BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-082N10
Chromosome2 (Build37)
Map Location 166,431,422 - 166,560,518
singlet/doubletdoublet
Overlap geneBC067047
Upstream geneEya2, Prkcbp1, LOC546780, Ncoa3, Sulf2, LOC670775, Ppia-ps2_2197.1
Downstream geneTrp53rk, Arfgef2, LOC670802, Cse1l, Stau1, LOC383774, Ddx27, AI481105, 1500012F01Rik, LOC668950, Kcnb1, Ptgis, LOC668951, B4galt5, Slc9a8, Spata2, Zfp313, Snai1, Ube2v1, AI840826, Cebpb
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-082N10.bB6Ng01-082N10.g
ACCDH897275DH897276
length1,143923
definitionDH897275|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-082N10, 5' end.DH897276|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-082N10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(166,431,422 - 166,432,573)(166,559,737 - 166,560,518)
sequence
tgggtggactttttaatcctgtgaaactttaagctggaacccaggaggga
aaccagataaagttaatctcttcttacgcaggaacctcaaactctgaaca
ggggatactggccaggtagagtctgtgccaagccagtcaaagctaaagcc
actgctcaaagagcccaccacaaccccgtgggtccagctcttcaagagag
cgagcaggaaatctgatatttcctatggagctcccagttgttcaatgctg
gccccaggcttccacgtgtactgggccagcagagagtgccccaagctgga
catcagcgtgcacagaagctctgagtgacaggtggcagtagggagctggg
atctgacagtagctctgggtgaggctataaacaacaaggcccaggcttcc
agatagatgtccccacagcagtgggaggcactgaggtttggaggccaagg
tggggtggaatcaaatggcagagtcctctgacaggctgtgccaacttccc
ttctccttcggccctgccgaatggacaccactcagcccgtttcaggtcaa
ggccaaggttgagcacagagggcatgtgggcacatcctttcatgagcgac
acctgatcagaggctccatgtaccactccccaaagggacatcttcccact
tgcttcctgcctggagcctggggttgagatgccacctggagtcccatgca
caaagtccctgccaatgtccctggtgatgtctgtcaggccgtgtgactct
catacctcaacttcatgactgccgagagtgcaggcgtgtgccgctacacc
cagtttgatctctgttgcatgcagctatgcacacagccttctacctcaga
gcccccagtgtgtggatgtttaacaacaagacacgccgtcactatcaagg
gaggcaacaaatgcctctgcctcagaaaccatcccgagtggcctgggtct
cacattcatctttgcccctactgagcctcctgaacacctggactaaagcc
tgaccctgacccagtgccacgagaatgcagcctgctgactccgagcctcg
ggcaacagttcgccaactcagctcctgccacccagcataccaagctccga
aagccaccagatcttgccacgcccaggcgtgctgctcccctgg
gaattccataccctcctctggcctcatagggcactgcacacatgtggcaa
atggcaaatacacagatggatggacacacacacacacacggacacacaca
agacaaaataaaataagcctttattgaaggcaaacaagcaaggcatggtg
gttcgtgtctgaggccacaacccttgagaggctgaagcaggactgccatg
agttcaagccaaacagagtgcccttgaatgtcttgagatacagagggaga
ctgtctttaaattttaaaaaggaagaaaggaaaataaaaccaagtggcta
agagcactgtgccttccagagcagcggttctcaacctgtgggtctcgacc
cctttaccagacctctatctccaaaagtgtttacattacaattcgtaaca
gtagcaaaattgcagtcatgaagtagcaacaaacataattctatggttag
aggtcggcacagcgtgaggaactgtgttaaagggtcacagcactaggaag
gctgagagccgctgctctacaggattcaagttcagttcccagcaccaaac
agcagctcactgctgcctgtaacttcagttctaggagatcagacattctc
ttctggactctacaggcactgaacacattgcacacgcatgcacacacaaa
ataaagtaaaaacaaaaccaaaaaacaggaggaggaggagtgcttggtgt
tagaataataatggtcacaattttcatctcacacataaacacatccacat
atatacacatacacacatatacacatacactcatatacacatacatacat
atagatacatacatatacacacatgtacatatacacacatacacacatgc
acaatatacatatatataaacatatatgcacataaacacatatatacact
cataatactcatacatacacctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_166431422_166432573
seq2: B6Ng01-082N10.b_57_1199

seq1  TGGGTGGACTTTTTAATCCTGTGAAACTTTAAGCTGGAACCCAGGAGGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTGGACTTTTTAATCCTGTGAAACTTTAAGCTGGAACCCAGGAGGGA  50

