BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-084E22
Chromosome2 (Build37)
Map Location 155,392,648 - 155,569,151
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGss, Myh7b, Trpc4ap, Edem2
Upstream geneE2f1, Pxmp4, Zfp341, Chmp4b, LOC668936, LOC435692, Raly, Eif2s2, a, Ahcy, Itch, LOC100043877, LOC668931, Dynlrb1, Map1lc3a, Cdc91l1, Trp53inp2, Ncoa6, LOC668938, Ggtl3, Acss2
Downstream geneProcr, Mmp24, Itgb4bp, 5530400B04Rik, 2410003P15Rik, Gdf5, Cep250, Ergic3, Fer1l4, Spag4, Cpne1, Rbm12, Nfs1, 2010100O12Rik, Rbm39, Phf20, Scand1, LOC632394, LOC628707, LOC669792, 2900097C17Rik, LOC668941, Epb4.1l1, 0610011L14Rik, Dlgap4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-084E22.bB6Ng01-084E22.g
ACCDH898303DH898304
length1,1061,076
definitionDH898303|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-084E22, 5' end.DH898304|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-084E22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(155,392,648 - 155,393,757)(155,568,051 - 155,569,151)
sequence
gaattcagtctataggtcctgctggtcatgcagagtgacttccaggggtg
gggggaacagaagggaaaacaccataaattcctttaggctagacacttca
atccagatgtgacccttaactcccttgcagcactaaataccaaacaggct
ttcagtactacagcaaaggcctggaaagtggctacagatataccctaatt
ctctctactctccagtcatttcctttggttttcatccttatcatcaccat
tgctgagggagttgaaatggatttttagccccccaagttttagctcctgc
tgtggtggtttgaatatgcttggcccagggaatgtcatgactaggaggtg
tggccttgttggagtaggcgtggccctgttggacaaagtgtgtcactgtg
ggggtgggctttgagaccctcctcttagctgtccacgagccagtcttctt
tctcctggctgcattgaatcaagatgtagaactttcagctcgttctccaa
catcatgcctgcctggaagctgcatgctcttaccttgatgataatggatg
gaacctctaagccagccccaattaaatgttgtcctttataagaggacatg
ccttggccatggtgtctgttcacagcaatggaaaccctaactaagacacc
tgctcgcaaggcttaggggtcctccagagcagcaaggatgtgagccatat
gccagccacagtgccagctgtgatacaccctcaccagcacatttgccgtc
tctgttgtgtggtaggaaaaatgctacataccatgtccagtgaatagagg
ccagcaaaggtggctcggaggcgggccacagcctcagctggcccgggagc
agcgcttccagcagacccaccctgctcagttcctgctgcaccttcttagt
cccagccagctgtatggcaatgtctggacacttggcagcacgagatctct
ctagcatcagcgtgcttcccagttctgcagatgcaatagaccacagagcc
tttatgagtaggtgccagacactgtgccttttaatcctcaagctgattat
cattacaacatcctgttgaggcagaatgacctctggtctgccagaatgct
agcctt
gaattcagagaggatgagggcaatgggttgagcaggagagagtgggagag
tactggaagtaggtagtccaggagctgctgagctgggaagagccaaaggt
ttagcttgccatctaaacccagaaatgttggcattggagctgaggggctg
ataaatcacacaccatggcgggctctgggccagcagccagattcgactag
aatctgaaaaataaagatctttaatgagctaagggaagtgaaggaagcaa
gtggtagtttctcatcccgaattgcacatgttgggaatagataagagaaa
caggaaaccgcctgcccgggccagtgttggtgcggccccagcgggtgaga
gcggggcccctgcccggcctggctgtgtgcccagctgcacttcagaggat
ccactccctggtccccgtgacccgaagatagacctgacccaacctggctc
aactccaccacagtgctacctctatggagacgatgcccacccccacctcg
ccaggactggggaccaataacagttacacgaagtttacaaggcccagaca
gacactgtgctgagtgagagtacttgggcttgattttcattagacacccc
ccacccccaccccacccccaaaatgcccagagaagcatcctgggaactct
cattttccagatgaggatacagaggcactggctgtgagcgaacagctaag
atacccagatggtcagagtcaaagctgcaaaccaggtgagctgggctccc
aaacatgctctcctcgtccttagagcatcgtatggatcctgcgtgcccac
acactgtgtgacctgagaaggcaaaggagacaaagagaggagctggcttt
gcaggcagccaagccaacgaacggtggctcagaagaatggaggtggatgc
gaatggactgtaatttcctgaagggaaaggcagagcacagcgaagcctta
gtcagatgtcagtgtagtgtagcgtctcaacacactcagctagggcatgt
ggacatgtgacagcgccgcagcagcaaactcagctcttgcagcccaatgt
gccagcactgatgggtgctatgactc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_155392648_155393757
seq2: B6Ng01-084E22.b_46_1151

