BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-093F21
Chromosome2 (Build37)
Map Location 53,833,786 - 53,932,869
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneFmnl2, Prpf40a, Arl6ip6, LOC666872, LOC666876, LOC207933
Downstream geneRprm, LOC666913, LOC626563, LOC100041792, LOC100042878, Galnt13
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-093F21.bB6Ng01-093F21.g
ACCDH904877DH904878
length1,1251,148
definitionDH904877|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-093F21, 5' end.DH904878|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-093F21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(53,833,786 - 53,834,931)(53,931,726 - 53,932,869)
sequence
gaattctttcttccagaaaaggaagtatactttgggaactgtggaatgga
atgaaggaatgatggaaaggaaggaggaaggaaagaaaaaagaaggggaa
ggagaaaggggaagagaatgaggaagtctcatccttgctttgtctctttc
tagttaagtggtccttatcattttccatatctgtaagacagtagcctccc
aaagtggtagcatgggttagaatagacacattgattgagtgtcaggcttt
agctcatcaggatttcagacaaggaatatatttttatgcatggaaaatat
ttttatttcctgaagtctactgagttaagagcatggattaatatccagaa
cagagattaggtaggccctagaatttgagagggcctctaaatctttgagt
tcaattctcttatagcacaaaagagagaaaaagatctatgggtatggtgg
ctggtaaaaactgctcaggtgcaaagccaggaggagccctctgtcctgga
atgtcccacatgagctatctttcttgatattgcaaaagcccagaaaccca
ggtgatagacaggcataacttaattttttatgttttgctatcctggagtt
gattgctttcaaaactgtaggtgctccttggggacaattggtagaataaa
agttgcttctcgcacagaactaatagcagctcccaggaaccacaacaaaa
gaagaaatctgaaccataggagaacaaattaagtcctcagcaaacttaag
tccttagtaacacagtttacatcctcacagtttgttatatgctctgaggg
atcctggtcagcttcctgtccacatgaattgaatttttatttgctaatga
catcctatgagccccctacaaaactgagttggatggtttctttgtgcaaa
tgatgtagcacaggtttggtgccaggttttcccaggtgctagagggttta
tgaaggaacacaggaccctggagctctgaaatatttatggctctactctg
cccactgtgccttcaattactaaacctggagtcttcaacagcattaatag
gctgatgcttgtgtctactcccacagtatcttggaaattatcttgatgca
atacgagctcaactttgagagtagt
gaattccaggtttcagtttgttaagatccaagcctagttttaaagtctat
tgaagcagcaagtctgcagcaatctccaaaacagaaatcaatacatcttt
tatccacctgccaaatcccatttagacatgtgcacaaaggctcaaacagg
atatgttttaaagtccattccagccgtaattgattcctaacatctgcatt
taaatgcttcgtgactatttgttttcatggcccacttcacattctaggtc
tttttgtattgttataaatgcttaagatgttgaaagtcctgataagtttc
acggcaacatctatgattttaaaattcttggaaagctagatagtttaagg
aaatatatagttttgtgaaattgcacttcagtgaaagtgatgataacttt
taaaaaactgaactagtattcatgttttatttgctttattcctaatatat
ttgagaagctaaatctatttgagcagaaggttcactaaagactgttagaa
gagaagttagacacattttgcaaatattcactttgtaaatggtagcttgc
ctcataacccaaacaacagtatttacaaatgagaatagcatgttttattt
gtatgtatccaactatgtgattttggaagcctcatgagtagtcttctgcc
tgaatgtatataagtacttggcttgctgcaatatttttttgagtgggtga
ctgcgagcatagagtgatcaatacagaaaaggtcatctgtgctgtttgct
gagcggccctgggccctgccccctctcagttcagattcagtgtccattag
aacggctatcttagggagctcatgactcaaactgcctcgtagtgttttcc
tgcaattatgtgcacatagcacactatacttactactgaataaaatgtga
tagttcctatacatttggatcataacaccacaagcacaggacagatatta
caaaaggagaaaggtaaagactgtacccacaagagccagactctaagaac
tggtgtttcactaccatttcagatcagagtcctataaaatatgcatgtaa
ttattcccacgactatgtttttggcacaagtctattacagccaaaagggt
agagttttacgatagatggttttttctttgcttgcttccctcctccag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_53833786_53834931
seq2: B6Ng01-093F21.b_44_1168

