAACACAAGTCTCTCTGGAACTCACA  100

seq1  TTTCAATAGTTCTTACCTAGGAAGGTCTGTTCATTTGGATTTGCTTTTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAATAGTTCTTACCTAGGAAGGTCTGTTCATTTGGATTTGCTTTTGA  150

seq1  ATTGAACCCAGTACCACGTGGTGGAGGAACCAACCAGCCCCACTAGCGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAACCCAGTACCACGTGGTGGAGGAACCAACCAGCCCCACTAGCGCC  200

seq1  ATAATTTGAGGCAGGTGAGATCTTGGACTTCTGGCCTCTGGGTCTGTCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTTGAGGCAGGTGAGATCTTGGACTTCTGGCCTCTGGGTCTGTCAC  250

seq1  ACAACTGCAAATGTGTATTGCTTCAAGCCTCTGTGTTCAGAGTTGTTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACTGCAAATGTGTATTGCTTCAAGCCTCTGTGTTCAGAGTTGTTTGT  300

seq1  TATAGTACTTAACAAATGAAGAAACCAAAAGCCAAAACAAACCCGGGGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGTACTTAACAAATGAAGAAACCAAAAGCCAAAACAAACCCGGGGTT  350

seq1  ACTCTGGGGACTAGAGAGAGGGCTCCTCAGTTAGGAGCCCCTGCTGTTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTGGGGACTAGAGAGAGGGCTCCTCAGTTAGGAGCCCCTGCTGTTCT  400

seq1  TCCAGCAGACCAGAGTTTGGTTCCAGCTCCAAGGAATCTGACTCCTCCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCAGACCAGAGTTTGGTTCCAGCTCCAAGGAATCTGACTCCTCCCT  450

seq1  CCGGGCTCCAGGGGCACCAGCATTCACATGTATATATGCATACAAACACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGGCTCCAGGGGCACCAGCATTCACATGTATATATGCATACAAACACA  500

seq1  CATGTGCAAGAATGAAGTTTCAAGGTAATTGGGGTAGCCCACACTGGTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGCAAGAATGAAGTTTCAAGGTAATTGGGGTAGCCCACACTGGTAG  550

seq1  GATATGCTGGAGAGGTAGACACAAGAGGATCGTAAGTTTGAGGCTAGCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATGCTGGAGAGGTAGACACAAGAGGATCGTAAGTTTGAGGCTAGCCT  600

seq1  GGAAATTACCTTAAAGGACTGGAGAGATGACTCAGTACTCAGTACTCAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATTACCTTAAAGGACTGGAGAGATGACTCAGTACTCAGTACTCAGG  650

seq1  AGCCCTTTCTCATGGTGCTGCACACCTTTAATCCTAGCACTTGGGAGGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTTTCTCATGGTGCTGCACACCTTTAATCCTAGCACTTGGGAGGCA  700

seq1  GACACAGGCAGATCTCTGCTTTCGAGGCCACTCTGGTCTACAAAACCCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACAGGCAGATCTCTGCTTTCGAGGCCACTCTGGTCTACAAAACCCTT  750

seq1  TCCAGGATAGCCAGGGCCACATGAGAAAACTTTGTTTTAAAAAAAAAAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGATAGCCAGGGCCACATGAGAAAACTTTGTTTTAAAAAAAAAAAT  800

seq1  CAAAAGAACTAAAGTGGGAGGGAACCAAACCAACCACCAACAACAATAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CAAAAGAACTAAAGTGGGAGGGAACCAAACCAACCACCAACAACAAT-AA  849

seq1  AAACCCAAAGCAATAAAATAGAAAAGAGCCCTTGCCGCTCTTCCAGAAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCAAAGCAATAAAATAGAAAAGAGCCCTTGCCGCTCTTCCAGAAGA  899

seq1  CTTAGGTTAGATTCCCAGCACCCATGTGGCTCACTCAGTAATGTATACAC  950
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAGTTAGATTCCCAGCACCCATGTGGCTCACTCAGTAATGTATACAC  949

seq1  ACACACACACACACACACACACACACACTCACACACTCACACACACTCAC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACACACTTACATACTCACACACACTCAC  999

seq1  ACACACACACTCACACACACACACAGACATACACACA-TTCGATCAAGCA  1049
      ||| | ||||||| ||||||    |||| | | |||| ||||||| ||||
seq2  ACA-AAACACTCAAACACAC---TAGACTTTC-CACATTTCGATC-AGCA  1043

seq1  ATCATTCAATAAAAAGTAAATAAGTTTCAGGATGGGAGTGGTGCCACATG  1099
      |||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||   ||
seq2  ATCATTCAAT-AAAAGTAAATAAG-TTCAGATGGGGAGTGGTGCCCACTG  1091

seq1  TCTTTC  1105
      ||||||
seq2  TCTTTC  1097

seq1: chr2_168931026_168931702
seq2: B6Ng01-042E07.g_67_743 (reverse)

seq1  TGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTG  50

seq1  AGCGTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTA  100

seq1  TGTGAGTGTATATGTGTGTTTATATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGTGTATATGTGTGTTTATATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTG  150

seq1  TAGGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTATGTGTGTATATGTGTATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTATGTGTGTATATGTGTATG  200

seq1  TGTGTGTATATGTGTGTTTATATATGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTATATGTGTGTTTATATATGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTA  250

seq1  GGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGAATATGTGTATGTGTGTATATGTGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGAATATGTGTATGTGTGTATATGTGTA  300

seq1  TGTGTGGTGTATGTGTGTATGTATATGTGTATGTGTGTATATGTGTGTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGGTGTATGTGTGTATGTATATGTGTATGTGTGTATATGTGTGTGT  350

seq1  ATAAACATATGTACATGTTCGTGCATTGGCTGTAGAGGTCAGAAGCAAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACATATGTACATGTTCGTGCATTGGCTGTAGAGGTCAGAAGCAAAC  400

seq1  ATGGGATTGATTAGATCTGTCTTGTGGATGCTGGGAACTGAACTCTGGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGATTGATTAGATCTGTCTTGTGGATGCTGGGAACTGAACTCTGGTC  450

seq1  CCCTGGAAGAGCATCCAGTACTCTTAACCACTGAGTCATCTCTCCAGCCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGAAGAGCATCCAGTACTCTTAACCACTGAGTCATCTCTCCAGCCC  500

seq1  TCCTAACTCCTGCTTTTCCTCATTGAACTATAGGTTTGAGGATGTAGCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAACTCCTGCTTTTCCTCATTGAACTATAGGTTTGAGGATGTAGCCT  550

seq1  AGTGGGTAGAGCAGTTTACTGGACTACATGAGCCCTGGTCACTGTATAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGGTAGAGCAGTTTACTGGACTACATGAGCCCTGGTCACTGTATAAA  600

seq1  TGAGGTATGAGCACTCACACCTGTGATCTCACCATGAAGGTGGAGGCAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGTATGAGCACTCACACCTGTGATCTCACCATGAAGGTGGAGGCAGG  650

seq1  ACGTCAGGCACATTCAGTTATGAATTC  677
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTCAGGCACATTCAGTTATGAATTC  677