BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-056J24
Chromosome2 (Build37)
Map Location 133,684,880 - 133,852,471
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneCrls1, B430119L13Rik, 5830467P10Rik, LOC668908, LOC100043785, A430048G15Rik, Bmp2
Downstream geneHao1, Txndc13, LOC627897, LOC433478, Plcb1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-056J24.bB6Ng01-056J24.g
ACCDH878728DH878729
length1,0971,059
definitionDH878728|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-056J24, 5' end.DH878729|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-056J24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(133,851,363 - 133,852,471)(133,684,880 - 133,685,950)
sequence
gaattcagctggactcctcacatttcagtaaaccaggaggcagaggggtc
aggggctattcacccgatagtgggatattcctcaagcctgccactggaga
cctacatcgcccagctagaccccatgtaccaaaggtgccacaacctctca
acatggtatcaccactgagaaggaaccaagaattcaagcacatgaatctg
taggcaatgtgctatgcccaaagcataccatggaagtatagataagtaga
aaatatcattataattaataatgagttgtgctaagagaaagagaaggatc
acatgttcaatgatcccacttagaaatacttataataggaagatgtacag
agttgtaataaaaattagttaagagctatgtctgtgtttaagtggggcaa
cacactctacaatgattttttagatgctttcacagctctctgaatatatt
aaaactgttgatctatatattctaatagagcagattacatgttatattat
actaagcatatgattaaggtttcatgaattaatgtgaaaactattcaaga
caatctatagctttgtttaagggaacatcaaaggtttgccaaagactttg
gcctttggagactgcatagagagaactggctactgtgagtagaatgatag
ctatgggagaagtccagcatggggagtagaggcagggtcgctggacttta
cactacagtgacaccagctgagccctgccattggtgttgaggcaaaccat
gccatactgaacactgagaagtaaagctgcctgtgtcagatatgtggagg
acagagacagatggattttatagtcacattcaagtagggaaatggacatt
ttaaggaccaaattatagtataggcttaagactaaaagatgaaaattaga
gttaagtttctttaactataaggaaataggaatttcacataagaatatat
tcctgtcaagatattcatccaagtagctatgaaactggctttttggtata
ggaagattagcagtaaaaatacgtagaagaactgaagattgaggtgtcta
cctattgaaagtttaatttttgggaaaactctagaacatgagaaaaa
gaattcctttgggttggtaggagacttgccttctatgtatcctcagggga
gacttcttttgtggatttctatttttacattgaaaagtttatacatgaat
atagtgtgttttggtcaagcccaccctagtttttattcccaatgtcaacc
tctctctcctctatctctccctccctacttacctccctcccttccttctt
ctcaaaacccacttagtgctgcctgtatgtatatggatggaggaccatct
attggaatgtaggtaacctgtcagaggccacatccatgaagcaaacttac
tctcccatgatccatgacagggatcctcagggaagaaaggatagaaagat
cgtcagagccagagactgcaacagatgtcgccagtcaaacaccatttgct
agacatataggacctttatacacatgaacacgcaaacgaatttcagtgtg
gcagaggagggtctcatggaatctcacctctagctgaggagctttgacct
actggcctactgagggcattgctttcctttctcatctccctcctccccgc
acacctctggatgtgctcttgggcaaatggtcagtcttactcagacagtg
tctttcagctttctgcctaaaggcagtagtcttctgctcccttgtgggca
tggctgcccttggcatagcgcacaggcaagtacagggaccatggatgggc
tggctgttcttacccacactgctcctgaagctctaatattaaactaatgt
gcagctctaatgagagcagttaacaagatttgatatgcactctgctctgc
accttggggttctcatttcggatattctttagctggtgccacccccagtt
ttctatcgctgcttaaaacttagtgattatttttctttttgtttttgttt
gtttgtttgtttccttcctggatgttagagaaaggaggagactcattgtt
caatagtttctaatagtgggggactgacaattgactagggtcaattcctg
tagtcaaaataaattcaaaccaatgtgcttccctcctgagcctgcgttag
taagtctga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_133851363_133852471
seq2: B6Ng01-056J24.b_49_1145 (reverse)

seq1  TTTTCCTCAGTGTTCTAGAGTTTGTCCCAATATATAACACTTTCAAATAG  50
      |||| |||| ||||||||||||| |||||| | || | |||||| |||||
seq2  TTTTTCTCA-TGTTCTAGAGTTT-TCCCAA-AAATTAAACTTTC-AATAG  46

seq1  GTAGACATCTTCAATCTTTCAGTTCTTCTACGTATTTTTAACTGCTTAAT  100
      ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||
seq2  GTAGACA-CCTCAATC-TTCAGTTCTTCTACGTATTTTT-ACTGC-TAAT  92

seq1  CTTCCTATACCAAAAAGCCAGTTTCAATAGCTACTTGGATGAATATCTTG  150
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTATACCAAAAAGCCAGTTTC-ATAGCTACTTGGATGAATATCTTG  141

