BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-067I08
Chromosome2 (Build37)
Map Location 36,660,685 - 36,793,608
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRpl18p, Olfr3, Olfr349-ps1, Olfr350, Olfr351, Olfr352, Olfr353, Olfr354, Olfr355, Olfr356
Upstream geneTtll11, Ndufa8, 1700010A17Rik, Lhx6, Rbm18, LOC100042236, Mrrf, LOC100040493, Ptgs1, Olfr334-ps1, Olfr335, Olfr336-ps1, Olfr337-ps1, Olfr338, LOC675440, Olfr339, Olfr340, Olfr341, Olfr342, Olfr343-ps1, Olfr344, Olfr345, Olfr346, Olfr347, Olfr348, Olfr50
Downstream geneOlfr357, Olfr358, Olfr359-ps1, Olfr360, Olfr361, Olfr362, Olfr364-ps1, Olfr365, Olfr366, Olfr367, Olfr368, Pdcl, Rc3h2, Zbtb6, Zbtb26, Rabgap1, Gpr21, 6430510M02Rik, Strbp, LOC639491, Dennd1a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-067I08.bB6Ng01-067I08.g
ACCDH886383DH886384
length1,120812
definitionDH886383|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067I08, 5' end.DH886384|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067I08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(36,792,470 - 36,793,608)(36,660,685 - 36,661,503)
sequence
gaattccacaaaggatgtatttagctttgtggaggttgcagcaaaatttt
gttcaggaaccttctcaaggcacttgtcatatctttgtttctcaggctat
agatgaatgggttcagcatgggggtcaccacagcatacatcactgatgca
atcctatccctgctagctgaatcagcagcgtatggaatgaaatacacccc
aatagcagacacatagaacaggcagactgctgagagatgggacccacagg
tggagaaggtcttccactttccacttgctgatgggactctcacaatggtg
gccacaatgcggacatatgaaacaatgattaacaaagggatcaagacagt
taatgctcctccccagtagagcagcacacactggttggcataagtgttag
aacaagagagcttcaacatgggaagcagttcacaaaagaaatggagaatg
atgttgtccatgcagaaggataactgagacagcagaatgatgtgggttag
agcatatgaatgggcaaggaatagggatgtcgtcaccagcaggatgcagc
atctgggactcatgaccaaggtgtagtgaaggggatagcatatggccaca
agtctgtcataagccatcactgccaggaggaaaacatctagtccaatgaa
ccacaggaagaaatagatttgagacaggcatccagcataggggatgctat
gcctctgagtttggatgtttaccagcatcctaggaactgtggtagatgat
aaacacatgtcagtgagagagaggttagccaggaagaaatacatgggact
gtggaggtgtggatcagagacaattgccaggatgattagtgtatttccca
ccacagtgacaaggtatatgaccaaaaagatgccaaagagtaaaggttcc
tgttcccagtgctccgagaggcccaggaggagaaattcagaaacactact
gtggtttcttgtcatcataattcagtggactaaaagatagaatgagaaca
cacaccaagaactcttataggatattcgccttgatgggaaagagataaga
caagatgtcataaatgttgtgcttgtgttctctgaaactaatgatctctg
atctgtctgatccatgtacc
gaattcaatgctcatgtccagtggcttggagtgtttatatgtgcataagc
aaggatcctaggctttggggttacacaacaagggaggtgacaaggggaag
ccatctttaaacctgatattgtttgttcagacagtgggacagaatcatgc
aattgaaaggggggactcttctgatccgggaagtaactttatggtactat
ctggaactagtgtgtttttacaaactgatcacagctgtcttaattgccct
tctttcatggcccaagaggggcacttattttttcaagaatgtttggtcct
tgtttccctcaaggataggagccagctgcactgaagaaatgttagttatt
aaggagagtgacagccttgatgacccagaggctaggatatgttgcccttt
ctctgttctcaaagctggcatctaccgctcctcaggtggggctgttcatt
atgtggaagggagatctgtgcaagtggtgagaaaatgcataggcaggttt
cctgtgtcttttcattcatacagttctttctcccatacccaatcccatct
cctctgagaagggttggttccccccaggcacctcaatcactgcagggcta
ggcacatcctctcctactgaagccagacaaggcagctcagttaggggaac
aagatacacaggtaggcaatagagtcagagacaagcccctgctccagttg
ctgggggacctcatgaagaccaagctacgtatctgctacatacacagaca
tacctatgttcagtccatatatgctcttggtagggatatttggtagggat
atatttggaaat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_36792470_36793608
seq2: B6Ng01-067I08.b_43_1162 (reverse)

