BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-046D19
Chromosome2 (Build37)
Map Location 126,008,611 - 126,107,977
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneSlc12a1, Dut, A530010F05Rik, LOC100043698, Fbn1, Cep152, Shc4, Eid1, 3110001I20Rik, Cops2, Galk2, Fgf7, Dtwd1
Downstream geneAtp8b4, Slc27a2, Hdc, Gabpb1, Usp8, LOC100043714, Usp50, Trpm7, 2010106G01Rik, Ap4e1, Blvra, Ncaph, 1700041B20Rik, 1810024B03Rik, LOC100043408, Ascc3l1, Ciao1, Tmem127, ENSMUSG00000074822, Stard7
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-046D19.bB6Ng01-046D19.g
ACCDH871462DH871463
length2401,074
definitionDH871462|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-046D19, 5' end.DH871463|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-046D19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(126,107,738 - 126,107,977)(126,008,611 - 126,009,716)
sequence
gaattctcccatctggcaaattttaagttcccagtgtgagagagctaaac
acatatggaaacagatgcacagaaatgtgctctcctggcttagtgtgagt
ggactgtaggatgctgatggtgagcaggctgtgggatgctgatggtgagt
gagtgggctgtaggatgctgatggtgagtgagtgggctgtgggatgctga
tggtgagcgggctgtgggatgctgatggtgagtgagtggg
gaattctgatttaagtgtgatgttactgcttagtaggaaaagccccctcc
ccttttaaccctaacctaacccccactttcacacgtggattcagacatgg
tgtcatatgaagactcaaagactctatcctttcgacattgtcttcatcaa
actcaaatgaagctatcttccagtgtaggctctctccatggacttgagac
aattttcactgctgtggatgaaaagcctttcttccctaaaaacagaggga
acatcagaggtgaccacatcccagtgcactaaaatgcaggttggtgcagt
ggaatctcaagtagctagctgcgttgcccagagaagggtatgtgtacata
gtatatgcaggtgaggggcctccattgtccagtgctttgttagaagagag
ctgtgtgcatagcccatgccaagaggaggttgctaagctatctactatgc
ttggctggtctctggaccaaggttgtatttctatctggttattttctgtt
gcttaaaagggagcaaaaagtaagacctctttgagatatgaactatcgaa
aatatttattattttttaatcttttcaaagactcgtgaacctactataat
ttttaagctctaatgttccttagttgaggtgaattctgatcataaataaa
taagacatttattcgggattgtcattaataagacagaattgcctatacta
gcagggttaggaagtgatgctttaggacagatacagttatgcttgtgttc
tttctcatttctgttcatgtctaggatgcgaagtgatagctcccactaca
tctccctgtacctgtctaggtcttatacttttggtaagatgcaaaggcca
ccaaaagtggtccttgctaatgatgtggacaaatctagtggagaggatta
cataagcagatgcaaagaaacagtgtactctgtaacattcctatgcacac
ataatacattatttagatacacagagtcaggataaacataatgatttata
tgtattaagctcaaagggtggtggtggtgtgtgaatcaagtttgaatacc
atgtcaatgaaaaatttcttagca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_126107738_126107977
seq2: B6Ng01-046D19.b_41_280 (reverse)

seq1  CCCACTCACTCACCATCAGCATCCCACAGCCCGCTCACCATCAGCATCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACTCACTCACCATCAGCATCCCACAGCCCGCTCACCATCAGCATCCC  50

seq1  ACAGCCCACTCACTCACCATCAGCATCCTACAGCCCACTCACTCACCATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCCCACTCACTCACCATCAGCATCCTACAGCCCACTCACTCACCATC  100

seq1  AGCATCCCACAGCCTGCTCACCATCAGCATCCTACAGTCCACTCACACTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCCCACAGCCTGCTCACCATCAGCATCCTACAGTCCACTCACACTA  150

seq1  AGCCAGGAGAGCACATTTCTGTGCATCTGTTTCCATATGTGTTTAGCTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGGAGAGCACATTTCTGTGCATCTGTTTCCATATGTGTTTAGCTCT  200

seq1  CTCACACTGGGAACTTAAAATTTGCCAGATGGGAGAATTC  240
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACACTGGGAACTTAAAATTTGCCAGATGGGAGAATTC  240

seq1: chr2_126008611_126009716
seq2: B6Ng01-046D19.g_67_1140

seq1  GAATTCTGATTTAAGTGTGATGTTACTGCTTAGTAGGAAAAGCCCCCTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGATTTAAGTGTGATGTTACTGCTTAGTAGGAAAAGCCCCCTCC  50

seq1  CCTTTTAACCCTAACCTAACCCCCACTTTCACACGTGGATTCAGACATGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTAACCCTAACCTAACCCCCACTTTCACACGTGGATTCAGACATGG  100

seq1  TGTCATATGAAGACTCAAAGACTCTATCCTTTCGACATTGTCTTCATCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCATATGAAGACTCAAAGACTCTATCCTTTCGACATTGTCTTCATCAA  150

