BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-072H19
Chromosome2 (Build37)
Map Location 41,766,710 - 41,911,351
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLrp1b, LOC625094
Upstream geneLOC100042629
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-072H19.bB6Ng01-072H19.g
ACCDH889894DH889895
length912937
definitionDH889894|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-072H19, 5' end.DH889895|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-072H19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(41,766,710 - 41,767,624)(41,910,413 - 41,911,351)
sequence
gaattcctcaggaaaccttcctcaaagagtaactcatgaaacatttctta
gtcataaagctataaaaatagtgtttaagtttaatgttagtgatattttt
cttatacaaaatatttcttgtcctatgcattttacataattttacaaagt
ggtataatctctggacaattagtttgcctatctagagtccagtgtaagaa
agatagcttagattgatgtaggtcacagttacatttaccaatctaagtca
gggtttggaatgagtgagtgataaccttgaagaattagctaccactgcag
aaatgattcagtactaagcaaaataccatgagatatccaataagcctgac
aataatatgttgtaaaactcatgtacagcaaaatctattagtgaatcagg
tcatattatgtacagtagaaagaatgcagatatttcataaaaataatact
tagctttgaatcttggtcctattacttagtgacaacgtagacacagttta
tttataaaacagtatgaaatccccatttctccactataaaaaaatgcaag
acagataaaatagatttatttagaatatacatgacacaacatatgtattg
tagagagagtctcttgtactatatggaagctttacctgtcaacaaaatgc
tgttggtctattaacttaggccaagaagaaggtaaggaagaagagagagg
ctgttagaaggaaggaggcctgggagatttacctgaaactctcaggagga
gacagatgaatgaaactgaagacaaagtaaccagctatgtggcacactta
aaatagaacaaactggactattgaaagctattcgcctgagcattttattc
atatataagaagtctcagaatcattattttggggatgagtgatgggtggg
attatggcatgt
gaattcacttttaaaggcctcgtaattctgagtatttatgggcttcctct
gctcattccgatttctttagacttcatcttccagtagttcctttcttgtg
ttataaaagaagagtgatattgtttgtttgtgtgtgtattgctcctgtaa
ttaactgtttgttaggtcagaatgatatgtgtatggttgttctgagcaag
gatagtgttaatttctaaaggccatagtccaaatcagaacttgaatatct
gggagtattgtctttggggactttgtgtcctagttctggaagattcactg
ccaatagatggtgctattaggttacaaacttttcaagaataaaacttaaa
accaatgcagttcagacttaagtgaactttacagtcagtcaaagtattga
tgggacacggattgctatgtcctttcctgtaaagtctgtttcaagttatg
agttgggcacaaacatttggatttctagcagtacacatgtggaggattct
tcaacagtaatttggacaattctttaccagaaaatcagaaaactaacatt
ttagaaattaaagcttacttattcattacagtcattttgtatgaattaaa
atgttaagcatttatgacaacatttatacataattgctactcagaagatt
atagagaaaccagggacatttaaattacataattcatacatattaacatc
attccaatgtacagtgttcttgataaagtccacattgtccttatggttat
gtttctctataatatttatttaatatacttgtaatgatatattagatatt
ttaatggtaaaaatgcactccttaatgtctcatcttttacttcaagaaat
atttctaactggcttctagcttcttctagaagtgatcattacaacacata
cacctcctgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgagtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_41766710_41767624
seq2: B6Ng01-072H19.b_43_954

seq1  GAATTCCTCAGGAAACCTTCCTCAAAGAGTAACTCATGAAACATTTCTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCAGGAAACCTTCCTCAAAGAGTAACTCATGAAACATTTCTTA  50

seq1  GTCATAAAGCTATAAAAATAGTGTTTAAGTTTAATGTTAGTGATATTTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATAAAGCTATAAAAATAGTGTTTAAGTTTAATGTTAGTGATATTTTT  100

