BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-103I07
Chromosome2 (Build37)
Map Location 123,133,954 - 123,290,156
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDuoxa1, Duox1, Shf, Slc28a2, Bambi-ps1, Rp23-357i14.1, Gatm, Spata5l1, AA467197, Slc30a4, Pldn, Sqrdl
Downstream gene4930517E11Rik, LOC100043360
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-103I07.bB6Ng01-103I07.g
ACCDH912084DH912085
length1,081756
definitionDH912084|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-103I07, 5' end.DH912085|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-103I07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(123,289,116 - 123,290,156)(123,133,954 - 123,134,709)
sequence
aaccgtgaaagaaaaattaatacaaatctttcagaagcccttgaaaaata
tagaagacaagggaatacttctcagctcattatgttgggttattatttcc
ataatatcaaacagttaaagacatttcaagaagaaaagaaaactgaagga
cattgtatctcctatgaatacaggtgtaacaatcttcaacaaatagcagc
aaactgattccagaaacactttaaaagaattgttgagggaatactgcata
gctgttagtgggagaatgaattcagaccgttcacagcacactcagcaaaa
atataacccaacgaactggacctaaatatgagatgtggaagcatgaattt
ctaaaagaaaacataagtttaaatctcttcaagatcataggaataagcaa
tcatttcttagttatggtacgcacacttgttcatttgtactgctttgcca
aagaagtgaactctgaataatcttatcgaaaccataaacttaccaatagt
tctgcagccatagaagtccaagatcaatacaccaccatttggagagagcc
ttcctgtaatctaatagcatcaagtgcagaagggatcacaaggacagtca
aatcagagccacagcatggacttaactccaacttctaagaaggcacaagc
cccagtcatgatggcatatccttcttggacctaaacctctaaacaagcaa
caaactaaactcataatagtttaagcacttaaataagacttacatttcat
gtgcttgtattggtcttcattatgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgcatata
tatacatatatatataattcattaatatataaatatatgtaatctactat
atttattataaataaatatatactccaaaatgagacaccaagaaatgagg
gtgaaaagagaaaagtagagtatatcaataaaaatataccatatacacca
aagcacacacaataagacatttatgattaggaaaatatttacaaaccatg
tatataaatggagctatattcaaaataaattatcactcatacacccatag
caaagcatgatgattttattttagatagaca
gaattccataaaagccccagtcatagataccatggtttggggatagcaat
ttaaacagttttgggtagtcctacacattcagaccacagcacagggctag
agctagaattatctgtaagaataacacataggtatagaagcctcttggga
caaactgcctaggtggtttttaaactgggaagcatttatagagcaactct
gaggcagaaatttgagttgaaagactactttccatctgcaaggtagataa
agcttactcctacctcaatctccctttccccatatatgtgaaataaatgc
attggtttttgcttttcaaggaatttatggaaaaaacaaacaaacaaaca
aacaaacactgcagaatgctaactaggaagtaagaaaaaccctgccaaag
ttagtggttcagagagtcctgaagtagaaagcagggggagaggggagcta
gccagccttgacccatcagatatgggacttaggacttggtactatagtgg
ccttccctgtgccgtgcaccactgaagatatggggcattggatctcctgt
atgcccatcatgtggctttgtttgctgtttagtggtttgagggtctttat
cagagctggaaggtcaatgggaaggtctgaacacctaagatatgaagagg
cttaagggagaaggctatcagtcagtgatctcagtcgtgtaaggataccc
atatttcgcatggatgcatgtgtgcatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
tgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_123289116_123290156
seq2: B6Ng01-103I07.b_107_1134 (reverse)

seq1  TGTCTATCTAAAATAAAATCATTCATGCTTTTGCTATTGGGTTGTATGAG  50
      ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  || ||||||||
seq2  TGTCTATCTAAAATAAAATCA-TCATGC-TTTGCTAT--GGGTGTATGAG  46

