BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-084F06
Chromosome2 (Build37)
Map Location 156,133,880 - 156,321,747
singlet/doubletdoublet
Overlap genePhf20, Scand1, LOC632394, LOC628707, LOC669792, 2900097C17Rik, LOC668941, Epb4.1l1
Upstream geneCdc91l1, Trp53inp2, Ncoa6, LOC668938, Ggtl3, Acss2, Gss, Myh7b, Trpc4ap, Edem2, Procr, Mmp24, Itgb4bp, 5530400B04Rik, 2410003P15Rik, Gdf5, Cep250, Ergic3, Fer1l4, Spag4, Cpne1, Rbm12, Nfs1, 2010100O12Rik, Rbm39
Downstream gene0610011L14Rik, Dlgap4, Myl9, LOC433546, Tgif2, LOC100043677, 1110008F13Rik, Sla2, LOC100043880, Ndrg3, LOC668943, Dsn1, 9830001H06Rik, Gm1332, Samhd1, Rbl1, LOC100043882, 4922505G16Rik, Rpn2, Ghrh, LOC100043678, Manbal, Src
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-084F06.bB6Ng01-084F06.g
ACCDH898319DH898320
length1,154983
definitionDH898319|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-084F06, 5' end.DH898320|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-084F06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(156,133,880 - 156,135,040)(156,320,765 - 156,321,747)
sequence
gaattccaggaggaagcagtcaggggctggaacccaaaggacagcatttt
ctacccacttactaatttcaactgcttcccagttctatttaaagttatga
aaaaaagtttcccaaaattttcgaactcttttactgtaaagatttgttac
aaagaaggtgggaattaccttactttatgtctcatccgcaaacttgcaac
tctgttgcttgtttccctcctccctggaggctggggtagcagtcgccact
ccagccactccactctttcaattccccgtctgtgttactttatgagatga
aggtaattatgctgcttatggtccaggtacaacctctttgtaccttcaca
gagatgtttgtgttgtttcttgtttcgcaggttctggttccatgtgtcat
tgctatgttgtttgcttggttttatcttattaggtgaaatgtaaaaggtt
ccgtgctgtgaggacttcattttcaccagtttttgtatcactaacggtaa
actttgtttgatttattcatcaacatccacagattcattatcagttttgt
aatctgtaatgttctaggctgcaaatatttactatgtaaacattaaggag
ccaatgtcggtagctaccaacagcagcacctctcgctgccttaggaatgg
ttaagtttcaggcctaacaggccatcatggccataaattcaggcttgtgt
acagagaagctttcagggaatgaatgcccttatctaaagatctgttcacc
atctgatacaaaatgtgctgtggagcaagcatgaggtgacctggcatagc
tttagggaatgtgtgatgtgtaattaagccaacacagtcccttacaagag
gctgcttcccactgctcacattgatgtcttcttgtgggaagaagtgctcc
aagagtacacatgccatcacggttctggaatatttatcatagagctacat
tttgagacttgtatgatgattgtctgaaagggaaagaaacagatacttaa
agctacactgtgtgaggtatgatgattgttagatactaatttggggccat
caaagtgcttagttgggagaggtgcttgctaccagctgctgacttgagtt
caagatccaggaacgaaaaagagaatgacaccttcagtgttctgtgaccc
acat
gaattctccctgcccacccgccacaccctgcctccccagctgggcacctt
ctggctgtcagcatcacagtaggtcagaccgaagtagtccttctccagga
ggttaaggtgctcacagaccaggtcaaacagcacctggccccggccgtgc
ttctgagggagaaagaagagtttttgtgaggccggtggacctgttgttgg
ggctgggagctgacccaggtcccagtgcacacaggaagagttcccacaag
cctcccctcagcagggcaggacctcagcactcctgccacaggctcccctc
tctgggtctataatgcccactgcatctaggtctctcttacaagccctgcc
agggtcttcctagactatggacctgcctgaaagcatgctggagatttctg
cttaacagaaaccaagagaagcagctgaaaaccaaagttctatgacttgt
gggagaaaaagagaagatgccctcaaaagatgcgagccagagccagggga
tgggagtgggggttgcaggagatagagtggaactaggaatcacagtggga
ttattttgtggtcaaccctgcatatcagttcttaaatggggacattttta
ccaaggcacggataccccgagacaccttttcctgatgccagtccgtgctg
agtcttaatttggtctgcaatagtaatgacccttttctggacctcggtgt
caccatcttgtaccagggagtaccaggccaagccatcactccggacatca
cagtgggtcctcctgtggtttggcttggactcaggacacacagagctagc
ctggcgctggggcccagccagcctgggccagggcatatggtactggggcc
agccggcctgggcaggtcttatggcgctgggcgtcccctaccttcacttc
acactcatactcagaagcatcgagcaggatgacgcggcatatggcacttc
tgaacttcttggcatcttctaagtggacttctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_156133880_156135040
seq2: B6Ng01-084F06.b_43_1196