seq1  GAATTCAGTCTATAGGTCCTGCTGGTCATGCAGAGTGACTTCCAGGGGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTCTATAGGTCCTGCTGGTCATGCAGAGTGACTTCCAGGGGTG  50

seq1  GGGGGAACAGAAGGGAAAACACCATAAATTCCTTTAGGCTAGACACTTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGAACAGAAGGGAAAACACCATAAATTCCTTTAGGCTAGACACTTCA  100

seq1  ATCCAGATGTGACCCTTAACTCCCTTGCAGCACTAAATACCAAACAGGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAGATGTGACCCTTAACTCCCTTGCAGCACTAAATACCAAACAGGCT  150

seq1  TTCAGTACTACAGCAAAGGCCTGGAAAGTGGCTACAGATATACCCTAATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGTACTACAGCAAAGGCCTGGAAAGTGGCTACAGATATACCCTAATT  200

seq1  CTCTCTACTCTCCAGTCATTTCCTTTGGTTTTCATCCTTATCATCACCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTACTCTCCAGTCATTTCCTTTGGTTTTCATCCTTATCATCACCAT  250

seq1  TGCTGAGGGAGTTGAAATGGATTTTTAGCCCCCCAAGTTTTAGCTCCTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGAGGGAGTTGAAATGGATTTTTAGCCCCCCAAGTTTTAGCTCCTGC  300

seq1  TGTGGTGGTTTGAATATGCTTGGCCCAGGGAATGTCATGACTAGGAGGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTGGTTTGAATATGCTTGGCCCAGGGAATGTCATGACTAGGAGGTG  350

seq1  TGGCCTTGTTGGAGTAGGCGTGGCCCTGTTGGACAAAGTGTGTCACTGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTTGTTGGAGTAGGCGTGGCCCTGTTGGACAAAGTGTGTCACTGTG  400

seq1  GGGGTGGGCTTTGAGACCCTCCTCTTAGCTGTCCACGAGCCAGTCTTCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTGGGCTTTGAGACCCTCCTCTTAGCTGTCCACGAGCCAGTCTTCTT  450

seq1  TCTCCTGGCTGCATTGAATCAAGATGTAGAACTTTCAGCTCGTTCTCCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTGGCTGCATTGAATCAAGATGTAGAACTTTCAGCTCGTTCTCCAA  500

seq1  CATCATGCCTGCCTGGAAGCTGCATGCTCTTACCTTGATGATAATGGATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATGCCTGCCTGGAAGCTGCATGCTCTTACCTTGATGATAATGGATG  550

seq1  GAACCTCTAAGCCAGCCCCAATTAAATGTTGTCCTTTATAAGAGGACATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCTCTAAGCCAGCCCCAATTAAATGTTGTCCTTTATAAGAGGACATG  600

seq1  CCTTGGCCATGGTGTCTGTTCACAGCAATGGAAACCCTAACTAAGACACC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGCCATGGTGTCTGTTCACAGCAATGGAAACCCTAACTAAGACACC  650

seq1  TGCTCGCAAGGCTTAGGGGTCCTCCAGAGCAGCAAGGATGTGAGCCATAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCGCAAGGCTTAGGGGTCCTCCAGAGCAGCAAGGATGTGAGCCATAT  700

seq1  GCCAGCCACAGTGCCAGCTGTGATACACCCTCACCAGCACATTTGCCGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGCCACAGTGCCAGCTGTGATACACCCTCACCAGCACATTTGCCGTC  750

seq1  TCTGTTGTGTGGTAGGAAAAATGCTACATACCATGTCCAGTGAATAGAGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTGTGTGGTAGGAAAAATGCTACATACCATGTCCAGTGAATAGAGG  800

seq1  CCAGCAAAGGTGGCTCGGAGGCGGGCCACAGCCTCAGGCTGGCCCGGGAG  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CCAGCAAAGGTGGCTCGGAGGCGGGCCACAGCCTCA-GCTGGCCCGGGAG  849

seq1  CAGCGCTTCCAGCAGACCCACCCTGCTCAGTTCCTGCTGCACCTTCTTAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCGCTTCCAGCAGACCCACCCTGCTCAGTTCCTGCTGCACCTTCTTAG  899

seq1  TCCCAGCCAGCTGTATGGCAATGTCTGGACACTTGGCAGCACGAGATCTC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGCCAGCTGTATGGCAATGTCTGGACACTTGGCAGCACGAGATCTC  949

seq1  TCTAGCATCAGGCGTGCTTCCCAGTTCTGCAGATGCAATAAGACCACAGA  1000
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TCTAGCATCA-GCGTGCTTCCCAGTTCTGCAGATGCAAT-AGACCACAGA  997

seq1  GCCTTTATGAGTAGGTGCCAGACACTGTGCCTTTTAATCCTCAAGCTGAT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTTATGAGTAGGTGCCAGACACTGTGCCTTTTAATCCTCAAGCTGAT  1047

seq1  TATCATTACAACATCCTTGTGAGGCAGATATGACCTCTCGGTCTGCAAG-  1099
      |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| || 
seq2  TATCATTACAACATCCTGTTGAGGCAGA-ATGACCTCT-GGTCTGCCAGA  1095

seq1  ATGCTAGCCTT  1110
      |||||||||||
seq2  ATGCTAGCCTT  1106

seq1: chr2_155568051_155569151
seq2: B6Ng01-084E22.g_68_1143 (reverse)

seq1  GAGTCATAGCAACACCATCAGGTGCCTGCCAACCATTGGGGCTGGCAGAG  50
      |||||||||||   |||||| ||| ||| ||  |||| ||||||  ||||
seq2  GAGTCATAGCA--CCCATCA-GTG-CTGGCA--CATT-GGGCTGCAAGAG  43

seq1  CTGGAGTTTGCCTGGCCTGCGGCCGCTGGTCACATGTCCCACATGCCCTA  100
      || ||||||| |||  |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||
seq2  CT-GAGTTTG-CTG--CTGCGG-CGCT-GTCACATGT-CCACATGCCCTA  86

seq1  GGCTGAAGTGTGTTGAGAACGGCTAACACTACACTGAACATCCTGACTAA  150
       |||| ||||||||||||   ||| ||||||||||| |||| ||||||||
seq2  -GCTG-AGTGTGTTGAGA--CGCT-ACACTACACTG-ACAT-CTGACTAA  129

seq1  GGCCTTCCGCCTGTGCCTCTGCC-TTCCCTTCAGGAAATTACAGTCCATT  199
      || ||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GG-CTTC--GCTGTG-CTCTGCCTTTCCCTTCAGGAAATTACAGTCCATT  175

seq1  CGCATCCACCTCCATTCTTCCTGAGCCACCGTTCGTTGGCTTGGCTGCCT  249
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCATCCACCTCCATTCTT-CTGAGCCACCGTTCGTTGGCTTGGCTGCCT  224

seq1  GCAAAGCCAGCTCCTCTCTTTGTCTCCTTTGCCTTCTCAGGTCACACAGT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGCCAGCTCCTCTCTTTGTCTCCTTTGCCTTCTCAGGTCACACAGT  274

seq1  GTGTGGGCACGCAGGATCCATACGATGCTCTAAGGACGAGGAGAGCATGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGGGCACGCAGGATCCATACGATGCTCTAAGGACGAGGAGAGCATGT  324

seq1  TTGGGAGCCCAGCTCACCTGGTTTGCAGCTTTGACTCTGACCATCTGGGT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGAGCCCAGCTCACCTGGTTTGCAGCTTTGACTCTGACCATCTGGGT  374

seq1  ATCTTAGCTGTTCGCTCACAGCCAGTGCCTCTGTATCCTCATCTGGAAAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTAGCTGTTCGCTCACAGCCAGTGCCTCTGTATCCTCATCTGGAAAA  424

seq1  TGAGAGTTCCCAGGATGCTTCTCTGGGCATTTTGGGGGTGGGGTGGGGGT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGTTCCCAGGATGCTTCTCTGGGCATTTTGGGGGTGGGGTGGGGGT  474

seq1  GGGGGGTGTCTAATGAAAATCAAGCCCAAGTACTCTCACTCAGCACAGTG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGGTGTCTAATGAAAATCAAGCCCAAGTACTCTCACTCAGCACAGTG  524

seq1  TCTGTCTGGGCCTTGTAAACTTCGTGTAACTGTTATTGGTCCCCAGTCCT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCTGGGCCTTGTAAACTTCGTGTAACTGTTATTGGTCCCCAGTCCT  574

seq1  GGCGAGGTGGGGGTGGGCATCGTCTCCATAGAGGTAGCACTGTGGTGGAG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGAGGTGGGGGTGGGCATCGTCTCCATAGAGGTAGCACTGTGGTGGAG  624

seq1  TTGAGCCAGGTTGGGTCAGGTCTATCTTCGGGTCACGGGGACCAGGGAGT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGCCAGGTTGGGTCAGGTCTATCTTCGGGTCACGGGGACCAGGGAGT  674

seq1  GGATCCTCTGAAGTGCAGCTGGGCACACAGCCAGGCCGGGCAGGGGCCCC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCCTCTGAAGTGCAGCTGGGCACACAGCCAGGCCGGGCAGGGGCCCC  724

seq1  GCTCTCACCCGCTGGGGCCGCACCAACACTGGCCCGGGCAGGCGGTTTCC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCACCCGCTGGGGCCGCACCAACACTGGCCCGGGCAGGCGGTTTCC  774

seq1  TGTTTCTCTTATCTATTCCCAACATGTGCAATTCGGGATGAGAAACTACC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCTCTTATCTATTCCCAACATGTGCAATTCGGGATGAGAAACTACC  824

seq1  ACTTGCTTCCTTCACTTCCCTTAGCTCATTAAAGATCTTTATTTTTCAGA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGCTTCCTTCACTTCCCTTAGCTCATTAAAGATCTTTATTTTTCAGA  874

seq1  TTCTAGTCGAATCTGGCTGCTGGCCCAGAGCCCGCCATGGTGTGTGATTT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAGTCGAATCTGGCTGCTGGCCCAGAGCCCGCCATGGTGTGTGATTT  924

seq1  ATCAGCCCCTCAGCTCCAATGCCAACATTTCTGGGTTTAGATGGCAAGCT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGCCCCTCAGCTCCAATGCCAACATTTCTGGGTTTAGATGGCAAGCT  974

seq1  AAACCTTTGGCTCTTCCCAGCTCAGCAGCTCCTGGACTACCTACTTCCAG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTTTGGCTCTTCCCAGCTCAGCAGCTCCTGGACTACCTACTTCCAG  1024

seq1  TACTCTCCCACTCTCTCCTGCTCAACCCATTGCCCTCATCCTCTCTGAAT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCTCCCACTCTCTCCTGCTCAACCCATTGCCCTCATCCTCTCTGAAT  1074

seq1  TC  1101
      ||
seq2  TC  1076