BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-091L19
Chromosome2 (Build37)
Map Location 58,123,818 - 58,294,028
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAcvr1c, LOC667062
Upstream geneGpd2, LOC271788, Galnt5, A330104H05Rik, LOC667026, Pscdbp, LOC100042926
Downstream geneAcvr1, LOC674940, Upp2, BC062650, Pkp4, LOC625354
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-091L19.bB6Ng01-091L19.g
ACCDH903682DH903683
length1,1031,015
definitionDH903682|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-091L19, 5' end.DH903683|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-091L19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(58,123,818 - 58,124,924)(58,293,006 - 58,294,028)
sequence
gaattcagcaaccaacttggatgcatttgttattgttccctaactgcttg
atagaaatcaaaatttccacattttaaatgaattaatttagccatgtaaa
tgttcatatttcctttcaagaatcagtcaaaaatcattgcctgccaagta
atttcaagttgttctcttgctccttgtatgatggcagatgcctgctccct
gccttcaggcagtgcactgcggtcttccctgggacttttgcttccactcc
aagattgccctgagtttgctctgtctcagtaagtcccatggtggcaaaat
tccaggacagtagacatttcttttatttaatcattctgcaatagacgaag
cactcaaaacaataagtgattgtggaacttctgatctaatgaatgtgttg
tagttttttttttttcattttaaaataaacgccgatttgaaactcttcag
acattgcgatcaggttactattttcatacaattatggaaatttaaaatgc
aaagttaattgaaaagtataaagatgaaaagcaagtgctgcgcttaaaat
agagcatgacagtcatgtttcacttaactctcatggcagaacataaatta
agaattctagatgtgacatgccaaatattttagacgtggaaggatgcata
caacagagtcagtactgattacaaactcaaaacgcaggacttataaggca
acaaattcatgctcaaatgtagacaacaaataatgcgttctgtatttcaa
gaagtgatgctgtatataaaccccaccattttttgcatacagtactaaaa
attcataatagcattcctaagctctatgttatacccagagccaaaatatc
cataaaggagcaaagcaatggtgtcactttgcacctaacctaagaagata
tttttgctcgtaacaaaatttacaaggaccaagtgttacataagattcca
tcaaaaacacataatacaaattgaactgcatagatatatacagtaaatat
gccttatgcttctaaattactctattttttataagtggagcagtatctat
gtagactatgttgagagttaagcaaaaactacacttctatgtcctgacat
act
gaattcatagtctccttttttttttctttttcttttcttttttctttttt
ttttttttttttgaggtttttgaagcagggtctcatagcctgaagcccat
tcaattgtggggcctggctggctgtaagttctaggtacctgcctgactat
gtccctgctccatccagctctggggttatagatacatgccagcttttatg
cacaccactgctggggatccaacccaggtccttctgcttacatgacaagc
actctacccacggagtcatttccctagatacctctatgcagtgagagact
ttggaatgttagagacaaggccgtttttgttttgttctggcttgggaggc
caggtcagtctgttagttaccaactgacttggtgggtggctgataattac
ttttctcaatttataatgttaatactttttaagttattgtctttaaaaac
aacaacaacagggaagcaacctctacagttacaataaaaagccgcagtcc
cttggtatctctctgttccatcacttcctcctctctaatggcaaccccta
ttactttttaaaggtcattcattgcctttgttttgaaatagcataatggt
ctttctacttcttgattttgtttttagtctcagccattattatccagctc
tactgaagaggttgtagcttttctcagctccttctccccctcgccttgcc
tgtgtttttatctctttcctccctggatccattcattgacttgagtgcct
agtatgtgcccagtgggtttgccttgcagaggtgtgtatgttagaaaccc
ataaactagcagacagaaacagctttttcatacctagagtatttgagatt
atattttgtgttaagtcattgccaattgcttgatttgttacagtaatgtt
ccccacccatgattccatttctctactctacatattgcttcctaagtaat
ggggtgtgtgtgtgcacactgcatgtgttgtgtgagcacttgcatgcatg
cacatatgtgtgcac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_58123818_58124924
seq2: B6Ng01-091L19.b_49_1151

seq1  GAATTCAGCAACCAACTTGGATGCATTTGTTATTGTTCCCTAACTGCTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCAACCAACTTGGATGCATTTGTTATTGTTCCCTAACTGCTTG  50

seq1  ATAGAAATCAAAATTTCCACATTTTAAATGAATTAATTTAGCCATGTAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAAATCAAAATTTCCACATTTTAAATGAATTAATTTAGCCATGTAAA  100

seq1  TGTTCATATTTCCTTTCAAGAATCAGTCAAAAATCATTGCCTGCCAAGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCATATTTCCTTTCAAGAATCAGTCAAAAATCATTGCCTGCCAAGTA  150