seq1  GAATTCTTTCTTCCAGAAAAGGAAGTATACTTTGGGAACTGTGGAATGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCTTCCAGAAAAGGAAGTATACTTTGGGAACTGTGGAATGGA  50

seq1  ATGAAGGAATGATGGAAAGGAAGGAGGAAGGAAAGAAAAAAGAAGGGGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGGAATGATGGAAAGGAAGGAGGAAGGAAAGAAAAAAGAAGGGGAA  100

seq1  GGAGAAAGGGGAAGAGAATGAGGAAGTCTCATCCTTGCTTTGTCTCTTTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAAAGGGGAAGAGAATGAGGAAGTCTCATCCTTGCTTTGTCTCTTTC  150

seq1  TAGTTAAGTGGTCCTTATCATTTTCCATATCTGTAAGACAGTAGCCTCCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTAAGTGGTCCTTATCATTTTCCATATCTGTAAGACAGTAGCCTCCC  200

seq1  AAAGTGGTAGCATGGGTTAGAATAGACACATTGATTGAGTGTCAGGCTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGGTAGCATGGGTTAGAATAGACACATTGATTGAGTGTCAGGCTTT  250

seq1  AGCTCATCAGGATTTCAGACAAGGAATATATTTTTATGCATGGAAAATAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCATCAGGATTTCAGACAAGGAATATATTTTTATGCATGGAAAATAT  300

seq1  TTTTATTTCCTGAAGTCTACTGAGTTAAGAGCATGGATTAATATCCAGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATTTCCTGAAGTCTACTGAGTTAAGAGCATGGATTAATATCCAGAA  350

seq1  CAGAGATTAGGTAGGCCCTAGAATTTGAGAGGGCCTCTAAATCTTTGAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGATTAGGTAGGCCCTAGAATTTGAGAGGGCCTCTAAATCTTTGAGT  400

seq1  TCAATTCTCTTATAGCACAAAAGAGAGAAAAAGATCTATGGGTATGGTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATTCTCTTATAGCACAAAAGAGAGAAAAAGATCTATGGGTATGGTGG  450

seq1  CTGGTAAAAACTGCTCAGGTGCAAAGCCAGGAGGAGCCCTCTGTCCTGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTAAAAACTGCTCAGGTGCAAAGCCAGGAGGAGCCCTCTGTCCTGGA  500

seq1  ATGTCCCACATGAGCTATCTTTCTTGATATTGCAAAAGCCCAGAAACCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCCCACATGAGCTATCTTTCTTGATATTGCAAAAGCCCAGAAACCCA  550

seq1  GGTGATAGACAGGCATAACTTAATTTTTTATGTTTTGCTATCCTGGAGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGATAGACAGGCATAACTTAATTTTTTATGTTTTGCTATCCTGGAGTT  600

seq1  GATTGCTTTCAAAACTGTAGGTGCTCCTTGGGGACAATTGGTAGAATAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGCTTTCAAAACTGTAGGTGCTCCTTGGGGACAATTGGTAGAATAAA  650

seq1  AGTTGCTTCTCGCACAGAACTAATAGCAGCTCCCAGGAACCACAACAAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGCTTCTCGCACAGAACTAATAGCAGCTCCCAGGAACCACAACAAAA  700

seq1  GAAGAAATCTGAACCATAGGAGAACAAATTAAGTCCTCAGCAAACTTAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAAATCTGAACCATAGGAGAACAAATTAAGTCCTCAGCAAACTTAAG  750

seq1  TCCTTAGTAACACAGTTTACATCCTCACAGTTTGTTATATGCTCTGAGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTAGTAACACAGTTTACATCCTCACAGTTTGTTATATGCTCTGAGGG  800

seq1  ATCCTGGTCAGCTTCCTGTCCACATGAATTGAATTTTTATTTGCTAATGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGGTCAGCTTCCTGTCCACATGAATTGAATTTTTATTTGCTAATGA  850

seq1  CATCCTATGAGCCCCCTACAAAACTGAGTTGGATGGTTTCTTTGTGCAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CATCCTATGAGCCCCCTACAAAACTGAGTTGGATGGTTTCTTTGTGC-AA  899

seq1  ATGATGTAGCCACAGGTTTGTTGCCAGGTTTTCCCAGGTGCTAAGAAGGT  950
      ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||
seq2  ATGATGTAG-CACAGGTTTGGTGCCAGGTTTTCCCAGGTGCT-AGAGGGT  947

seq1  TTATGAAGGAACACAGGACCCCTGGAGCCTCTGAAAATTATTTATGGCTC  1000
      |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||
seq2  TTATGAAGGAACACAGGA-CCCTGGAG-CTCTGAAA--TATTTATGGCTC  993

seq1  TACTCCTGCCCACTGTGCCTTCAATTAACTAAACCTGGAGTCTTCAAACC  1050
      |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |
seq2  TACT-CTGCCCACTGTGCCTTCAATT-ACTAAACCTGGAGTCTTCAA--C  1039

seq1  AGCATTTATAGTCTGATTGTCTGTGTCTACTCCCACCAATTAATTCTTGA  1100
      |||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||  | ||  ||||| 
seq2  AGCATTAATAGGCTGA-TGCTTGTGTCTACTCCCAC--AGTA--TCTTGG  1084

seq1  AATATAATCTTTGATGCAATACGAGCTCAAAACTTTGAGAAGTAGT  1146
      || || ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||
seq2  AA-ATTATC-TTGATGCAATACGAGCTC--AACTTTGAG-AGTAGT  1125

seq1: chr2_53931726_53932869
seq2: B6Ng01-093F21.g_68_1215 (reverse)

seq1  CTGGAGGAGGGAAAGGCAAGCAAAG-AAAAACAATCATACGTAAAACTCT  49
      |||||||||||||  |||||||||| |||||| |||   |||||||||||
seq2  CTGGAGGAGGGAA--GCAAGCAAAGAAAAAACCATCTATCGTAAAACTCT  48

seq1  AACCTTTTTTGCTGTAATAGAC-TGTGCC-AAAACATAGTCTGTGGG-AT  96
       ||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||
seq2  -ACCCTTTTGGCTGTAATAGACTTGTGCCAAAAACATAGTC-GTGGGAAT  96

seq1  AATTACATGCATATATTTATAGGACTCTGAATCTTGAAATGGTAGTGAAA  146
      |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
seq2  AATTACATGCATAT-TTTATAGGACTCTG-ATC-TGAAATGGTAGTGAAA  143

seq1  CA-CAGTTCTTTAGAGTCTGGCTCTTGTGGGTACAGTCTTTA-CTTTCT-  193
      || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| 
seq2  CACCAGTTC-TTAGAGTCTGGCTCTTGTGGGTACAGTCTTTACCTTTCTC  192

seq1  CTTTTGT-ATATCTGT-CTGTGCTTGT-GTGTTATGATCCAAATGTATAG  240
      ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGTAATATCTGTCCTGTGCTTGTGGTGTTATGATCCAAATGTATAG  242

seq1  GAACTATCACATTTTATTCAGTAGTAAGTATAGTGTGCTATGTGCACATA  290
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTATCACATTTTATTCAGTAGTAAGTATAGTGTGCTATGTGCACATA  292

seq1  ATTGCAGGAAAACACTACGAGGCAGTTTGAGTCATGAGCT-CCTAAGATA  339
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  ATTGCAGGAAAACACTACGAGGCAGTTTGAGTCATGAGCTCCCTAAGATA  342

seq1  GCCGTTCTAATGGACACTGAATCTGAACTGAGAGGGGGCAGGGCCCAGGG  389
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGTTCTAATGGACACTGAATCTGAACTGAGAGGGGGCAGGGCCCAGGG  392

seq1  CCGCTCAGC-AACAGCACAGATGACCTTTTCTGTATTGATCACTCTATGC  438
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGCTCAGCAAACAGCACAGATGACCTTTTCTGTATTGATCACTCTATGC  442

seq1  TCGCAGTCACCCACTCAAAAAAATATTGCAGCAAGCCAAGTACTTATATA  488
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCAGTCACCCACTCAAAAAAATATTGCAGCAAGCCAAGTACTTATATA  492

seq1  CATTCAGGCAGAAGACTACTCATGAGGCTTCCAAAATCACATAGTTGGAT  538
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCAGGCAGAAGACTACTCATGAGGCTTCCAAAATCACATAGTTGGAT  542

seq1  ACATACAAATAAAACATGCTATTCTCATTTGTAAATACTGTTGTTTGGGT  588
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACAAATAAAACATGCTATTCTCATTTGTAAATACTGTTGTTTGGGT  592

seq1  TATGAGGCAAGCTACCATTTACAAAGTGAATATTTGCAAAATGTGTCTAA  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAGGCAAGCTACCATTTACAAAGTGAATATTTGCAAAATGTGTCTAA  642

seq1  CTTCTCTTCTAACAGTCTTTAGTGAACCTTCTGCTCAAATAGATTTAGCT  688
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCTTCTAACAGTCTTTAGTGAACCTTCTGCTCAAATAGATTTAGCT  692

seq1  TCTCAAATATATTAGGAATAAAGCAAATAAAACATGAATACTAGTTCAGT  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAAATATATTAGGAATAAAGCAAATAAAACATGAATACTAGTTCAGT  742

seq1  TTTTTAAAAGTTATCATCACTTTCACTGAAGTGCAATTTCACAAAACTAT  788
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAAAAGTTATCATCACTTTCACTGAAGTGCAATTTCACAAAACTAT  792

seq1  ATATTTCCTTAAACTATCTAGCTTTCCAAGAATTTTAAAATCATAGATGT  838
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTCCTTAAACTATCTAGCTTTCCAAGAATTTTAAAATCATAGATGT  842

seq1  TGCCGTGAAACTTATCAGGACTTTCAACATCTTAAGCATTTATAACAATA  888
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCGTGAAACTTATCAGGACTTTCAACATCTTAAGCATTTATAACAATA  892

seq1  CAAAAAGACCTAGAATGTGAAGTGGGCCATGAAAACAAATAGTCACGAAG  938
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAAGACCTAGAATGTGAAGTGGGCCATGAAAACAAATAGTCACGAAG  942

seq1  CATTTAAATGCAGATGTTAGGAATCAATTACGGCTGGAATGGACTTTAAA  988
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTAAATGCAGATGTTAGGAATCAATTACGGCTGGAATGGACTTTAAA  992

seq1  ACATATCCTGTTTGAGCCTTTGTGCACATGTCTAAATGGGATTTGGCAGG  1038
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATCCTGTTTGAGCCTTTGTGCACATGTCTAAATGGGATTTGGCAGG  1042

seq1  TGGATAAAAGATGTATTGATTTCTGTTTTGGAGATTGCTGCAGACTTGCT  1088
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATAAAAGATGTATTGATTTCTGTTTTGGAGATTGCTGCAGACTTGCT  1092

seq1  GCTTCAATAGACTTTAAAACTAGGCTTGGATCTTAACAAACTGAAACCTG  1138
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCAATAGACTTTAAAACTAGGCTTGGATCTTAACAAACTGAAACCTG  1142

seq1  GAATTC  1144
      ||||||
seq2  GAATTC  1148