seq1  GAATTCCAGGAGGAAGCAGTCAGGGGCTGGAACCCAAAGGACAGCATTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGAGGAAGCAGTCAGGGGCTGGAACCCAAAGGACAGCATTTT  50

seq1  CTACCCACTTACTAATTTCAACTGCTTCCCAGTTCTATTTAAAGTTATGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCCACTTACTAATTTCAACTGCTTCCCAGTTCTATTTAAAGTTATGA  100

seq1  AAAAAAGTTTCCCAAAATTTTCGAACTCTTTTACTGTAAAGATTTGTTAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAGTTTCCCAAAATTTTCGAACTCTTTTACTGTAAAGATTTGTTAC  150

seq1  AAAGAAGGTGGGAATTACCTTACTTTATGTCTCATCCGCAAACTTGCAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAGGTGGGAATTACCTTACTTTATGTCTCATCCGCAAACTTGCAAC  200

seq1  TCTGTTGCTTGTTTCCCTCCTCCCTGGAGGCTGGGGTAGCAGTCGCCACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTGCTTGTTTCCCTCCTCCCTGGAGGCTGGGGTAGCAGTCGCCACT  250

seq1  CCAGCCACTCCACTCTTTCAATTCCCCGTCTGTGTTACTTTATGAGATGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCACTCCACTCTTTCAATTCCCCGTCTGTGTTACTTTATGAGATGA  300

seq1  AGGTAATTATGCTGCTTATGGTCCAGGTACAACCTCTTTGTACCTTCACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAATTATGCTGCTTATGGTCCAGGTACAACCTCTTTGTACCTTCACA  350

seq1  GAGATGTTTGTGTTGTTTCTTGTTTCGCAGGTTCTGGTTCCATGTGTCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGTTTGTGTTGTTTCTTGTTTCGCAGGTTCTGGTTCCATGTGTCAT  400

seq1  TGCTATGTTGTTTGCTTGGTTTTATCTTATTAGGTGAAATGTAAAAGGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTATGTTGTTTGCTTGGTTTTATCTTATTAGGTGAAATGTAAAAGGTT  450

seq1  CCGTGCTGTGAGGACTTCATTTTCACCAGTTTTTGTATCACTAACGGTAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTGCTGTGAGGACTTCATTTTCACCAGTTTTTGTATCACTAACGGTAA  500

seq1  ACTTTGTTTGATTTATTCATCAACATCCACAGATTCATTATCAGTTTTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTGTTTGATTTATTCATCAACATCCACAGATTCATTATCAGTTTTGT  550

seq1  AATCTGTAATGTTCTAGGCTGCAAATATTTACTATGTAAACATTAAGGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGTAATGTTCTAGGCTGCAAATATTTACTATGTAAACATTAAGGAG  600

seq1  CCAATGTCGGTAGCTACCAACAGCAGCACCTCTCGCTGCCTTAGGAATGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGTCGGTAGCTACCAACAGCAGCACCTCTCGCTGCCTTAGGAATGG  650

seq1  TTAAGTTTCAGGCCTAACAGGCCATCATGGCCATAAATTCAGGCTTGTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGTTTCAGGCCTAACAGGCCATCATGGCCATAAATTCAGGCTTGTGT  700

seq1  ACAGAGAAGC-TTCAGGGAATGAATGCCCTTATCTAAAGATCTGTTCACC  749
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGAAGCTTTCAGGGAATGAATGCCCTTATCTAAAGATCTGTTCACC  750

seq1  ATCTGATACAAAATGTGCTGTGGAGCAAGCATGAGGTGACCTGGCATAGC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGATACAAAATGTGCTGTGGAGCAAGCATGAGGTGACCTGGCATAGC  800

seq1  -TTAGGGAATGTGTGATGTGTAATTAAGCCAACACAGTCCCTTACAAGAG  848
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGGGAATGTGTGATGTGTAATTAAGCCAACACAGTCCCTTACAAGAG  850

seq1  GCTGCTTCCCACTGCTCACATTGATGTCTTCTTGTGGGAAGAAGTGCTCC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCTTCCCACTGCTCACATTGATGTCTTCTTGTGGGAAGAAGTGCTCC  900

seq1  AAGAGTACACATGCCATCACGGTTCTGGATAATTTATCATAGAGCTACAT  948
      |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||
seq2  AAGAGTACACATGCCATCACGGTTCTGGAATATTTATCATAGAGCTACAT  950

seq1  TTTGAGACTTGTATGATGATTGTCTGAAAGGGAAAGAAACAAGATACTTA  998
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TTTGAGACTTGTATGATGATTGTCTGAAAGGGAAAGAAAC-AGATACTTA  999

seq1  AAGCTACAACTGTGTGAGGTATGATGATTGTTAGATACTAATTTGGGGCC  1048
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTAC-ACTGTGTGAGGTATGATGATTGTTAGATACTAATTTGGGGCC  1048

seq1  ATCAAAGTGGCTTAGTTGGGAGAGGTGCTTGCCACCAAGCCTGCTGACCT  1098
      |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |
seq2  ATCAAAGT-GCTTAGTTGGGAGAGGTGCTTGCTACCA--GCTGCTGACTT  1095

seq1  GAGTTCAAGACCCAGGACCGAATAGAGAGAATTGACACCTTCAAGTTGTT  1148
      |||||||||| |||||| |||| | |||||| |||||||||||   ||||
seq2  GAGTTCAAGATCCAGGAACGAA-AAAGAGAA-TGACACCTTCA--GTGTT  1141

seq1  CTGTGACACACAT  1161
      ||||||| |||||
seq2  CTGTGACCCACAT  1154

seq1: chr2_156320765_156321747
seq2: B6Ng01-084F06.g_69_1051 (reverse)

seq1  CAGAAGTCACCTCAGAAGATTGCCAAGAAGTTCAAGAGTGCCATATGCCG  50
      ||||||||  || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||
seq2  CAGAAGTCCACTTAGAAGA-TGCCAAGAAGTTCAGAAGTGCCATATGCCG  49

seq1  CGTCACCCTGCTCGATGCTTCTGAGTATGAGTGTGAAGTGGAGGTAGGGG  100
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CGTCATCCTGCTCGATGCTTCTGAGTATGAGTGTGAAGTGAAGGTAGGGG  99

seq1  ACGCCCAGCGCCATATGCCCTGCCCCAGGCCGGCTGGCCCCAGTACCATA  150
      ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCCCAGCGCCATAAGACCTG-CCCAGGCCGGCTGGCCCCAGTACCATA  148

seq1  TGCCCTGGCCCAGGCTGGCT-GGCCCCAGCGCCAGGCTAGCTCCTGTGTG  199
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TGCCCTGGCCCAGGCTGGCTGGGCCCCAGCGCCAGGCTAGCT-CTGTGTG  197

