BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-109O22
Chromosome2 (Build37)
Map Location 27,196,702 - 27,361,852
singlet/doubletdoublet
Overlap geneVav2, D2Bwg1423e, Brd3
Upstream geneGpsm1, D2Bwg1335e, Card9, Snapc4, Sdccag3, Pmpca, Inpp5e, AU024582, Notch1, Egfl7, Agpat2, B230317C12Rik, 5730588L14Rik, LOC100039446, Lcn4, LOC669582, Abo, Surf6, Surf5-ps, Surf5, Rpl7a, Surf1, Surf2, Surf4, Gm711, Rexo4, Adamts13, 5930434B04Rik, Slc2a6, LOC665315, 1110002H13Rik, Adamtsl2, C630035N08Rik, Dbh, Sardh
Downstream geneWdr5, Rxra, Col5a1, Fcnb, Olfm1, Gm347, 1700007K13Rik, Mrps2, LOC665412, Gbgt1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-109O22.bB6Ng01-109O22.g
ACCDH916703DH916704
length1,065928
definitionDH916703|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-109O22, 5' end.DH916704|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-109O22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(27,360,792 - 27,361,852)(27,196,702 - 27,197,451)
sequence
gaattcttggccagccaaagctattcagtgagtccctgtctccaaagtac
ataaacaaacaaacaaataagccaagtgtgtacttaggagacaggggaag
gcaaattggatctctgggtttgaggccagcctggtttacaggataagttc
cagaatagtcagagctacacagagaaaccctgagtcaacacccccctaaa
acaataatttaaaatatatttttaaaaatcatgccgggcagtggtggcac
acgcctttaatcccagcacttgggaggcagaggcaggggaatttctgagt
tttaggccagcctggtctacagagtgagttccaggtcagccagggctaca
cagagaaaccctgtctcaaaacaaacaaacaaaaagatccatctgctcac
cacccaggtagctgctgagggaagataacagcactcaaccaacaactgga
atgtccgctgggttgaagctctaaactatactgtttccagcaaactgcag
gccaaagttgctggattgggactctccttacctccaggtggtgctgggag
cccagccacagcaccggatgtgtctcaagaccatctggccctaagatcag
ccggggccgggtcttagaggaagaatctcaggaatgtggccctgcttcca
aagtcaggccgcacctagctctgtctcagtggctcctcccacctgggctc
aggtttgagcttcctagacgagaaaggacttgacaaagaaaggcagatgt
gacagccctgagaagctcagaggccctgaggcccaggggaatagttttct
ttccttttttaaacagggtttctctgtgcagctttgggtgtcctggaacg
cgctctgtagaccaggttggctttcgactcagagatcctcctgttccccc
aaaatgctaagatttaaggcttgcgccaccgccaccaccactggaatatt
tttactattaataataattatctttattacaattgttctgttttgcttga
gacagggtctcaccttggactacaactccgaaactgccatagaccaggcg
gccttgggagtaacc
gaattctgggatagagttaggcaggagattaacttgggaagatgtgagga
gatggatgcctggtgcctgagcataggtaagcagccacatggcagaagaa
gttaaaacaaatgggtcattgttagttatgatctagtcagagtagcgcct
agctatatggcccaggtatttgtaaatatattttgagtctgagactttat
ttctgggaggaaggccaggtctatcttttacaacttacaaaagtctgtaa
ctccagttccaggactctcttccagtgtccataggcaccgtataaacatg
gctcacagacatacatgaaggcagcactcacacacattcaaaagtaaagt
taaatgcatactcattgaaagagatggcagacaccaaacgacatctcagc
agccactagtactgaccacccacaccccacatcctctaccgtatagatgt
aagctctacacaaacctccctaaacacattattcaaacccaagacatatc
caaggtagatacacaagaccactcaaactcaccatgccatagctaccacc
attccggagttcaatcgtgcaaacccagggagctggggctcactcttaag
aaacaaaaaatgttctaaaaagagattagactagtttgaatgagctagca
tgtgaagccatgacactttcctttatgctcctcaagtaaaagtcaaatgt
gaatgtaggtgggtggacacatggatggatagatgggtagatgtatgggt
agattatctttccgcgattcagcccttcaaggacaataacagaaaaaagc
caatacaaggacagaaaccatgccctagaaaaaaacaagaagtaatcctt
cacaaaccaaaaagaagacagccacagaacagaatgccaactctaacaac
aaaatatacggaggcagcaattactttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_27360792_27361852
seq2: B6Ng01-109O22.b_43_1106 (reverse)