seq1  CTTATACAAAATATTTCTTGTCCTATGCATTTTACATAATTTTACAAAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATACAAAATATTTCTTGTCCTATGCATTTTACATAATTTTACAAAGT  150

seq1  GGTATAATCTCTGGACAATTAGTTTGCCTATCTAGAGTCCAGTGTAAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATAATCTCTGGACAATTAGTTTGCCTATCTAGAGTCCAGTGTAAGAA  200

seq1  AGATAGCTTAGATTGATGTAGGTCACAGTTACATTTACCAATCTAAGTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGCTTAGATTGATGTAGGTCACAGTTACATTTACCAATCTAAGTCA  250

seq1  GGGTTTGGAATGAGTGAGTGATAACCTTGAAGAATTAGCTACCACTGCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTTGGAATGAGTGAGTGATAACCTTGAAGAATTAGCTACCACTGCAG  300

seq1  AAATGATTCAGTACTAAGCAAAATACCATGAGATATCCAATAAGCCTGAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGATTCAGTACTAAGCAAAATACCATGAGATATCCAATAAGCCTGAC  350

seq1  AATAATATGTTGTAAAACTCATGTACAGCAAAATCTATTAGTGAATCAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATATGTTGTAAAACTCATGTACAGCAAAATCTATTAGTGAATCAGG  400

seq1  TCATATTATGTACAGTAGAAAGAATGCAGATATTTCATAAAAATAATACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATTATGTACAGTAGAAAGAATGCAGATATTTCATAAAAATAATACT  450

seq1  TAGCTTTGAATCTTGGTCCTATTACTTAGTGACAACGTAGACACAGTTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTTGAATCTTGGTCCTATTACTTAGTGACAACGTAGACACAGTTTA  500

seq1  TTTATAAAACAGTATGAAATCCCCATTTCTCCACTATAAAAAAATGCAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATAAAACAGTATGAAATCCCCATTTCTCCACTATAAAAAAATGCAAG  550

seq1  ACAGATAAAATAGATTTATTTAGAATATACATGACACAACATATGTATTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATAAAATAGATTTATTTAGAATATACATGACACAACATATGTATTG  600

seq1  TAGAGAGAGTCTCTTGTACTATATGGAAGCTTTACCTGTCAACAAAATGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGAGAGTCTCTTGTACTATATGGAAGCTTTACCTGTCAACAAAATGC  650

seq1  TGTTGGTCTATTAACTTAGGCCAAGAAGAAGGTAAGGAAGAAGAGAGAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGGTCTATTAACTTAGGCCAAGAAGAAGGTAAGGAAGAAGAGAGAGG  700

seq1  CTGTTAGAAGGAAGGAGGCCTGGGAGATTTACCTGAAACTCTCAGGAGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTAGAAGGAAGGAGGCCTGGGAGATTTACCTGAAACTCTCAGGAGGA  750

seq1  GACAGATGAATGAAACTGAAGACAAAGTAACCAGCTATGTGGCACACTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGATGAATGAAACTGAAGACAAAGTAACCAGCTATGTGGCACACTTA  800

seq1  AAATAGAACAAACTGGACTATTGAAAGCTATTCGCCTGAGCATTTTATTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAGAACAAACTGGACTATTGAAAGCTATTCGCCTGAGCATTTTATTC  850

seq1  ATATATAAGAAGTCTCAGAATCATTATTTTGGGGAATGAAGTGGATGGGT  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||
seq2  ATATATAAGAAGTCTCAGAATCATTATTTTGGGG-ATG-AGT-GATGGGT  897

seq1  GGGATTATGGGATGT  915
      |||||||||| ||||
seq2  GGGATTATGGCATGT  912

seq1: chr2_41910413_41911351
seq2: B6Ng01-072H19.g_64_1000 (reverse)

seq1  CACACACACACACACACACACACACACACAGGAGGTGTATGTGTTTGTAA  50
      ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CACACACTCACACACTCACACACACACACAGGAGGTGTATGTG-TTGTAA  49

