BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-059H03
Chromosome2 (Build37)
Map Location 124,754,277 - 124,903,210
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSlc24a5
Upstream gene4930517E11Rik, LOC100043360, Sema6d, LOC100043367, LOC100043369
Downstream geneMyef2, LOC100043375, Slc12a1, Dut, A530010F05Rik, LOC100043698, Fbn1, Cep152, Shc4, Eid1, 3110001I20Rik, Cops2, Galk2, Fgf7
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-059H03.bB6Ng01-059H03.g
ACCDH880727DH880728
length1,127725
definitionDH880727|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-059H03, 5' end.DH880728|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-059H03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(124,902,073 - 124,903,210)(124,754,277 - 124,755,001)
sequence
gaattcaatccaggctctctcatcaattcctacttgccttaactgtgtca
cttaaatatttgacttcagtaaacaatgaagggagagaaacataatggct
tgtgggccttggtttcatggtgtttcttttagtacatatataaaccatac
atactcaaccctgtccccacaggttacattacatagcctcagattcaacc
acctgtgtatcaaaatattcaaagagaaattaccttcattctgcatatgg
actagactcttctttttctttggacaatatagtgtaaagctatttgcaca
ttttgcagactgtattagttcttatagatcactctggaatctttaagcta
ctcaggagggtagtgaacactatgcacacacagtagatgattttatgtgc
tagacctcagtgtcctcagattttgacattctcagtacctcaggagtact
gagcagtgcttatttgtcataatgtatagaatgtgaccaatatgtacata
gatgcatacacatgtatatacatatattactaacttgccatagactttta
aaattgaacaaaaaggcaaagtgaattgctgtataatcgaacatcatttt
agaaatgaaggcattatcttgcacagtggcattcagcttacttccatatt
tctagtgttagatgtgagttttagaatttacattgtacaaagaatcagtt
ttgctactacatatgaggcactggctttattacccagcacatccaaccaa
acaaactcatcagacctgtgagtaaagaaacaaagtcaagtctcacggat
tgtaaagattgtaaatgtagaatttggcagaccttgagggcaagagcatt
tccatggcttcgtgctactgacaccataactatgtctatttgatgctttt
taacattttctttgaatggtctcatgtatcccaggttggccttgcattca
cggtgtagccaaagatggcattttacctcttatctcctgcttctgcaggg
attgctgttgtggcaacacttcaggatggtgcagagttgggattgaaccc
ggggttgagcttgcaggcagcactctaccactgagcacatctcaggtcgc
tctctggctcttatcataggagaaaat
gaattctagatgccattgcccagtcccacccatcccaggctgtggtgggt
ggtatgatctggaagtctgctatgcattcaggggaaataagcctgggctg
actgtgcatagagaaggaagacactgccacctgcaggctctaagcttagg
gagatagtaaatgtttaatttatgggagatttgttttattaaagtaacat
tttcataaacagtaaaagtctcaaagttggctcacttactcctgtacctt
tgagcaactccgttccacagtagtcaagaactgtagctactagtggagaa
gctggttctaagttaaaggtagccaatgttggcgttgttccgtggggact
gagaactagcctggaccttgcacaggtgacactgggaaagtgataagtaa
ttgtctgctgacgttctctttaaaccctaagcatactttgagcctcagtt
cctttcattgtaagctaaggctattagataagattagatcggtgttttcc
aaactgtgaatgctgtgccagcattggtggtgagaccaggaattgttaat
attaattgcatctggttctatcccaggccttagagtcagaaactgcagaa
ggcaggccttcaggtgtgaggagtgctcagtcatatgacttataaatatt
taatatgcaattccttgcctctaagatgatgtcatctgtagtccaactgt
ctcctgggaaggtggagttttgggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_124902073_124903210
seq2: B6Ng01-059H03.b_46_1172 (reverse)

seq1  ATTTTCTCCTATG-TAAGAGCGCAAGAGGCGGACTGAGGATGTGGCTCAG  49
      ||||||||||||| |||||||   ||| |||  |||| ||||| ||||||
seq2  ATTTTCTCCTATGATAAGAGCCAGAGA-GCGACCTGA-GATGT-GCTCAG  47