seq1  GTTACT-CCAAGGCCAGCCTGGTCTAT-GCAGTTCTGGGTTAGTTAGTCC  48
      |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  ||  | | ||||||
seq2  GTTACTCCCAAGGCC-GCCTGGTCTATGGCAGTTTCGGAGTTG-TAGTCC  48

seq1  CAAGTGAGACCCTGTCTCAAGCAAAACAGAACAATAGTAATAAAGATAAT  98
       | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AAGGTGAGACCCTGTCTCAAGCAAAACAGAACAATTGTAATAAAGATAAT  98

seq1  TAATATTAATAGTAAAAATATTCCAGTGGTGGTGGCGGTGGCGC-AGCCT  147
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TATTATTAATAGTAAAAATATTCCAGTGGTGGTGGCGGTGGCGCAAGCCT  148

seq1  TTAATCTTAGCATTT--GGGGGACAGGAGGATCTCTGAGTCGGAAGCCAA  195
      | |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TAAATCTTAGCATTTTGGGGGAACAGGAGGATCTCTGAGTCGAAAGCCAA  198

seq1  CCTGGTCTACAGAGCGCGTTCCAGGACACCCAAAGCTGCACAGAGAAACC  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTCTACAGAGCGCGTTCCAGGACACCCAAAGCTGCACAGAGAAACC  248

seq1  CTGTTTTAAAAAAGGAAAAGAAAACTATT-CCCTGGGCCTCAGGGCCTCT  294
      ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CTG-TTTAAAAAAGG-AAAGAAAACTATTCCCCTGGGCCTCAGGGCCTCT  296

seq1  GAGCTTCTCAGGGCTGTCACATCTGCCTTTCTTTGTCAAGTCCTTTCTCG  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTTCTCAGGGCTGTCACATCTGCCTTTCTTTGTCAAGTCCTTTCTCG  346

seq1  TCTAGGAAGCTC-AACCTGAGCCCAGGTGGGAGGAGCCACTGAGACAGAG  393
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGGAAGCTCAAACCTGAGCCCAGGTGGGAGGAGCCACTGAGACAGAG  396

seq1  CTAGGTGCGGCCTGACTTTGGAAGCAGGGCCACATTCCTGAGATTCTTCC  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGTGCGGCCTGACTTTGGAAGCAGGGCCACATTCCTGAGATTCTTCC  446

seq1  TCTAAGACCCGGCCCCGGCTGATCTTAGGGCCAGATGGTCTTGAGACACA  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAGACCCGGCCCCGGCTGATCTTAGGGCCAGATGGTCTTGAGACACA  496

seq1  TCCGGTGCTGTGGCTGGGCTCCCAGCACCACCTGGAGGTAAGGAGAGTCC  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGGTGCTGTGGCTGGGCTCCCAGCACCACCTGGAGGTAAGGAGAGTCC  546

seq1  CAATCCAGCAACTTTGGCCTGCAGTTTGCTGGAAACAGTATAGTTTAGAG  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCCAGCAACTTTGGCCTGCAGTTTGCTGGAAACAGTATAGTTTAGAG  596

seq1  CTTCAACCCAGCGGACATTCCAGTTGTTGGTTGAGTGCTGTTATCTTCCC  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAACCCAGCGGACATTCCAGTTGTTGGTTGAGTGCTGTTATCTTCCC  646

seq1  TCAGCAGCTACCTGGGTGGTGAGCAGATGGATCTTTTTGTTTGTTTGTTT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCAGCTACCTGGGTGGTGAGCAGATGGATCTTTTTGTTTGTTTGTTT  696

seq1  TGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGACCTGGAACTCACTCTGT  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGACCTGGAACTCACTCTGT  746

seq1  AGACCAGGCTGGCCTAAAACTCAGAAATTCCCCTGCCTCTGCCTCCCAAG  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCAGGCTGGCCTAAAACTCAGAAATTCCCCTGCCTCTGCCTCCCAAG  796

seq1  TGCTGGGATTAAAGGCGTGTGCCACCACTGCCCGGCATGATTTTTAAAAA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGGATTAAAGGCGTGTGCCACCACTGCCCGGCATGATTTTTAAAAA  846