seq1  TGATCACTTCTAGAAGAAGCTAGAAGCCAGTTAGAAATTATTTCTTGAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TGATCACTTCTAGAAGAAGCTAGAAGCCAGTTAGAAA-TATTTCTTGAAG  98

seq1  TAAAAGATGAGGCATTAAGGAGTGCATTTTTACCATTAAAATATCTAATA  150
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGATGAGACATTAAGGAGTGCATTTTTACCATTAAAATATCTAATA  148

seq1  TATCATTACAAGTATATTAAATAAATATTATAGAGAAACATAACCATAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCATTACAAGTATATTAAATAAATATTATAGAGAAACATAACCATAAG  198

seq1  GACAATGTGGACTTTATCAAGAACACTGTACATTGGAATGATGTTAATAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAATGTGGACTTTATCAAGAACACTGTACATTGGAATGATGTTAATAT  248

seq1  GTATGAATTATGTAATTTAAATGTCCCTGGTTTCTCTATAATCTTCTGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGAATTATGTAATTTAAATGTCCCTGGTTTCTCTATAATCTTCTGAG  298

seq1  TAGCAATTATGTATAAATGTTGTCATAAATGCTTAACATTTTAATTCATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAATTATGTATAAATGTTGTCATAAATGCTTAACATTTTAATTCATA  348

seq1  CAAAATGACTGTAATGAATAAGTAAGCTTTAATTTCTAAAATGTTAGTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATGACTGTAATGAATAAGTAAGCTTTAATTTCTAAAATGTTAGTTT  398

seq1  TCTGATTTTCTGGTAAAGAATTGTCCAAATTACTGTTGAAGAATCCTCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGATTTTCTGGTAAAGAATTGTCCAAATTACTGTTGAAGAATCCTCCA  448

seq1  CATGTGTACTGCTAGAAATCCAAATGTTTGTGCCCAACTCATAACTTGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGTACTGCTAGAAATCCAAATGTTTGTGCCCAACTCATAACTTGAA  498

seq1  ACAGACTTTACAGGAAAGGACATAGCAATCCGTGTCCCATCAATACTTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACTTTACAGGAAAGGACATAGCAATCCGTGTCCCATCAATACTTTG  548

seq1  ACTGACTGTAAAGTTCACTTAAGTCTGAACTGCATTGGTTTTAAGTTTTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGACTGTAAAGTTCACTTAAGTCTGAACTGCATTGGTTTTAAGTTTTA  598

seq1  TTCTTGAAAAGTTTGTAACCTAATAGCACCATCTATTGGCAGTGAATCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGAAAAGTTTGTAACCTAATAGCACCATCTATTGGCAGTGAATCTT  648

seq1  CCAGAACTAGGACACAAAGTCCCCAAAGACAATACTCCCAGATATTCAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAACTAGGACACAAAGTCCCCAAAGACAATACTCCCAGATATTCAAG  698

seq1  TTCTGATTTGGACTATGGCCTTTAGAAATTAACACTATCCTTGCTCAGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGATTTGGACTATGGCCTTTAGAAATTAACACTATCCTTGCTCAGAA  748

seq1  CAACCATACACATATCATTCTGACCTAACAAACAGTTAATTACAGGAGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCATACACATATCATTCTGACCTAACAAACAGTTAATTACAGGAGCA  798

seq1  ATACACACACAAACAAACAATATCACTCTTCTTTTATAACACAAGAAAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACACACACAAACAAACAATATCACTCTTCTTTTATAACACAAGAAAGG  848

seq1  AACTACTGGAAGATGAAGTCTAAAGAAATCGGAATGAGCAGAGGAAGCCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTACTGGAAGATGAAGTCTAAAGAAATCGGAATGAGCAGAGGAAGCCC  898

seq1  ATAAATACTCAGAATTACGAGGCCTTTAAAAGTGAATTC  939
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATACTCAGAATTACGAGGCCTTTAAAAGTGAATTC  937