seq1  TTGATAATGTATTTTGAATATTAGCTCCATTTAATAATACATGGTTTGTA  100
       ||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||
seq2  -TGATAATTTATTTTGAATA-TAGCTCCATTTA--TATACATGGTTTGTA  92

seq1  AATATTTTTCCTAATCATAAATGTCTTATTGTGTTGTTGCTTTGGTGTAT  150
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||
seq2  AATA-TTTTCCTAATCATAAATGTCTTATTGTGT--GTGCTTTGGTGTAT  139

seq1  ATGGTATATTTTTTATTGATATACTCCTACTTTTCTCTTTTCACCCTCAT  200
      |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTATA-TTTTTATTGATATACT-CTACTTTTCTCTTTTCACCCTCAT  187

seq1  TTCTTGGTGTCTCATTTTGGAGTATATATTTATTTATAATAAATATAGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGGTGTCTCATTTTGGAGTATATATTTATTTATAATAAATATAGTA  237

seq1  GATTACATATATTTATATATTAATGAATTATATATATATGTATATATATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTACATATATTTATATATTAATGAATTATATATATATGTATATATATG  287

seq1  CACACACACACATACACACACATAATGAAGACCAATACAAGCACATGAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACATACACACACATAATGAAGACCAATACAAGCACATGAAA  337

seq1  TGTAAGTCTTATTTAAGTGCTTAAACTATTATGAGTTTAGTTTGTTGCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGTCTTATTTAAGTGCTTAAACTATTATGAGTTTAGTTTGTTGCTT  387

seq1  GTTTAGAGGTTTAGGTCCAAGAAGGATATGCCATCATGACTGGGGCTTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAGAGGTTTAGGTCCAAGAAGGATATGCCATCATGACTGGGGCTTGT  437

seq1  GCCTTCTTAGAAGTTGGAGTTAAGTCCATGCTGTGGCTCTGATTTGACTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTCTTAGAAGTTGGAGTTAAGTCCATGCTGTGGCTCTGATTTGACTG  487

seq1  TCCTTGTGATCCCTTCTGCACTTGATGCTATTAGATTACAGGAAGGCTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGTGATCCCTTCTGCACTTGATGCTATTAGATTACAGGAAGGCTCT  537

seq1  CTCCAAATGGTGGTGTATTGATCTTGGACTTCTATGGCTGCAGAACTATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAAATGGTGGTGTATTGATCTTGGACTTCTATGGCTGCAGAACTATT  587

seq1  GGTAAGTTTATGGTTTCGATAAGATTATTCAGAGTTCACTTCTTTGGCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAGTTTATGGTTTCGATAAGATTATTCAGAGTTCACTTCTTTGGCAA  637

seq1  AGCAGTACAAATGAACAAGTGTGCGTACCATAACTAAGAAATGATTGCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTACAAATGAACAAGTGTGCGTACCATAACTAAGAAATGATTGCTT  687

seq1  ATTCCTATGATCTTGAAGAGATTTAAACTTATGTTTTCTTTTAGAAATTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTATGATCTTGAAGAGATTTAAACTTATGTTTTCTTTTAGAAATTC  737

seq1  ATGCTTCCACATCTCATATTTAGGTCCAGTTCGTTGGGTTATATTTTTGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTCCACATCTCATATTTAGGTCCAGTTCGTTGGGTTATATTTTTGC  787

seq1  TGAGTGTGCTGTGAACGGTCTGAATTCATTCTCCCACTAACAGCTATGCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTGTGCTGTGAACGGTCTGAATTCATTCTCCCACTAACAGCTATGCA  837

seq1  GTATTCCCTCAACAATTCTTTTAAAGTGTTTCTGGAATCAGTTTGCTGCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTCCCTCAACAATTCTTTTAAAGTGTTTCTGGAATCAGTTTGCTGCT  887

seq1  ATTTGTTGAAGATTGTTACACCTGTATTCATAGGAGATACAATGTCCTTC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTTGAAGATTGTTACACCTGTATTCATAGGAGATACAATGTCCTTC  937

