BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-076E15
Chromosome2 (Build37)
Map Location 116,829,527 - 116,936,241
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC241621
Upstream geneMrg1, G630016G05Rik, 2810405F15Rik, LOC433464, Tmco5, LOC100043557
Downstream geneSpred1, LOC624574, 2610510H03Rik, Rasgrp1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-076E15.bB6Ng01-076E15.g
ACCDH892598DH892599
length1,2071,201
definitionDH892598|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-076E15, 5' end.DH892599|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-076E15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(116,935,002 - 116,936,241)(116,829,527 - 116,830,715)
sequence
gaattccaagccatcctgggctacagactaagaccttctccccttgctcc
tccccggcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacctgctcatggatcttgaag
ctcaagaaaagagggtaactgtgcgcaatgtgccacaggatctatagggc
tgggctggatccacagggctgttgtaggtccacagaggaatccacactct
gcaggatccacagggctgctgtaggtccacgaggacccagagatctgtag
gatccatagggctgctgtacatccacagaggactccacggtctgcaggat
ccatagggctgctgtacatccacagaggactccacggtctgcaggatcca
tagggctgcagtaggtccacagaggactccacggtctgcaggatccatag
ggctgctgtaggtccacagaggactccatgttctgcagacacaaggcaaa
ctagttactaaacaatgccacctgactgaatgcctagcaagtaataactg
ttatgactttttttttagttgaaacaaatgcaatatcctcaaatgtgtcc
attttggaaatctactgtattattgtacatacttttatataataaagcta
ctcatacaagctgggcatcttggtgcaggcctttaatcacagcactcagg
agacagaagcaggtggacctctgtgagttccaggccagcctggtctacat
agcctgttccagaacagcctgggctacatagagataccttgtctcaaaac
acaaaacaacaaacaaaaggccctcataaaaagctgaagacaaatcataa
gttctccagttgcagtgacagctggccagtcatcaaccttaccataaaga
actgtctttattctcccaaggctgaaggctgagcagatactgtctctcct
ttacactagagagccaccctggctcaaacctctttatcaaaggccctaca
cacttcacaccctctttgcctcctgggtttagccaatcttgtttatttca
gcttcttccttgctgcgtgtccagacttccttctggttccttgccagcca
ggccaaatccttgagcagctctttctcactgcttgctgtgcttacagaat
acatctcttgactgtttctactatgatccagaatgatggaaaacaattgt
gctcctcgtgcaaatttgcagctcagcttacagtggtgacattctgtttg
accatgg
gaattctctatttacatttacttacttacttacttacttacttacttact
tacttacttacttaacttagaaagagggtctcacaaagaatcactggctg
gtctagattcccaatgtacattaagctgatctcaaactcacagagatcta
cctcagcctcccaagtgctaatattaagggcaggaaccactgtgcctggc
ctcttcctcatattttgagacagtctctcactgaacttggagcccactga
ttgacttggctgagctggcccgcaagctgcagagacctcctgtccccaag
tcccctgggttaggatgctaggcaggtgctgtgccaaccttttgtttgct
tgctagtttaatatgagttctgggtgttggaatcagggccccaggtttgc
gtaacaagcccttccttttgcctactgagcccagtactttaatattctga
gtgagcagagaatggagtgaagctaactagggtggtaagcagattttaaa
gataaggctggatcctagctgcaatagatgtacatcttttccagggagcc
agtgaacactcagtccaggcactgctttgaaaactcataggtgtaactaa
ggcctgcggtgagctggtctttgctttagttgtgaagccaatcagatgaa
ccatagaaagaccataatgtgctttttaaaaaggagagatttgaactacc
agaaagcggtaatgcaagagaggcttttctatctggctttgaatgccaag
aggataatgtaaaattggctgtggacagcctatagctggagtccaacccc
caaggacacaaggaccttggtcccacaatgggaaggaacgtgagtttagc
ctgcagcctacattgagcacaagccaggtctccggggttacctggaggaa
ggagcctggtactttggtttcaaccttctaagaccctgagctgagaacat
agccatgctacacttggcttttgtttgatagaactgggtgaattaacaat
tgtttttcttttaaagctgctctttgtggtgtttttgttaaataacaata
gaagatctagtgcaaaaacccccatctgctctctagaagggagtatagat
tgggtcctgggacagtattataaattgggtccctggcacgagagtgtagt
ttgttttccgcaggagtgttgatagtgatcctggcacaggagtgttggtt
g
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_116935002_116936241
seq2: B6Ng01-076E15.b_46_1252 (reverse)

seq1  CCATGGTCCAAAACAAGAATAGCTACACACTGCTAAGACGTAGGCTGGGC  50
      ||||||||  |||| ||||| |  || ||||| ||||   |  |||  ||
seq2  CCATGGTC--AAAC-AGAAT-GTCAC-CACTG-TAAG--CTGAGCT--GC  40

seq1  AAATATTTGCA-GA-GAGCAAATTTGTTTTCCCAAATCAATTCTAGATCA  98
      ||  ||||||| || ||||| | |||||||||   ||| ||||| |||||
seq2  AA--ATTTGCACGAGGAGCACAATTGTTTTCC---ATC-ATTCTGGATCA  84

seq1  TTATGTAGAAACAGTCAGGAGATGTAAATCTGTAAGCACAGCAAGGCAGG  148
      |   ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| |
seq2  T--AGTAGAAACAGTCAAGAGATGT-ATTCTGTAAGCACAGCAA-GCA-G  129

seq1  TGAGAAAGAGGCTGCTCAAAGGATGTGGCCTGGCTTGGCAAGGGACCCAG  198
      ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| ||||
seq2  TGAGAAAGA-GCTGCTC-AAGGATTTGGCCTGGC-TGGCAA-GGAACCAG  175

seq1  AAGGAAGTCTGGGACAACGCAGCAAAGGAAGGAAGCCTGAAATAAACAAA  248
      |||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||
seq2  AAGGAAGTCT-GGAC-ACGCAGC-AAGGAA-GAAG-CTGAAATAAAC-AA  219

seq1  GATTGGCTAAAACCCAGGAGGCAAAGAGGGTGTGAAGTGGTGTAGGGCCT  298
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GATTGGCT-AAACCCAGGAGGCAAAGAGGGTGTGAAGT-GTGTAGGGCCT  267

seq1  TTGATAAAGAGGTTTGGAGCCCAGGGTGGCTCTCTAGTGTAAAGGAGAGA  348
      ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATAAAGAGGTTT-GAG-CCAGGGTGGCTCTCTAGTGTAAAGGAGAGA  315

seq1  CAGTATCTGCTCAGCCTTCAGCCTTGGGAGAATAAAGACAGTTCTTTATG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTATCTGCTCAGCCTTCAGCCTTGGGAGAATAAAGACAGTTCTTTATG  365

seq1  GTAAGGTTGATGACTGGCCAGCTGTCACTGCAACTGGAGAACTTATGATT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGGTTGATGACTGGCCAGCTGTCACTGCAACTGGAGAACTTATGATT  415

seq1  TGTCTTCAGCTTTTTATGAGGGCCTTTTGTTTGTTGTTTTGTGTTTTGAG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTCAGCTTTTTATGAGGGCCTTTTGTTTGTTGTTTTGTGTTTTGAG  465

seq1  ACAAGGTATCTCTATGTAGCCCAGGCTGTTCTGGAACAGGCTATGTAGAC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGGTATCTCTATGTAGCCCAGGCTGTTCTGGAACAGGCTATGTAGAC  515

seq1  CAGGCTGGCCTGGAACTCACAGAGGTCCACCTGCTTCTGTCTCCTGAGTG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTGGCCTGGAACTCACAGAGGTCCACCTGCTTCTGTCTCCTGAGTG  565

seq1  CTGTGATTAAAGGCCTGCACCAAGATGCCCAGCTTGTATGAGTAGCTTTA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGATTAAAGGCCTGCACCAAGATGCCCAGCTTGTATGAGTAGCTTTA  615

seq1  TTATATAAAAGTATGTACAATAATACAGTAGATTTCCAAAATGGACACAT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATAAAAGTATGTACAATAATACAGTAGATTTCCAAAATGGACACAT  665

seq1  TTGAGGATATTGCATTTGTTTCAACTAAAAAAAAAGTCATAACAGTTATT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGGATATTGCATTTGTTTCAACTAAAAAAAAAGTCATAACAGTTATT  715

