BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-057A24
Chromosome2 (Build37)
Map Location 96,941,346 - 97,063,481
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043267
Upstream genenone
Downstream geneLrrc4c, LOC621146, LOC664974
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-057A24.bB6Ng01-057A24.g
ACCDH879041DH879042
length939790
definitionDH879041|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-057A24, 5' end.DH879042|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-057A24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(97,062,540 - 97,063,481)(96,941,346 - 96,942,135)
sequence
gaattctcagctacctctctagttccatgtgtgcctttctgctgccatgc
tttcctgctctgatgataatagactaaacctcggaaactgtaagcaagct
ccatttatatgctttattttataagagttgctgttgtcatggtgtctttt
caaaataataggatagtgaccaaaacaaagaagaaatcatttttgattca
ataagagcattctagatttcaatacaaagctgaacagaacaatattttat
cacaaatggtgaaagagtttctatgtagctaaaatgttatagtttgtgga
tattcattgcagtcttgttaactgagtaaaatataattagtatactgata
tgctgctattggttgtctaagggaaaagccatcagtgtgcagtggatgca
atagaaaggcagagaagacagcctctctatactgcgtatttataatacag
cttatgcataatttgatcatgcacctggctcttttgaatttgctctctct
ctctctctctctctccacacacacacacacacacacacacacacacacac
acacacatacacacacacacatacacacacatacatacaaaattgagtat
tactcagccattaaaaataatgttattttgaaattggtaagcaaatggat
ggaaatagaaaagatcatcctaagtgagaaaacctagactcagaacaaaa
gaaaacatgacatgtactcactcacaggtagatatttgtcataaagtaca
gtataaactatgctataaaccatagacccaaagctatataacaaggaggg
agcaagaaggatgctttaatctcactgagaagggaaaatagattaaaatt
agatatcaggggtgaatgaaggcattgagagatgggagggggggagtggg
atgcaaagggagtatattggaccaggaggaaaggtagga
gaattccaaacagaatttttcttctcttcaatattccctagctattccaa
acttgacatttaattaaatagtactataattatttctgtttcataaatta
ggtacatggaatagatcacttgttacaattttttccaggtttattactta
acaattcttgattaagcccattgtttcacaaatgtttactgtgcattcac
tataatcagttgcttttcgttttggaaggattcatagggaccaaaacaaa
caccaaccctcttacccctttgttgtagtaggtaaagacaataagaaaaa
caaacaaaataatacatgagtatattatgagacactgtggtacatagtac
aggagaatatcagctgaggaaggaccaggagtgcctaagcatctctacag
gggtacaattaagaaagctaggtgatagtaaaaagctaacgtatgtaaat
atattgcagatcatcttcttcattcaaagcacagaaccccaaggcgatat
tgtgacttataccattagcaacagggtcaataagcagagcgtctgagaga
caatgtcttgactgaccctatgtgttctttatccaatacagattgagagt
taggagatgtaaaggggcaggtgattagcagctatcacagcaatccaggt
gaatgaaggtgatcacttgggtcatagtggggacatgcaactggttagat
ttttataaagtttcaagtacatataatttgtgggatgattataggtagga
tatggcagaaagagagagagagagagagagagagagagag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_97062540_97063481
seq2: B6Ng01-057A24.b_46_984 (reverse)

seq1  TCCTACCTTATCCCTCCTGGTCCTATATACCTCCCTTTGCTTTCCCACT-  49
      ||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| 
seq2  TCCTACCT--TTCCTCCTGGTCCAATATA-CTCCCTTTGC-ATCCCACTC  46

seq1  CCCCCCTCCCATCTCTCAATGCCTTCATTCACCCCTGATATCTAATTTTA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCTCCCATCTCTCAATGCCTTCATTCACCCCTGATATCTAATTTTA  96

seq1  ATCTATTTTCCCTTCTCAGTGAGATTAAAGCATCCTTCTTGCTCCCTCCT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATTTTCCCTTCTCAGTGAGATTAAAGCATCCTTCTTGCTCCCTCCT  146

seq1  TGTTATATAGCTTTGGGTCTATGGTTTATAGCATAGTTTATACTGTACTT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATATAGCTTTGGGTCTATGGTTTATAGCATAGTTTATACTGTACTT  196

seq1  TATGACAAATATCTACCTGTGAGTGAGTACATGTCATGTTTTCTTTTGTT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGACAAATATCTACCTGTGAGTGAGTACATGTCATGTTTTCTTTTGTT  246

seq1  CTGAGTCTAGGTTTTCTCACTTAGGATGATCTTTTCTATTTCCATCCATT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTCTAGGTTTTCTCACTTAGGATGATCTTTTCTATTTCCATCCATT  296

seq1  TGCTTACCAATTTCAAAATAACATTATTTTTAATGGCTGAGTAATACTCA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTACCAATTTCAAAATAACATTATTTTTAATGGCTGAGTAATACTCA  346

seq1  ATTTTGTATGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGTATGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTG  396

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  446

seq1  GCAAATTCAAAAGAGCCAGGTGCATGATCAAATTATGCATAAGCTGTATT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAATTCAAAAGAGCCAGGTGCATGATCAAATTATGCATAAGCTGTATT  496

seq1  ATAAATACGCAGTATAGAGAGGCTGTCTTCTCTGCCTTTCTATTGCATCC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATACGCAGTATAGAGAGGCTGTCTTCTCTGCCTTTCTATTGCATCC  546

seq1  ACTGCACACTGATGGCTTTTCCCTTAGACAACCAATAGCAGCATATCAGT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCACACTGATGGCTTTTCCCTTAGACAACCAATAGCAGCATATCAGT  596

seq1  ATACTAATTATATTTTACTCAGTTAACAAGACTGCAATGAATATCCACAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTAATTATATTTTACTCAGTTAACAAGACTGCAATGAATATCCACAA  646

seq1  ACTATAACATTTTAGCTACATAGAAACTCTTTCACCATTTGTGATAAAAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATAACATTTTAGCTACATAGAAACTCTTTCACCATTTGTGATAAAAT  696

seq1  ATTGTTCTGTTCAGCTTTGTATTGAAATCTAGAATGCTCTTATTGAATCA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTTCTGTTCAGCTTTGTATTGAAATCTAGAATGCTCTTATTGAATCA  746

seq1  AAAATGATTTCTTCTTTGTTTTGGTCACTATCCTATTATTTTGAAAAGAC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGATTTCTTCTTTGTTTTGGTCACTATCCTATTATTTTGAAAAGAC  796

seq1  ACCATGACAACAGCAACTCTTATAAAATAAAGCATATAAATGGAGCTTGC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGACAACAGCAACTCTTATAAAATAAAGCATATAAATGGAGCTTGC  846

seq1  TTACAGTTTCCGAGGTTTAGTCTATTATCATCAGAGCAGGAAAGCATGGC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGTTTCCGAGGTTTAGTCTATTATCATCAGAGCAGGAAAGCATGGC  896

seq1  AGCAGAAAGGCACACATGGAACTAGAGAGGTAGCTGAGAATTC  942
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGAAAGGCACACATGGAACTAGAGAGGTAGCTGAGAATTC  939

seq1: chr2_96941346_96942135
seq2: B6Ng01-057A24.g_73_862

seq1  GAATTCCAAACAGAATTTTTCTTCTCTTCAATATTCCCTAGCTATTCCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAACAGAATTTTTCTTCTCTTCAATATTCCCTAGCTATTCCAA  50

seq1  ACTTGACATTTAATTAAATAGTACTATAATTATTTCTGTTTCATAAATTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGACATTTAATTAAATAGTACTATAATTATTTCTGTTTCATAAATTA  100

seq1  GGTACATGGAATAGATCACTTGTTACAATTTTTTCCAGGTTTATTACTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACATGGAATAGATCACTTGTTACAATTTTTTCCAGGTTTATTACTTA  150

seq1  ACAATTCTTGATTAAGCCCATTGTTTCACAAATGTTTACTGTGCATTCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTCTTGATTAAGCCCATTGTTTCACAAATGTTTACTGTGCATTCAC  200

seq1  TATAATCAGTTGCTTTTCGTTTTGGAAGGATTCATAGGGACCAAAACAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATCAGTTGCTTTTCGTTTTGGAAGGATTCATAGGGACCAAAACAAA  250

seq1  CACCAACCCTCTTACCCCTTTGTTGTAGTAGGTAAAGACAATAAGAAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAACCCTCTTACCCCTTTGTTGTAGTAGGTAAAGACAATAAGAAAAA  300

seq1  CAAACAAAATAATACATGAGTATATTATGAGACACTGTGGTACATAGTAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACAAAATAATACATGAGTATATTATGAGACACTGTGGTACATAGTAC  350

seq1  AGGAGAATATCAGCTGAGGAAGGACCAGGAGTGCCTAAGCATCTCTACAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGAATATCAGCTGAGGAAGGACCAGGAGTGCCTAAGCATCTCTACAG  400

seq1  GGGTACAATTAAGAAAGCTAGGTGATAGTAAAAAGCTAACGTATGTAAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTACAATTAAGAAAGCTAGGTGATAGTAAAAAGCTAACGTATGTAAAT  450

seq1  ATATTGCAGATCATCTTCTTCATTCAAAGCACAGAACCCCAAGGCGATAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTGCAGATCATCTTCTTCATTCAAAGCACAGAACCCCAAGGCGATAT  500

seq1  TGTGACTTATACCATTAGCAACAGGGTCAATAAGCAGAGCGTCTGAGAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGACTTATACCATTAGCAACAGGGTCAATAAGCAGAGCGTCTGAGAGA  550

seq1  CAATGTCTTGACTGACCCTATGTGTTCTTTATCCAATACAGATTGAGAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGTCTTGACTGACCCTATGTGTTCTTTATCCAATACAGATTGAGAGT  600

seq1  TAGGAGATGTAAAGGGGCAGGTGATTAGCAGCTATCACAGCAATCCAGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAGATGTAAAGGGGCAGGTGATTAGCAGCTATCACAGCAATCCAGGT  650

seq1  GAATGAAGGTGATCACTTGGGTCATAGTGGGGACATGCAACTGGTTAGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGAAGGTGATCACTTGGGTCATAGTGGGGACATGCAACTGGTTAGAT  700

seq1  TTTTATAAAGTTTCAAGTACATATAATTTGTGGGATGATTATAGGTAGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATAAAGTTTCAAGTACATATAATTTGTGGGATGATTATAGGTAGGA  750

seq1  TATGGCAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGCAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  790