seq1  GGTACATGTGATCATGACCAGATCAGAGGATCAATTTAGGTCTCAGAGAA  50
      |||||||| ||||| || ||||||||| |||||  ||| || ||||||||
seq2  GGTACATG-GATCA-GA-CAGATCAGA-GATCA--TTA-GTTTCAGAGAA  43

seq1  CACATAGCCACCAACAATTTAATGACATCTTGTCTTTATCCTCTGTTCCC  100
      |||| |||   |||||  || ||||||||||||| |||| |||| |||||
seq2  CACA-AGC--ACAACA--TTTATGACATCTTGTC-TTAT-CTCT-TTCCC  85

seq1  ATCAAGGCG-ATATCCTAATAAGAGTTCTTGGTGTGTTGTTCTTCATTCT  149
      ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||
seq2  ATCAAGGCGAATATCCT-ATAAGAGTTCTTGGTGTG-TGTTC-TCATTCT  132

seq1  ATCTTTTAGTTCCCACTGAATTATGATGACAAGAAACCACAGTAGTGTTT  199
      ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTTAGT--CCACTGAATTATGATGACAAGAAACCACAGTAGTGTTT  180

seq1  CTGAATTTCTCCTCCTGGGCCTCTCGGAGCACTGGGAACAGGAACCTTTA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAATTTCTCCTCCTGGGCCTCTCGGAGCACTGGGAACAGGAACCTTTA  230

seq1  CTCTTTGGCATCTTTTTGGTCATATACCTTGTCACTGTGGTGGGAAATAC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTGGCATCTTTTTGGTCATATACCTTGTCACTGTGGTGGGAAATAC  280

seq1  ACTAATCATCCTGGCAATTGTCTCTGATCCACACCTCCACAGTCCCATGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAATCATCCTGGCAATTGTCTCTGATCCACACCTCCACAGTCCCATGT  330

seq1  ATTTCTTCCTGGCTAACCTCTCTCTCACTGACATGTGTTTATCATCTACC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCTTCCTGGCTAACCTCTCTCTCACTGACATGTGTTTATCATCTACC  380

seq1  ACAGTTCCTAGGATGCTGGTAAACATCCAAACTCAGAGGCATAGCATCCC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTTCCTAGGATGCTGGTAAACATCCAAACTCAGAGGCATAGCATCCC  430

seq1  CTATGCTGGATGCCTGTCTCAAATCTATTTCTTCCTGTGGTTCATTGGAC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGCTGGATGCCTGTCTCAAATCTATTTCTTCCTGTGGTTCATTGGAC  480

seq1  TAGATGTTTTCCTCCTGGCAGTGATGGCTTATGACAGACTTGTGGCCATA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATGTTTTCCTCCTGGCAGTGATGGCTTATGACAGACTTGTGGCCATA  530

seq1  TGCTATCCCCTTCACTACACCTTGGTCATGAGTCCCAGATGCTGCATCCT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTATCCCCTTCACTACACCTTGGTCATGAGTCCCAGATGCTGCATCCT  580

seq1  GCTGGTGACGACATCCCTATTCCTTGCCCATTCATATGCTCTAACCCACA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGTGACGACATCCCTATTCCTTGCCCATTCATATGCTCTAACCCACA  630

seq1  TCATTCTGCTGTCTCAGTTATCCTTCTGCATGGACAACATCATTCTCCAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTCTGCTGTCTCAGTTATCCTTCTGCATGGACAACATCATTCTCCAT  680

seq1  TTCTTTTGTGAACTGCTTCCCATGTTGAAGCTCTCTTGTTCTAACACTTA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTTGTGAACTGCTTCCCATGTTGAAGCTCTCTTGTTCTAACACTTA  730

seq1  TGCCAACCAGTGTGTGCTGCTCTACTGGGGAGGAGCATTAACTGTCTTGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAACCAGTGTGTGCTGCTCTACTGGGGAGGAGCATTAACTGTCTTGA  780

seq1  TCCCTTTGTTAATCATTGTTTCATATGTCCGCATTGTGGCCACCATTGTG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTTGTTAATCATTGTTTCATATGTCCGCATTGTGGCCACCATTGTG  830

seq1  AGAGTCCCATCAGCAAGTGGAAAGTGGAAGACCTTCTCCACCTGTGGGTC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTCCCATCAGCAAGTGGAAAGTGGAAGACCTTCTCCACCTGTGGGTC  880

seq1  CCATCTCTCAGCAGTCTGCCTGTTCTATGTGTCTGCTATTGGGGTGTATT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTCTCAGCAGTCTGCCTGTTCTATGTGTCTGCTATTGGGGTGTATT  930

seq1  TCATTCCATACGCTGCTGATTCAGCTAGCAGGGATAGGATTGCATCAGTG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTCCATACGCTGCTGATTCAGCTAGCAGGGATAGGATTGCATCAGTG  980

