BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-070C02
Chromosome2 (Build37)
Map Location 133,662,532 - 133,757,344
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneMcm8, Crls1, B430119L13Rik, 5830467P10Rik, LOC668908, LOC100043785, A430048G15Rik, Bmp2
Downstream geneHao1, Txndc13, LOC627897, LOC433478, Plcb1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-070C02.bB6Ng01-070C02.g
ACCDH888224DH888225
length1,0961,112
definitionDH888224|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-070C02, 5' end.DH888225|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-070C02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(133,756,249 - 133,757,344)(133,662,532 - 133,663,653)
sequence
gaattctagtagattgtgcccttccatgtgggtgttgggaactaaccctg
tgtctacagaagcagcaagatatttttactggtgacatatctctcccttt
ttatttaaaaaatgttttattagtgtatattcattgctctaagcagaggg
tttcataagaggaacttgttcaaacacaccatgtgcactgaccacgccca
ctcatcactaccctatcttgcctctccatcagtctatcagccacactcct
ctccccaataatactccttttttccagtgctatgtattgtgcttgtgtat
gtatatatgaatgcttacacatctatatacacctatgcatatttttatgc
aggagagtaaccctagggtccacttctaagacataaagataataattttc
atttttgatcagggctcatttgattaacatgatctcctataaaacccatt
ttctgaaatgaaagaacccttatttatagtttaatgaaactttgctgatt
atttaggtcatgttttcattactcctttatctattaatgaacatgaaggc
tgatgctataacttggcggtggtgaaaagtgcttctataagcacaaatgg
gaatatctataatgagcagaaatggtttgattcaattatctgatagttct
attttttataagttttaaatttttttaaaaatttgatgttatacacaatt
tctcccttctctttcacccctacaagccctcccataagtcctctctgctc
ttcaaattcaaggcctcttttgaagaacctctgtagtgatttcaagagag
ggtgcactatgttacattgccaccctaaaagtgagcctttgcccccatgt
ccttgccagcattttttatttattgactttgaatgatagacattctgact
ggggtaagatgttctctcactggagtttgggtccttatttccttgataac
atttttcatgtgccttgcatctgtacttcatcatctgagaatagtctact
cattattttgtgaaacttttgtggcttacttttatgagttcttttatgta
ttctagctactcattggtgttgtcagataaaagctgccagaatttc
gaattcagtgacctcctaatggaagtacaggtgttgaaaattcaagtggc
tgttataattaaggatatgaaagcaatgttgggtaaaaaggctgctttgt
gttgatttgtggattatattttgagtgtattgaatgtttataaggagaaa
aatgaaaagataaggcccattaaggctcatttgaagttgtggtatgagaa
ccagacagtatcatgggaatcagacagtcatgtcagtcttaaaatgactt
ttctctggtaggtacaagacttaaatcacagaatatatccatttgtttct
gctatgataataaaactgatttggtggcatataaaaaatagttacttctt
ctggttatggagaccaggaagccctgcctcattgtactttaacctgtcaa
gagtcttaccattgtgtcataatatgatgaagggcataatgtcatgagac
agcccacacacagtgaagaaaggacaagagagaagactgtgcaaagcctc
agcctcctgagaccatcacacagtcaatgctgtcctgcctcagtttagga
gatcttcaaagcacgccctgaagccaaactattgaattgtgagagttctt
gagttctagcaattatgtagtaattgccttatggcaactcactctttcat
gttaaagctcattaacaaacagggaaataaagggattctgaaatttggaa
tgggggggggtctgattgaacccaggtgaaagtgctaccgtagaagtact
cctgaggctctctatcattgtagactgcttgcaagctggcattctggtct
tctttcagcctgaaaactatggtaaccttggggttaggtatcttgagagt
tgtgcttattcgtatcccccagcatggtccatagtaagtgttagatggta
taaccctgggtgggaacattaagatcttcttatacctgggaaatgtgtga
gaaatgttccaaaatttaggagtcaagtaaggaacatactatagattgtg
ctgaattcattacaggagaaccattaccatgcagggcgattctgaagaac
agaataagaagtccacagagcaaacttaataagtcatctcctattgttat
tcacttacattc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_133756249_133757344
seq2: B6Ng01-070C02.b_42_1137 (reverse)

seq1  GAAATTCCTGGCAGCTTTATATCTGAC-ACA-CAATGAGTAGCTAGAATA  48
      |||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||
seq2  GAAATT-CTGGCAGCTTT-TATCTGACAACACCAATGAGTAGCTAGAATA  48

seq1  CAT-AAAGAACTCATAAAAGTAAG-CACAAAAGTTTTCACAAAATAATGA  96
      ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
seq2  CATAAAAGAACTCATAAAAGTAAGCCACAAAAG-TTTCACAAAATAATGA  97

seq1  GTAGACTATTCTCAGATGATGAAGTACAGATGCAAGGCACATGAAAAATG  146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGACTATTCTCAGATGATGAAGTACAGATGCAAGGCACATGAAAAATG  147

seq1  TTTATCAAGGAAATAAGGACCCAAACTCCAGTGAGAGAACATCTTACCCC  196
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -TTATCAAGGAAATAAGGACCCAAACTCCAGTGAGAGAACATCTTACCCC  196

seq1  AGTCAGAATGTCTATCATTCAAAGTCAATAAATAAAAAATGCTGGCAAGG  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGAATGTCTATCATTCAAAGTCAATAAATAAAAAATGCTGGCAAGG  246

seq1  ACATGGGGGCAAAGGCTCACTTTTAGGGTGGCAATGTAACATAGTGCACC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGGGGCAAAGGCTCACTTTTAGGGTGGCAATGTAACATAGTGCACC  296

seq1  CTCTCTTGAAATCACTACAGAGGTTCTTCAAAAGAGGCCTTGAATTTGAA  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTTGAAATCACTACAGAGGTTCTTCAAAAGAGGCCTTGAATTTGAA  346

seq1  GAGCAGAGAGGACTTATGGGAGGGCTTGTAGGGGTGAAAGAGAAGGGAGA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGAGAGGACTTATGGGAGGGCTTGTAGGGGTGAAAGAGAAGGGAGA  396

seq1  AATTGTGTATAACATCAAATTTTTAAAAAAATTTAAAACTTATAAAAAAT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGTGTATAACATCAAATTTTTAAAAAAATTTAAAACTTATAAAAAAT  446

seq1  AGAACTATCAGATAATTGAATCAAACCATTTCTGCTCATTATAGATATTC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTATCAGATAATTGAATCAAACCATTTCTGCTCATTATAGATATTC  496

seq1  CCATTTGTGCTTATAGAAGCACTTTTCACCACCGCCAAGTTATAGCATCA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTGTGCTTATAGAAGCACTTTTCACCACCGCCAAGTTATAGCATCA  546

seq1  GCCTTCATGTTCATTAATAGATAAAGGAGTAATGAAAACATGACCTAAAT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTCATGTTCATTAATAGATAAAGGAGTAATGAAAACATGACCTAAAT  596

seq1  AATCAGCAAAGTTTCATTAAACTATAAATAAGGGTTCTTTCATTTCAGAA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAGCAAAGTTTCATTAAACTATAAATAAGGGTTCTTTCATTTCAGAA  646

seq1  AATGGGTTTTATAGGAGATCATGTTAATCAAATGAGCCCTGATCAAAAAT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGGTTTTATAGGAGATCATGTTAATCAAATGAGCCCTGATCAAAAAT  696

seq1  GAAAATTATTATCTTTATGTCTTAGAAGTGGACCCTAGGGTTACTCTCCT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATTATTATCTTTATGTCTTAGAAGTGGACCCTAGGGTTACTCTCCT  746

seq1  GCATAAAAATATGCATAGGTGTATATAGATGTGTAAGCATTCATATATAC  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAAAAATATGCATAGGTGTATATAGATGTGTAAGCATTCATATATAC  796

seq1  ATACACAAGCACAATACATAGCACTGGAAAAAAGGAGTATTATTGGGGAG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACACAAGCACAATACATAGCACTGGAAAAAAGGAGTATTATTGGGGAG  846

seq1  AGGAGTGTGGCTGATAGACTGATGGAGAGGCAAGATAGGGTAGTGATGAG  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGTGTGGCTGATAGACTGATGGAGAGGCAAGATAGGGTAGTGATGAG  896

seq1  TGGGCGTGGTCAGTGCACATGGTGTGTTTGAACAAGTTCCTCTTATGAAA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCGTGGTCAGTGCACATGGTGTGTTTGAACAAGTTCCTCTTATGAAA  946

seq1  CCCTCTGCTTAGAGCAATGAATATACACTAATAAAACATTTTTTAAATAA  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTGCTTAGAGCAATGAATATACACTAATAAAACATTTTTTAAATAA  996

seq1  AAAGGGAGAGATATGTCACCAGTAAAAATATCTTGCTGCTTCTGTAGACA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGGAGAGATATGTCACCAGTAAAAATATCTTGCTGCTTCTGTAGACA  1046

seq1  CAGGGTTAGTTCCCAACACCCACATGGAAGGGCACAATCTACTAGAATTC  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGTTAGTTCCCAACACCCACATGGAAGGGCACAATCTACTAGAATTC  1096

seq1: chr2_133662532_133663653
seq2: B6Ng01-070C02.g_67_1178

seq1  GAATTCAGTGACCTCCTAATGGAAGTACAGGTGTTGAAAATTCAAGTGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTGACCTCCTAATGGAAGTACAGGTGTTGAAAATTCAAGTGGC  50

seq1  TGTTATAATTAAGGATATGAAAGCAATGTTGGGTAAAAAGGCTGCTTTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATAATTAAGGATATGAAAGCAATGTTGGGTAAAAAGGCTGCTTTGT  100

seq1  GTTGATTTGTGGATTATATTTTGAGTGTATTGAATGTTTATAAGGAGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGATTTGTGGATTATATTTTGAGTGTATTGAATGTTTATAAGGAGAAA  150

seq1  AATGAAAAGATAAGGCCCATTAAGGCTCATTTGAAGTTGTGGTATGAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAAAAGATAAGGCCCATTAAGGCTCATTTGAAGTTGTGGTATGAGAA  200

seq1  CCAGACAGTATCATGGGAATCAGACAGTCATGTCAGTCTTAAAATGACTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGACAGTATCATGGGAATCAGACAGTCATGTCAGTCTTAAAATGACTT  250

seq1  TTCTCTGGTAGGTACAAGACTTAAATCACAGAATATATCCATTTGTTTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTGGTAGGTACAAGACTTAAATCACAGAATATATCCATTTGTTTCT  300

seq1  GCTATGATAATAAAACTGATTTGGTGGCATATAAAAAATAGTTACTTCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATGATAATAAAACTGATTTGGTGGCATATAAAAAATAGTTACTTCTT  350

seq1  CTGGTTATGGAGACCAGGAAGCCCTGCCTCATTGTACTTTAACCTGTCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTATGGAGACCAGGAAGCCCTGCCTCATTGTACTTTAACCTGTCAA  400

seq1  GAGTCTTACCATTGTGTCATAATATGATGAAGGGCATAATGTCATGAGAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCTTACCATTGTGTCATAATATGATGAAGGGCATAATGTCATGAGAC  450

seq1  AGCCCACACACAGTGAAGAAAGGACAAGAGAGAAGACTGTGCAAAGCCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCACACACAGTGAAGAAAGGACAAGAGAGAAGACTGTGCAAAGCCTC  500

seq1  AGCCTCCTGAGACCATCACACAGTCAATGCTGTCCTGCCTCAGTTTAGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCCTGAGACCATCACACAGTCAATGCTGTCCTGCCTCAGTTTAGGA  550

seq1  GATCTTCAAAGCACGCCCTGAAGCCAAACTATTGAATTGTGAGAGTTCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTTCAAAGCACGCCCTGAAGCCAAACTATTGAATTGTGAGAGTTCTT  600

seq1  GAGTTCTAGCAATTATGTAGTAATTGCCTTATGGCAACTCACTCTTTCAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTCTAGCAATTATGTAGTAATTGCCTTATGGCAACTCACTCTTTCAT  650

seq1  GTTAAAGCTCATTAACAAACAGGGAAATAAAGGGATTCTGAAATTTGGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAAGCTCATTAACAAACAGGGAAATAAAGGGATTCTGAAATTTGGAA  700

seq1  TGGGGGGGGGTCTGATTGAACCCAGGTGAAAGTGCTACCGTAGAAGTACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGGGGGGTCTGATTGAACCCAGGTGAAAGTGCTACCGTAGAAGTACT  750

seq1  CCTGAGGCTCTCTATCATTGTAGACTGCTTGCAAGCTGGCATTCTGGTCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGGCTCTCTATCATTGTAGACTGCTTGCAAGCTGGCATTCTGGTCT  800

seq1  TC-TTCAGCCTGAAAACTATGGTAACCTTGGGGTTAGGTATCTTGAGAGT  849
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCAGCCTGAAAACTATGGTAACCTTGGGGTTAGGTATCTTGAGAGT  850

seq1  TGTGCTTATTCGTATCCCCCAGCATGGTCCATAGTAAGTGTTAGATGGTA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTTATTCGTATCCCCCAGCATGGTCCATAGTAAGTGTTAGATGGTA  900

seq1  TAA-CCTGGGT-GGAACATTAAGATCTTCTTAATACCTGGGAAATGTGTG  947
      ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TAACCCTGGGTGGGAACATTAAGATCTTCTT-ATACCTGGGAAATGTGTG  949

seq1  AGAAATGTTCCAAAAATTTTAGGAGTCAAAGTAAGGAACATACTAATAGA  997
      |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||
seq2  AGAAATGTTCCAAAA--TTTAGGAGTC-AAGTAAGGAACATACT-ATAGA  995

seq1  TTGTGCTGAATTCATTAACAGGAGGACCCATTACCATGCAGGGGCGATTC  1047
      |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||
seq2  TTGTGCTGAATTCATT-ACAGGA-GAACCATTACCATGCA-GGGCGATTC  1042

seq1  TGAAGAACAGAAATAAAGAAAGTCCACAAGAAGGCAAACTTAATAAAGCA  1097
      |||||||||| |||||   |||||||| |||  |||||||||||||  ||
seq2  TGAAGAACAG-AATAA--GAAGTCCAC-AGA--GCAAACTTAATAAGTCA  1086

seq1  -CTCACTATTGTTATTCAC-TACATTC  1122
       ||| |||||||||||||| |||||||
seq2  TCTC-CTATTGTTATTCACTTACATTC  1112