BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-062H23
Chromosome2 (Build37)
Map Location 76,471,712 - 76,593,001
singlet/doubletdoublet
Overlap genePrkra, Dfnb59, Fkbp7, Plekha3, Ttn
Upstream geneLOC667828, Hnrpa3, Nfe2l2, E030042O20Rik, LOC623453, Agps, Ttc30b, Ttc30a2, Ttc30a1, Pde11a, Cyct, Drbp1, Osbpl6
Downstream gene2610301F02Rik, Sestd1, LOC623706, LOC667906, Zfp533
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-062H23.bB6Ng01-062H23.g
ACCDH882874DH882875
length1,1601,069
definitionDH882874|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-062H23, 5' end.DH882875|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-062H23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(76,471,712 - 76,472,875)(76,591,915 - 76,593,001)
sequence
gaattcctcaaggagtgccaagtgcatcctagggaatgtccaaccacgtt
cgtctaaaaggcagagaggagggaaacgtcagctccgaaatgggccagtt
ccaacatcagtaccagggtaagtgaacacagatgctcgggggatggagag
atgggtcggggtgaaaaacactggctgcttttccggaggacccagctttg
ttttttatttccagtattatgtatgtctaggagagacactgccaacagaa
atgcttttattttaataaatgttacaacttgagccagagagatggctcag
caggttagggctctttgatgccaaatctaattcctgagtctgatccctgg
gacccatatggaaagaggagagaagtgacaccctttgacctccatacata
tgcaccttgccccctcctacatacctcagtgcagcaaatgcttgcaggtt
gatttctgaactaatttacatacccaccgaccaaagtgcttgcttatcac
actctcaccaacagcagctagttaccaaacagtgtagcttccaccaactt
aaaacagacagaatatcttagttggcatgaatacactgaatatttttcca
ttccttcatatttttcctactagacttttcaaaaaattgatgtatacagg
ctttacacgtatgaaagctgaattctttgcttgttttagttatgttgatt
ttattcatacttttttggctgtatcgtaagttctagtcaaattcatttgc
ttcagattttagatgttaagttacagttaaaaaagactttctatccctaa
gattcttttcaaaagaccgtttgtgtttgccaagacagttctattcatgc
tcaatccttgatctgggatttacttaggcacgaggtttggtatggggata
tgccatctatttacacaaggacacacagacaaatgcactatctcccatcc
tcgcccatggctgtcagctgtctacactgtacctggaccatcccatcctc
acctgtctgtcagctgtccacactgtacctgatttttaaattcccttgct
gccatcacgaggtggcatgcacttgcacacctctgagccgggttccgcct
ctcccacagtaacctggctttataccaggtccacactctgcatatattct
caagggcgag
gaattcaaggaaagaaacagccttctgtggaagagagctaacaagactcc
tataaggatgaaagattttaaagtgacaggattaactgaaggtcttgaat
atgaattcagagttatggctatcaatctagctggagtgggcaagccaagc
ctgccatcagagccagttgtggcacttgatccaattggtaagtcattact
aaagcaaagcctgagggagtgtgctatgctacatgaagcaagcattagtg
gtttgtttgatgggttttcttttctgttttagatcctcctggaaaacctg
aggttatcagcgtaacaaggaattcagtgactctcatctggacagaacct
aaatacgatggtggccataaattaacaggatatatcgtggagaagcggga
tctaccctctaagtcttggatgaaagccaaccatgttaatgtcccagact
gtgcctttactgtaactgatcttgttgaaggtggaaaatatgaattccga
atcagagcaaagaatacagcgggtgctattagtgctccatcagagagcac
aggaaccattatttgcaaggatgaatacggtatgtggaacttacatttct
cccaaatcaaaaagcagaaaattaaaccgccttcattttctgatgaattt
atttatttttcctttgcagaggcaccaaccattgtccttgatccaacaat
taaagatgggctaacagtcaaggcaggggatagcattgttttaagtgcca
ttagcattctcggcaaaccccttccaaagtcaagctggtccagggcagga
aaagatatcagaccatcagacatagctcaaataacttcaaccccaacatc
ttctatgctgacagttaagtatgccacaagaaaggatgctggcgagtata
ccatcaccgctaccaatccttttggcacaaaggaggacatgtgagtatca
gtccttgatgtacctggtcctccaggtctcattgaatcagtatgtttcag
ctgaaaagcacacttacttgacacctccttagagatggggctcacgataa
gcttatgttcttggagaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_76471712_76472875
seq2: B6Ng01-062H23.b_46_1205

seq1  GAATTCCTCAAGGAGTGCCAAGTGCATCCTAGGGAATGTCCAACCACGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCAAGGAGTGCCAAGTGCATCCTAGGGAATGTCCAACCACGTT  50

seq1  CGTCTAAAAGGCAGAGAGGAGGGAAACGTCAGCTCCGAAATGGGCCAGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCTAAAAGGCAGAGAGGAGGGAAACGTCAGCTCCGAAATGGGCCAGTT  100

seq1  CCAACATCAGTACCAGGGTAAGTGAACACAGATGCTCGGGGGATGGAGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACATCAGTACCAGGGTAAGTGAACACAGATGCTCGGGGGATGGAGAG  150

seq1  ATGGGTCGGGGTGAAAAACACTGGCTGCTTTTCCGGAGGACCCAGCTTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGTCGGGGTGAAAAACACTGGCTGCTTTTCCGGAGGACCCAGCTTTG  200

seq1  TTTTTTATTTCCAGTATTATGTATGTCTAGGAGAGACACTGCCAACAGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTATTTCCAGTATTATGTATGTCTAGGAGAGACACTGCCAACAGAA  250

seq1  ATGCTTTTATTTTAATAAATGTTACAACTTGAGCCAGAGAGATGGCTCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTTTATTTTAATAAATGTTACAACTTGAGCCAGAGAGATGGCTCAG  300

seq1  CAGGTTAGGGCTCTTTGATGCCAAATCTAATTCCTGAGTCTGATCCCTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTTAGGGCTCTTTGATGCCAAATCTAATTCCTGAGTCTGATCCCTGG  350

seq1  GACCCATATGGAAAGAGGAGAGAAGTGACACCCTTTGACCTCCATACATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCATATGGAAAGAGGAGAGAAGTGACACCCTTTGACCTCCATACATA  400

seq1  TGCACCTTGCCCCCTCCTACATACCTCAGTGCAGCAAATGCTTGCAGGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACCTTGCCCCCTCCTACATACCTCAGTGCAGCAAATGCTTGCAGGTT  450

seq1  GATTTCTGAACTAATTTACATACCCACCGACCAAAGTGCTTGCTTATCAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTCTGAACTAATTTACATACCCACCGACCAAAGTGCTTGCTTATCAC  500

seq1  ACTCTCACCAACAGCAGCTAGTTACCAAACAGTGTAGCTTCCACCAACTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTCACCAACAGCAGCTAGTTACCAAACAGTGTAGCTTCCACCAACTT  550

seq1  AAAACAGACAGAATATCTTAGTTGGCATGAATACACTGAATATTTTTCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAGACAGAATATCTTAGTTGGCATGAATACACTGAATATTTTTCCA  600

seq1  TTCCTTCATATTTTTCCTACTAGACTTTTCAAAAAATTGATGTATACAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTCATATTTTTCCTACTAGACTTTTCAAAAAATTGATGTATACAGG  650

seq1  CTTTACACGTATGAAAGCTGAATTCTTTGCTTGTTTTAGTTATGTTGATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTACACGTATGAAAGCTGAATTCTTTGCTTGTTTTAGTTATGTTGATT  700

seq1  TTATTCATACTTTTTTGGCTGTATCGTAAGTTCTAGTCAAATTCATTTGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCATACTTTTTTGGCTGTATCGTAAGTTCTAGTCAAATTCATTTGC  750

seq1  TTCAGATTTTAGATGTTAAGTTACAGTTAAAAAAGACTTTCTATCCCTAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGATTTTAGATGTTAAGTTACAGTTAAAAAAGACTTTCTATCCCTAA  800

seq1  GATTCTTTTCAAAAGACCGTTTGTGTTTGCCAAGACAGTTCTATTCATGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCTTTTCAAAAGACCGTTTGTGTTTGCCAAGACAGTTCTATTCATGC  850

seq1  TCAATCCTTGATCTGGGATTTACTTAGGCACGAGGTTTGGTATGGGGATA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATCCTTGATCTGGGATTTACTTAGGCACGAGGTTTGGTATGGGGATA  900

seq1  TGCCATCTATTTACACAAGGACACACAGACAAATGCACTATCTCCCATCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCATCTATTTACACAAGGACACACAGACAAATGCACTATCTCCCATCC  950

seq1  TCGCCCATGGCTGTCAGCTGTCTACACTGTACCTGGACCATCCCATCCTC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCCCATGGCTGTCAGCTGTCTACACTGTACCTGGACCATCCCATCCTC  1000

seq1  ACCTGTCTGTCAGCTGTCCACACTGTACCTGATCTTCTAAAATCCCCTTG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||| ||||||
seq2  ACCTGTCTGTCAGCTGTCCACACTGTACCTGA--TTTTTAAATTCCCTTG  1048

seq1  CTGCCATCACGAGGTGGCCATGCACTTGCACCAACTCCTGAGCCGTGTTC  1100
      ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||| ||||
seq2  CTGCCATCACGAGGTGG-CATGCACTTGCAC--ACCTCTGAGCCGGGTTC  1095

seq1  CG-CTCTCCCACCAGTAACCT-GCTTTATCACAGGTCCACACTCTGCAT-  1147
      || |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| 
seq2  CGCCTCTCCCA-CAGTAACCTGGCTTTATACCAGGTCCACACTCTGCATA  1144

seq1  TATTCTCAGAGGGCGAG  1164
      |||||||| ||||||||
seq2  TATTCTCA-AGGGCGAG  1160

seq1: chr2_76591915_76593001
seq2: B6Ng01-062H23.g_68_1136 (reverse)

seq1  TCTCTCTTCTCAAGAACATAAGCTTTAATCGGTGAGCCCCCATCTTCTAA  50
      ||||||    |||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||
seq2  TCTCTC----CAAGAACATAAGCTT--ATC-GTGAG-CCCCATC-TCTAA  41

seq1  GGGAGGTGTCCAAGTAAGTGTTGCTTTTTCAGCTGAAACATTACTGATTT  100
       |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||
seq2  -GGAGGTGT-CAAGTAAGTG-TGC-TTTTCAGCTGAAACA-TACTGA-TT  85

seq1  CAATGGGACCTGGGGGACCAGGTACATCAAGGACTGATACCTTCACATGT  150
      ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| 
seq2  CAATGAGACCTGGAGGACCAGGTACATCAAGGACTGATAC--TCACATG-  132

seq1  TCCTCCTTTGTGCCAAAAGGATTGGTAGCGGTGATGGTATACTCGCCAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCCTTTGTGCCAAAAGGATTGGTAGCGGTGATGGTATACTCGCCAGC  182

seq1  ATCCTTTCTTGTGGCATACTTAACTGTCAGCATAGAAGATGTTGGGGTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTTTCTTGTGGCATACTTAACTGTCAGCATAGAAGATGTTGGGGTTG  232

seq1  AAGTTATTTGAGCTATGTCTGATGGTCTGATATCTTTTCCTGCCCTGGAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTATTTGAGCTATGTCTGATGGTCTGATATCTTTTCCTGCCCTGGAC  282

seq1  CAGCTTGACTTTGGAAGGGGTTTGCCGAGAATGCTAATGGCACTTAAAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTGACTTTGGAAGGGGTTTGCCGAGAATGCTAATGGCACTTAAAAC  332

seq1  AATGCTATCCCCTGCCTTGACTGTTAGCCCATCTTTAATTGTTGGATCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCTATCCCCTGCCTTGACTGTTAGCCCATCTTTAATTGTTGGATCAA  382

seq1  GGACAATGGTTGGTGCCTCTGCAAAGGAAAAATAAATAAATTCATCAGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAATGGTTGGTGCCTCTGCAAAGGAAAAATAAATAAATTCATCAGAA  432

seq1  AATGAAGGCGGTTTAATTTTCTGCTTTTTGATTTGGGAGAAATGTAAGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAAGGCGGTTTAATTTTCTGCTTTTTGATTTGGGAGAAATGTAAGTT  482

seq1  CCACATACCGTATTCATCCTTGCAAATAATGGTTCCTGTGCTCTCTGATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATACCGTATTCATCCTTGCAAATAATGGTTCCTGTGCTCTCTGATG  532

seq1  GAGCACTAATAGCACCCGCTGTATTCTTTGCTCTGATTCGGAATTCATAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCACTAATAGCACCCGCTGTATTCTTTGCTCTGATTCGGAATTCATAT  582

seq1  TTTCCACCTTCAACAAGATCAGTTACAGTAAAGGCACAGTCTGGGACATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCACCTTCAACAAGATCAGTTACAGTAAAGGCACAGTCTGGGACATT  632

seq1  AACATGGTTGGCTTTCATCCAAGACTTAGAGGGTAGATCCCGCTTCTCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGGTTGGCTTTCATCCAAGACTTAGAGGGTAGATCCCGCTTCTCCA  682

seq1  CGATATATCCTGTTAATTTATGGCCACCATCGTATTTAGGTTCTGTCCAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATATATCCTGTTAATTTATGGCCACCATCGTATTTAGGTTCTGTCCAG  732

seq1  ATGAGAGTCACTGAATTCCTTGTTACGCTGATAACCTCAGGTTTTCCAGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGAGTCACTGAATTCCTTGTTACGCTGATAACCTCAGGTTTTCCAGG  782

seq1  AGGATCTAAAACAGAAAAGAAAACCCATCAAACAAACCACTAATGCTTGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATCTAAAACAGAAAAGAAAACCCATCAAACAAACCACTAATGCTTGC  832

seq1  TTCATGTAGCATAGCACACTCCCTCAGGCTTTGCTTTAGTAATGACTTAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGTAGCATAGCACACTCCCTCAGGCTTTGCTTTAGTAATGACTTAC  882

seq1  CAATTGGATCAAGTGCCACAACTGGCTCTGATGGCAGGCTTGGCTTGCCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTGGATCAAGTGCCACAACTGGCTCTGATGGCAGGCTTGGCTTGCCC  932

seq1  ACTCCAGCTAGATTGATAGCCATAACTCTGAATTCATATTCAAGACCTTC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCAGCTAGATTGATAGCCATAACTCTGAATTCATATTCAAGACCTTC  982

seq1  AGTTAATCCTGTCACTTTAAAATCTTTCATCCTTATAGGAGTCTTGTTAG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAATCCTGTCACTTTAAAATCTTTCATCCTTATAGGAGTCTTGTTAG  1032

seq1  CTCTCTTCCACAGAAGGCTGTTTCTTTCCTTGAATTC  1087
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTTCCACAGAAGGCTGTTTCTTTCCTTGAATTC  1069