seq1  TCCTGAGTCCAAGCCAAACCACAGGAGGACCCACTGTGATGTCCGGAGTG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGAGTCCAAGCCAAACCACAGGAGGACCCACTGTGATGTCCGGAGTG  247

seq1  ATGGCTTGGCCTGGTACTCCCTGGTAC-AGATGGTGACACCGAGGTCCAG  298
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTTGGCCTGGTACTCCCTGGTACAAGATGGTGACACCGAGGTCCAG  297

seq1  -AAAGGGTCATTACTATTGCAGACCAAATTAAGACTCAGCACGGACTGGC  347
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGGGTCATTACTATTGCAGACCAAATTAAGACTCAGCACGGACTGGC  347

seq1  ATCAGGAAAAGGTGTCTCGGGGTATCCGTGCCTTGGTAAAAATGTCCCCA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGGAAAAGGTGTCTCGGGGTATCCGTGCCTTGGTAAAAATGTCCCCA  397

seq1  TTTAAGAACTGATATGCAGGGTTGACCACAAAATAATCCCACTGTGATTC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGAACTGATATGCAGGGTTGACCACAAAATAATCCCACTGTGATTC  447

seq1  CTAGTTCCACTCTATCTCCTGCAACCCCCACTCCCATCCCCTGGCTCTGG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTTCCACTCTATCTCCTGCAACCCCCACTCCCATCCCCTGGCTCTGG  497

seq1  CTCGCATCTTTTGAGGGCATCTTCTCTTTTTCTCCCACAAGTCATAGAAC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGCATCTTTTGAGGGCATCTTCTCTTTTTCTCCCACAAGTCATAGAAC  547

seq1  TTTGGTTTTCAGCTGCTTCTCTTGGTTTCTGTTAAGCAGAAATCTCCAGC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTTTTCAGCTGCTTCTCTTGGTTTCTGTTAAGCAGAAATCTCCAGC  597

seq1  ATGCTTTCAGGCAGGTCCATAGTCTAGGAAGACCCTGGCAGGGCTTGTAA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTTCAGGCAGGTCCATAGTCTAGGAAGACCCTGGCAGGGCTTGTAA  647

seq1  GAGAGACCTAGATGCAGTGGGCATTATAGACCCAGAGAGGGGAGCCTGTG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGACCTAGATGCAGTGGGCATTATAGACCCAGAGAGGGGAGCCTGTG  697

seq1  GCAGGAGTGCTGAGGTCCTGCCCTGCTGAGGGGAGGCTTGTGGGAACTCT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGAGTGCTGAGGTCCTGCCCTGCTGAGGGGAGGCTTGTGGGAACTCT  747

seq1  TCCTGTGTGCACTGGGACCTGGGTCAGCTCCCAGCCCCAACAACAGGTCC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTGTGCACTGGGACCTGGGTCAGCTCCCAGCCCCAACAACAGGTCC  797

seq1  ACCGGCCTCACAAAAACTCTTCTTTCTCCCTCAGAAGCACGGCCGGGGCC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGGCCTCACAAAAACTCTTCTTTCTCCCTCAGAAGCACGGCCGGGGCC  847

seq1  AGGTGCTGTTTGACCTGGTCTGTGAGCACCTTAACCTCCTGGAGAAGGAC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGCTGTTTGACCTGGTCTGTGAGCACCTTAACCTCCTGGAGAAGGAC  897

seq1  TACTTCGGTCTGACCTACTGTGATGCTGACAGCCAGAAGGTGCCCAGCTG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTCGGTCTGACCTACTGTGATGCTGACAGCCAGAAGGTGCCCAGCTG  947

seq1  GGGAGGCAGGGTGTGGCGGGTGGGCAGGGAGAATTC  983
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGGCAGGGTGTGGCGGGTGGGCAGGGAGAATTC  983