seq1  AACCAGATAAAGTTAATCTCTTCTTACGCAGGAACCTCAAACTCTGAACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAGATAAAGTTAATCTCTTCTTACGCAGGAACCTCAAACTCTGAACA  100

seq1  GGGGATACTGGCCAGGTAGAGTCTGTGCCAAGCCAGTCAAAGCTAAAGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGATACTGGCCAGGTAGAGTCTGTGCCAAGCCAGTCAAAGCTAAAGCC  150

seq1  ACTGCTCAAAGAGCCCACCACAACCCCGTGGGTCCAGCTCTTCAAGAGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTCAAAGAGCCCACCACAACCCCGTGGGTCCAGCTCTTCAAGAGAG  200

seq1  CGAGCAGGAAATCTGATATTTCCTATGGAGCTCCCAGTTGTTCAATGCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGCAGGAAATCTGATATTTCCTATGGAGCTCCCAGTTGTTCAATGCTG  250

seq1  GCCCCAGGCTTCCACGTGTACTGGGCCAGCAGAGAGTGCCCCAAGCTGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCAGGCTTCCACGTGTACTGGGCCAGCAGAGAGTGCCCCAAGCTGGA  300

seq1  CATCAGCGTGCACAGAAGCTCTGAGTGACAGGTGGCAGTAGGGAGCTGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGCGTGCACAGAAGCTCTGAGTGACAGGTGGCAGTAGGGAGCTGGG  350

seq1  ATCTGACAGTAGCTCTGGGTGAGGCTATAAACAACAAGGCCCAGGCTTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGACAGTAGCTCTGGGTGAGGCTATAAACAACAAGGCCCAGGCTTCC  400

seq1  AGATAGATGTCCCCACAGCAGTGGGAGGCACTGAGGTTTGGAGGCCAAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGATGTCCCCACAGCAGTGGGAGGCACTGAGGTTTGGAGGCCAAGG  450

seq1  TGGGGTGGAATCAAATGGCAGAGTCCTCTGACAGGCTGTGCCAACTTCCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGTGGAATCAAATGGCAGAGTCCTCTGACAGGCTGTGCCAACTTCCC  500

seq1  TTCTCCTTCGGCCCTGCCGAATGGACACCACTCAGCCCGTTTCAGGTCAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCTTCGGCCCTGCCGAATGGACACCACTCAGCCCGTTTCAGGTCAA  550

seq1  GGCCAAGGTTGAGCACAGAGGGCATGTGGGCACATCCTTTCATGAGCGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAAGGTTGAGCACAGAGGGCATGTGGGCACATCCTTTCATGAGCGAC  600

seq1  ACCTGATCAGAGGCTCCATGTACCACTCCCCAAAGGGACATCTTCCCACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGATCAGAGGCTCCATGTACCACTCCCCAAAGGGACATCTTCCCACT  650

seq1  TGCTTCCTGCCTGGAGCCTGGGGTTGAGATGCCACCTGGAGTCCCATGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCCTGCCTGGAGCCTGGGGTTGAGATGCCACCTGGAGTCCCATGCA  700

seq1  CAAAGTCCCTGCCAATGTCCCTGGTGATGTCTGTCAGGCCGTGTGACTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTCCCTGCCAATGTCCCTGGTGATGTCTGTCAGGCCGTGTGACTCT  750

seq1  CATACCTCAACTTCATGACTGCCGAGAGTGCAGGCGTGTGCCGCTACACC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACCTCAACTTCATGACTGCCGAGAGTGCAGGCGTGTGCCGCTACACC  800

seq1  CAGTTTGATCTCTGTTGCATGCAGCTATGCACACAGCCTTCTACCTCAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTTGATCTCTGTTGCATGCAGCTATGCACACAGCCTTCTACCTCAGA  850

seq1  GCCCCCAGTGTGTGGATGTTTAACAACAAGACACGCCGTCACTATCAAGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCCAGTGTGTGGATGTTTAACAACAAGACACGCCGTCACTATCAAGG  900

seq1  GAGGCAACAAATGCCTCTGCCTCAGGAAACCATCCCGAGTGGCCCTGGGG  950
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||
seq2  GAGGCAACAAATGCCTCTGCCTCA-GAAACCATCCCGAGTGGCC--TGGG  947

seq1  TCTCACAATTCATCTTTGCCCCCTACTGAGCCTCCCTGAACACCTGGACT  1000
      |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TCTCAC-ATTCATCTTTG-CCCCTACTGAGCCT-CCTGAACACCTGGACT  994

