BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-046P22
Chromosome2 (Build37)
Map Location 114,690,925 - 114,815,052
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043222
Upstream geneGja9, A530058N18Rik, Actc1, Aqr, Zfp770, Atpbd4, LOC100043219
Downstream geneLOC100043232, LOC100043236, BC052040, Mrg1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-046P22.bB6Ng01-046P22.g
ACCDH871983DH871984
length1,0761,054
definitionDH871983|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-046P22, 5' end.DH871984|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-046P22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(114,690,925 - 114,692,005)(114,813,992 - 114,815,052)
sequence
gaattcccacaaacactctcagaatgaagtgttggaaaagtcctcatttc
aaaataagaatctttagagttcatggagctttgaacaagttaatgcgtaa
acatcagtgacagcaggtagtaataggtctattttacttgacttttattg
atgtcaatgattctttgaacaggccttcagagtaagtttgcatccctaag
atctggtgctcaaccagctaaggtcttcagtgatgggggtacttgcaatt
ctctagaactatttaccttgctgaaattccaaagggcttaagtactgagt
ctttgagatgaggtgattttatttggaaagaataatgtaatttcctgcta
ctgagaataaaatgaaatatgtaaataaatgtttggtgtttgaatggcta
ctaaccatcattacataggcacattcttaacttttgtaacttactgggat
atcttggagaagggatgcttgctcttagactaagcaacccttttcactga
aggggctcatgaggtggccatataaatactgagaagctggaggttattat
agctaatattgattatccgcttgataggtcttccaatcaccatgaatctg
aatctctgcgcatgtctatgagagatctgctaaattatgttaatgaaggt
gcaaagacccactttgagagagggcagcattattttatggtgtataaaaa
tgtaggatgtgatgtattttattcaaacgctgacaccattgcatacacta
gcaagattttgctgaaaggacccagatatagctgtttcttgtgagacaat
gccggggcctagcaaacacagaagtggatgctcacagtcagctattggat
ggatcacagggccctaatggaggagctagagaaagtacccaaggagctaa
agagatctgcaaccctatagtggaacaacattatgaactaaccagtaccc
cagagctcttgactgtagctgcatatgtatcaaaagatggcctagtcggc
catcactggaaagagagtcaatggacttgcaaactttattatgcccagta
caggggatggcaagggccacaagtgg
gaattcagaatagaacactgtaagagaaaggggacttggtgttgtatcta
gcatggttccatgatttggatataactgggaagatgaagaaacgaataaa
tgtcaaagggctacacagacagaataatgggatcagatggtctggagtct
ccattggagaagtctcaggaccctaggatctcagtgtatttattaagtag
agttgaatagagatgtggaattgttgcatacagctggacagttattatag
gttggattattacatacagattaatagggaggcagggtttatgatatgca
gctaatttctgtaggaggaatctcttcaggggatcaatcttcaggccata
aatatatgaagagaggaagctctagtaaaaataaaaatttctgcacaatc
tatcaacactcaccttcagttcccttggaaggctttgccatctctctgag
cccagcaatttgaagtcattaacatggctgcacctttatcaaaagatatt
cactccacagactcaggactttctctgctccctatatgacaccagttcaa
aggtaagggaaaatcagtaagttatggatttcagtcaactacatatgaat
atatgtgacagtgcttctcaatctgggtcatggctccttggggctacata
tacacatcctgcatatcagatacttatattacaattcataacaatagcaa
aattacagttatgaagtagcaatgaaataactttatggttgggaattacc
acaacatgaaaaacggtattaaaggttgcagaattaggaagcttgcgaca
cactagtaacagataaacgatattaattaatgcacatggatgaaatgaac
cattacaatgtaggtgaaattaattattatttaaatcagatgcttaattt
agacaaactatggtaccacttactataatattcttttctattttctaaaa
ttctaagattaaagttgattttattttttaatggaggtggactatcctta
tctgaaaagaatacttctaatatgtcacagtatacatgtgcatgacaata
ctat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_114690925_114692005
seq2: B6Ng01-046P22.b_44_1119

seq1  GAATTCCCACAAACACTCTCAGAATGAAGTGTTGGAAAAGTCCTCATTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCACAAACACTCTCAGAATGAAGTGTTGGAAAAGTCCTCATTTC  50

seq1  AAAATAAGAATCTTTAGAGTTCATGGAGCTTTGAACAAGTTAATGCGTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAAGAATCTTTAGAGTTCATGGAGCTTTGAACAAGTTAATGCGTAA  100

seq1  ACATCAGTGACAGCAGGTAGTAATAGGTCTATTTTACTTGACTTTTATTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCAGTGACAGCAGGTAGTAATAGGTCTATTTTACTTGACTTTTATTG  150