seq1  TATATTTTAAATTATTGTTTTAGGGGGGTGTTGACTCAGGGTTTCTCTGT  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTTTAAATTATTGTTTTAGGGGGGTGTTGACTCAGGGTTTCTCTGT  896

seq1  GTAGCTCTGACTATTCTGGAACTTATCCTGTAAACCAGGCTGGCCTCAAA  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCTCTGACTATTCTGGAACTTATCCTGTAAACCAGGCTGGCCTCAAA  946

seq1  CCCAGAGATCCAATTTGCCTTCCCCTGTCTCCTAAGTACACACTTGGCTT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGAGATCCAATTTGCCTTCCCCTGTCTCCTAAGTACACACTTGGCTT  996

seq1  ATTTGTTTGTTTGTTTATGTACTTTGGAGACAGGGACTCACTGAATAGCT  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTTTGTTTGTTTATGTACTTTGGAGACAGGGACTCACTGAATAGCT  1046

seq1  TTGGCTGGCCAAGAATTC  1061
      ||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTGGCCAAGAATTC  1064

seq1: chr2_27196702_27197451
seq2: B6Ng01-109O22.g_67_816

seq1  GAATTCTGGGATAGAGTTAGGCAGGAGATTAACTTGGGAAGATGTGAGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGGATAGAGTTAGGCAGGAGATTAACTTGGGAAGATGTGAGGA  50

seq1  GATGGATGCCTGGTGCCTGAGCATAGGTAAGCAGCCACATGGCAGAAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGATGCCTGGTGCCTGAGCATAGGTAAGCAGCCACATGGCAGAAGAA  100

seq1  GTTAAAACAAATGGGTCATTGTTAGTTATGATCTAGTCAGAGTAGCGCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAAACAAATGGGTCATTGTTAGTTATGATCTAGTCAGAGTAGCGCCT  150

seq1  AGCTATATGGCCCAGGTATTTGTAAATATATTTTGAGTCTGAGACTTTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATATGGCCCAGGTATTTGTAAATATATTTTGAGTCTGAGACTTTAT  200

seq1  TTCTGGGAGGAAGGCCAGGTCTATCTTTTACAACTTACAAAAGTCTGTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGGAGGAAGGCCAGGTCTATCTTTTACAACTTACAAAAGTCTGTAA  250

seq1  CTCCAGTTCCAGGACTCTCTTCCAGTGTCCATAGGCACCGTATAAACATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAGTTCCAGGACTCTCTTCCAGTGTCCATAGGCACCGTATAAACATG  300

seq1  GCTCACAGACATACATGAAGGCAGCACTCACACACATTCAAAAGTAAAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCACAGACATACATGAAGGCAGCACTCACACACATTCAAAAGTAAAGT  350

seq1  TAAATGCATACTCATTGAAAGAGATGGCAGACACCAAACGACATCTCAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGCATACTCATTGAAAGAGATGGCAGACACCAAACGACATCTCAGC  400

seq1  AGCCACTAGTACTGACCACCCACACCCCACATCCTCTACCGTATAGATGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCACTAGTACTGACCACCCACACCCCACATCCTCTACCGTATAGATGT  450

seq1  AAGCTCTACACAAACCTCCCTAAACACATTATTCAAACCCAAGACATATC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTCTACACAAACCTCCCTAAACACATTATTCAAACCCAAGACATATC  500

seq1  CAAGGTAGATACACAAGACCACTCAAACTCACCATGCCATAGCTACCACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGTAGATACACAAGACCACTCAAACTCACCATGCCATAGCTACCACC  550

seq1  ATTCCGGAGTTCAATCGTGCAAACCCAGGGAGCTGGGGCTCACTCTTAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCGGAGTTCAATCGTGCAAACCCAGGGAGCTGGGGCTCACTCTTAAG  600

seq1  AAACAAAAAATGTTCTAAAAAGAGATTAGACTAGTTTGAATGAGCTAGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAAAAATGTTCTAAAAAGAGATTAGACTAGTTTGAATGAGCTAGCA  650

seq1  TGTGAAGCCATGACACTTTCCTTTATGCTCCTCAAGTAAAAGTCAAATGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAAGCCATGACACTTTCCTTTATGCTCCTCAAGTAAAAGTCAAATGT  700

seq1  GAATGTAGGTGGGTGGACACATGGATGGATAGATGGGTAGATGTATGGGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGTAGGTGGGTGGACACATGGATGGATAGATGGGTAGATGTATGGGT  750