BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-060I05
Chromosome2 (Build37)
Map Location 46,640,118 - 46,723,382
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC666604, LOC383690
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-060I05.bB6Ng01-060I05.g
ACCDH881467DH881468
length6661,094
definitionDH881467|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-060I05, 5' end.DH881468|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-060I05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(46,640,118 - 46,640,765)(46,722,280 - 46,723,382)
sequence
gaattcagtttttcattttccttatagggtggataatattccactgtgtt
catatgccatattttcattatctatttatttgtctatttatttccacttt
ctggcttccttaaatgtgcagccatgaagatagatgagtaggtgtctcta
cattaatgtaaatttatttaaaggctaagctattttcttcaatagatttc
atagctttaaaactatgtttctcttttcaataacacttgtattttttgat
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ttatgattaaacatagtgtggactatccaacatttgaatgtgctatgttt
gaatgactactttgatatttgttcattgtacttttcaatactttttgttc
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aaccatttggtcaatctgaaataaaaaaatgcaaaagtctgcaacagatg
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tcttcatcaatagaatctaacatttcaccagaagttctagtgtggccagc
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tctacagatcaagtaatgatccttggtggctatgagatctgtaaggggta
aaaatactaaatatctggaagtttttaagattaaaaattcgactcagaac
tttagtatacttctctacaataataacaaatttgaaataggtaattaaaa
gtatgttattatttaattttattccttcaaaacatattgagtacactatc
tatagcactctcacttctttttcttccccctaaaactcctacaaatagcc
aatttctatgtctctttttaaatttaattgcaacatgtatttggatatgt
atatgtatgtatatataaatctgtatatataacatgtatgcatatattgt
tatcttatttctatgatgctttataaacatatctatgcatgtatatatag
atataaaatacagatatataacttactcacctcttcagtacagtcaactt
ttcttatatgtataactgcctgctatgtccagggctgacaactttaggtt
acacaacttttatgggtacctttctcagaggaaacattcactcacgaatc
ttagacattctggtctcctggatctcacagtcttcctgtccggtgttcat
gatttttcctgaatcttaagaatacttagttggagatgtgtcagtcagag
ttgggctctctgtagccatttattcttaatggagtaagctgctctgaagt
tttctaattcacgctcaatctgttcttttctttcatgaacgatctctatc
atcaatagaggattatgagattacagcaagtctgaccaggctgatgaatt
aactgtctggtgatcttgaatgcttaatctaataggactataaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_46640118_46640765
seq2: B6Ng01-060I05.b_47_694

seq1  GAATTCAGTTTTTCATTTTCCTTATAGGGTGGATAATATTCCACTGTGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTTTTTCATTTTCCTTATAGGGTGGATAATATTCCACTGTGTT  50

seq1  CATATGCCATATTTTCATTATCTATTTATTTGTCTATTTATTTCCACTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGCCATATTTTCATTATCTATTTATTTGTCTATTTATTTCCACTTT  100

seq1  CTGGCTTCCTTAAATGTGCAGCCATGAAGATAGATGAGTAGGTGTCTCTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTTCCTTAAATGTGCAGCCATGAAGATAGATGAGTAGGTGTCTCTA  150

seq1  CATTAATGTAAATTTATTTAAAGGCTAAGCTATTTTCTTCAATAGATTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAATGTAAATTTATTTAAAGGCTAAGCTATTTTCTTCAATAGATTTC  200

seq1  ATAGCTTTAAAACTATGTTTCTCTTTTCAATAACACTTGTATTTTTTGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCTTTAAAACTATGTTTCTCTTTTCAATAACACTTGTATTTTTTGAT  250

seq1  TTTTAAATTTTCTTTTCTTTTTGATGAAATCAAAAATTTTTCATGTTTTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAATTTTCTTTTCTTTTTGATGAAATCAAAAATTTTTCATGTTTTC  300

seq1  AATATATTTAAAATTACAAGAGAAATGTATTTAATTTTTATAAATATCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATATTTAAAATTACAAGAGAAATGTATTTAATTTTTATAAATATCAT  350

seq1  TTATGATTAAACATAGTGTGGACTATCCAACATTTGAATGTGCTATGTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGATTAAACATAGTGTGGACTATCCAACATTTGAATGTGCTATGTTT  400

seq1  GAATGACTACTTTGATATTTGTTCATTGTACTTTTCAATACTTTTTGTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGACTACTTTGATATTTGTTCATTGTACTTTTCAATACTTTTTGTTC  450

seq1  TTGATCAGTTTATGTAACATTGCTCAGTAATTCACTAAAGAACACTGCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATCAGTTTATGTAACATTGCTCAGTAATTCACTAAAGAACACTGCTA  500

seq1  ATATAATTATGATGGCCAAGGGTTCAATTCTAACTTAAAACTATATCCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAATTATGATGGCCAAGGGTTCAATTCTAACTTAAAACTATATCCAC  550

seq1  TTTTGTTTTATATATATATAAATAAAACAAGGAAGATTTCATATAACCAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTTTTATATATATATAAATAAAACAAGGAAGATTTCATATAACCAC  600

seq1  AGGCAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT  648

seq1: chr2_46722280_46723382
seq2: B6Ng01-060I05.g_69_1162 (reverse)