seq1  ACTTGCTAGGCATTCAGTCAGGTGGCATTGTTTAGTAACTAGTTTGCCTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGCTAGGCATTCAGTCAGGTGGCATTGTTTAGTAACTAGTTTGCCTT  765

seq1  GTGTCTGCAGAACATGGAGTCCTCTGTGGACCTACAGCAGCCCTATGGAT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTGCAGAACATGGAGTCCTCTGTGGACCTACAGCAGCCCTATGGAT  815

seq1  CCTGCAGACCGTGGAGTCCTCTGTGGACCTACTGCAGCCCTATGGATCCT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCAGACCGTGGAGTCCTCTGTGGACCTACTGCAGCCCTATGGATCCT  865

seq1  GCAGACCGTGGAGTCCTCTGTGGATGTACAGCAGCCCTATGGATCCTGCA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGACCGTGGAGTCCTCTGTGGATGTACAGCAGCCCTATGGATCCTGCA  915

seq1  GACCGTGGAGTCCTCTGTGGATGTACAGCAGCCCTATGGATCCTACAGAT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCGTGGAGTCCTCTGTGGATGTACAGCAGCCCTATGGATCCTACAGAT  965

seq1  CTCTGGGTCCTCGTGGACCTACAGCAGCCCTGTGGATCCTGCAGAGTGTG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGGTCCTCGTGGACCTACAGCAGCCCTGTGGATCCTGCAGAGTGTG  1015

seq1  GATTCCTCTGTGGACCTACAACAGCCCTGTGGATCCAGCCCAGCCCTATA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCCTCTGTGGACCTACAACAGCCCTGTGGATCCAGCCCAGCCCTATA  1065

seq1  GATCCTGTGGCACATTGCGCACAGTTACCCTCTTTTCTTGAGCTTCAAGA  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCTGTGGCACATTGCGCACAGTTACCCTCTTTTCTTGAGCTTCAAGA  1115

seq1  TCCATGAGCAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCCGGGGAGGAGCAAG  1198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGAGCAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCCGGGGAGGAGCAAG  1165

seq1  GGGAGAAGGTCTTAGTCTGTAGCCCAGGATGGCTTGGAATTC  1240
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGAAGGTCTTAGTCTGTAGCCCAGGATGGCTTGGAATTC  1207

seq1: chr2_116829527_116830715
seq2: B6Ng01-076E15.g_70_1270

seq1  GAATTCTCTATTTACATTTACTTACTTACTTACTTACTTACTTACTTACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTATTTACATTTACTTACTTACTTACTTACTTACTTACTTACT  50

seq1  TACTTACTTACTTAACTTAGAAAGAGGGTCTCACAAAGAATCACTGGCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTACTTACTTAACTTAGAAAGAGGGTCTCACAAAGAATCACTGGCTG  100

seq1  GTCTAGATTCCCAATGTACATTAAGCTGATCTCAAACTCACAGAGATCTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAGATTCCCAATGTACATTAAGCTGATCTCAAACTCACAGAGATCTA  150

seq1  CCTCAGCCTCCCAAGTGCTAATATTAAGGGCAGGAACCACTGTGCCTGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAGCCTCCCAAGTGCTAATATTAAGGGCAGGAACCACTGTGCCTGGC  200

seq1  CTCTTCCTCATATTTTGAGACAGTCTCTCACTGAACTTGGAGCCCACTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCCTCATATTTTGAGACAGTCTCTCACTGAACTTGGAGCCCACTGA  250

seq1  TTGACTTGGCTGAGCTGGCCCGCAAGCTGCAGAGACCTCCTGTCCCCAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACTTGGCTGAGCTGGCCCGCAAGCTGCAGAGACCTCCTGTCCCCAAG  300

seq1  TCCCCTGGGTTAGGATGCTAGGCAGGTGCTGTGCCAACCTTTTGTTTGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCTGGGTTAGGATGCTAGGCAGGTGCTGTGCCAACCTTTTGTTTGCT  350

seq1  TGCTAGTTTAATATGAGTTCTGGGTGTTGGAATCAGGGCCCCAGGTTTGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTAGTTTAATATGAGTTCTGGGTGTTGGAATCAGGGCCCCAGGTTTGC  400

