BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-079E16
Chromosome2 (Build37)
Map Location 141,429,200 - 141,531,237
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneFlrt3
Downstream geneLOC668913, LOC668914, Kif16b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-079E16.bB6Ng01-079E16.g
ACCDH894740DH894741
length1,1641,135
definitionDH894740|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-079E16, 5' end.DH894741|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-079E16, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(141,530,058 - 141,531,237)(141,429,200 - 141,430,350)
sequence
gaattccaaaaagtttccattatctggcctgtcatctagtttttaaaatg
tttaaacatttattatgtttgttaaatatatattgtagaacaattaatta
atcaatatccaccttcgaatgtgtctcttgttagtacacaatagtagggg
attagttaataagcaaatgtgttagaaataaatccttaatggtgaaatag
acaatgctcaaaacttgtggttgcctgaaaagactgcataaatgctgcca
agcttggtcctaagatatcaaaagctaagccagatccagagcaaccgcag
ttacacgtggaacgaatgactctctgggctgatttgcacagaggtttggc
tgcccaaaataaacttattctctaaagagttatctataagacttcccaca
gatgcagagttatcaagagatgtaccagataggcctggatagacacttct
gctaacggatgtttgcatgtgtggcggagttcagtccatgagttgttagt
tgtttccattgaaacagagtttggcatggctatgacataacagaggagct
tttttattttttaatttatttctatttttatccctgtgcattagtatttc
caaagtcttgattgttggtggagctaaaagttgttgagcagaaacagaac
aacaatgaagaaataggttgttggagaaagtgattcaggagcagtcctga
accgaccgccagaatcccctgcaacacactagagataactcccttagaaa
tggaggcatgatttgttccttctgtctaattctcaaatacactgggctca
taaatcaatgctaccatgaaatctcttctttctggagatccatcacacag
ccctgagtgctagagctggtgacaaacagctctggtagggggagagatac
acatgggtgagacatggggtcagctgaacatttttttctagtacattcat
tcacatcaagaacttcacttccttacaagtaccatattatttcccatcac
tctgacttatataaatagtcactaaaatagtatagatagctaaataacta
tattctcatgtaatggttatatgtacatactatcaagcatcatgtcatgt
atatgtgtaagtgctgcacatatgcatattggtggtgtgagtcaaggttc
aactggttgtattt
gaattccacagctcctgagaaatatgcatccttctcctgtcagacttttg
ctttttcattacttggaggtggttggagaaataggggaaatgagaagctt
gatagtattctctcttagacctgtggaaaaagtttctgtgggtgggatct
atgaatgggattcaggacatatcatgccaaaatggggcaactcagtattt
gagaaaagagcaggagtatgaaaattattccctttccctctgcacttcac
agaaatgggacctaagactccatgtgagaggtgagttccctatatgtcta
gaaaaggaacgtgcctatatctgaagggatgggaaagaagctgaactaaa
ggacccttgggtaccttcttgttatttgtccttacattttatttcccttc
tcagtcgaattctctgtgattgtcaagtcttcaccaaacctagcaggaac
ccacacatgttagcttccttctgtgggtctttacatccttgggaagtctc
atgaagccaatattaaatgaactttgtcatcttctcttaccaattctctg
ccttagcaatgaatctgatgatgggtggcatgatgagatactttcccccc
ttacctatttctaagccagcatccataggagcccacagacttctactctc
aaaagcactcctgaacatctggaattcacaagtcacagactttgccatat
tcaggctcagcaggtgaccctggctgcagaaggcctttgcttgagaatga
tgggtgatataaacatgtctttcctctcagagaagaatgtgctctaggca
agatggagatacatgttgcgaacattgaggaggattaaaagggagattac
aagcattttccttttccaggcaatggaaaatgtcgaaacttttactttta
ttaccagttgaactcaaatgatgttggatgagcactgtaaggaaagctat
agcacacacatacactctcactcacacatcacacacacacacacacacaa
agcatgatgtgagctgattaaagcctgttatctgcagaagcacggtaact
gtaccatgggtaaaataaagacttgcttgtttcctactagttgcttaaac
gaataaattctctttgactccttatcgtcctctga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_141530058_141531237
seq2: B6Ng01-079E16.b_46_1209 (reverse)