seq1  TTTA-AGTCCTATTTAAGAATTAAGCAATCAAGATCACAAGACCAGTTAA  49
      |||| |||||||||  || |||||||| |||||||||| ||| |||||||
seq2  TTTATAGTCCTATT--AG-ATTAAGCATTCAAGATCACCAGA-CAGTTAA  46

seq1  TTTCATACAGCCTGGTCAGACTTGCTGTAATTCTCAATAAT-CTCTATTG  98
       ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||
seq2  -TTCAT-CAGCCTGGTCAGACTTGCTGTAA-TCTC-ATAATCCTCTATTG  92

seq1  ATGATAGAGATCGTTTCATGAAAGAAAAGAACAGATTGAGCGGTGAATTA  148
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  ATGATAGAGATCG-TTCATGAAAGAAAAGAACAGATTGAGC-GTGAATTA  140

seq1  GAAAACTTCAGAGCAGCTTAACTCCATTAAGAATAAATGGCTACAGAGGG  198
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GAAAACTTCAGAGCAGCTT-ACTCCATTAAGAATAAATGGCTACAGAGAG  189

seq1  CCCAACTCTGACTGACACATCTCCAACTAAGTATTCTTAAGATTCAGGAA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAACTCTGACTGACACATCTCCAACTAAGTATTCTTAAGATTCAGGAA  239

seq1  AAATCATGAACACCGGACAGGAAGACTGTGAGATCCAGGAGACCAGAATG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCATGAACACCGGACAGGAAGACTGTGAGATCCAGGAGACCAGAATG  289

seq1  TCTAAGATTCGTGAGTGAATGTTTCCTCTGAGAAAGGTACCCATAAAAGT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAGATTCGTGAGTGAATGTTTCCTCTGAGAAAGGTACCCATAAAAGT  339

seq1  TGTGTAACCTAAAGTTGTCAGCCCTGGACATAGCAGGCAGTTATACATAT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTAACCTAAAGTTGTCAGCCCTGGACATAGCAGGCAGTTATACATAT  389

seq1  AAGAAAAGTTGACTGTACTGAAGAGGTGAGTAAGTTATATATCTGTATTT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAAGTTGACTGTACTGAAGAGGTGAGTAAGTTATATATCTGTATTT  439

seq1  TATATCTATATATACATGCATAGATATGTTTATAAAGCATCATAGAAATA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATCTATATATACATGCATAGATATGTTTATAAAGCATCATAGAAATA  489

seq1  AGATAACAATATATGCATACATGTTATATATACAGATTTATATATACATA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAACAATATATGCATACATGTTATATATACAGATTTATATATACATA  539

seq1  CATATACATATCCAAATACATGTTGCAATTAAATTTAAAAAGAGACATAG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATACATATCCAAATACATGTTGCAATTAAATTTAAAAAGAGACATAG  589

seq1  AAATTGGCTATTTGTAGGAGTTTTAGGGGGAAGAAAAAGAAGTGAGAGTG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTGGCTATTTGTAGGAGTTTTAGGGGGAAGAAAAAGAAGTGAGAGTG  639

seq1  CTATAGATAGTGTACTCAATATGTTTTGAAGGAATAAAATTAAATAATAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAGATAGTGTACTCAATATGTTTTGAAGGAATAAAATTAAATAATAA  689

seq1  CATACTTTTAATTACCTATTTCAAATTTGTTATTATTGTAGAGAAGTATA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACTTTTAATTACCTATTTCAAATTTGTTATTATTGTAGAGAAGTATA  739

seq1  CTAAAGTTCTGAGTCGAATTTTTAATCTTAAAAACTTCCAGATATTTAGT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAGTTCTGAGTCGAATTTTTAATCTTAAAAACTTCCAGATATTTAGT  789

seq1  ATTTTTACCCCTTACAGATCTCATAGCCACCAAGGATCATTACTTGATCT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTACCCCTTACAGATCTCATAGCCACCAAGGATCATTACTTGATCT  839

seq1  GTAGACAGTTCTGCTGGGGTTGCAGGCTCTTTTGTTCTGTGTACATCCTC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGACAGTTCTGCTGGGGTTGCAGGCTCTTTTGTTCTGTGTACATCCTC  889

seq1  TTGTTGCTGGCCACACTAGAACTTCTGGTGAAATGTTAGATTCTATTGAT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGCTGGCCACACTAGAACTTCTGGTGAAATGTTAGATTCTATTGAT  939

seq1  GAAGATAATTGTTAACTTTTTTGTTTGATTATAAAGAATAAACAAGACTT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATAATTGTTAACTTTTTTGTTTGATTATAAAGAATAAACAAGACTT  989

seq1  TTTCTCATCTGTTGCAGACTTTTGCATTTTTTTATTTCAGATTGACCAAA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCATCTGTTGCAGACTTTTGCATTTTTTTATTTCAGATTGACCAAA  1039

seq1  TGGTTTCTTATGCTGCAACAAGTTGTGGTTGTGAATAATGCTGGTTTGTG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTCTTATGCTGCAACAAGTTGTGGTTGTGAATAATGCTGGTTTGTG  1089

seq1  AATTC  1103
      |||||
seq2  AATTC  1094