seq1  GTAACAAGCCCTTCCTTTTGCCTACTGAGCCCAGTACTTTAATATTCTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACAAGCCCTTCCTTTTGCCTACTGAGCCCAGTACTTTAATATTCTGA  450

seq1  GTGAGCAGAGAATGGAGTGAAGCTAACTAGGGTGGTAAGCAGATTTTAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGCAGAGAATGGAGTGAAGCTAACTAGGGTGGTAAGCAGATTTTAAA  500

seq1  GATAAGGCTGGATCCTAGCTGCAATAGATGTACATCTTTTCCAGGGAGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAGGCTGGATCCTAGCTGCAATAGATGTACATCTTTTCCAGGGAGCC  550

seq1  AGTGAACACTCAGTCCAGGCACTGCTTTGAAAACTCATAGGTGTAACTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAACACTCAGTCCAGGCACTGCTTTGAAAACTCATAGGTGTAACTAA  600

seq1  GGCCTGCGGTGAGCTGGTCTTTGCTTTAGTTGTGAAGCCAATCAGATGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTGCGGTGAGCTGGTCTTTGCTTTAGTTGTGAAGCCAATCAGATGAA  650

seq1  CCATAGAAAGACCATAATGTGCTTTTTAAAAAGGAGAGATTTGAACTACC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAGAAAGACCATAATGTGCTTTTTAAAAAGGAGAGATTTGAACTACC  700

seq1  AGAAAGCGGTAATGCAAGAGAGGCTTTTCTATCTGGCTTTGAATGCCAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGCGGTAATGCAAGAGAGGCTTTTCTATCTGGCTTTGAATGCCAAG  750

seq1  AGGATAATGTAAAATTGGCTGTGGACAGCCTATAGCTGGAGTCCAACCCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATAATGTAAAATTGGCTGTGGACAGCCTATAGCTGGAGTCCAACCCC  800

seq1  CAAGGACACAAGGACCTTGGTCCCACAATGGGAAGGAACGTGAGTTTAGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGACACAAGGACCTTGGTCCCACAATGGGAAGGAACGTGAGTTTAGC  850

seq1  CTGCAGCCTACATTGAGCACAAAGCCAGGTCTCCGGGGTTACCTGGAGGA  900
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGCCTACATTGAGCAC-AAGCCAGGTCTCCGGGGTTACCTGGAGGA  899

seq1  AGGAGCCTGGTACTTTGGTTTCAACCTTCTAAGACCCTGAGCTGAGAACA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGCCTGGTACTTTGGTTTCAACCTTCTAAGACCCTGAGCTGAGAACA  949

seq1  TAGCCATGCTACACTTGGCTTTTGTTTGATAGAACTGTGTGAATTAACAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TAGCCATGCTACACTTGGCTTTTGTTTGATAGAACTGGGTGAATTAACAA  999

seq1  ATG-TTTTCTTTTAAAGCTGCTCTTTGTGGTG-TTTTGTTATATAACAAT  1048
       || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
seq2  TTGTTTTTCTTTTAAAGCTGCTCTTTGTGGTGTTTTTGTTAAATAACAAT  1049

seq1  AG-AGAGCTAGTGCAAAA--CCCCATCTGCGTCCTAG-AGGGAGTATAGA  1094
      || ||| |||||||||||  ||||||||||   |||| ||||||||||||
seq2  AGAAGATCTAGTGCAAAAACCCCCATCTGCTCTCTAGAAGGGAGTATAGA  1099

seq1  TTGGGTCCTGG--CAGGAGTATAGATTGGGT-CCTGGCA--GGAGTGTAG  1139
      |||||||||||  ||| | |||| ||||||| |||||||   ||||||||
seq2  TTGGGTCCTGGGACAGTATTATAAATTGGGTCCCTGGCACGAGAGTGTAG  1149

seq1  GTTGGGTCCTGGCAGGAGTGTTGGTTG-GGTCCTGG--CAGGAGTGTTGG  1186
       |||  | |  |||||||||||| | | | ||||||  ||||||||||||
seq2  TTTGTTTTC-CGCAGGAGTGTTGATAGTGATCCTGGCACAGGAGTGTTGG  1198

seq1  TTG  1189
      |||
seq2  TTG  1201