seq1  AAATACAACCAGTTTTGACCTCTGGACTTCACA-CAC--ATATGCATATG  47
      ||||||||||||  |||| | || ||| ||||| |||  |||||||||||
seq2  AAATACAACCAG--TTGAAC-CTTGAC-TCACACCACCAATATGCATATG  46

seq1  TGCACGCACTAACACATATACATGAACATGGATGCTTGAATATGTATGTA  97
      |||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||
seq2  TGCA-GCACTTACACATATACATG-ACAT-GATGCTTG-ATA-GTATGTA  91

seq1  CATATACACCATATACATGAAGAATAATAGTTTATTTTTAAGCTATTCTA  147
      |||||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||||   ||||| ||||
seq2  CATATA-ACCAT-TACATG-AGAAT-ATAG-TTATTT---AGCTA-TCTA  132

seq1  TACTATTTTAGTGACTTATTTATATAAGTCAGAGTGATTGGGAAATAATA  197
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TACTATTTTAGTGAC-TATTTATATAAGTCAGAGTGA-TGGGAAATAATA  180

seq1  TGGTACTTGTAAGGAAGTGAAGTTCTTGATGTGAATGAATGTACTAG-AA  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TGGTACTTGTAAGGAAGTGAAGTTCTTGATGTGAATGAATGTACTAGAAA  230

seq1  AAAATGTTCAGCTGACCCCATGTCTCACCCATGTGTATCTCTCCCCCTAC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGTTCAGCTGACCCCATGTCTCACCCATGTGTATCTCTCCCCCTAC  280

seq1  CAGAGCTGTTTGTCACCAGCTCTAGCACTCAGGGCTGTGTGATGGATCTC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCTGTTTGTCACCAGCTCTAGCACTCAGGGCTGTGTGATGGATCTC  330

seq1  CAGAAAGAAGAGATTTCATGGTAGCATTGATTTATGAGCCCAGTGTATTT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAAGAAGAGATTTCATGGTAGCATTGATTTATGAGCCCAGTGTATTT  380

seq1  GAGAATTAGACAGAAGGAACAAATCATGCCTCCATTTCTAAGGGAGTTAT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAATTAGACAGAAGGAACAAATCATGCCTCCATTTCTAAGGGAGTTAT  430

seq1  CTCTAGTGTGTTGCAGGGGATTCTGGCGGTCGGTTCAGGACTGCTCCTGA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAGTGTGTTGCAGGGGATTCTGGCGGTCGGTTCAGGACTGCTCCTGA  480

seq1  ATCACTTTCTCCAACAACCTATTTCTTCATTGTTGTTCTGTTTCTGCTCA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACTTTCTCCAACAACCTATTTCTTCATTGTTGTTCTGTTTCTGCTCA  530

seq1  ACAACTTTTAGCTCCACCAACAATCAAGACTTTGGAAATACTAATGCACA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACTTTTAGCTCCACCAACAATCAAGACTTTGGAAATACTAATGCACA  580

seq1  GGGATAAAAATAGAAATAAATTAAAAAATAAAAAAGCTCCTCTGTTATGT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATAAAAATAGAAATAAATTAAAAAATAAAAAAGCTCCTCTGTTATGT  630

seq1  CATAGCCATGCCAAACTCTGTTTCAATGGAAACAACTAACAACTCATGGA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGCCATGCCAAACTCTGTTTCAATGGAAACAACTAACAACTCATGGA  680