seq1  TGGGTAGAGTGCTTGCCTCGCAAGCTCAAAACCCCGGGTTCAATCCCAAC  99
      | |||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||
seq2  T-GGTAGAGTGC-TGCCT-GCAAGCTC--AACCCCGGGTTCAATCCCAAC  92

seq1  TCTGCACCATCCTGAAGTGTTGGCACAACAGCAATCCCTGGCAGAGGCAG  149
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| 
seq2  TCTGCACCATCCTGAAGTGTTGCCACAACAGCAATCCCT-GCAGAAGCA-  140

seq1  GGAGATAAGAGGTTAAATGCCATCTTTGGCTACACCGTGAATGCAAGGCC  199
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGATAAGAGGTAAAATGCCATCTTTGGCTACACCGTGAATGCAAGGCC  190

seq1  AACCTGGGATACATGAGACCATTCAAAGAAAATGTTAAAAAGCATCAAAT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTGGGATACATGAGACCATTCAAAGAAAATGTTAAAAAGCATCAAAT  240

seq1  AGACATAGTTATGGTGTCAGTAGCACGAAGCCATGGAAATGCTCTTGCCC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATAGTTATGGTGTCAGTAGCACGAAGCCATGGAAATGCTCTTGCCC  290

seq1  TCAAGGTCTGCCAAATTCCTACATTTACAATCTTTACAATCCGTGAGACT  349
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGGTCTGCCAAATT-CTACATTTACAATCTTTACAATCCGTGAGACT  339

seq1  TGACTTTGTTTCTTTACTCACAGGTCCTGATGAGTTTGTTTGGTTGGATG  399
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTTGTTTCTTTACTCACAGGT-CTGATGAGTTTGTTTGGTTGGATG  388

seq1  TGCTGGGTAATAAAGCCAGTGCCTCATATGTAGTAGCAAAACTGATTCTT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGGTAATAAAGCCAGTGCCTCATATGTAGTAGCAAAACTGATTCTT  438

seq1  TGTACAATGTAAATTCTAAAACTCACATCTAACACTAGAAATATGGAAGT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACAATGTAAATTCTAAAACTCACATCTAACACTAGAAATATGGAAGT  488

seq1  AAGCTGAATGCCACTGTGCAAGATAATGCCTTCATTTCTAAAATGATGTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGAATGCCACTGTGCAAGATAATGCCTTCATTTCTAAAATGATGTT  538

seq1  CGATTATACAGCAATTCACTTTGCCTTTTTGTTCAATTTTAAAAGTCTAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATTATACAGCAATTCACTTTGCCTTTTTGTTCAATTTTAAAAGTCTAT  588

seq1  GGCAAGTTAGTAATATATGTATATACATGTGTATGCATCTATGTACATAT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAGTTAGTAATATATGTATATACATGTGTATGCATCTATGTACATAT  638

seq1  TGGTCACATTCTATACATTATGACAAATAAGCACTGCTCAGTACTCCTGA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCACATTCTATACATTATGACAAATAAGCACTGCTCAGTACTCCTGA  688

seq1  GGTACTGAGAATGTCAAAATCTGAGGACACTGAGGTCTAGCACATAAAAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACTGAGAATGTCAAAATCTGAGGACACTGAGGTCTAGCACATAAAAT  738

seq1  CATCTACTGTGTGTGCATAGTGTTCACTACCCTCCTGAGTAGCTTAAAGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTACTGTGTGTGCATAGTGTTCACTACCCTCCTGAGTAGCTTAAAGA  788

seq1  TTCCAGAGTGATCTATAAGAACTAATACAGTCTGCAAAATGTGCAAATAG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGAGTGATCTATAAGAACTAATACAGTCTGCAAAATGTGCAAATAG  838

seq1  CTTTACACTATATTGTCCAAAGAAAAAGAAGAGTCTAGTCCATATGCAGA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTACACTATATTGTCCAAAGAAAAAGAAGAGTCTAGTCCATATGCAGA  888

seq1  ATGAAGGTAATTTCTCTTTGAATATTTTGATACACAGGTGGTTGAATCTG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGGTAATTTCTCTTTGAATATTTTGATACACAGGTGGTTGAATCTG  938

seq1  AGGCTATGTAATGTAACCTGTGGGGACAGGGTTGAGTATGTATGGTTTAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTATGTAATGTAACCTGTGGGGACAGGGTTGAGTATGTATGGTTTAT  988

