BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-079E14
Chromosome2 (Build37)
Map Location 141,429,200 - 141,531,237
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneFlrt3
Downstream geneLOC668913, LOC668914, Kif16b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-079E14.bB6Ng01-079E14.g
ACCDH894738DH894739
length1,1921,041
definitionDH894738|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-079E14, 5' end.DH894739|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-079E14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(141,530,030 - 141,531,237)(141,429,200 - 141,430,252)
sequence
gaattccaaaaagtttccattatctggcctgtcatctagtttttaaaatg
tttaaacatttattatgtttgttaaatatatattgtagaacaattaatta
atcaatatccaccttcgaatgtgtctcttgttagtacacaatagtagggg
attagttaataagcaaatgtgttagaaataaatccttaatggtgaaatag
acaatgctcaaaacttgtggttgcctgaaaagactgcataaatgctgcca
agcttggtcctaagatatcaaaagctaagccagatccagagcaaccgcag
ttacacgtggaacgaatgactctctgggctgatttgcacagaggtttggc
tgcccaaaataaacttattctctaaagagttatctataagacttcccaca
gatgcagagttatcaagagatgtaccagataggcctggatagacacttct
gctaacggatgtttgcatgtgtggcggagttcagtccatgagttgttagt
tgtttccattgaaacagagtttggcatggctatgacataacagaggagct
tttttattttttaatttatttctatttttatccctgtgcattagtatttc
caaagtcttgattgttggtggagctaaaagttgttgagcagaaacagaac
aacaatgaagaaataggttgttggagaaagtgattcaggagcagtcctga
accgaccgccagaatcccctgcaacacactagagataactcccttagaaa
tggaggcatgatttgttccttctgtctaattctcaaatacactgggctca
taaatcaatgctaccatgaaatctcttctttctggagatccatcacacag
ccctgagtgctagagctggtgacaaacagctctggtagggggagagatac
acatgggtgagacatggggtcagctgaacattttttctagtacattcatt
cacatcaggacttcacttccttacagtaccatattatttcccaatcactc
tgacttatataaatagtcactaaaatagtatagatagcttaaaaataact
attattcttcatgtatatggggtatttgtacatacatattcagcatccat
gtcatgtatatggtgtagtgcgtgcctatgcatatggtgtggggaagtcc
gaggtcaactggtgtatttccaatgcctgcatttatttgggg
gaattccacagctcctgagaaatatgcatccttctcctgtcagacttttg
ctttttcattacttggaggtggttggagaaataggggaaatgagaagctt
gatagtattctctcttagacctgtggaaaaagtttctgtgggtgggatct
atgaatgggattcaggacatatcatgccaaaatggggcaactcagtattt
gagaaaagagcaggagtatgaaaattattccctttccctctgcacttcac
agaaatgggacctaagactccatgtgagaggtgagttccctatatgtcta
gaaaaggaacgtgcctatatctgaagggatgggaaagaagctgaactaaa
ggacccttgggtaccttcttgttatttgtccttacattttatttcccttc
tcagtcgaattctctgtgattgtcaagtcttcaccaaacctagcaggaac
ccacacatgttagcttccttctgtgggtctttacatccttgggaagtctc
atgaagccaatattaaatgaactttgtcatcttctcttaccaattctctg
ccttagcaatgaatctgatgatgggtggcatgatgagatactttcccccc
ttacctatttctaagccagcatccataggagcccacagacttctactctc
aaaagcactcctgaacatctggaattcacaagtcacagactttgccatat
tcaggctcagcaggtgaccctggctgcagaaggcctttgcttgagaatga
tgggtgatataaacatgtctttccctctcagagaagaatgtgctctaggc
aagatggagatacatgtttgcgaacattgaggaggattaaaagggagata
caagcatttccttttccaagcaatggaaaatgtcgaaacttttactttta
ttaccagtgaactcaaatgatgttggatgagcactgtaaggaaagctata
gcacactacaccaccacacctcacacgcacatcccacaccatcaagcatg
atgtgagctgattagagcctgttatctgcagaagcacggta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_141530030_141531237
seq2: B6Ng01-079E14.b_48_1239 (reverse)

seq1  CCCCAAAATAAAATGCAGGGCAATTGAGAAATACAACCAGTTTTGACCTC  50
       ||| |||| |||||||||   |||| ||||||| |||||  ||||||||
seq2  -CCCCAAAT-AAATGCAGG--CATTG-GAAATAC-ACCAG--TTGACCTC  42

seq1  TGGACTT-CACACA-CATATGCATATGTGCACGCACTAACACATATACAT  98
       |||||| | |||| ||||||||||   ||||||||||   |||||||||
seq2  -GGACTTCCCCACACCATATGCATA--GGCACGCACTACACCATATACAT  89

seq1  GAACATGGATGCTTGAATATGTATGTACATATACACCATATACATGAAGA  148
      | |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
seq2  G-ACATGGATGC-TGAATATGTATGTACAAATACCCCATATACATGAAGA  137

seq1  ATAATAGTTTATTTTTAAGCTATTCTATACTATTTTAGTGACTTATTTAT  198
      ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ATAATAG-TTATTTTTAAGCTA-TCTATACTATTTTAGTGAC-TATTTAT  184

seq1  ATAAGTCAGAGTGATTGGGAAATAATATGGTACTTGTAAGGAAGTGAAGT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| 
seq2  ATAAGTCAGAGTGATTGGGAAATAATATGGTAC-TGTAAGGAAGTGAAG-  232

seq1  TCTTGATGTGAATGAATGTACTAGAAAAAATGTTCAGCTGACCCCATGTC  298
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGATGTGAATGAATGTACTAGAAAAAATGTTCAGCTGACCCCATGTC  282

seq1  TCACCCATGTGTATCTCTCCCCCTACCAGAGCTGTTTGTCACCAGCTCTA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCCATGTGTATCTCTCCCCCTACCAGAGCTGTTTGTCACCAGCTCTA  332

seq1  GCACTCAGGGCTGTGTGATGGATCTCCAGAAAGAAGAGATTTCATGGTAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTCAGGGCTGTGTGATGGATCTCCAGAAAGAAGAGATTTCATGGTAG  382

seq1  CATTGATTTATGAGCCCAGTGTATTTGAGAATTAGACAGAAGGAACAAAT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGATTTATGAGCCCAGTGTATTTGAGAATTAGACAGAAGGAACAAAT  432

seq1  CATGCCTCCATTTCTAAGGGAGTTATCTCTAGTGTGTTGCAGGGGATTCT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCCTCCATTTCTAAGGGAGTTATCTCTAGTGTGTTGCAGGGGATTCT  482

seq1  GGCGGTCGGTTCAGGACTGCTCCTGAATCACTTTCTCCAACAACCTATTT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGGTCGGTTCAGGACTGCTCCTGAATCACTTTCTCCAACAACCTATTT  532

seq1  CTTCATTGTTGTTCTGTTTCTGCTCAACAACTTTTAGCTCCACCAACAAT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCATTGTTGTTCTGTTTCTGCTCAACAACTTTTAGCTCCACCAACAAT  582

seq1  CAAGACTTTGGAAATACTAATGCACAGGGATAAAAATAGAAATAAATTAA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACTTTGGAAATACTAATGCACAGGGATAAAAATAGAAATAAATTAA  632

seq1  AAAATAAAAAAGCTCCTCTGTTATGTCATAGCCATGCCAAACTCTGTTTC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAAAAAAGCTCCTCTGTTATGTCATAGCCATGCCAAACTCTGTTTC  682

seq1  AATGGAAACAACTAACAACTCATGGACTGAACTCCGCCACACATGCAAAC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGAAACAACTAACAACTCATGGACTGAACTCCGCCACACATGCAAAC  732

seq1  ATCCGTTAGCAGAAGTGTCTATCCAGGCCTATCTGGTACATCTCTTGATA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCGTTAGCAGAAGTGTCTATCCAGGCCTATCTGGTACATCTCTTGATA  782

seq1  ACTCTGCATCTGTGGGAAGTCTTATAGATAACTCTTTAGAGAATAAGTTT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTGCATCTGTGGGAAGTCTTATAGATAACTCTTTAGAGAATAAGTTT  832

seq1  ATTTTGGGCAGCCAAACCTCTGTGCAAATCAGCCCAGAGAGTCATTCGTT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGGGCAGCCAAACCTCTGTGCAAATCAGCCCAGAGAGTCATTCGTT  882

seq1  CCACGTGTAACTGCGGTTGCTCTGGATCTGGCTTAGCTTTTGATATCTTA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACGTGTAACTGCGGTTGCTCTGGATCTGGCTTAGCTTTTGATATCTTA  932

seq1  GGACCAAGCTTGGCAGCATTTATGCAGTCTTTTCAGGCAACCACAAGTTT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCAAGCTTGGCAGCATTTATGCAGTCTTTTCAGGCAACCACAAGTTT  982

seq1  TGAGCATTGTCTATTTCACCATTAAGGATTTATTTCTAACACATTTGCTT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCATTGTCTATTTCACCATTAAGGATTTATTTCTAACACATTTGCTT  1032

seq1  ATTAACTAATCCCCTACTATTGTGTACTAACAAGAGACACATTCGAAGGT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAACTAATCCCCTACTATTGTGTACTAACAAGAGACACATTCGAAGGT  1082

seq1  GGATATTGATTAATTAATTGTTCTACAATATATATTTAACAAACATAATA  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATATTGATTAATTAATTGTTCTACAATATATATTTAACAAACATAATA  1132

seq1  AATGTTTAAACATTTTAAAAACTAGATGACAGGCCAGATAATGGAAACTT  1198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTTTAAACATTTTAAAAACTAGATGACAGGCCAGATAATGGAAACTT  1182