seq1  CTGAACTCCGCCACACATGCAAACATCCGTTAGCAGAAGTGTCTATCCAG  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAACTCCGCCACACATGCAAACATCCGTTAGCAGAAGTGTCTATCCAG  730

seq1  GCCTATCTGGTACATCTCTTGATAACTCTGCATCTGTGGGAAGTCTTATA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTATCTGGTACATCTCTTGATAACTCTGCATCTGTGGGAAGTCTTATA  780

seq1  GATAACTCTTTAGAGAATAAGTTTATTTTGGGCAGCCAAACCTCTGTGCA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAACTCTTTAGAGAATAAGTTTATTTTGGGCAGCCAAACCTCTGTGCA  830

seq1  AATCAGCCCAGAGAGTCATTCGTTCCACGTGTAACTGCGGTTGCTCTGGA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAGCCCAGAGAGTCATTCGTTCCACGTGTAACTGCGGTTGCTCTGGA  880

seq1  TCTGGCTTAGCTTTTGATATCTTAGGACCAAGCTTGGCAGCATTTATGCA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGCTTAGCTTTTGATATCTTAGGACCAAGCTTGGCAGCATTTATGCA  930

seq1  GTCTTTTCAGGCAACCACAAGTTTTGAGCATTGTCTATTTCACCATTAAG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTTCAGGCAACCACAAGTTTTGAGCATTGTCTATTTCACCATTAAG  980

seq1  GATTTATTTCTAACACATTTGCTTATTAACTAATCCCCTACTATTGTGTA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTATTTCTAACACATTTGCTTATTAACTAATCCCCTACTATTGTGTA  1030

seq1  CTAACAAGAGACACATTCGAAGGTGGATATTGATTAATTAATTGTTCTAC  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACAAGAGACACATTCGAAGGTGGATATTGATTAATTAATTGTTCTAC  1080

seq1  AATATATATTTAACAAACATAATAAATGTTTAAACATTTTAAAAACTAGA  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATATATTTAACAAACATAATAAATGTTTAAACATTTTAAAAACTAGA  1130

seq1  TGACAGGCCAGATAATGGAAACTTTTTGGAATTC  1180
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGGCCAGATAATGGAAACTTTTTGGAATTC  1164

seq1: chr2_141429200_141430350
seq2: B6Ng01-079E16.g_69_1203

seq1  GAATTCCACAGCTCCTGAGAAATATGCATCCTTCTCCTGTCAGACTTTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACAGCTCCTGAGAAATATGCATCCTTCTCCTGTCAGACTTTTG  50

seq1  CTTTTTCATTACTTGGAGGTGGTTGGAGAAATAGGGGAAATGAGAAGCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTCATTACTTGGAGGTGGTTGGAGAAATAGGGGAAATGAGAAGCTT  100

seq1  GATAGTATTCTCTCTTAGACCTGTGGAAAAAGTTTCTGTGGGTGGGATCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGTATTCTCTCTTAGACCTGTGGAAAAAGTTTCTGTGGGTGGGATCT  150

seq1  ATGAATGGGATTCAGGACATATCATGCCAAAATGGGGCAACTCAGTATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATGGGATTCAGGACATATCATGCCAAAATGGGGCAACTCAGTATTT  200

seq1  GAGAAAAGAGCAGGAGTATGAAAATTATTCCCTTTCCCTCTGCACTTCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAAGAGCAGGAGTATGAAAATTATTCCCTTTCCCTCTGCACTTCAC  250

seq1  AGAAATGGGACCTAAGACTCCATGTGAGAGGTGAGTTCCCTATATGTCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATGGGACCTAAGACTCCATGTGAGAGGTGAGTTCCCTATATGTCTA  300

seq1  GAAAAGGAACGTGCCTATATCTGAAGGGATGGGAAAGAAGCTGAACTAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGGAACGTGCCTATATCTGAAGGGATGGGAAAGAAGCTGAACTAAA  350

seq1  GGACCCTTGGGTACCTTCTTGTTATTTGTCCTTACATTTTATTTCCCTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCCTTGGGTACCTTCTTGTTATTTGTCCTTACATTTTATTTCCCTTC  400

seq1  TCAGTCGAATTCTCTGTGATTGTCAAGTCTTCACCAAACCTAGCAGGAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTCGAATTCTCTGTGATTGTCAAGTCTTCACCAAACCTAGCAGGAAC  450

seq1  CCACACATGTTAGCTTCCTTCTGTGGGTCTTTACATCCTTGGGAAGTCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACATGTTAGCTTCCTTCTGTGGGTCTTTACATCCTTGGGAAGTCTC  500

seq1  ATGAAGCCAATATTAAATGAACTTTGTCATCTTCTCTTACCAATTCTCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGCCAATATTAAATGAACTTTGTCATCTTCTCTTACCAATTCTCTG  550

seq1  CCTTAGCAATGAATCTGATGATGGGTGGCATGATGAGATACTTTCCCCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAGCAATGAATCTGATGATGGGTGGCATGATGAGATACTTTCCCCCC  600

seq1  TTACCTATTTCTAAGCCAGCATCCATAGGAGCCCACAGACTTCTACTCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCTATTTCTAAGCCAGCATCCATAGGAGCCCACAGACTTCTACTCTC  650

seq1  AAAAGCACTCCTGAACATCTGGAATTCACAAGTCACAGACTTTGCCATAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCACTCCTGAACATCTGGAATTCACAAGTCACAGACTTTGCCATAT  700

seq1  TCAGGCTCAGCAGGTGACCCTGGCTGCAGAAGGCCTTTGCTTGAGAATGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGCTCAGCAGGTGACCCTGGCTGCAGAAGGCCTTTGCTTGAGAATGA  750

seq1  TGGGTGATATAAACATGTCTTTCCCTCTCAGAGAAGAATGTGCTCTAGGC  800
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTGATATAAACATGTCTTT-CCTCTCAGAGAAGAATGTGCTCTAGGC  799

seq1  AAGATGGAGATACATGTTTGCGAACATTGAGGAGGATTAAAAGGGAGATT  850
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGGAGATACATG-TTGCGAACATTGAGGAGGATTAAAAGGGAGATT  848

seq1  ACAAGCATTTCCCTTTCCAAGGCAATGGAAAATGTCGAAACTTTTACTTT  900
      |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGCATTTTCCTTTTCCAGGCAATGGAAAATGTCGAAACTTTTACTTT  898

seq1  TATTACCAG-TGAACTCAAAATGATGTTGGATGAGCACTGTAAGGAAAGC  949
      ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTACCAGTTGAACTC-AAATGATGTTGGATGAGCACTGTAAGGAAAGC  947

seq1  TATAGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC  999
      ||||||||||||| |||| | ||| ||||||  |||||||||||||||||
seq2  TATAGCACACACATACACTCTCACTCACACA-TCACACACACACACACAC  996

seq1  ACAAAGCATGATGGTGAGCTGATTTAGAAGCCTGTTATCTGCAGAAGCAC  1049
      |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGCATGAT-GTGAGCTGATT--AAAGCCTGTTATCTGCAGAAGCAC  1043

seq1  GGTAACTTGTACCATGGGTGAAAATAGAAGACTTGCCTTTGTCTTTCTTA  1099
      |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||  |||  |||| ||
seq2  GGTAAC-TGTACCATGGGT-AAAATA-AAGACTTGC--TTG--TTTCCTA  1086

seq1  CTAGTTGCTTATACAGATGAAATTCTCTTGAACTCCTTAAATCGTCCTCT  1149
      ||||||||||| || ||  ||||||||||  |||||||  ||||||||||
seq2  CTAGTTGCTTAAAC-GAATAAATTCTCTTTGACTCCTT--ATCGTCCTCT  1133

seq1  GA  1151
      ||
seq2  GA  1135