BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-076M03
Chromosome2 (Build37)
Map Location 174,722,683 - 174,769,418
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC664880, LOC100043912, LOC664901, Stx16, Npepl1, Nespas, Gnas, Th1l, Ctsz, Rpl30-ps5, Tubb1, Atp5e, Slmo2, LOC664967, LOC100043757, Edn3
Downstream geneLOC545487, LOC100043760, LOC100043761, LOC620790, LOC665001, LOC100043762, LOC100043763, LOC100043764, LOC100043914, LOC100043915, LOC668009, LOC100038953, LOC620804, LOC100039000, LOC100043126, LOC100039017
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-076M03.bB6Ng01-076M03.g
ACCDH892930DH892931
length1,133942
definitionDH892930|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-076M03, 5' end.DH892931|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-076M03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(174,722,683 - 174,723,829)(174,768,477 - 174,769,418)
sequence
gaattcaccccctacaagatgtgacacacttgcgttggggaaattagtgc
tgactcccgaaacagatttatcttctaagccctcaaaacacttccaggaa
atggcaggccatggagctcaaatgtctgcatcaaacacagatctccaatg
tcctggctttatttccagaggtccagctaagccttctatagttcccagta
tcctggtttatcaagtgaattaactctgtttatgtgtgtaccatgattac
aaagaagtgtggatacacagagtccccgtggagtgtccacagggactcaa
gttcttcctgacttggtcactcactgacctactcagctgttgacccacaa
cacactcttgtttacagatacgacatgctgggcacagacacgtggacaag
gaaatccctgccccatgctccaagctgagcgagcctttccagacagccct
ggctagaagaacaagacggggtgctgtttgacagaaagcaggcacaaaca
ggagacgcccaggccagcagctccagaaaggacgtgttgcaatcacccct
gtgctatcaaggtgtctctctgatgacccctctctgccagcactctgcca
ggctctgagagatcaggtcctgtggcgagcttatcactgtatatgcagag
ggacacctgtccctaaaagaagtacatacaataaagtgtgacaaggctag
aacgagcaaagagggttagtaggtcaggcccgctgggctgggagacttgg
tctgctcaacacgatcaaggaaaggcaggtctagaacagcaaggttaatc
tgagccccacagacagagaaggggaccgtatggagagcatggcccaccta
ctggacacaggaaaataaatgctgagcaggaacagagagtggaatactag
tgggaaagaggaagaagagagggggcatagaagaagaagaggaaggggag
aaatgaagtggagaagagaaggaaatttccagcagcacttgtgtagtctc
acagcttagactagtctctctcacaactgcaggagcaagactgtgtgctg
agttccgctgaatagaatcatccaccacttggactgaatcctcccgaagg
caggatggaagtggcttctccctaagtttggga
gaattctctccctgagctgacaacaagaccatgtggcacaggaattcctg
gaacatcatgcagggaggcagcaacacctgcatgtcaaggtcagacaaca
gaaagtcagaggcaaatgaaagccttgaactcatccagagccaaaaaaaa
aaaaacagtttccttgagagttctctctgccctttcttcagagaccctgt
cagcaagaatagagcacacacaagtatttaatgtctaaagagaaacaaac
actcacaccaacccatcccctcaatcactatccctccacctcacactcac
tccacattcctagcccctccatcgcacctgctctgcactcacaggggtca
cccactcaccagctgcacttggcggctccaagaaggctgacctccctgcc
tgtctgccagctcagcagtatcccactaagctcagcaaaggcaactctgg
ccttgtgcaccctgggtagggatgccattccccctgggctccagtccgtt
gtccctcttagcatatccacgctacaggttccaaatgtctgtcccttcca
cagcccaccagagagatgtatcatcatcaaatgcacctacatgccagatc
cagttaggaagggaccctatcagccacatgtctacagatggagaaaagat
cccgcaaaaccctgccacatttgtcgctaccaaagactacacaacatcat
ggtggctgcagacactccaacctcgactgctgaacactcctagcagattg
cacccttgaaccttccattccttaagttcttcttagatgttttgtcattg
gggataaaagaaatgaagagttacatgtttaaagtgaaatcttacagttt
gaatctgaagtggccaccatgggcttatgtttacatttggttgctagcta
tcagtccttttgggtagatggggcgtataaccttgtgtgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_174722683_174723829
seq2: B6Ng01-076M03.b_48_1180

seq1  GAATTCACCCCCTACAAGATGTGACACACTTGCGTTGGGGAAATTAGTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCCCCTACAAGATGTGACACACTTGCGTTGGGGAAATTAGTGC  50

seq1  TGACTCCCGAAACAGATTTATCTTCTAAGCCCTCAAAACACTTCCAGGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTCCCGAAACAGATTTATCTTCTAAGCCCTCAAAACACTTCCAGGAA  100