seq1  TTTGGAATTC  1208
      ||||||||||
seq2  TTTGGAATTC  1192

seq1: chr2_141429200_141430252
seq2: B6Ng01-079E14.g_66_1106

seq1  GAATTCCACAGCTCCTGAGAAATATGCATCCTTCTCCTGTCAGACTTTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACAGCTCCTGAGAAATATGCATCCTTCTCCTGTCAGACTTTTG  50

seq1  CTTTTTCATTACTTGGAGGTGGTTGGAGAAATAGGGGAAATGAGAAGCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTCATTACTTGGAGGTGGTTGGAGAAATAGGGGAAATGAGAAGCTT  100

seq1  GATAGTATTCTCTCTTAGACCTGTGGAAAAAGTTTCTGTGGGTGGGATCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGTATTCTCTCTTAGACCTGTGGAAAAAGTTTCTGTGGGTGGGATCT  150

seq1  ATGAATGGGATTCAGGACATATCATGCCAAAATGGGGCAACTCAGTATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATGGGATTCAGGACATATCATGCCAAAATGGGGCAACTCAGTATTT  200

seq1  GAGAAAAGAGCAGGAGTATGAAAATTATTCCCTTTCCCTCTGCACTTCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAAGAGCAGGAGTATGAAAATTATTCCCTTTCCCTCTGCACTTCAC  250

seq1  AGAAATGGGACCTAAGACTCCATGTGAGAGGTGAGTTCCCTATATGTCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATGGGACCTAAGACTCCATGTGAGAGGTGAGTTCCCTATATGTCTA  300

seq1  GAAAAGGAACGTGCCTATATCTGAAGGGATGGGAAAGAAGCTGAACTAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGGAACGTGCCTATATCTGAAGGGATGGGAAAGAAGCTGAACTAAA  350

seq1  GGACCCTTGGGTACCTTCTTGTTATTTGTCCTTACATTTTATTTCCCTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCCTTGGGTACCTTCTTGTTATTTGTCCTTACATTTTATTTCCCTTC  400

seq1  TCAGTCGAATTCTCTGTGATTGTCAAGTCTTCACCAAACCTAGCAGGAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTCGAATTCTCTGTGATTGTCAAGTCTTCACCAAACCTAGCAGGAAC  450

seq1  CCACACATGTTAGCTTCCTTCTGTGGGTCTTTACATCCTTGGGAAGTCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACATGTTAGCTTCCTTCTGTGGGTCTTTACATCCTTGGGAAGTCTC  500

seq1  ATGAAGCCAATATTAAATGAACTTTGTCATCTTCTCTTACCAATTCTCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGCCAATATTAAATGAACTTTGTCATCTTCTCTTACCAATTCTCTG  550

seq1  CCTTAGCAATGAATCTGATGATGGGTGGCATGATGAGATACTTTCCCCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAGCAATGAATCTGATGATGGGTGGCATGATGAGATACTTTCCCCCC  600

seq1  TTACCTATTTCTAAGCCAGCATCCATAGGAGCCCACAGACTTCTACTCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCTATTTCTAAGCCAGCATCCATAGGAGCCCACAGACTTCTACTCTC  650

seq1  AAAAGCACTCCTGAACATCTGGAATTCACAAGTCACAGACTTTGCCATAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCACTCCTGAACATCTGGAATTCACAAGTCACAGACTTTGCCATAT  700

seq1  TCAGGCTCAGCAGGTGACCCTGGCTGCAGAAGGCCTTTGCTTGAGAATGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGCTCAGCAGGTGACCCTGGCTGCAGAAGGCCTTTGCTTGAGAATGA  750

seq1  TGGGTGATATAAACATGTCTTTCCCTCTCAGAGAAGAATGTGCTCTAGGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTGATATAAACATGTCTTTCCCTCTCAGAGAAGAATGTGCTCTAGGC  800

seq1  AAGATGGAGATACATGTTTGCGAACATTGAGGAGGATTAAAAGGGAGATT  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  AAGATGGAGATACATGTTTGCGAACATTGAGGAGGATTAAAAGGGAGA-T  849

seq1  ACAAGCATTTCCCTTTCCAAGGCAATGGAAAATGTCGAAACTTTTACTTT  900
      |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGCATTTCCTTTTCCAA-GCAATGGAAAATGTCGAAACTTTTACTTT  898

seq1  TATTACCAGTGAACTCAAAATGATGTTGGATGAGCACTGTAAGGAAAGCT  950
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTACCAGTGAACTC-AAATGATGTTGGATGAGCACTGTAAGGAAAGCT  947

seq1  ATAGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA  1000
      |||||||||  |||| ||| ||||| | ||||| ||||  | ||||| ||
seq2  ATAGCACAC-TACAC-CAC-CACAC-CTCACACGCACA-TCCCACAC-CA  991

seq1  CAAAGCATGATGGTGAGCTGATTTAGAAGCCTGTTATCTGCAGAAGCACG  1050
        ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGCATGAT-GTGAGCTGA-TTAG-AGCCTGTTATCTGCAGAAGCACG  1038

seq1  GTA  1053
      |||
seq2  GTA  1041