seq1  ACAGGAATATATTCTTATGTGAAATTCCTATTTCCTTATAGTTAAAGAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGAATATATTCTTATGTGAAATTCCTATTTCCTTATAGTTAAAGAAA  191

seq1  CTTAACTCTAATTTTCATCCTTTTTAGTCTTAAGCCTATACTATAATTTG  250
      |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAACTCTAATTTTCATC--TTTTAGTCTTAAGCCTATACTATAATTTG  239

seq1  GTCCTTAAAATGTCCATTTCCCTACTTGAATGTGACTATTAAAATCCATC  300
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GTCCTTAAAATGTCCATTTCCCTACTTGAATGTGACTA-TAAAATCCATC  288

seq1  TGTCTCTGTCCTCCACATATCTGACACAGGCAGCTTTACTTCTCAGTGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCTGTCCTCCACATATCTGACACAGGCAGCTTTACTTCTCAGTGTT  338

seq1  CAGTATGGCATGGTTTGCCTCAACACCAATGGCAGGGCTCAGCTGGTGTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTATGGCATGGTTTGCCTCAACACCAATGGCAGGGCTCAGCTGGTGTC  388

seq1  ACTGTAGTGTAAAGTCCAGCGACCCTGCCTCTACTCCCCATGCTGGACTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTAGTGTAAAGTCCAGCGACCCTGCCTCTACTCCCCATGCTGGACTT  438

seq1  CTCCCATAGCTATCATTCTACTCACAGTAGCCAGTTCTCTCTATGCAGTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCATAGCTATCATTCTACTCACAGTAGCCAGTTCTCTCTATGCAGTC  488

seq1  TCCAAAGGCCAAAGTCTTTGGCAAACCTTTGATGTTCCCTTAAACAAAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAGGCCAAAGTCTTTGGCAAACCTTTGATGTTCCCTTAAACAAAGC  538

seq1  TATAGATTGTCTTGAATAGTTTTCACATTAATTCATGAAACCTTAATCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGATTGTCTTGAATAGTTTTCACATTAATTCATGAAACCTTAATCAT  588

seq1  ATGCTTAGTATAATATAACATGTAATCTGCTCTATTAGAATATATAGATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTAGTATAATATAACATGTAATCTGCTCTATTAGAATATATAGATC  638

seq1  AACAGTTTTAATATATTCAGAGAGCTGTGAAAGCATCTAAAAAATCATTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGTTTTAATATATTCAGAGAGCTGTGAAAGCATCTAAAAAATCATTG  688

seq1  TAGAGTGTGTTGCCCCACTTAAACACAGACATAGCTCTTAACTAATTTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGTGTGTTGCCCCACTTAAACACAGACATAGCTCTTAACTAATTTTT  738

seq1  ATTACAACTCTGTACATCTTCCTATTATAAGTATTTCTAAGTGGGATCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACAACTCTGTACATCTTCCTATTATAAGTATTTCTAAGTGGGATCAT  788

seq1  TGAACATGTGATCCTTCTCTTTCTCTTAGCACAACTCATTATTAATTATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACATGTGATCCTTCTCTTTCTCTTAGCACAACTCATTATTAATTATA  838

seq1  ATGATATTTTCTACTTATCTATACTTCCATGGTATGCTTTGGGCATAGCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATATTTTCTACTTATCTATACTTCCATGGTATGCTTTGGGCATAGCA  888

seq1  CATTGCCTACAGATTCATGTGCTTGAATTCTTGGTTCCTTCTCAGTGGTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGCCTACAGATTCATGTGCTTGAATTCTTGGTTCCTTCTCAGTGGTG  938

seq1  ATACCATGTTGAGAGGTTGTGGCACCTTTGGTACATGGGGTCTAGCTGGG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCATGTTGAGAGGTTGTGGCACCTTTGGTACATGGGGTCTAGCTGGG  988

seq1  CGATGTAGGTCTCCAGTGGCAGGCTTGAGGAATATCCCACTATCGGGTGA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATGTAGGTCTCCAGTGGCAGGCTTGAGGAATATCCCACTATCGGGTGA  1038

seq1  ATAGCCCCTGACCCCTCTGCCTCCTGGTTTACTGAAATGTGAGGAGTCCA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCCCCTGACCCCTCTGCCTCCTGGTTTACTGAAATGTGAGGAGTCCA  1088

seq1  GCTGAATTC  1109
      |||||||||
seq2  GCTGAATTC  1097

seq1: chr2_133684880_133685950
seq2: B6Ng01-056J24.g_69_1127

seq1  GAATTCCTTTGGGTTGGTAGGAGACTTGCCTTCTATGTATCCTCAGGGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTTGGGTTGGTAGGAGACTTGCCTTCTATGTATCCTCAGGGGA  50

seq1  GACTTCTTTTGTGGATTTCTATTTTTACATTGAAAAGTTTATACATGAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTCTTTTGTGGATTTCTATTTTTACATTGAAAAGTTTATACATGAAT  100

seq1  ATAGTGTGTTTTGGTCAAGCCCACCCTAGTTTTTATTCCCAATGTCAACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTGTGTTTTGGTCAAGCCCACCCTAGTTTTTATTCCCAATGTCAACC  150

seq1  TCTCTCTCCTCTATCTCTCCCTCCCTACTTACCTCCCTCCCTTCCTTCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCCTCTATCTCTCCCTCCCTACTTACCTCCCTCCCTTCCTTCTT  200

seq1  CTCAAAACCCACTTAGTGCTGCCTGTATGTATATGGATGGAGGACCATCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAAACCCACTTAGTGCTGCCTGTATGTATATGGATGGAGGACCATCT  250

seq1  ATTGGAATGTAGGTAACCTGTCAGAGGCCACATCCATGAAGCAAACTTAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGAATGTAGGTAACCTGTCAGAGGCCACATCCATGAAGCAAACTTAC  300

seq1  TCTCCCATGATCCATGACAGGGATCCTCAGGGAAGAAAGGATAGAAAGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCATGATCCATGACAGGGATCCTCAGGGAAGAAAGGATAGAAAGAT  350

seq1  CGTCAGAGCCAGAGACTGCAACAGATGTCGCCAGTCAAACACCATTTGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCAGAGCCAGAGACTGCAACAGATGTCGCCAGTCAAACACCATTTGCT  400

seq1  AGACATATAGGACCTTTATACACATGAACACGCAAACGAATTTCAGTGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATATAGGACCTTTATACACATGAACACGCAAACGAATTTCAGTGTG  450

seq1  GCAGAGGAGGGTCTCATGGAATCTCACCTCTAGCTGAGGAGCTTTGACCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGGAGGGTCTCATGGAATCTCACCTCTAGCTGAGGAGCTTTGACCT  500

seq1  ACTGGCCTACTGAGGGCATTGCTTTCCTTTCTCATCTCCCTCCTCCCCGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGCCTACTGAGGGCATTGCTTTCCTTTCTCATCTCCCTCCTCCCCGC  550

seq1  ACACCTCTGGATGTGCTCTTGGGCAAATGGTCAGTCTTACTCAGACAGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTCTGGATGTGCTCTTGGGCAAATGGTCAGTCTTACTCAGACAGTG  600

seq1  TCTTTCAGC-TTCTGCCTAAAGGCAGTAGTCTTCTGCTCCCTTGTGGGCA  649
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCAGCTTTCTGCCTAAAGGCAGTAGTCTTCTGCTCCCTTGTGGGCA  650

seq1  TGGCTGCCCTTGGCATAGCGCACAGGCAAGTACAGGGACCATGGATGGGC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGCCCTTGGCATAGCGCACAGGCAAGTACAGGGACCATGGATGGGC  700

seq1  TGGCTGTTCTTACCCACACTGCTCCTGAAGCTCTAATATTAAACTAATGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGTTCTTACCCACACTGCTCCTGAAGCTCTAATATTAAACTAATGT  750

seq1  GCAGCTCTAATGAGAGCAGTTAACAAGATTTGATATGCACTCTGCTCTGC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCTCTAATGAGAGCAGTTAACAAGATTTGATATGCACTCTGCTCTGC  800

seq1  ACCTTGGGGTTCTCATTTCGGATATTCTTTAGCTGGTGCCACCCCCAGTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTGGGGTTCTCATTTCGGATATTCTTTAGCTGGTGCCACCCCCAGTT  850

seq1  TTCTATCGCTGCTTAAAACTTAGTGATTATTTTTTCTTTTTTGTTTTTGT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||
seq2  TTCTATCGCTGCTTAAAACTTAGTGATTATTTTT--CTTTTTGTTTTTGT  898

seq1  TTGTTTGTTTGTTTTCCTTCCTTGGATGTGAAGAGAAAGGGAGGAGACTC  949
      ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||
seq2  TTGTTTGTTTG-TTTCCTTCC-TGGATGT-TAGAGAAA-GGAGGAGACTC  944

seq1  AATTGTTCAATAGTTTCTATAAGTGTGGGACTGACAATTGACCTAGGGGT  999
       ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||  
seq2  -ATTGTTCAATAGTTTCTAATAGTGGGGGACTGACAATTGA-CTAGGGTC  992

seq1  CATTCCTGTAGTCAAAATAAATTCCAACACAATTGTGCTTCCCTTCTGTA  1049
       ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |
seq2  AATTCCTGTAGTCAAAATAAATTCAAAC-CAA-TGTGCTTCCCTCCTG-A  1039

seq1  GTCTGCAGTTTAGTAAGTCTGA  1071
      | ||||   |||||||||||||
seq2  GCCTGC--GTTAGTAAGTCTGA  1059