seq1  ATGGCAGGCCATGGAGCTCAAATGTCTGCATCAAACACAGATCTCCAATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCAGGCCATGGAGCTCAAATGTCTGCATCAAACACAGATCTCCAATG  150

seq1  TCCTGGCTTTATTTCCAGAGGTCCAGCTAAGCCTTCTATAGTTCCCAGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGCTTTATTTCCAGAGGTCCAGCTAAGCCTTCTATAGTTCCCAGTA  200

seq1  TCCTGGTTTATCAAGTGAATTAACTCTGTTTATGTGTGTACCATGATTAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGTTTATCAAGTGAATTAACTCTGTTTATGTGTGTACCATGATTAC  250

seq1  AAAGAAGTGTGGATACACAGAGTCCCCGTGGAGTGTCCACAGGGACTCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAGTGTGGATACACAGAGTCCCCGTGGAGTGTCCACAGGGACTCAA  300

seq1  GTTCTTCCTGACTTGGTCACTCACTGACCTACTCAGCTGTTGACCCACAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTCCTGACTTGGTCACTCACTGACCTACTCAGCTGTTGACCCACAA  350

seq1  CACACTCTTGTTTACAGATACGACATGCTGGGCACAGACACGTGGACAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTCTTGTTTACAGATACGACATGCTGGGCACAGACACGTGGACAAG  400

seq1  GAAATCCCTGCCCCATGCTCCAAGCTGAGCGAGCCTTTCCAGACAGCCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATCCCTGCCCCATGCTCCAAGCTGAGCGAGCCTTTCCAGACAGCCCT  450

seq1  GGCTAGAAGAACAAGACGGGGTGCTGTTTGACAGAAAGCAGGCACAAACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTAGAAGAACAAGACGGGGTGCTGTTTGACAGAAAGCAGGCACAAACA  500

seq1  GGAGACGCCCAGGCCAGCAGCTCCAGAAAGGACGTGTTGCAATCACCCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGACGCCCAGGCCAGCAGCTCCAGAAAGGACGTGTTGCAATCACCCCT  550

seq1  GTGCTATCAAGGTGTCTCTCTGATGACCCCTCTCTGCCAGCACTCTGCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTATCAAGGTGTCTCTCTGATGACCCCTCTCTGCCAGCACTCTGCCA  600

seq1  GGCTCTGAGAGATCAGGTCCTGTGGCGAGCTTATCACTGTATATGCAGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCTGAGAGATCAGGTCCTGTGGCGAGCTTATCACTGTATATGCAGAG  650

seq1  GGACACCTGTCCCTAAAAGAAGTACATACAATAAAGTGTGACAAGGCTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACACCTGTCCCTAAAAGAAGTACATACAATAAAGTGTGACAAGGCTAG  700

seq1  AACGAGCAAAGAGGGTTAGTAGGTCAGGCCCGCTGGGCTGGGAGACTTGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGAGCAAAGAGGGTTAGTAGGTCAGGCCCGCTGGGCTGGGAGACTTGG  750

seq1  TCTGCTCAACACGATCAAGG-AAGGCAGGTCTAGAACAGCAAGGTTAATC  799
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTCAACACGATCAAGGAAAGGCAGGTCTAGAACAGCAAGGTTAATC  800

seq1  TGAGCCCCACAGACAGAGAAGGGGACCGTATGGAGAGCATGGCCCACCTA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCCCCACAGACAGAGAAGGGGACCGTATGGAGAGCATGGCCCACCTA  850

seq1  CTGGACACAGGAAAATTAAATGCTGAGCAGGAACAGAGAGTGGAATACTA  899
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGACACAGGAAAA-TAAATGCTGAGCAGGAACAGAGAGTGGAATACTA  899

seq1  GTGGGAAAGAGGAAGAAGAGAGGGGGCATAGGAAGAAGAAGAGGAAGGGG  949
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GTGGGAAAGAGGAAGAAGAGAGGGGGCATA-GAAGAAGAAGAGGAAGGGG  948

seq1  AGAAATGAAGTGGAAGAAGAGAAGGGAAATTTCCAGGCAGCAACTGTGTA  999
      ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||
seq2  AGAAATGAAGTGG-AGAAGAGAA-GGAAATTTCCA-GCAGCACTTGTGTA  995

seq1  GGTCTCACAGGCTTAGACTAGTCTCTTCTCACCAACTGCAGGAGCAGGAC  1049
       |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||
seq2  -GTCTCACA-GCTTAGACTAGTCTC-TCTCA-CAACTGCAGGAGCAAGAC  1041

seq1  TGTGTGCTGAGTTCCGGCTGGACATAGAATCATCCAGCACTGGGACTGGA  1099
      ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||| |||||| |
seq2  TGTGTGCTGAGTTCC-GCTG--AATAGAATCATCCACCACTTGGACTGAA  1088

seq1  TCCACCCAGAAGGCAGGGATGGAAGTGGCTGCTCGCCTAGGTTTGGGA  1147
      ||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||
seq2  TCCTCCC-GAAGGCA-GGATGGAAGTGGCTTCTC-CCTAAGTTTGGGA  1133

seq1: chr2_174768477_174769418
seq2: B6Ng01-076M03.g_69_1010 (reverse)

seq1  ACACACACAAGGTTATACG-CCCATCTACCCAAAAGGACTGATAGCTAGC  49
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACAAGGTTATACGCCCCATCTACCCAAAAGGACTGATAGCTAGC  50

seq1  AACCAAATGTAAAACATAAGCCCATGGTGGCCACTTCAGATTCAAACTGT  99
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAAATGT-AAACATAAGCCCATGGTGGCCACTTCAGATTCAAACTGT  99

seq1  AAGATTTCACTTTAAACATGTAACTCTTCATTTCTTTTATCCCCAATGAC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTTCACTTTAAACATGTAACTCTTCATTTCTTTTATCCCCAATGAC  149

seq1  AAAACATCTAAGAAGAACTTAAGGAATGGAAGGTTCAAGGGTGCAATCTG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACATCTAAGAAGAACTTAAGGAATGGAAGGTTCAAGGGTGCAATCTG  199

seq1  CTAGGAGTGTTCAGCAGTCGAGGTTGGAGTGTCTGCAGCCACCATGATGT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGAGTGTTCAGCAGTCGAGGTTGGAGTGTCTGCAGCCACCATGATGT  249

seq1  TGTGTAGTCTTTGGTAGCGACAAATGTGGCAGGGTTTTGCGGGATCTTTT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTAGTCTTTGGTAGCGACAAATGTGGCAGGGTTTTGCGGGATCTTTT  299

seq1  CTCCATCTGTAGACATGTGGCTGATAGGGTCCCTTCCTAACTGGATCTGG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCATCTGTAGACATGTGGCTGATAGGGTCCCTTCCTAACTGGATCTGG  349

seq1  CATGTAGGTGCATTTGATGATGATACATCTCTCTGGTGGGCTGTGGAAGG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTAGGTGCATTTGATGATGATACATCTCTCTGGTGGGCTGTGGAAGG  399

seq1  GACAGACATTTGGAACCTGTAGCGTGGATATGCTAAGAGGGACAACGGAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGACATTTGGAACCTGTAGCGTGGATATGCTAAGAGGGACAACGGAC  449

seq1  TGGAGCCCAGGGGGAATGGCATCCCTACCCAGGGTGCACAAGGCCAGAGT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCCCAGGGGGAATGGCATCCCTACCCAGGGTGCACAAGGCCAGAGT  499

seq1  TGCCTTTGCTGAGCTTAGTGGGATACTGCTGAGCTGGCAGACAGGCAGGG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTTTGCTGAGCTTAGTGGGATACTGCTGAGCTGGCAGACAGGCAGGG  549

seq1  AGGTCAGCCTTCTTGGAGCCGCCAAGTGCAGCTGGTGAGTGGGTGACCCC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCAGCCTTCTTGGAGCCGCCAAGTGCAGCTGGTGAGTGGGTGACCCC  599

seq1  TGTGAGTGCAGAGCAGGTGCGATGGAGGGGCTAGGAATGTGGAGTGAGTG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGTGCAGAGCAGGTGCGATGGAGGGGCTAGGAATGTGGAGTGAGTG  649

seq1  TGAGGTGGAGGGATAGTGATTGAGGGGATGGGTTGGTGTGAGTGTTTGTT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGTGGAGGGATAGTGATTGAGGGGATGGGTTGGTGTGAGTGTTTGTT  699

seq1  TCTCTTTAGACATTAAATACTTGTGTGTGCTCTATTCTTGCTGACAGGGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTTAGACATTAAATACTTGTGTGTGCTCTATTCTTGCTGACAGGGT  749

seq1  CTCTGAAGAAAGGGCAGAGAGAACTCTCAAGGAAACTGTTTTTTTTTTTT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGAAGAAAGGGCAGAGAGAACTCTCAAGGAAACTGTTTTTTTTTTTT  799

seq1  TGGCTCTGGATGAGTTCAAGGCTTTCATTTGCCTCTGACTTTCTGTTGTC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTCTGGATGAGTTCAAGGCTTTCATTTGCCTCTGACTTTCTGTTGTC  849

seq1  TGACCTTGACATGCAGGTGTTGCTGCCTCCCTGCATGATGTTCCAGGAAT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCTTGACATGCAGGTGTTGCTGCCTCCCTGCATGATGTTCCAGGAAT  899

seq1  TCCTGTGCCACATGGTCTTGTTGTCAGCTCAGGGAGAGAATTC  942
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTGCCACATGGTCTTGTTGTCAGCTCAGGGAGAGAATTC  942