seq1  AAAGCCTGACCCCTGACCCAGTGCCACGAG-ATGCAGCCCTGCTGACTCC  1049
      ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
seq2  AAAGCCTGA-CCCTGACCCAGTGCCACGAGAATGCAG-CCTGCTGACT-C  1041

seq1  CGAGCCTCGGGCCAACAG-TCGCCAACTCAGCTCCTGCCACCCCAGCAT-  1097
      ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| 
seq2  CGAGCCTCGGG-CAACAGTTCGCCAACTCAGCTCCTGCCA-CCCAGCATA  1089

seq1  CACAGCTCACGAAAGCCACCAGACTCTGCCACGCCCAGGCGTGCTGCTCC  1147
      |  ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGCTC-CGAAAGCCACCAGATCTTGCCACGCCCAGGCGTGCTGCTCC  1138

seq1  TCTGG  1152
       ||||
seq2  CCTGG  1143

seq1: chr2_166559737_166560518
seq2: B6Ng01-082N10.g_70_852 (reverse)

seq1  TGAGTGTATGTGTATATGTGTGTATGTGTATATATGTGGATGTGTTTATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTGTATGTGTATATGTGTGTATGTGTATATATGTGGATGTGTTTATG  50

seq1  TGTGAGATGAAAATTGTGACCATTATTATTCTAACACCAAGCACTCCTCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGATGAAAATTGTGACCATTATTATTCTAACACCAAGCACTCCTCC  100

seq1  TCCTCCTGTTTTTTGGTTTTGTTTTTACTTTA-TTTGTGTGTGCATGCGT  149
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TCCTCCTGTTTTTTGGTTTTGTTTTTACTTTATTTTGTGTGTGCATGCGT  150

seq1  GTGCAATGTGTTCAGTGCCTGTAGAGTCCAGAAGAGAATGTCTGATCTCC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAATGTGTTCAGTGCCTGTAGAGTCCAGAAGAGAATGTCTGATCTCC  200

seq1  TAGAACTGAAGTTACAGGCAGCAGTGAGCTGCTGTTTGGTGCTGGGAACT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAACTGAAGTTACAGGCAGCAGTGAGCTGCTGTTTGGTGCTGGGAACT  250

seq1  GAACTTGAATCCTGTAGAGCAGCGGCTCTCAGCCTTCCTAGTGCTGTGAC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTTGAATCCTGTAGAGCAGCGGCTCTCAGCCTTCCTAGTGCTGTGAC  300

seq1  CCTTTAACACAGTTCCTCACGCTGTGCCGACCTCTAACCATAGAATTATG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTAACACAGTTCCTCACGCTGTGCCGACCTCTAACCATAGAATTATG  350

seq1  TTTGTTGCTACTTCATGACTGCAATTTTGCTACTGTTACGAATTGTAATG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTGCTACTTCATGACTGCAATTTTGCTACTGTTACGAATTGTAATG  400

seq1  TAAACACTTTTGGAGATAGAGGTCTGGTAAAGGGGTCGAGACCCACAGGT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACACTTTTGGAGATAGAGGTCTGGTAAAGGGGTCGAGACCCACAGGT  450

seq1  TGAGAACCGCTGCTCTGGAAGGCACAGTGCTCTTAGCCACTTGGTTTTAT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAACCGCTGCTCTGGAAGGCACAGTGCTCTTAGCCACTTGGTTTTAT  500

seq1  TTTCCTTTCTTCCTTTTTAAAATTTAAAGACAGTCTCCCTCTGTATCTCA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTTTCTTCCTTTTTAAAATTTAAAGACAGTCTCCCTCTGTATCTCA  550

seq1  AGACATTCAAGGGCACTCTGTTTGGCTTGAACTCATGGCAGTCCTGCTTC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATTCAAGGGCACTCTGTTTGGCTTGAACTCATGGCAGTCCTGCTTC  600

seq1  AGCCTCTCAAGGGTTGTGGCCTCAGACACGAACCACCATGCCTTGCTTGT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCTCAAGGGTTGTGGCCTCAGACACGAACCACCATGCCTTGCTTGT  650

seq1  TTGCCTTCAATAAAGGCTTATTTTATTTTGTCTTGTGTGTGTCCGTGTGT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCTTCAATAAAGGCTTATTTTATTTTGTCTTGTGTGTGTCCGTGTGT  700

seq1  GTGTGTGTGTCCATCCATCTGTGTATTTGCCATTTGCCACATGTGTGCAG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTCCATCCATCTGTGTATTTGCCATTTGCCACATGTGTGCAG  750

seq1  TGCCCTATGAGGCCAGAGGAGGGTATGGAATTC  782
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTATGAGGCCAGAGGAGGGTATGGAATTC  783