BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-061G16
Chromosome2 (Build37)
Map Location 41,769,948 - 41,910,299
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLrp1b, LOC625094
Upstream geneLOC100042629
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-061G16.bB6Ng01-061G16.g
ACCDH882098DH882099
length1,0071,029
definitionDH882098|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-061G16, 5' end.DH882099|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-061G16, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(41,909,292 - 41,910,299)(41,769,948 - 41,770,984)
sequence
gaattcagcatggttgagaaggtctagtgtcaagaagagcttatagctgc
tgtgctaaaaacacattgctgttttatcactttttggaaaacaacgctat
agagaaagggagacaaagcactggctattacccacacagcctgcctgatc
aaaacctattcctttctatctcccttaggaggccccatctcctaaagttt
ccacaatcaggcaaagcagcagccgcagtagcagcagctgaagacagaag
cttgcagcacaggggctggtggcaatattttacatgaaatcatattaaca
ttatttaacacgttctttgcacaaataagatctgccattttgtggctata
cttaacacatcttgaatatttttcattatcactttgattagataattttt
caataattttgttctggagtgttctggtagaagaagtgatagattctttg
aatattcagaggtagcattccgaatgaagaagaaaatgtagttcatattt
atgttgtcactcttcttctaacaaaaatattaaacttgcttgatgccagc
atagagttatgtctatgaggaccaaaggattaagctgtgattgctacctt
caagaatctgtagagggatccatgtagaaaaaataaaggactacagtaca
ctttaaccaaattcgttctcactaagtctcacattatttattcttccgct
tttctttgcttccctcttcttatctttgtgatctcttctaactaatgttc
acatcttctcacaatttaggacacaattctttctcattgtacatccctgt
taaattttttctcaacaacttaagggagtcaatagtagctggtattggtc
tctaatacacaacaggggttatatatttggtttcttttgcaatctcaaaa
ttttccttctgaaaaaatactttagctatgaaactcggtttctaaactat
ttataatagatattttctaaatttgtcaactagaatcaccgaaaatatat
atatata
gaattctcttgcttcagaatttaatggattcagtcttcagaattggcgaa
tgttctttatgacatgcaaatattgagactggaaatttaaatggagtagg
acttggtggtaaaggatgaaggaacacagatgtttccagtgttctaattc
caggttcttatgcctttctcatgatgtctctgtaatgctgtctgtctccc
agcagacaagtgaatgtggatcagtgtgctctgtgaagatgctggaccag
tctgttgtatggactctatgccaactcttcacaatacacatgtttgtaag
tgtcttctgtgctaaaagtaaattctcacagagtgtaccaccatgataga
gacaacagttcctgcaacaggagcaatcaggaacagcagactgaggctgg
acccaacactatggttgaatgcctatatagcctgtcacatcaagaaagaa
tcatgaaatttcttcagttacaatctacctttcctgtctcatttggcaat
gcactcctgcttgttgtctgcaataaggaaccctcttgatcttgtttgtt
tgtttgtttgcttgcttgcttgttttttgagacagggtttctctgtgtag
ctctagctgtcctggaactcactctgtagtcaccaggctaacctcaaact
cagaaatccatctacttctgcctcccaagtgttgggattaaaggtgtgtg
ccaccactgtccagcctctcttgatcttattcatttaccagagtcaatgt
ttctaggatattaaaatagctatgtgggatataaaaccatgccaggaagt
ctggtaaggtaggtaggtcgagaactggtgtctcagtggacacacatttg
aggttaagtgacttatgctctctgccagactctctgacttggacattgaa
acacaaaaatatgtgacttttatagaactttacaactagattatatacat
gtttaatataaatagattttatatggatattttagtattggaatataaat
aattctttattagaattctttattcttaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_41909292_41910299
seq2: B6Ng01-061G16.b_46_1052 (reverse)

seq1  TATATATATATA---TCTGTGATTCTAGTTTGACAAATTTAGAAAATATC  47
      ||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATATATTTTCGGTGATTCTAG-TTGACAAATTTAGAAAATATC  49

seq1  TATTATAAATAGTTTTAGAAACCTGAGTTTCATAGCTAAAGTATTTTTTT  97
      |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TATTATAAATAG-TTTAGAAACC-GAGTTTCATAGCTAAAGTA-TTTTTT  96

seq1  CAGAAGGAAAATTTTGAGATTGCAAAAGAAACCAAATATATAACCCCTGT  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGGAAAATTTTGAGATTGCAAAAGAAACCAAATATATAACCCCTGT  146