seq1  ATGTATGCTGTGGTGACCCCCATGCTGAACCCATTCATCTATAGCCTGAG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATGCTGTGGTGACCCCCATGCTGAACCCATTCATCTATAGCCTGAG  1030

seq1  AAACAAAGATATGACAAGTGCCTTGAGAAGGTTCCTGAACAAAATTTTGC  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAAGATATGACAAGTGCCTTGAGAAGGTTCCTGAACAAAATTTTGC  1080

seq1  TGCAACCTCCACAAAGCTAAATACATCCTTTGTGGAATTC  1139
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAACCTCCACAAAGCTAAATACATCCTTTGTGGAATTC  1120

seq1: chr2_36660685_36661503
seq2: B6Ng01-067I08.g_68_879

seq1  GAATTCAATGCTCATGTCCAGTGGCTTGGAGTGTTTATATGTGCATAAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATGCTCATGTCCAGTGGCTTGGAGTGTTTATATGTGCATAAGC  50

seq1  AAGGATCCTAGGCTTTGGGGTTACACAACAAGGGAGGTGACAAGGGGAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGATCCTAGGCTTTGGGGTTACACAACAAGGGAGGTGACAAGGGGAAG  100

seq1  CCATCTTTAAACCTGATATTGTTTGTTCAGACAGTGGGACAGAATCATGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTTTAAACCTGATATTGTTTGTTCAGACAGTGGGACAGAATCATGC  150

seq1  AATTGAAAGGGGGGACTCTTCTGATCCGGGAAGTAACTTTATGGTACTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGAAAGGGGGGACTCTTCTGATCCGGGAAGTAACTTTATGGTACTAT  200

seq1  CTGGAACTAGTGTGTTTTTACAAACTGATCACAGCTGTCTTAATTGCCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAACTAGTGTGTTTTTACAAACTGATCACAGCTGTCTTAATTGCCCT  250

seq1  TCTTTCATGGCCCAAGAGGGGCACTTATTTTTTCAAGAATGTTTGGTCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCATGGCCCAAGAGGGGCACTTATTTTTTCAAGAATGTTTGGTCCT  300

seq1  TGTTTCCCTCAAGGATAGGAGCCAGCTGCACTGAAGAAATGTTAGTTATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCCCTCAAGGATAGGAGCCAGCTGCACTGAAGAAATGTTAGTTATT  350

seq1  AAGGAGAGTGACAGCCTTGATGACCCAGAGGCTAGGATATGTTGCCCTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAGAGTGACAGCCTTGATGACCCAGAGGCTAGGATATGTTGCCCTTT  400

seq1  CTCTGTTCTCAAAGCTGGCATCTACCGCTCCTCAGGTGGGGCTGTTCATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTTCTCAAAGCTGGCATCTACCGCTCCTCAGGTGGGGCTGTTCATT  450

seq1  ATGTGGAAGGGAGATCTGTGCAAGTGGTGAGAAAATGCATAGGCAGGTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGGAAGGGAGATCTGTGCAAGTGGTGAGAAAATGCATAGGCAGGTTT  500

seq1  CCTGTGTCTTTTCATTCATACAGTTCTTTCTCCCATACCCAATCCCATCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGTCTTTTCATTCATACAGTTCTTTCTCCCATACCCAATCCCATCT  550

seq1  CCTCTGAGAAGGGTTGGTTCCCCCCAGGCACCTCAATCACTGCAGGGCTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGAGAAGGGTTGGTTCCCCCCAGGCACCTCAATCACTGCAGGGCTA  600

seq1  GGCACATCCTCTCCTACTGAAGCCAGACAAGGCAGCTCAGTTAGGGGAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACATCCTCTCCTACTGAAGCCAGACAAGGCAGCTCAGTTAGGGGAAC  650

seq1  AAGATACACAGGTAGGCAATAGAGTCAGAGACAAGCCCCTGCTCCAGTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATACACAGGTAGGCAATAGAGTCAGAGACAAGCCCCTGCTCCAGTTG  700

seq1  CTGGGGGACCCTCATGAAGACCAAGCTACGTATCTGCTACATACACAGAC  750
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGGA-CCTCATGAAGACCAAGCTACGTATCTGCTACATACACAGAC  749

seq1  ATACCTATGTTCAGTCCATATATGCTCTTTGGTAGGGGATAATTTGGTAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| 
seq2  ATACCTATGTTCAGTCCATATATGCTC-TTGGTA-GGGAT-ATTTGGTA-  795

seq1  GGGATAATAATTTGGAAAT  819
      ||||||   ||||||||||
seq2  GGGATA--TATTTGGAAAT  812