seq1  ACTCAAATGAAGCTATCTTCCAGTGTAGGCTCTCTCCATGGACTTGAGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAAATGAAGCTATCTTCCAGTGTAGGCTCTCTCCATGGACTTGAGAC  200

seq1  AATTTTCACTGCTGTGGATGAAAAGCCTTTCTTCCCTAAAAACAGAGGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTCACTGCTGTGGATGAAAAGCCTTTCTTCCCTAAAAACAGAGGGA  250

seq1  ACATCAGAGGTGACCACATCCCAGTGCACTAAAATGCAGGTTGGTGCAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCAGAGGTGACCACATCCCAGTGCACTAAAATGCAGGTTGGTGCAGT  300

seq1  GGAATCTCAAGTAGCTAGCTGCGTTGCCCAGAGAAGGGTATGTGTACATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATCTCAAGTAGCTAGCTGCGTTGCCCAGAGAAGGGTATGTGTACATA  350

seq1  GTATATGCAGGTGAGGGGCCTCCATTGTCCAGTGCTTTGTTAGAAGAGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATATGCAGGTGAGGGGCCTCCATTGTCCAGTGCTTTGTTAGAAGAGAG  400

seq1  CTGTGTGCATAGCCCATGCCAAGAGGAGGTTGCTAAGCTATCTACTATGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTGCATAGCCCATGCCAAGAGGAGGTTGCTAAGCTATCTACTATGC  450

seq1  TTGGCTGGTCTCTGGACCAAGGTTGTATTTCTATCTGGTTATTTTCTGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTGGTCTCTGGACCAAGGTTGTATTTCTATCTGGTTATTTTCTGTT  500

seq1  GCTTAAAAGGGAGCAAAAAGTAAGACCTCTTTGAGATATGAACTATCGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAAAAGGGAGCAAAAAGTAAGACCTCTTTGAGATATGAACTATCGAA  550

seq1  AATATTTATTATTTTTTAATCTTTTCAAAGACTCGTGAACCTACTATAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTTATTATTTTTTAATCTTTTCAAAGACTCGTGAACCTACTATAAT  600

seq1  TTTTAAGCTCTAATGTTCCTTAGTTGAGGTGAATTCTGATCATAAATAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAGCTCTAATGTTCCTTAGTTGAGGTGAATTCTGATCATAAATAAA  650

seq1  TAAGACATTTATTCGGGATTGTCATTAATAAGACAGAATTGCCTATACTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGACATTTATTCGGGATTGTCATTAATAAGACAGAATTGCCTATACTA  700

seq1  GCAGGGTTAGGAAGTGATGCTTTAGGACAGATACAGTTATGCTTGTGTTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGGTTAGGAAGTGATGCTTTAGGACAGATACAGTTATGCTTGTGTTC  750

seq1  TTTCTCATTTCTGTTCATGTCTAGGATGCGAAGGTGATAGCTCCCACTAC  800
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTTCTCATTTCTGTTCATGTCTAGGATGCGAA-GTGATAGCTCCCACTAC  799

seq1  ATCTCCCTGTACCTGTCTAGGTCTTATACTTTTGGTAAGATGCAAAGGCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCCCTGTACCTGTCTAGGTCTTATACTTTTGGTAAGATGCAAAGGCC  849

seq1  ACCAAAAGTGGTCCTTGCTAATGATGTGGACAAATCTAGTGGAGAGGAAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  ACCAAAAGTGGTCCTTGCTAATGATGTGGACAAATCTAGTGGAGAGG-AT  898

seq1  TACATAAGGCAAGAATGCAAAGAAACAGTGGTACTCTGTTAAACATTCCT  950
      ||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||
seq2  TACATAA-GCA--GATGCAAAGAAACAGT-GTACTCTGT--AACATTCCT  942

seq1  ATTGCACACATAAATACAATTATTTTAGGAATACCACAGGAGTTCAGGAA  1000
      | ||||||||| ||||| |||| |||||  ||| |||| ||| |||||| 
seq2  A-TGCACACAT-AATAC-ATTA-TTTAG--ATA-CACA-GAG-TCAGGA-  982

seq1  TAAAACATAAATGAATTTATATGTAATTTTAGGGTTTAAAAAGTGTGTGT  1050
        |||||| |||| |||||||||||   ||| | |    |||| ||| ||
seq2  -TAAACAT-AATG-ATTTATATGTA---TTAAGCT---CAAAGGGTG-GT  1022

seq1  GTGTGTGTGTGTATTTAAAGTTTGGAATACCATGTCAATGAAAAAAATTT  1100
      |   ||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||  ||||||||
seq2  GGTGGTGTGTGAA--TCAAGTTT-GAATACCATGTCAATG--AAAAATTT  1067

seq1  C-TAGCA  1106
      | |||||
seq2  CTTAGCA  1074