seq1  TGTGTATTAGAGACCAATACCAGCTACTATTGACTCCCTTAAGTTGTTGA  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTATTAGAGACCAATACCAGCTACTATTGACTCCCTTAAGTTGTTGA  196

seq1  GAAAAAATTTAACAGGGATGTACAATGAGAAAGAATTGTGTCCTAAATTG  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAAATTTAACAGGGATGTACAATGAGAAAGAATTGTGTCCTAAATTG  246

seq1  TGAGAAGATGTGAACATTAGTTAGAAGAGATCACAAAGATAAGAAGAGGG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAAGATGTGAACATTAGTTAGAAGAGATCACAAAGATAAGAAGAGGG  296

seq1  AAGCAAAGAAAAGCGGAAGAATAAATAATGTGAGACTTAGTGAGAACGAA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAAAGAAAAGCGGAAGAATAAATAATGTGAGACTTAGTGAGAACGAA  346

seq1  TTTGGTTAAAGTGTACTGTAGTCCTTTATTTTTTCTACATGGATCCCTCT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTTAAAGTGTACTGTAGTCCTTTATTTTTTCTACATGGATCCCTCT  396

seq1  ACAGATTCTTGAAGGTAGCAATCACAGCTTAATCCTTTGGTCCTCATAGA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATTCTTGAAGGTAGCAATCACAGCTTAATCCTTTGGTCCTCATAGA  446

seq1  CATAACTCTATGCTGGCATCAAGCAAGTTTAATATTTTTGTTAGAAGAAG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAACTCTATGCTGGCATCAAGCAAGTTTAATATTTTTGTTAGAAGAAG  496

seq1  AGTGACAACATAAATATGAACTACATTTTCTTCTTCATTCGGAATGCTAC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGACAACATAAATATGAACTACATTTTCTTCTTCATTCGGAATGCTAC  546

seq1  CTCTGAATATTCAAAGAATCTATCACTTCTTCTACCAGAACACTCCAGAA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGAATATTCAAAGAATCTATCACTTCTTCTACCAGAACACTCCAGAA  596

seq1  CAAAATTATTGAAAAATTATCTAATCAAAGTGATAATGAAAAATATTCAA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATTATTGAAAAATTATCTAATCAAAGTGATAATGAAAAATATTCAA  646

seq1  GATGTGTTAAGTATAGCCACAAAATGGCAGATCTTATTTGTGCAAAGAAC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTGTTAAGTATAGCCACAAAATGGCAGATCTTATTTGTGCAAAGAAC  696

seq1  GTGTTAAATAATGTTAATATGATTTCATGTAAAATATTGCCACCAGCCCC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTAAATAATGTTAATATGATTTCATGTAAAATATTGCCACCAGCCCC  746

seq1  TGTGCTGCAAGCTTCTGTCTTCAGCTGCTGCTACTGCGGCTGCTGCTTTG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTGCAAGCTTCTGTCTTCAGCTGCTGCTACTGCGGCTGCTGCTTTG  796

seq1  CCTGATTGTGGAAACTTTAGGAGATGGGGCCTCCTAAGGGAGATAGAAAG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGATTGTGGAAACTTTAGGAGATGGGGCCTCCTAAGGGAGATAGAAAG  846

seq1  GAATAGGTTTTGATCAGGCAGGCTGTGTGGGTAATAGCCAGTGCTTTGTC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAGGTTTTGATCAGGCAGGCTGTGTGGGTAATAGCCAGTGCTTTGTC  896

seq1  TCCCTTTCTCTATAGCGTTGTTTTCCAAAAAGTGATAAAACAGCAATGTG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTTCTCTATAGCGTTGTTTTCCAAAAAGTGATAAAACAGCAATGTG  946

seq1  TTTTTAGCACAGCAGCTATAAGCTCTTCTTGACACTAGACCTTCTCAACC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAGCACAGCAGCTATAAGCTCTTCTTGACACTAGACCTTCTCAACC  996

seq1  ATGCTGAATTC  1008
      |||||||||||
seq2  ATGCTGAATTC  1007

seq1: chr2_41769948_41770984
seq2: B6Ng01-061G16.g_70_1098

seq1  GAATTCTCTTGCTTCAGAATTTAATGGATTCAGTCTTCAGAATTGGCGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTGCTTCAGAATTTAATGGATTCAGTCTTCAGAATTGGCGAA  50

seq1  TGTTCTTTATGACATGCAAATATTGAGACTGGAAATTTAAATGGAGTAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTTTATGACATGCAAATATTGAGACTGGAAATTTAAATGGAGTAGG  100

seq1  ACTTGGTGGTAAAGGATGAAGGAACACAGATGTTTCCAGTGTTCTAATTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGGTGGTAAAGGATGAAGGAACACAGATGTTTCCAGTGTTCTAATTC  150

seq1  CAGGTTCTTATGCCTTTCTCATGATGTCTCTGTAATGCTGTCTGTCTCCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTTCTTATGCCTTTCTCATGATGTCTCTGTAATGCTGTCTGTCTCCC  200

seq1  AGCAGACAAGTGAATGTGGATCAGTGTGCTCTGTGAAGATGCTGGACCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGACAAGTGAATGTGGATCAGTGTGCTCTGTGAAGATGCTGGACCAG  250

seq1  TCTGTTGTATGGACTCTATGCCAACTCTTCACAATACACATGTTTGTAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTGTATGGACTCTATGCCAACTCTTCACAATACACATGTTTGTAAG  300

seq1  TGTCTTCTGTGCTAAAAGTAAATTCTCACAGAGTGTACCACCATGATAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTCTGTGCTAAAAGTAAATTCTCACAGAGTGTACCACCATGATAGA  350

seq1  GACAACAGTTCCTGCAACAGGAGCAATCAGGAACAGCAGACTGAGGCTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAACAGTTCCTGCAACAGGAGCAATCAGGAACAGCAGACTGAGGCTGG  400

seq1  ACCCAACACTATGGTTGAATGCCTATATAGCCTGTCACATCAAGAAAGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAACACTATGGTTGAATGCCTATATAGCCTGTCACATCAAGAAAGAA  450

seq1  TCATGAAATTTCTTCAGTTACAATCTACCTTTCCTGTCTCATTTGGCAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGAAATTTCTTCAGTTACAATCTACCTTTCCTGTCTCATTTGGCAAT  500

seq1  GCACTCCTGCTTGTTGTCTGCAATAAGGAACCCTCTTGATCTTGTTTGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTCCTGCTTGTTGTCTGCAATAAGGAACCCTCTTGATCTTGTTTGTT  550

seq1  TGTTTGTTTGCTTGCTTGCTTGTTTTTTGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGTTTGCTTGCTTGCTTGTTTTTTGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAG  600

seq1  CTCTAGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGTCACCAGGCTAACCTCAAACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGTCACCAGGCTAACCTCAAACT  650

seq1  CAGAAATCCATCTACTTCTGCCTCCCAAGTGTTGGGATTAAAGGTGTGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAATCCATCTACTTCTGCCTCCCAAGTGTTGGGATTAAAGGTGTGTG  700

seq1  CCACCACTGTCCAGCCTCTCTTGATCTTATTCATTTACCAGAGTCAAATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CCACCACTGTCCAGCCTCTCTTGATCTTATTCATTTACCAGAGTC-AATG  749

seq1  TTTCTAGGATATTAAAATAGCTATGTGGGATATAAAACCATGCCAGGAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTAGGATATTAAAATAGCTATGTGGGATATAAAACCATGCCAGGAAG  799

seq1  TCTGGTAAGGTAGGTAGGTCGAGAACTGGTGTCTCAGTGGACACACATTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGTAAGGTAGGTAGGTCGAGAACTGGTGTCTCAGTGGACACACATTT  849

seq1  GAGGCTTAAGTGACTTATGCTCCCTGCCAGACTC-CTGACTTGGAACATT  899
      |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||
seq2  GAGG-TTAAGTGACTTATGCTCTCTGCCAGACTCTCTGACTTGG-ACATT  897

seq1  GAAACACAGAAAATAATGTGACTTTTATAGAACTTTACAACTAGATTATA  949
      |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACACA-AAAAT-ATGTGACTTTTATAGAACTTTACAACTAGATTATA  945

seq1  TACATGTTTAATATAAATAGATTTTAATATTGGATATTTTAGTATTGGAT  999
      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| 
seq2  TACATGTTTAATATAAATAGATTTT-ATA-TGGATATTTTAGTATTGGAA  993

seq1  ATTAGATATTCTTTTATATAGTAATTCTTTATTCTTAA  1037
        || ||| |  ||||| ||| ||||||||||||||||
seq2  TATAAATAATTCTTTAT-TAG-AATTCTTTATTCTTAA  1029