seq1  ATTTCAAGTTGTTCTCTTGCTCCTTGTATGATGGCAGATGCCTGCTCCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCAAGTTGTTCTCTTGCTCCTTGTATGATGGCAGATGCCTGCTCCCT  200

seq1  GCCTTCAGGCAGTGCACTGCGGTCTTCCCTGGGACTTTTGCTTCCACTCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTCAGGCAGTGCACTGCGGTCTTCCCTGGGACTTTTGCTTCCACTCC  250

seq1  AAGATTGCCCTGAGTTTGCTCTGTCTCAGTAAGTCCCATGGTGGCAAAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTGCCCTGAGTTTGCTCTGTCTCAGTAAGTCCCATGGTGGCAAAAT  300

seq1  TCCAGGACAGTAGACATTTCTTTTATTTAATCATTCTGCAATAGACGAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGACAGTAGACATTTCTTTTATTTAATCATTCTGCAATAGACGAAG  350

seq1  CACTCAAAACAATAAGTGATTGTGGAACTTCTGATCTAATGAATGTGTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCAAAACAATAAGTGATTGTGGAACTTCTGATCTAATGAATGTGTTG  400

seq1  TAGTTTTTTTTTTTTCATTTTAAAATAAACGCCGATTTGAAACTCTTCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTTTTTTTTTTTCATTTTAAAATAAACGCCGATTTGAAACTCTTCAG  450

seq1  ACATTGCGATCAGGTTACTATTTTCATACAATTATGGAAATTTAAAATGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGCGATCAGGTTACTATTTTCATACAATTATGGAAATTTAAAATGC  500

seq1  AAAGTTAATTGAAAAGTATAAAGATGAAAAGCAAGTGCTGCGCTTAAAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTAATTGAAAAGTATAAAGATGAAAAGCAAGTGCTGCGCTTAAAAT  550

seq1  AGAGCATGACAGTCATGTTTCACTTAACTCTCATGGCAGAACATAAATTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCATGACAGTCATGTTTCACTTAACTCTCATGGCAGAACATAAATTA  600

seq1  AGAATTCTAGATGTGACATGCCAAATATTTTAGACGTGGAAGGATGCATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTCTAGATGTGACATGCCAAATATTTTAGACGTGGAAGGATGCATA  650

seq1  CAACAGAGTCAGTACTGATTACAAACTCAAAACGCAGGACTTATAAGGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGAGTCAGTACTGATTACAAACTCAAAACGCAGGACTTATAAGGCA  700

seq1  ACAAATTCATGCTCAAATGTAGACAACAAATAATGCGTTCTGTATTTCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATTCATGCTCAAATGTAGACAACAAATAATGCGTTCTGTATTTCAA  750

seq1  GAAGTGATGCTGTATATAAACCCCACCATTTTTTGCATACAGTACTAAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGATGCTGTATATAAACCCCACCATTTTTTGCATACAGTACTAAAA  800

seq1  ATTCATAATAGCATTCCTAAGCTCTATGTTATACCCAGAGCCAAAATATC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATAATAGCATTCCTAAGCTCTATGTTATACCCAGAGCCAAAATATC  850

seq1  CAT-AAGGAGCAAAGCAATGGTGTCACTTTGCACCTAACCTAAGAAGATA  899
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAGGAGCAAAGCAATGGTGTCACTTTGCACCTAACCTAAGAAGATA  900

seq1  TTTTTGCTCGTAACAAAATTTACAAGGACCAAGTGTTACATAAGATTCCA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGCTCGTAACAAAATTTACAAGGACCAAGTGTTACATAAGATTCCA  950

seq1  TCAAAAACACATAATACAAAATTGAACTGCATAGATATATACAGTAAATA  999
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAAACACATAATAC-AAATTGAACTGCATAGATATATACAGTAAATA  999

seq1  TGCCTTATGCTCTAAAAATTACTCTATTTTTTATAAGT-GAGCAGTATCT  1048
      ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TGCCTTATGCT-TCTAAATTACTCTATTTTTTATAAGTGGAGCAGTATCT  1048

seq1  ATGTAGAACTATGTTGAGAGTTAAGCAAAAACTACAACTTCTATTGTTCC  1098
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |
seq2  ATGTAG-ACTATGTTGAGAGTTAAGCAAAAACTAC-ACTTCTA-TGT--C  1093

seq1  CTGAC-TACT  1107
      ||||| ||||
seq2  CTGACATACT  1103

seq1: chr2_58293006_58294028
seq2: B6Ng01-091L19.g_68_1082 (reverse)