seq1  ATATGTACTAAAAGAAACACCATGAAACCAAGGCCCACAAGCCATTATGT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTACTAAAAGAAACACCATGAAACCAAGGCCCACAAGCCATTATGT  1038

seq1  TTCTCTCCCTTCATTGTTTACTGAAGTCAAATATTTAAGTGACACAGTTA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTCCCTTCATTGTTTACTGAAGTCAAATATTTAAGTGACACAGTTA  1088

seq1  AGGCAAGTAGGAATTGATGAGAGAGCCTGGATTGAATTC  1138
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAAGTAGGAATTGATGAGAGAGCCTGGATTGAATTC  1127

seq1: chr2_124754277_124755001
seq2: B6Ng01-059H03.g_67_791

seq1  GAATTCTAGATGCCATTGCCCAGTCCCACCCATCCCAGGCTGTGGTGGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGATGCCATTGCCCAGTCCCACCCATCCCAGGCTGTGGTGGGT  50

seq1  GGTATGATCTGGAAGTCTGCTATGCATTCAGGGGAAATAAGCCTGGGCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATGATCTGGAAGTCTGCTATGCATTCAGGGGAAATAAGCCTGGGCTG  100

seq1  ACTGTGCATAGAGAAGGAAGACACTGCCACCTGCAGGCTCTAAGCTTAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGCATAGAGAAGGAAGACACTGCCACCTGCAGGCTCTAAGCTTAGG  150

seq1  GAGATAGTAAATGTTTAATTTATGGGAGATTTGTTTTATTAAAGTAACAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATAGTAAATGTTTAATTTATGGGAGATTTGTTTTATTAAAGTAACAT  200

seq1  TTTCATAAACAGTAAAAGTCTCAAAGTTGGCTCACTTACTCCTGTACCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATAAACAGTAAAAGTCTCAAAGTTGGCTCACTTACTCCTGTACCTT  250

seq1  TGAGCAACTCCGTTCCACAGTAGTCAAGAACTGTAGCTACTAGTGGAGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCAACTCCGTTCCACAGTAGTCAAGAACTGTAGCTACTAGTGGAGAA  300

seq1  GCTGGTTCTAAGTTAAAGGTAGCCAATGTTGGCGTTGTTCCGTGGGGACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGTTCTAAGTTAAAGGTAGCCAATGTTGGCGTTGTTCCGTGGGGACT  350

seq1  GAGAACTAGCCTGGACCTTGCACAGGTGACACTGGGAAAGTGATAAGTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAACTAGCCTGGACCTTGCACAGGTGACACTGGGAAAGTGATAAGTAA  400

seq1  TTGTCTGCTGACGTTCTCTTTAAACCCTAAGCATACTTTGAGCCTCAGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTGCTGACGTTCTCTTTAAACCCTAAGCATACTTTGAGCCTCAGTT  450

seq1  CCTTTCATTGTAAGCTAAGGCTATTAGATAAGATTAGATCGGTGTTTTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTCATTGTAAGCTAAGGCTATTAGATAAGATTAGATCGGTGTTTTCC  500

seq1  AAACTGTGAATGCTGTGCCAGCATTGGTGGTGAGACCAGGAATTGTTAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGTGAATGCTGTGCCAGCATTGGTGGTGAGACCAGGAATTGTTAAT  550

seq1  ATTAATTGCATCTGGTTCTATCCCAGGCCTTAGAGTCAGAAACTGCAGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATTGCATCTGGTTCTATCCCAGGCCTTAGAGTCAGAAACTGCAGAA  600

seq1  GGCAGGCCTTCAGGTGTGAGGAGTGCTCAGTCATATGACTTATAAATATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGCCTTCAGGTGTGAGGAGTGCTCAGTCATATGACTTATAAATATT  650

seq1  TAATATGCAATTCCTTGCCTCTAAGATGATGTCATCTGTAGTCCAACTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATGCAATTCCTTGCCTCTAAGATGATGTCATCTGTAGTCCAACTGT  700

seq1  CTCCTGGGAAGGTGGAGTTTGGGGG  725
      |||||||||||||||||||| ||||
seq2  CTCCTGGGAAGGTGGAGTTTTGGGG  725