seq1  AGTTTTCTTTTCTTCTTGAAATGTCTTTAACTGTTTGATATTATGGAAAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTTCTTTTCTTCTTGAAATGTCTTTAACTGTTTGATATTATGGAAAT  987

seq1  AATAACCCAACATAATGAGCTGAGAAGTATTCCCTTGTCTT  1041
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAACCCAACATAATGAGCTGAGAAGTATTCCCTTGTCTT  1028

seq1: chr2_123133954_123134709
seq2: B6Ng01-103I07.g_67_822

seq1  GAATTCCATAAAAGCCCCAGTCATAGATACCATGGTTTGGGGATAGCAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATAAAAGCCCCAGTCATAGATACCATGGTTTGGGGATAGCAAT  50

seq1  TTAAACAGTTTTGGGTAGTCCTACACATTCAGACCACAGCACAGGGCTAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAACAGTTTTGGGTAGTCCTACACATTCAGACCACAGCACAGGGCTAG  100

seq1  AGCTAGAATTATCTGTAAGAATAACACATAGGTATAGAAGCCTCTTGGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAGAATTATCTGTAAGAATAACACATAGGTATAGAAGCCTCTTGGGA  150

seq1  CAAACTGCCTAGGTGGTTTTTAAACTGGGAAGCATTTATAGAGCAACTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTGCCTAGGTGGTTTTTAAACTGGGAAGCATTTATAGAGCAACTCT  200

seq1  GAGGCAGAAATTTGAGTTGAAAGACTACTTTCCATCTGCAAGGTAGATAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCAGAAATTTGAGTTGAAAGACTACTTTCCATCTGCAAGGTAGATAA  250

seq1  AGCTTACTCCTACCTCAATCTCCCTTTCCCCATATATGTGAAATAAATGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTACTCCTACCTCAATCTCCCTTTCCCCATATATGTGAAATAAATGC  300

seq1  ATTGGTTTTTGCTTTTCAAGGAATTTATGGAAAAAACAAACAAACAAACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGTTTTTGCTTTTCAAGGAATTTATGGAAAAAACAAACAAACAAACA  350

seq1  AACAAACACTGCAGAATGCTAACTAGGAAGTAAGAAAAACCCTGCCAAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAACACTGCAGAATGCTAACTAGGAAGTAAGAAAAACCCTGCCAAAG  400

seq1  TTAGTGGTTCAGAGAGTCCTGAAGTAGAAAGCAGGGGGAGAGGGGAGCTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTGGTTCAGAGAGTCCTGAAGTAGAAAGCAGGGGGAGAGGGGAGCTA  450

seq1  GCCAGCCTTGACCCATCAGATATGGGACTTAGGACTTGGTACTATAGTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGCCTTGACCCATCAGATATGGGACTTAGGACTTGGTACTATAGTGG  500

seq1  CCTTCCCTGTGCCGTGCACCACTGAAGATATGGGGCATTGGATCTCCTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCCTGTGCCGTGCACCACTGAAGATATGGGGCATTGGATCTCCTGT  550

seq1  ATGCCCATCATGTGGCTTTGTTTGCTGTTTAGTGGTTTGAGGGTCTTTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCCATCATGTGGCTTTGTTTGCTGTTTAGTGGTTTGAGGGTCTTTAT  600

seq1  CAGAGCTGGAAGGTCAATGGGAAGGTCTGAACACCTAAGATATGAAGAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCTGGAAGGTCAATGGGAAGGTCTGAACACCTAAGATATGAAGAGG  650

seq1  CTTAAGGGAGAAGGCTATCAGTCAGTGATCTCAGTCGTGTAAGGATACCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAGGGAGAAGGCTATCAGTCAGTGATCTCAGTCGTGTAAGGATACCC  700

seq1  ATATTTCGCATGGATGCATGTGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTCGCATGGATGCATGTGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  750

seq1  TGTGTG  756
      ||||||
seq2  TGTGTG  756