seq1  ATGTCAATGATTCTTTGAACAGGCCTTCAGAGTAAGTTTGCATCCCTAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCAATGATTCTTTGAACAGGCCTTCAGAGTAAGTTTGCATCCCTAAG  200

seq1  ATCTGGTGCTCAACCAGCTAAGGTCTTCAGTGATGGGGGTACTTGCAATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGGTGCTCAACCAGCTAAGGTCTTCAGTGATGGGGGTACTTGCAATT  250

seq1  CTCTAGAACTATTTACCTTGCTGAAATTCCAAAGGGCTTAAGTACTGAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAGAACTATTTACCTTGCTGAAATTCCAAAGGGCTTAAGTACTGAGT  300

seq1  CTTTGAGATGAGGTGATTTTATTTGGAAAGAATAATGTAATTTCCTGCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGAGATGAGGTGATTTTATTTGGAAAGAATAATGTAATTTCCTGCTA  350

seq1  CTGAGAATAAAATGAAATATGTAAATAAATGTTTGGTGTTTGAATGGCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGAATAAAATGAAATATGTAAATAAATGTTTGGTGTTTGAATGGCTA  400

seq1  CTAACCATCATTACATAGGCACATTCTTAACTTTTGTAACTTACTGGGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACCATCATTACATAGGCACATTCTTAACTTTTGTAACTTACTGGGAT  450

seq1  ATCTTGGAGAAGGGATGCTTGCTCTTAGACTAAGCAACCCTTTTCACTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTGGAGAAGGGATGCTTGCTCTTAGACTAAGCAACCCTTTTCACTGA  500

seq1  AGGGGCTCATGAGGTGGCCATATAAATACTGAGAAGCTGGAGGTTATTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGCTCATGAGGTGGCCATATAAATACTGAGAAGCTGGAGGTTATTAT  550

seq1  AGCTAATATTGATTATCCGCTTGATAGGTCTTCCAATCACCATGAATCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAATATTGATTATCCGCTTGATAGGTCTTCCAATCACCATGAATCTG  600

seq1  AATCTCTGCGCATGTCTATGAGAGATCTGCTAAATTATGTTAATGAAGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTCTGCGCATGTCTATGAGAGATCTGCTAAATTATGTTAATGAAGGT  650

seq1  GCAAAGACCCACTTTGAGAGAGGGCAGCATTATTTTATGGTGTATAAAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGACCCACTTTGAGAGAGGGCAGCATTATTTTATGGTGTATAAAAA  700

seq1  TGTAGGATGTGATGTATTTTATTCAAACGCTGACACCATTGCATACACTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGGATGTGATGTATTTTATTCAAACGCTGACACCATTGCATACACTA  750

seq1  GCAAGATTTTGCTGAAAGGACCCAGATATAGCTGTTTCTTGTGAGACAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGATTTTGCTGAAAGGACCCAGATATAGCTGTTTCTTGTGAGACAAT  800

seq1  GCCGGGGCCTAGCAAACACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTATTGGAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGGGGCCTAGCAAACACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTATTGGAT  850

seq1  GGATCACAGGGCCCCTAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTA  900
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCACAGGG-CCCTAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTA  899

seq1  AAGAGATCTGCAACCCTATAGGTGGAACAACATTATGAACTAACCAGTAC  950
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGATCTGCAACCCTATA-GTGGAACAACATTATGAACTAACCAGTAC  948

seq1  CCCAGAGCTCTTGACTGTAGCTGCATATGTATCAAAAGATGGCCTAGTCG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGAGCTCTTGACTGTAGCTGCATATGTATCAAAAGATGGCCTAGTCG  998

seq1  GCCATCACTGGAAAGAGAGGCCCATTGGACTTGCAAACTTTA-TATGCCC  1049
      |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||| ||
seq2  GCCATCACTGGAAAGAGAG--TCAATGGACTTGCAAACTTTATTATG-CC  1045

seq1  CAGTACAGGGGAATGCCAGGGCCAAAAAGTGG  1081
      ||||||||||||  || |||||| | ||||||
seq2  CAGTACAGGGGATGGCAAGGGCC-ACAAGTGG  1076

seq1: chr2_114813992_114815052
seq2: B6Ng01-046P22.g_69_1122 (reverse)

seq1  ATAGTATTTGTCATGCACATTGTAATAACTGTTGACATATATGAAGTATG  50
      |||||| |||||||||||| ||||   |||| ||||||||  ||||||| 
seq2  ATAGTA-TTGTCATGCACA-TGTA--TACTG-TGACATATTAGAAGTAT-  44

seq1  TCTCTTCAGATAAGGGATTAGTCCACCTCCATTTAAAAATAAAATCAACT  100
      ||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| 
seq2  TCTTTTCAGATAAGG--ATAGTCCACCTCCATTAAAAAATAAAATCAAC-  91

seq1  TTTAATTCTAGAATTTTAG-ATATAAGAAAGATTA-TATAGTATGTGGTA  148
      ||||||  ||||||||||| | |||  ||||| || ||||||| ||||||
seq2  TTTAATCTTAGAATTTTAGAAAATAGAAAAGAATATTATAGTAAGTGGTA  141

seq1  -CATAGTTTGTCTAAATTAAGCATCTGATTTAAAATATTAATTAATTTCA  197
       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
seq2  CCATAGTTTGTCTAAATTAAGCATCTGATTT-AAATAATAATTAATTTCA  190

seq1  ACTACATTGTTATGGTTCATTTCATCCATGTGCATTAATTAATATCGTTT  247
       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACATTGTAATGGTTCATTTCATCCATGTGCATTAATTAATATCGTTT  240

seq1  ATCTGTTACTAGTGTGTCGCAAGCTTCCTAATTCTGCAACCTTTAATACC  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTTACTAGTGTGTCGCAAGCTTCCTAATTCTGCAACCTTTAATACC  290

seq1  GTTTTTCATGTTGTGGTAATTCCCAACCATAAAGTTATTTCATTGCTACT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTCATGTTGTGGTAATTCCCAACCATAAAGTTATTTCATTGCTACT  340

seq1  TCATAACTGTAATTTTGCTATTGTTATGAATTGTAATATAAGTATCTGAT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAACTGTAATTTTGCTATTGTTATGAATTGTAATATAAGTATCTGAT  390

seq1  ATGCAGGATGTGTATATGTAGCCCCAAGGAGCCATGACCCAGATTGAGAA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAGGATGTGTATATGTAGCCCCAAGGAGCCATGACCCAGATTGAGAA  440

seq1  GCACTGTCACATATATTCATATGTAGTTGACTGAAATCCATAACTTACTG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTGTCACATATATTCATATGTAGTTGACTGAAATCCATAACTTACTG  490

seq1  ATTTTCCCTTACCTTTGAACTGGTGTCATATAGGGAGCAGAGAAAGTCCT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCCCTTACCTTTGAACTGGTGTCATATAGGGAGCAGAGAAAGTCCT  540

seq1  GAGTCTGTGGAGTGAATATCTTTTGATAAAGGTGCAGCCATGTTAATGAC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCTGTGGAGTGAATATCTTTTGATAAAGGTGCAGCCATGTTAATGAC  590

seq1  TTCAAATTGCTGGGCTCAGAGAGATGGCAAAGCCTTCCAAGGGAACTGAA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAATTGCTGGGCTCAGAGAGATGGCAAAGCCTTCCAAGGGAACTGAA  640

seq1  GGTGAGTGTTGATAGATTGTGCAGAAATTTTTATTTTTACTAGAGCTTCC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGTGTTGATAGATTGTGCAGAAATTTTTATTTTTACTAGAGCTTCC  690

seq1  TCTCTTCATATATTTATGGCCTGAAGATTGATCCCCTGAAGAGATTCCTC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTCATATATTTATGGCCTGAAGATTGATCCCCTGAAGAGATTCCTC  740

seq1  CTACAGAAATTAGCTGCATATCATAAACCCTGCCTCCCTATTAATCTGTA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGAAATTAGCTGCATATCATAAACCCTGCCTCCCTATTAATCTGTA  790

seq1  TGTAATAATCCAACCTATAATAACTGTCCAGCTGTATGCAACAATTCCAC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAATAATCCAACCTATAATAACTGTCCAGCTGTATGCAACAATTCCAC  840

seq1  ATCTCTATTCAACTCTACTTAATAAATACACTGAGATCCTAGGGTCCTGA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCTATTCAACTCTACTTAATAAATACACTGAGATCCTAGGGTCCTGA  890

seq1  GACTTCTCCAATGGAGACTCCAGACCATCTGATCCCATTATTCTGTCTGT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTCTCCAATGGAGACTCCAGACCATCTGATCCCATTATTCTGTCTGT  940

seq1  GTAGCCCTTTGACATTTATTCGTTTCTTCATCTTCCCAGTTATATCCAAA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCCCTTTGACATTTATTCGTTTCTTCATCTTCCCAGTTATATCCAAA  990

seq1  TCATGGAACCATGCTAGATACAACACCAAGTCCCCTTTCTCTTACAGTGT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGGAACCATGCTAGATACAACACCAAGTCCCCTTTCTCTTACAGTGT  1040

seq1  TCTATTCTGAATTC  1061
      ||||||||||||||
seq2  TCTATTCTGAATTC  1054