BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-071N12
Chromosome2 (Build37)
Map Location 128,682,523 - 128,823,079
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1600015H20Rik, Zc3h8, LOC100043735, LOC100043736
Upstream geneAcoxl, Bcl2l11, LOC100043424, LOC100043729, LOC383791, LOC100043730, Gm355, Anapc1, Mertk, Tmem87b
Downstream geneZc3h6, LOC668894, Ttl, LOC100043738, Rpo1-2, Chchd5, LOC545461, LOC100043431, Slc20a1, A730036I17Rik, LOC671466, Ckap2l, Il1a, Il1b, OTTMUSG00000015529, LOC668896, F830045P16Rik, Sirpa, Pdyn, Ppia-ps2_1620.1, Stk35
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-071N12.bB6Ng01-071N12.g
ACCDH889425DH889426
length1,055655
definitionDH889425|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-071N12, 5' end.DH889426|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-071N12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,682,523 - 128,683,571)(128,822,426 - 128,823,079)
sequence
gaattcaggtgagaataatcttgacagtagttcctcaaaatcagtttata
cccaggcaaacatacccaaattactcagcagatggtgccaaataccagct
ctgaagaattgtttccttgcctttaaccaactaataaatgcagtttttac
ttactaaatgtccttctgccaatttgaagatgaaggaaaagaccttaaag
aaattaagcatgctacatttaaaaagtgtttatttacttttgtagacagg
ttctctttacatagccctgactgcaatggaactcactctgtagaccaggc
cggccttgaactcagacaccctccagcctctgcttccagagtgctaggat
caaaggtgtgtgccaccacacctggcctatgctatggacttaaacgttga
acttttaaaatctgtttaagaataggcatgaatccctagatacaatcccc
agtaccacaaaataatggaggaaggagctctacagagcagggtagctgga
cataggtgtgggagagaaatgggaaaaggaggtacagggggaattgacag
ggaaagtggtgagagaggccaatatgaagggagaacagggaggaaggata
aacagcattaagggtgtttggaaagccttagggaagcattgttttatatt
aacttaaaaatacattgtgtctacacatattagatgatagataatagaag
atagacagacaggtagatgatagagtttgaatgaagtaatggcacttaga
gtgtcagttctcttccccaagaactaacaaaaaccttactatccagccta
ggaattctcccttcaaattgctggttagtggaaatctagaagactcccaa
aacaatataggccattgctactgccctttgctctcttacagaacttaaag
atgagaccctattgccgaacacacctgtgatggtttgtatatgcttggcc
cagggagtggcactattagaaggtatggccttgttggagtagtgtgtcac
tgtgggtgtgagctttagactttcatcctagctggaagtcagtctttcac
tagca
gaattcaggtcatcgcatagaaattccttttccaaaggaaaaggtataag
gccctggaggcacagcacatgaaggccaggccctgactctaggaccttca
acaatcaggctctgcccacagaacactcactatattaggtctagaggaca
aacccagcccctccagacacaagtggctaagctctaccctacagaataaa
aagcctgctctctattccagggcttgaatcccaccaatccccactctgga
aagccccacctctaagaaatgttacataaaactgcctccccctcagttct
ttgctgcttctccctaagcagaggcaaccaaccctcatgtgtctttccca
gtaaatcttttgaatgaggtttgttgtgcagtgtgattttgtgattattc
tctggtaaccgggatacacgttatctttccctcagacatatgacacttac
aaaaggcctttctaagaataaaaggaaacagtaaaggggcttagggagaa
tacaggaaatatgcatatatcaaacactgaaagttcaaatatgagagggg
tgcactggaggtgggtggggagggagaggaaagatagggttgagggtggg
aatgtgcaaagatacatctggaattgaggattgttttgaagaacgatttt
aaaac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_128682523_128683571
seq2: B6Ng01-071N12.b_43_1089

seq1  GAATTCAGGTGAGAATAATCTTGACAGTAGTTCCTCAAAATCAGTTTATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGTGAGAATAATCTTGACAGTAGTTCCTCAAAATCAGTTTATA  50

seq1  CCCAGGCAAACATACCCAAATTACTCAGCAGATGGTGCCAAATACCAGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGCAAACATACCCAAATTACTCAGCAGATGGTGCCAAATACCAGCT  100

seq1  CTGAAGAATTGTTTCCTTGCCTTTAACCAACTAATAAATGCAGTTTTTAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGAATTGTTTCCTTGCCTTTAACCAACTAATAAATGCAGTTTTTAC  150

seq1  TTACTAAATGTCCTTCTGCCAATTTGAAGATGAAGGAAAAGACCTTAAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTAAATGTCCTTCTGCCAATTTGAAGATGAAGGAAAAGACCTTAAAG  200

seq1  AAATTAAGCATGCTACATTTAAAAAGTGTTTATTTACTTTTGTAGACAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTAAGCATGCTACATTTAAAAAGTGTTTATTTACTTTTGTAGACAGG  250

seq1  TTCTCTTTACATAGCCCTGACTGCAATGGAACTCACTCTGTAGACCAGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTTTACATAGCCCTGACTGCAATGGAACTCACTCTGTAGACCAGGC  300

seq1  CGGCCTTGAACTCAGACACCCTCCAGCCTCTGCTTCCAGAGTGCTAGGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCCTTGAACTCAGACACCCTCCAGCCTCTGCTTCCAGAGTGCTAGGAT  350

seq1  CAAAGGTGTGTGCCACCACACCTGGCCTATGCTATGGACTTAAACGTTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGTGTGTGCCACCACACCTGGCCTATGCTATGGACTTAAACGTTGA  400

seq1  ACTTTTAAAATCTGTTTAAGAATAGGCATGAATCCCTAGATACAATCCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTAAAATCTGTTTAAGAATAGGCATGAATCCCTAGATACAATCCCC  450

seq1  AGTACCACAAAATAATGGAGGAAGGAGCTCTACAGAGCAGGGTAGCTGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACCACAAAATAATGGAGGAAGGAGCTCTACAGAGCAGGGTAGCTGGA  500

seq1  CATAGGTGTGGGAGAGAAATGGGAAAAGGAGGTACAGGGGGAATTGACAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGGTGTGGGAGAGAAATGGGAAAAGGAGGTACAGGGGGAATTGACAG  550

seq1  GGAAAGTGGTGAGAGAGGCCAATATGAAGGGAGAACAGGGAGGAAGGATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGTGGTGAGAGAGGCCAATATGAAGGGAGAACAGGGAGGAAGGATA  600

seq1  AACAGCATTAAGGGTGTTTGGAAAGCCTTAGGGAAGCATTGTTTTATATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGCATTAAGGGTGTTTGGAAAGCCTTAGGGAAGCATTGTTTTATATT  650

seq1  AACTTAAAAATACATTGTGTCTACACATATTAGATGATAGATAATAGAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTAAAAATACATTGTGTCTACACATATTAGATGATAGATAATAGAAG  700

seq1  ATAGACAGACAGGTAGATGATAGAGTTTGAATGAAGTAATGGCACTTAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGACAGACAGGTAGATGATAGAGTTTGAATGAAGTAATGGCACTTAGA  750

seq1  GTGTCAGTTCTCTTCCCCAAGAACTAACAAAAACCTTACTATCCAGCCTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCAGTTCTCTTCCCCAAGAACTAACAAAAACCTTACTATCCAGCCTA  800

seq1  GGAATTCTCCCTTCAAATTGCTGGTTAGTGGAAATCTAGAAGACTCCCAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATTCTCCCTTCAAATTGCTGGTTAGTGGAAATCTAGAAGACTCCCAA  850

seq1  AACAATATAGGCCATTGCTACTGCCCTTTGCTCTCTTACAGAACTTAAAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATATAGGCCATTGCTACTGCCCTTTGCTCTCTTACAGAACTTAAAG  900

seq1  ATGAGACCCTATTGCCGAACACACCTGTGATGGTTTGTATATGCTTGGCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGACCCTATTGCCGAACACACCTGTGATGGTTTGTATATGCTTGGCC  950

seq1  CAGGGAGTGGCACTATTAGAAGGTATGGCCTTGTTGGAGTAGGTGTGTCA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CAGGGAGTGGCACTATTAGAAGGTATGGCCTTGTTGGAGTA-GTGTGTCA  999

seq1  CTGTGGGTGTGAGCTTTAAGACTTTCATCCTAGCTGGAAGTCAGTCTTT  1049
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGGTGTGAGCTTT-AGACTTTCATCCTAGCTGGAAGTCAGTCTTT  1047

seq1: chr2_128822426_128823079
seq2: B6Ng01-071N12.g_66_720 (reverse)

seq1  GTTTTCAAATCGTTCTTC-AAACAGTCCTCAATTCCAGATGTCTCTCTGC  49
      ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||
seq2  GTTTTAAAATCGTTCTTCAAAACAATCCTCAATTCCAGATGTATCTTTGC  50

seq1  ACATTCCCACCCTCAACCCTATCTTTCCTCTCCCTCCCCACCCACCTCCA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCCCACCCTCAACCCTATCTTTCCTCTCCCTCCCCACCCACCTCCA  100

seq1  GTGCACCCCTCTCATATTTGAACTTTCAGTGTTTGATATATGCATATTTC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCACCCCTCTCATATTTGAACTTTCAGTGTTTGATATATGCATATTTC  150

seq1  CTGTATTCTCCCTAAGCCCCTTTACTGTTTCCTTTTATTCTTAGAAAGGC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTATTCTCCCTAAGCCCCTTTACTGTTTCCTTTTATTCTTAGAAAGGC  200

seq1  CTTTTGTAAGTGTCATATGTCTGAGGGAAAGATAACGTGTATCCCGGTTA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGTAAGTGTCATATGTCTGAGGGAAAGATAACGTGTATCCCGGTTA  250

seq1  CCAGAGAATAATCACAAAATCACACTGCACAACAAACCTCATTCAAAAGA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGAATAATCACAAAATCACACTGCACAACAAACCTCATTCAAAAGA  300

seq1  TTTACTGGGAAAGACACATGAGGGTTGGTTGCCTCTGCTTAGGGAGAAGC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTGGGAAAGACACATGAGGGTTGGTTGCCTCTGCTTAGGGAGAAGC  350

seq1  AGCAAAGAACTGAGGGGGAGGCAGTTTTATGTAACATTTCTTAGAGGTGG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAAGAACTGAGGGGGAGGCAGTTTTATGTAACATTTCTTAGAGGTGG  400

seq1  GGCTTTCCAGAGTGGGGATTGGTGGGATTCAAGCCCTGGAATAGAGAGCA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTTCCAGAGTGGGGATTGGTGGGATTCAAGCCCTGGAATAGAGAGCA  450

seq1  GGCTTTTTATTCTGTAGGGTAGAGCTTAGCCACTTGTGTCTGGAGGGGCT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTTTTATTCTGTAGGGTAGAGCTTAGCCACTTGTGTCTGGAGGGGCT  500

seq1  GGGTTTGTCCTCTAGACCTAATATAGTGAGTGTTCTGTGGGCAGAGCCTG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTTGTCCTCTAGACCTAATATAGTGAGTGTTCTGTGGGCAGAGCCTG  550

seq1  ATTGTTGAAGGTCCTAGAGTCAGGGCCTGGCCTTCATGTGCTGTGCCTCC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTTGAAGGTCCTAGAGTCAGGGCCTGGCCTTCATGTGCTGTGCCTCC  600

seq1  AGGGCCTTATACCTTTTCCTTTGGAAAAGGAATTTCTATGCGATGACCTG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCCTTATACCTTTTCCTTTGGAAAAGGAATTTCTATGCGATGACCTG  650

seq1  AATTC  654
      |||||
seq2  AATTC  655