seq1  GTGCACACATATGTGCATGCATGCAAGTGCTCACAC-ACACATGCAGGTG  49
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||
seq2  GTGCACACATATGTGCATGCATGCAAGTGCTCACACAACACATGCA-GTG  49

seq1  TGCACACACACACCCCATTTACTTTAGGGAAAGCAAATATTGTAGAGTAA  99
      ||||||||||||||||| |||| |||||  |||| |||| |||||||| |
seq2  TGCACACACACACCCCA-TTAC-TTAGG--AAGC-AATA-TGTAGAGT-A  92

seq1  GAGAAATGGAATCATGGGTGGGGAACATTACTGTAACAAAATCAAGCAAT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GAGAAATGGAATCATGGGTGGGGAACATTACTGTAAC-AAATCAAGCAAT  141

seq1  TGGCAATGACTTAACACAAAATTATAATCTCAAATACTCTAGGTATG-AA  198
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TGGCAATGACTTAACACAAAA-TATAATCTCAAATACTCTAGGTATGAAA  190

seq1  AAGCTGTTTCTGTCTGCTAGTTTATGGGTTTCTAACATACACACCTCTGC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGTTTCTGTCTGCTAGTTTATGGGTTTCTAACATACACACCTCTGC  240

seq1  AAGGCAAACCCACTGGGCACATACTAGGCACTCAAGTCAATGAATGGATC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCAAACCCACTGGGCACATACTAGGCACTCAAGTCAATGAATGGATC  290

seq1  CAGGGAGGAAAGAGATAAAAACACAGGCAAGGCGAGGGGGAGAAGGAGCT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGAGGAAAGAGATAAAAACACAGGCAAGGCGAGGGGGAGAAGGAGCT  340

seq1  GAGAAAAGCTACAACCTCTTCAGTAGAGCTGGATAATAATGGCTGAGACT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAAGCTACAACCTCTTCAGTAGAGCTGGATAATAATGGCTGAGACT  390

seq1  AAAAACAAAATCAAGAAGTAGAAAGACCATTATGCTATTTCAAAACAAAG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACAAAATCAAGAAGTAGAAAGACCATTATGCTATTTCAAAACAAAG  440

seq1  GCAATGAATGACCTTTAAAAAGTAATAGGGGTTGCCATTAGAGAGGAGGA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATGAATGACCTTTAAAAAGTAATAGGGGTTGCCATTAGAGAGGAGGA  490

seq1  AGTGATGGAACAGAGAGATACCAAGGGACTGCGGCTTTTTATTGTAACTG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGATGGAACAGAGAGATACCAAGGGACTGCGGCTTTTTATTGTAACTG  540

seq1  TAGAGGTTGCTTCCCTGTTGTTGTTGTTTTTAAAGACAATAACTTAAAAA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGGTTGCTTCCCTGTTGTTGTTGTTTTTAAAGACAATAACTTAAAAA  590

seq1  GTATTAACATTATAAATTGAGAAAAGTAATTATCAGCCACCCACCAAGTC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTAACATTATAAATTGAGAAAAGTAATTATCAGCCACCCACCAAGTC  640

seq1  AGTTGGTAACTAACAGACTGACCTGGCCTCCCAAGCCAGAACAAAACAAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGGTAACTAACAGACTGACCTGGCCTCCCAAGCCAGAACAAAACAAA  690

seq1  AACGGCCTTGTCTCTAACATTCCAAAGTCTCTCACTGCATAGAGGTATCT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGGCCTTGTCTCTAACATTCCAAAGTCTCTCACTGCATAGAGGTATCT  740

seq1  AGGGAAATGACTCCGTGGGTAGAGTGCTTGTCATGTAAGCAGAAGGACCT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAAATGACTCCGTGGGTAGAGTGCTTGTCATGTAAGCAGAAGGACCT  790

seq1  GGGTTGGATCCCCAGCAGTGGTGTGCATAAAAGCTGGCATGTATCTATAA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTGGATCCCCAGCAGTGGTGTGCATAAAAGCTGGCATGTATCTATAA  840

seq1  CCCCAGAGCTGGATGGAGCAGGGACATAGTCAGGCAGGTACCTAGAACTT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGAGCTGGATGGAGCAGGGACATAGTCAGGCAGGTACCTAGAACTT  890

seq1  ACAGCCAGCCAGGCCCCACAATTGAATGGGCTTCAGGCTATGAGACCCTG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCCAGCCAGGCCCCACAATTGAATGGGCTTCAGGCTATGAGACCCTG  940

seq1  CTTCAAAAACCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAAG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAAAAACCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAAG  990

seq1  AAAAAAAAAAGGAGACTATGAATTC  1023
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAAGGAGACTATGAATTC  1015