BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-105N13
Chromosome2 (Build37)
Map Location 77,466,425 - 77,612,408
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp533
Upstream genePrkra, Dfnb59, Fkbp7, Plekha3, Ttn, 2610301F02Rik, Sestd1, LOC623706, LOC667906
Downstream geneBC003993, LOC667920, OTTMUSG00000016703, LOC383717, LOC100040476
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-105N13.bB6Ng01-105N13.g
ACCDH913756DH913757
length1,141967
definitionDH913756|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-105N13, 5' end.DH913757|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-105N13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(77,611,269 - 77,612,408)(77,466,425 - 77,467,268)
sequence
gaattctttaaggctcctttggaggggaccatgtctcctcaaaaaaggaa
cataatgaacttcttccttttttaaaaaagaagagacttagtatgcaatg
caacgacacaccacactgacttttaagcatatgcagttgttaaaagctat
tttagtagtgtgtttctggatgctgtaggagtactccctccttgcattct
gttttgtcacattagtgaaactcaattatgacgtatacagtttaattaac
ataataagaattaagatgtattccttgtaggcctgtgagaactacagtca
agatagtattgggatcactagtgtgtcaggccagcaacaagggtgtaact
atataatcactcttggaccaagtgcctcttgacaaactagtaaagtgaag
aaagattagtacctaactacacacacacacacacacacacacacacacac
acacacacacacacacacagtatgtattataatatatgcagctgtttttt
atatacacacacagaccctttgtactcctgtgtcctgtgttgacagttgg
gaatttgtctgctggccagctgtagcatgacttgaagattccctgtaaag
tttggcagttatttcttgaattcatatcttgggtagtaaaaggaaaaaaa
accaaacagttgctccaagttccattcaccatcttgtattaagggaaata
ggttaaatgggaaactgtgcatttagaatagacatgcggaaagaatagta
actggctagatgttggtagttaaggacctcattggattctccattcttaa
cgccccttttcccagatttaaactttcacctcaaaatgaagcatctacca
gccatgcttatataaaaccaatgagttcctttttacaataaacagaccac
caaaattagaaatacagctatggatgttcagaagatacttaaagaataga
attacatgtcaaaatatatactgcataaaatgcaccaataggtatttata
atgcttagtgatggttattactttcttctaaaaataattagagacagtca
gataggctcaatgggtaaaggtgcctgttgctaactatgatatcctaaag
ttttttttctaggattgtctgtgagaggaagagaaaggacc
gaattcttacaccatcagtgataacctgatggaccactggctctgcttct
gtcctgggcttatgagaggtgctcatgtggttttatcaggcatttcactg
gcatcaaatgacaagggctaccatagtttccctttcattttttaaactat
ctttcagtgcatgcccttctaccctgtttggaaaccttctcttctctggt
agagtcagtcaagggcagcaaaatgcattatgcttccttatcccatggga
atggttgcctgctgggaggaatgtgtttatcctaatttgcctataaagta
tagttggaagtagatgcaggagatcacaaaactgtgggcaggttgtgcga
ttttatttatttatttaataggtattttcctcatttacatttccaatgct
atcccaaaagtctcccataacctcaccccccactcccctacccacccact
cccacttcttggccctggcattcccctgtactggggcatataaagtttgc
aagaccaatgggcctctctttccagtgatgatcgactaggccatcttctg
atacatatgcagctagagacacaagctctggggggtttggttagttcata
ttgttgttccacctatagggttgcagacccctttagctccttgggtactt
tctctagctcctccattggagaccctgtgatccatccaatagctgactgt
gagcatccacttctgtgtttgctaggccccagcatagcctcacaagagat
agctaaaatctgggtcctttcagcaaaatcttgctagtgtatgcaatggt
gtcagcgtttgggaggctgattatgggatgggattcccgggtatggcagt
ctctagatggtccatcctttcatctcagctccaaactttgtctctgtaac
tccttccatagatgttttgttcccaattctaagaagggcaaaatgtccac
acttggtctcccttctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_77611269_77612408
seq2: B6Ng01-105N13.b_47_1187 (reverse)

seq1  GGTCCTTTCTCTCCTTCTACTAGGCAGATCCCTAG--AAATAACCTTAGG  48
      |||||||||||| | |||   || || || |||||  ||| ||| |||||
seq2  GGTCCTTTCTCTTCCTCTCACAGACA-AT-CCTAGAAAAAAAACTTTAGG  48

seq1  ATATCATGTTTAGCAGCAAGCACCTTTACCCACTGAG-CTATCTGACTGT  97
      |||||||  |||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||
seq2  ATATCATAGTTAGCAACAGGCACCTTTACCCATTGAGCCTATCTGACTGT  98

seq1  CTCTAATTATTTTTAGAAGAAAGTAATAACAATCACTTAGCATTATAAAT  147
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||
seq2  CTCTAATTATTTTTAGAAGAAAGTAATAACCATCACTAAGCATTATAAAT  148

seq1  ACCTATTGGTGCATTTTTATGCAGTATATAATTTTGACATGTAATTCTAT  197
      ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  ACCTATTGGTGCA-TTTTATGCAGTATAT-ATTTTGACATGTAATTCTAT  196

seq1  TCTTTAAGTATCTTCTTGAACATCCATAGCTGTATTTCTAATTTTGGTGG  247
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTAAGTATCTTC-TGAACATCCATAGCTGTATTTCTAATTTTGGTGG  245

seq1  TCTGTTTATTGTAAAAAGGAACTCA-TGGTTTTATATAAGCATGGCTGGT  296
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTTATTGTAAAAAGGAACTCATTGGTTTTATATAAGCATGGCTGGT  295

seq1  AGATGCTTCATTTTGAGGTG-AAGTTTAAATCTGGG-AAAGGGGCGTTAA  344
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AGATGCTTCATTTTGAGGTGAAAGTTTAAATCTGGGAAAAGGGGCGTTAA  345

seq1  GAATGGAGAATCCAATGAGGTCCTTAACTACCAACATCTAGCCAGTTACT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGGAGAATCCAATGAGGTCCTTAACTACCAACATCTAGCCAGTTACT  395

seq1  ATTCTTTCCGCATGTCTATTCTAAATGCACAGTTTCCCATTTAACCTATT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTTCCGCATGTCTATTCTAAATGCACAGTTTCCCATTTAACCTATT  445

seq1  TCCCTTAATACAAGATGGTGAATGGAACTTGGAGCAACTGTTTGGTTTTT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTAATACAAGATGGTGAATGGAACTTGGAGCAACTGTTTGGTTTTT  495

seq1  TTTCCTTTTACTACCCAAGATATGAATTCAAGAAATAACTGCCAAACTTT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTTTTACTACCCAAGATATGAATTCAAGAAATAACTGCCAAACTTT  545

seq1  ACAGGGAATCTTCAAGTCATGCTACAGCTGGCCAGCAGACAAATTCCCAA  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGAATCTTCAAGTCATGCTACAGCTGGCCAGCAGACAAATTCCCAA  595

seq1  CTGTCAACACAGGACACAGGAGTACAAAGGGTCTGTGTGTGTATATAAAA  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCAACACAGGACACAGGAGTACAAAGGGTCTGTGTGTGTATATAAAA  645

seq1  AACAGCTGCATATATTATAATACATACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGCTGCATATATTATAATACATACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  695

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGTTAGGTACTAATCTTTCTTC  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGTTAGGTACTAATCTTTCTTC  745

seq1  ACTTTACTAGTTTGTCAAGAGGCACTTGGTCCAAGAGTGATTATATAGTT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTACTAGTTTGTCAAGAGGCACTTGGTCCAAGAGTGATTATATAGTT  795

seq1  ACACCCTTGTTGCTGGCCTGACACACTAGTGATCCCAATACTATCTTGAC  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCCTTGTTGCTGGCCTGACACACTAGTGATCCCAATACTATCTTGAC  845

seq1  TGTAGTTCTCACAGGCCTACAAGGAATACATCTTAATTCTTATTATGTTA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGTTCTCACAGGCCTACAAGGAATACATCTTAATTCTTATTATGTTA  895

seq1  ATTAAACTGTATACGTCATAATTGAGTTTCACTAATGTGACAAAACAGAA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAACTGTATACGTCATAATTGAGTTTCACTAATGTGACAAAACAGAA  945

seq1  TGCAAGGAGGGAGTACTCCTACAGCATCCAGAAACACACTACTAAAATAG  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAGGAGGGAGTACTCCTACAGCATCCAGAAACACACTACTAAAATAG  995

seq1  CTTTTAACAACTGCATATGCTTAAAAGTCAGTGTGGTGTGTCGTTGCATT  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTAACAACTGCATATGCTTAAAAGTCAGTGTGGTGTGTCGTTGCATT  1045

seq1  GCATACTAAGTCTCTTCTTTTTTAAAAAAGGAAGAAGTTCATTATGTTCC  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATACTAAGTCTCTTCTTTTTTAAAAAAGGAAGAAGTTCATTATGTTCC  1095

seq1  TTTTTTGAGGAGACATGGTCCCCTCCAAAGGAGCCTTAAAGAATTC  1140
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTGAGGAGACATGGTCCCCTCCAAAGGAGCCTTAAAGAATTC  1141

seq1: chr2_77466425_77467268
seq2: B6Ng01-105N13.g_67_913

seq1  GAATTCTTACACCATCAGTGATAACCTGATGGACCACTGGCTCTGCTTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTACACCATCAGTGATAACCTGATGGACCACTGGCTCTGCTTCT  50

seq1  GTCCTGGGCTTATGAGAGGTGCTCATGTGGTTTTATCAGGCATTTCACTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGGGCTTATGAGAGGTGCTCATGTGGTTTTATCAGGCATTTCACTG  100

seq1  GCATCAAATGACAAGGGCTACCATAGTTTCCCTTTCATTTTTTAAACTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCAAATGACAAGGGCTACCATAGTTTCCCTTTCATTTTTTAAACTAT  150

seq1  CTTTCAGTGCATGCCCTTCTACCCTGTTTGGAAACCTTCTCTTCTCTGGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCAGTGCATGCCCTTCTACCCTGTTTGGAAACCTTCTCTTCTCTGGT  200

seq1  AGAGTCAGTCAAGGGCAGCAAAATGCATTATGCTTCCTTATCCCATGGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTCAGTCAAGGGCAGCAAAATGCATTATGCTTCCTTATCCCATGGGA  250

seq1  ATGGTTGCCTGCTGGGAGGAATGTGTTTATCCTAATTTGCCTATAAAGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTTGCCTGCTGGGAGGAATGTGTTTATCCTAATTTGCCTATAAAGTA  300

seq1  TAGTTGGAAGTAGATGCAGGAGATCACAAAACTGTGGGCAGGTTGTGCGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTGGAAGTAGATGCAGGAGATCACAAAACTGTGGGCAGGTTGTGCGA  350

seq1  TTTTATTTATTTATTTAATAGGTATTTTCCTCATTTACATTTCCAATGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATTTATTTATTTAATAGGTATTTTCCTCATTTACATTTCCAATGCT  400

seq1  ATCCCAAAAGTCTCCCATAACCTCACCCCCCACTCCCCTACCCACCCACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCAAAAGTCTCCCATAACCTCACCCCCCACTCCCCTACCCACCCACT  450

seq1  CCCACTTCTTGGCCCTGGCATTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACTTCTTGGCCCTGGCATTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGC  500

seq1  AAGACCAATGGGCCTCTCTTTCCAGTGATGATCGACTAGGCCATCTTCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACCAATGGGCCTCTCTTTCCAGTGATGATCGACTAGGCCATCTTCTG  550

seq1  ATACATATGCAGCTAGAGACACAAGCTCTGGGGGGTTTGGTTAGTTCATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATATGCAGCTAGAGACACAAGCTCTGGGGGGTTTGGTTAGTTCATA  600

seq1  TTGTTGTTCCACCTATAGGGTTGCAGACCCCTTTAGCTCCTTGGGTACTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGTTCCACCTATAGGGTTGCAGACCCCTTTAGCTCCTTGGGTACTT  650

seq1  TCTCTAGCTCCTCCATTGGAGACCCTGTGATCCATCCAATAGCTGACTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTAGCTCCTCCATTGGAGACCCTGTGATCCATCCAATAGCTGACTGT  700

seq1  GAGCATCCACTTCTGTGTTTGCTAGGCCCCAGCATAGCCTCACAAGAGAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCATCCACTTCTGTGTTTGCTAGGCCCCAGCATAGCCTCACAAGAGAT  750

seq1  AGCT-ATATCTGGGTCCTTTCAGCAAAATCTTGCTAGTGTATGCAATGGT  799
      |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAAAATCTGGGTCCTTTCAGCAAAATCTTGCTAGTGTATGCAATGGT  800

seq1  GTCAGCGTTT-GGAGGCTGATTATGGGAT-GGATTCCCGGGTATGGC  844
      |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GTCAGCGTTTGGGAGGCTGATTATGGGATGGGATTCCCGGGTATGGC  847