BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-059P02
Chromosome2 (Build37)
Map Location 141,021,972 - 141,167,574
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene2310003L22Rik, Sel1l2, 2900006F19Rik, Flrt3
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-059P02.bB6Ng01-059P02.g
ACCDH881073DH881074
length1,072824
definitionDH881073|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-059P02, 5' end.DH881074|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-059P02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(141,021,972 - 141,023,050)(141,166,753 - 141,167,574)
sequence
gaattccatttaaactatacacacacacacacacacacacgcatacacac
acacacacacgcatacaaacttacctatactattggtattttcaggtaga
tatttaatgtatcccttgtgacttttctagacttcttttctattaattta
ccccctcttcatttttctgtattcagtctttccctccctaattagatctg
tctcgtatttttcatcttcagctcaagtcaccttgctattccacttctct
tgctctttttttctctgctgcccacaatggcccctttttactcttctcct
ttctgcagtcactccaggttgtatactcatctgaagatatggagctggga
acctcggatgagagacagagtccatttaagtccagccttctaaaggcatt
tgtagagatctggtttccaagacagctcatatctcagttttgggtgcatt
ttattgaatgtttgtggaagattctgggtaagtcataaacataaaataag
tatatattgaatgagtgaacaaatgaatttaaaaaacactctcagaaaag
tatgttcagctatttcagagagaattatagctatgcaggaagcagtttac
aactagctttctgtaagaatattggcttaaaataccgggatgagctgcaa
actataggagccagtggagcaaaactcagatgttgacagtaaagattaat
gaagcacctttccttaattgatagcacccagtgtgtgctcccttcagcct
ttgtctgtcaattgggcagagtatccagcagtcagacacactctattgct
tgctgaaatgtaaaaaaaaaaggtaatttaatcttctcagtgttgtagat
gatggttttttaaagttgcagttgaaataacagaacaatttgtgggtgaa
taggtctttgtaattcataatttagtagatggcatgttcaatttattaag
tggacctgaacataaaatcatcaagagacaattaatgtgtaactctttag
gcacaggacagtcattctctcagcatgtttttgtcattttttacgattgt
aaggggtgaatgcctcccgttt
gaattccagaagtcatctgtgtgggtgggctctaaaataaggatttctgg
tttctttggagactcccttaggttataatgatattttgctgggacaatca
ggtgaaagaatggtttgctaaagcagacatgtgagtgaacattttgctga
agccaacacaggtaaaggatgttttgctataccatacatgtgaaaggata
catggtatttagaaggaatataaatatgactctacagacaacgggagctt
gagtattgctttgcctcactccaccaaattaaccttcactgataacacac
atgtattggttggtgttaccttatgttgctgagtttcacttgtggtaact
tcataaagagtaactcaccaaagaacctgtcttgagattcctgtggcttc
ttgccacttccacggactttcgaagtgattggtgatccttgtggtttctt
ctggatttaactgctcttgctgatttgtgtgtgaagtctgccgagtgact
agactacaactgctgatttgtgtttggagtttgctagtggaatggactga
gaacaacaaacattagaattgccccaaagtactatttctagacagataca
ctttctccatatcctagtcaactttttccccctactacctctagtgggtg
gtgggctagagaagaggttgaacccttattaaagcaggttgtgaaaaatg
tatgcctgcagggctcaaaagcatgcatagatatgttgtcactgcttatc
attactctatttggactgctgctatgtgtatgattctgcttaatgtggca
tttattctattaatgttctggaag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_141021972_141023050
seq2: B6Ng01-059P02.b_44_1115

seq1  GAATTCCATTTAAACTATACACACACACACACACACACACGCATACACAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATTTAAACTATACACACACACACACACACACACGCATACACAC  50

seq1  ACACACACACGCATACAAACTTACCTATACTATTGGTATTTTCAGGTAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACGCATACAAACTTACCTATACTATTGGTATTTTCAGGTAGA  100

seq1  TATTTAATGTATCCCTTGTGACTTTTCTAGACTTCTTTTCTATTAATTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTAATGTATCCCTTGTGACTTTTCTAGACTTCTTTTCTATTAATTTA  150

seq1  CCCCCTCTTCATTTTTCTGTATTCAGTCTTTCCCTCCCTAATTAGATCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCTCTTCATTTTTCTGTATTCAGTCTTTCCCTCCCTAATTAGATCTG  200

seq1  TCTCGTATTTTTCATCTTCAGCTCAAGTCACCTTGCTATTCCACTTCTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCGTATTTTTCATCTTCAGCTCAAGTCACCTTGCTATTCCACTTCTCT  250

seq1  TGCTCTTTTTTTCTCTGCTGCCCACAATGGCCCCTTTTTACTCTTCTCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTTTTTTTCTCTGCTGCCCACAATGGCCCCTTTTTACTCTTCTCCT  300

seq1  TTCTGCAGTCACTCCAGGTTGTATACTCATCTGAAGATATGGAGCTGGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGCAGTCACTCCAGGTTGTATACTCATCTGAAGATATGGAGCTGGGA  350

seq1  ACCTCGGATGAGAGACAGAGTCCATTTAAGTCCAGCCTTCTAAAGGCATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCGGATGAGAGACAGAGTCCATTTAAGTCCAGCCTTCTAAAGGCATT  400

seq1  TGTAGAGATCTGGTTTCCAAGACAGCTCATATCTCAGTTTTGGGTGCATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGAGATCTGGTTTCCAAGACAGCTCATATCTCAGTTTTGGGTGCATT  450

seq1  TTATTGAATGTTTGTGGAAGATTCTGGGTAAGTCATAAACATAAAATAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTGAATGTTTGTGGAAGATTCTGGGTAAGTCATAAACATAAAATAAG  500

seq1  TATATATTGAATGAGTGAACAAATGAATTTAAAAAACACTCTCAGAAAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATTGAATGAGTGAACAAATGAATTTAAAAAACACTCTCAGAAAAG  550

seq1  TATGTTCAGCTATTTCAGAGAGAATTATAGCTATGCAGGAAGCAGTTTAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTTCAGCTATTTCAGAGAGAATTATAGCTATGCAGGAAGCAGTTTAC  600

seq1  AACTAGCTTTCTGTAAGAATATTGGCTTAAAATACCGGGATGAGCTGCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAGCTTTCTGTAAGAATATTGGCTTAAAATACCGGGATGAGCTGCAA  650

seq1  ACTATAGGAGCCAGTGGAGCAAAACTCAGATGTTGACAGTAAAGATTAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATAGGAGCCAGTGGAGCAAAACTCAGATGTTGACAGTAAAGATTAAT  700

seq1  GAAGCACCTTTCCTTAATTGATAGCACCCAGTGTGTGCTCCCTTCAGCCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCACCTTTCCTTAATTGATAGCACCCAGTGTGTGCTCCCTTCAGCCT  750

seq1  TTGTCTGTCAATT-GGCAGAGTATCCAGCAGTCAGACACACTCTATTGCT  799
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTGTCAATTGGGCAGAGTATCCAGCAGTCAGACACACTCTATTGCT  800

seq1  TGCTGAAATGTAAAAAAAAAAGGTAATTTAATCTTCTCAGTGTTGTAGAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGAAATGTAAAAAAAAAAGGTAATTTAATCTTCTCAGTGTTGTAGAT  850

seq1  GATGGTTTTTTAAAGTTGCAGTTGAAATAACAGAACAATTTGTGGGTGAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTTTTTTAAAGTTGCAGTTGAAATAACAGAACAATTTGTGGGTGAA  900

seq1  TAGGTCTTTGTAATTCATAATTTAGTAGATGGCATGTTCAAATTTATTAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TAGGTCTTTGTAATTCATAATTTAGTAGATGGCATGTTC-AATTTATTAA  949

seq1  GTGGACCTGAACATAAAAATCATCCAAGAGAACAATTAATGTGTAACTCT  999
      |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||
seq2  GTGGACCTGAACAT-AAAATCAT-CAAGAG-ACAATTAATGTGTAACTCT  996

seq1  TTAGGCACAGGACAGTCCATTCTCTCAGCATGTATTTGTTCATTTTTATA  1049
      |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||  | 
seq2  TTAGGCACAGGACAGT-CATTCTCTCAGCATGTTTTTG-TCATTTT--TT  1042

seq1  ACGATTGTAAGGGGTGAATGCTTCCCGTTT  1079
      ||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  ACGATTGTAAGGGGTGAATGCCTCCCGTTT  1072

seq1: chr2_141166753_141167574
seq2: B6Ng01-059P02.g_69_892 (reverse)

seq1  CTTCCAGAACA-TAATAGAATAAATGCCACATTAAGCAGAATCATACACA  49
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCAGAACATTAATAGAATAAATGCCACATTAAGCAGAATCATACACA  50

seq1  TAGCAGCAGTCCAAATAGAGTAATGAT-AGCAGTGACAACATATCTATGC  98
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAGCAGTCCAAATAGAGTAATGATAAGCAGTGACAACATATCTATGC  100

seq1  ATGCTTTTGAGCCCTGCAGGCATACATTTTTCACAACCTGCTTTAATAAG  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTTTGAGCCCTGCAGGCATACATTTTTCACAACCTGCTTTAATAAG  150

seq1  GGTTCAACCTCTTCTCTAGCCCACCACCCACTAGAGGTAGTAGGGGGAAA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCAACCTCTTCTCTAGCCCACCACCCACTAGAGGTAGTAGGGGGAAA  200

seq1  AAGTTGACTAGGATATGGAGAAAGTGTATCTGTCTAGAAATAGTACTTTG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGACTAGGATATGGAGAAAGTGTATCTGTCTAGAAATAGTACTTTG  250

seq1  GGGCAATTCTAATGTTTGTTGTTCTCAGTCCATTCCACTAGCAAACTCCA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAATTCTAATGTTTGTTGTTCTCAGTCCATTCCACTAGCAAACTCCA  300

seq1  AACACAAATCAGCAGTTGTAGTCTAGTCACTCGGCAGACTTCACACACAA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACAAATCAGCAGTTGTAGTCTAGTCACTCGGCAGACTTCACACACAA  350

seq1  ATCAGCAAGAGCAGTTAAATCCAGAAGAAACCACAAGGATCACCAATCAC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGCAAGAGCAGTTAAATCCAGAAGAAACCACAAGGATCACCAATCAC  400

seq1  TTCGAAAGTCCGTGGAAGTGGCAAGAAGCCACAGGAATCTCAAGACAGGT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGAAAGTCCGTGGAAGTGGCAAGAAGCCACAGGAATCTCAAGACAGGT  450

seq1  TCTTTGGTGAGTTACTCTTTATGAAGTTACCACAAGTGAAACTCAGCAAC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGGTGAGTTACTCTTTATGAAGTTACCACAAGTGAAACTCAGCAAC  500

seq1  ATAAGGTAACACCAACCAATACATGTGTGTTATCAGTGAAGGTTAATTTG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGGTAACACCAACCAATACATGTGTGTTATCAGTGAAGGTTAATTTG  550

seq1  GTGGAGTGAGGCAAAGCAATACTCAAGCTCCCGTTGTCTGTAGAGTCATA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAGTGAGGCAAAGCAATACTCAAGCTCCCGTTGTCTGTAGAGTCATA  600

seq1  TTTATATTCCTTCTAAATACCATGTATCCTTTCACATGTATGGTATAGCA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATATTCCTTCTAAATACCATGTATCCTTTCACATGTATGGTATAGCA  650

seq1  AAACATCCTTTACCTGTGTTGGCTTCAGCAAAATGTTCACTCACATGTCT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATCCTTTACCTGTGTTGGCTTCAGCAAAATGTTCACTCACATGTCT  700

seq1  GCTTTAGCAAACCATTCTTTCACCTGATTGTCCCAGCAAAATATCATTAT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTAGCAAACCATTCTTTCACCTGATTGTCCCAGCAAAATATCATTAT  750

seq1  AACCTAAGGGAGTCTCCAAAGAAACCAGAAATCCTTATTTTAGAGCCCAC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTAAGGGAGTCTCCAAAGAAACCAGAAATCCTTATTTTAGAGCCCAC  800

seq1  CCACACAGATGACTTCTGGAATTC  822
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACAGATGACTTCTGGAATTC  824