BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-113K11
Chromosome2 (Build37)
Map Location 14,605,621 - 14,730,964
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCacnb2, LOC625335, LOC625342
Upstream geneSt8sia6, Ptpla, Stam, 2010003H20Rik, Mrc1, Slc39a12, LOC100041164
Downstream geneLOC100041220, Nsun6, Arl5b, LOC633061, LOC667329, LOC227588
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-113K11.bB6Ng01-113K11.g
ACCDH919392DH919393
length1,0131,094
definitionDH919392|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113K11, 5' end.DH919393|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113K11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,605,621 - 14,606,635)(14,729,870 - 14,730,964)
sequence
gaattcactatgaaattttggtttgtgacagctcagcttttacaaacatt
ttagttttaagaattttagtttgatttatatattatgcggtatggactga
ttttagagcatgtgtgtggatatcagtggacagagaacagtatgtgagag
taagttctctctttccaccatctgggtcctggggattgaactcaggtcgc
catacttcatggccttcatcttctgggccatctcatcaaccaagttgttt
tcaactagacccaaaatctttaagaaatctgggatattcatggaagaagt
gaaagcagtaatgatgaggtaaaagttctttgggtataatgttcaacttg
tttaaaaattaagctttcagcccactctgagcttaattcctttgaacagt
ttgctgcataaatgactcagaaatgccatctgacacactcaagaacattg
tcaatcactaatgtgcatatgttatgggcatgccacatggacagaggaaa
cattctaacttggatcctaagcacaacagctttacttcagaaagaattct
ttgattttgatgctatcttacctaactccttcatatttggtcttcacctt
tgaactttgaattaaaccatgtagcctaatattgaacactgctgtaagat
acaacatggcagctgcatggcactgtagaataccctgtcaacaaaggctg
accaggaataaacatctacctagtgcttattgaatgcgcaaatggaatat
cattttgtatagtttgttgtgaaaacagaagggtattatcctctgtataa
tcttgttcagtacagcctttgttggtgttttgacaagattcaagaacaat
tactaaaaacatactcttttctgtacttaaccaggcaagcacatggggca
ggaggttgttacattgcgggtttgtttagttttgacattcactttctgta
ctaggcaagctgcacactctggcaattattgtgattctggggttgaaggt
tgtttgttgacac
gaattcaagataaatttgatccttttccagtgttagagacaacaacagaa
aaccccaaacaaacaaacaacatctaaaacaacaaccaacaaaatcagca
acaacaacaaaatcccttcaagtcagaaaaataaatccctaccaaataat
aattattggtcttttatacttctggcaaaatttcaatttacatatctata
ctatagggcgatacagaaaacatatagctacattagagaatcaatatatt
aaaactaagatctttttttccctctaggcattaatccaattttctggcta
taatttattttcattgttgactattagaaaataagacaacaaaaatatca
agtaaccacagcagcaacaaaagacttaccactgccttcccctgggctcc
taatctacagaaatggggtcagactccaaaggatgattgccagattacac
aaaacatctagcacacatctgccatatcagagtttccaaataaatgtcag
tttcctttgtataacagagtgattctccactgggggtgaatttgctcccc
aggagacattgagcaatgtctagaaccattgttgattgctacaacaggga
agggtgggtagtttactggcatttagctgggagaggctaaggatgctgct
gacatccacagtacacacacaatacaattaagagggatccacggctgtat
gcccacactgctaagatcagaacaccatggcagaaaagaaaggtgccctt
ttatatcaacgctgtgagtgagagatgctctcagtcaaaaccaaagacaa
cagctcttgaaattcagatcatttctagatcttctgcaggttgtttcaga
gtggaaacagctagagagaggatggggaggattaagaaaagagtctgaag
caactgtgcatggagatgctctgtgagtagagatgaagtctactgggacc
actgtcagagtttagctaagcacagaggtgctctcagacccataatattt
tgccttagctacttttcaggtttctccagctcctcaccttattctcctgg
gccccactctacctcatcatggttaaatactggagggagagggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_14605621_14606635
seq2: B6Ng01-113K11.b_48_1060

seq1  GAATTCACTATGAAATTTTGGTTTGTGACAGCTCAGCTTTTACAAACATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTATGAAATTTTGGTTTGTGACAGCTCAGCTTTTACAAACATT  50

seq1  TTAGTTTTAAGAATTTTAGTTTGATTTATATATTATGCGGTATGGACTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTTTTAAGAATTTTAGTTTGATTTATATATTATGCGGTATGGACTGA  100

seq1  TTTTAGAGCATGTGTGTGGATATCAGTGGACAGAGAACAGTATGTGAGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGAGCATGTGTGTGGATATCAGTGGACAGAGAACAGTATGTGAGAG  150

seq1  TAAGTTCTCTCTTTCCACCATCTGGGTCCTGGGGATTGAACTCAGGTCGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTTCTCTCTTTCCACCATCTGGGTCCTGGGGATTGAACTCAGGTCGC  200

seq1  CATACTTCATGGCCTTCATCTTCTGGGCCATCTCATCAACCAAGTTGTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACTTCATGGCCTTCATCTTCTGGGCCATCTCATCAACCAAGTTGTTT  250

seq1  TCAACTAGACCCAAAATCTTTAAGAAATCTGGGATATTCATGGAAGAAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACTAGACCCAAAATCTTTAAGAAATCTGGGATATTCATGGAAGAAGT  300

seq1  GAAAGCAGTAATGATGAGGTAAAAGTTCTTTGGGTATAATGTTCAACTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGCAGTAATGATGAGGTAAAAGTTCTTTGGGTATAATGTTCAACTTG  350

seq1  TTTAAAAATTAAGCTTTCAGCCCACTCTGAGCTTAATTCCTTTGAACAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAAATTAAGCTTTCAGCCCACTCTGAGCTTAATTCCTTTGAACAGT  400

seq1  TTGCTGCATAAATGACTCAGAAATGCCATCTGACACACTCAAGAACATTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGCATAAATGACTCAGAAATGCCATCTGACACACTCAAGAACATTG  450

seq1  TCAATCACTAATGTGCATATGTTATGGGCATGCCACATGGACAGAGGAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATCACTAATGTGCATATGTTATGGGCATGCCACATGGACAGAGGAAA  500

seq1  CATTCTAACTTGGATCCTAAGCACAACAGCTTTACTTCAGAAAGAATTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTAACTTGGATCCTAAGCACAACAGCTTTACTTCAGAAAGAATTCT  550

seq1  TTGATTTTGATGCTATCTTACCTAACTCCTTCATATTTGGTCTTCACCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATTTTGATGCTATCTTACCTAACTCCTTCATATTTGGTCTTCACCTT  600

seq1  TGAACTTTGAATTAAACCATGTAGCCTAATATTGAACACTGCTGTAAGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACTTTGAATTAAACCATGTAGCCTAATATTGAACACTGCTGTAAGAT  650

seq1  ACAACATGGCAGCTGCATGGCACTGTAGAATACCCTGTCAACAAAGGCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACATGGCAGCTGCATGGCACTGTAGAATACCCTGTCAACAAAGGCTG  700

seq1  ACCAGGAATAAACATCTACCTAGTGCTTATTGAATGCGCAAATGGAATAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGGAATAAACATCTACCTAGTGCTTATTGAATGCGCAAATGGAATAT  750

seq1  CATTTTGTATAGTTTGTTGTGAAAACAGAAGGGTATTATCCTCTGTATAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTGTATAGTTTGTTGTGAAAACAGAAGGGTATTATCCTCTGTATAA  800

seq1  TCTTGTTCAGTACAGCCTTTGTTGGTGTTTTGACAAGATTCAAGAACAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTTCAGTACAGCCTTTGTTGGTGTTTTGACAAGATTCAAGAACAAT  850

seq1  TACTAAAAACATACTCTTTTCTGTACTTAACCAGGCAAGCACATGGGGCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAAAAACATACTCTTTTCTGTACTTAACCAGGCAAGCACATGGGGCA  900

seq1  GGAGGTTGTTACATTGCGGGTTTGTTTAGTTTTGACATTCAACTTTCTGT  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GGAGGTTGTTACATTGCGGGTTTGTTTAGTTTTGACATTC-ACTTTCTGT  949

seq1  ACTAGGCAAGGCTGCACACTCATGCAATTATGGTAATCTGGGGGTTGAGG  1000
      ||||||||| |||||||||||  |||||||| || ||   |||||||| |
seq2  ACTAGGCAA-GCTGCACACTCTGGCAATTATTGTGATTCTGGGGTTGAAG  998

seq1  GTTGTGTGTTGACAC  1015
      ||||| |||||||||
seq2  GTTGTTTGTTGACAC  1013

seq1: chr2_14729870_14730964
seq2: B6Ng01-113K11.g_70_1163 (reverse)

seq1  CCCCTCTCCCTCCAGTATTTAACATGGATGAGTTAGAGTTGGGGCCAGGA  50
      |||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||| ||||||
seq2  CCCCTCTCCCTCCAGTATTTAACCATGATGAGGTAGAGTGGGGCCCAGGA  50

seq1  GAATAAGGTGAGGAGCTGGAAGAAACTTGAAAAGTAGCTAAGGCAAAATA  100
      ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAAGGTGAGGAGCTGG-AGAAACCTGAAAAGTAGCTAAGGCAAAATA  99

seq1  TTATGGGTCTGAGAGCACCTCTGTGCTTTAGCTAAACTCTGACAGTGGTC  150
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGGGTCTGAGAGCACCTCTGTGC-TTAGCTAAACTCTGACAGTGGTC  148

seq1  CCAGTAGACTTCATCTCTACTCACAGAGCATCTCCATGCACAGTTGCTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTAGACTTCATCTCTACTCACAGAGCATCTCCATGCACAGTTGCTTC  198

seq1  AGACTCTTTTCTTAATCCTCCCCATCCTCTCTCTAGCTGTTTCCCACTCT  250
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  AGACTCTTTTCTTAATCCTCCCCATCCTCTCTCTAGCTGTTT-CCACTCT  247

seq1  GAAACAACCTGCAGAAGATCTAGAAATGATCTGAATTTCAAGAGCTGTTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACAACCTGCAGAAGATCTAGAAATGATCTGAATTTCAAGAGCTGTTG  297

seq1  TCTTTGGTTTTGACTGAGAGCATCTCTCACTCACAGCGTTGATAT-AAAG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TCTTTGGTTTTGACTGAGAGCATCTCTCACTCACAGCGTTGATATAAAAG  347

seq1  GGCACCTTTC-TTTCTGCCATGGTGTTCTGATCTTAGCAGTGTGGGCATA  398
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACCTTTCTTTTCTGCCATGGTGTTCTGATCTTAGCAGTGTGGGCATA  397

seq1  CAGCCGTGGATCCCTCTTAATTGTATTGTGTGTGTACTGTGGATGTCAGC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCGTGGATCCCTCTTAATTGTATTGTGTGTGTACTGTGGATGTCAGC  447

seq1  AGCATCCTTAGCCTCTCCCAGCTAAATGCCAGTAAACTACCCACCCTTCC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCCTTAGCCTCTCCCAGCTAAATGCCAGTAAACTACCCACCCTTCC  497

seq1  CTGTTGTAGCAATCAACAATGGTTCTAGACATTGCTCAATGTCTCCTGGG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTGTAGCAATCAACAATGGTTCTAGACATTGCTCAATGTCTCCTGGG  547

seq1  GAGCAAATTCACCCCCAGTGGAGAATCACTCTGTTATACAAAGGAAACTG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAAATTCACCCCCAGTGGAGAATCACTCTGTTATACAAAGGAAACTG  597

seq1  ACATTTATTTGGAAACTCTGATATGGCAGATGTGTGCTAGATGTTTTGTG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTATTTGGAAACTCTGATATGGCAGATGTGTGCTAGATGTTTTGTG  647

seq1  TAATCTGGCAATCATCCTTTGGAGTCTGACCCCATTTCTGTAGATTAGGA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCTGGCAATCATCCTTTGGAGTCTGACCCCATTTCTGTAGATTAGGA  697

seq1  GCCCAGGGGAAGGCAGTGGTAAGTCTTTTGTTGCTGCTGTGGTTACTTGA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAGGGGAAGGCAGTGGTAAGTCTTTTGTTGCTGCTGTGGTTACTTGA  747

seq1  TATTTTTGTTGTCTTATTTTCTAATAGTCAACAATGAAAATAAATTATAG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTTGTTGTCTTATTTTCTAATAGTCAACAATGAAAATAAATTATAG  797

seq1  CCAGAAAATTGGATTAATGCCTAGAGGGAAAAAAAGATCTTAGTTTTAAT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAAAATTGGATTAATGCCTAGAGGGAAAAAAAGATCTTAGTTTTAAT  847

seq1  ATATTGATTCTCTAATGTAGCTATATGTTTTCTGTATCGCCCTATAGTAT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTGATTCTCTAATGTAGCTATATGTTTTCTGTATCGCCCTATAGTAT  897

seq1  AGATATGTAAATTGAAATTTTGCCAGAAGTATAAAAGACCAATAATTATT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATATGTAAATTGAAATTTTGCCAGAAGTATAAAAGACCAATAATTATT  947

seq1  ATTTGGTAGGGATTTATTTTTCTGACTTGAAGGGATTTTGTTGTTGTTGC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGGTAGGGATTTATTTTTCTGACTTGAAGGGATTTTGTTGTTGTTGC  997

seq1  TGATTTTGTTGGTTGTTGTTTTAGATGTTGTTTGTTTGTTTGGGGTTTTC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTTGTTGGTTGTTGTTTTAGATGTTGTTTGTTTGTTTGGGGTTTTC  1047

seq1  TGTTGTTGTCTCTAACACTGGAAAAGGATCAAATTTATCTTGAATTC  1095
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTTGTCTCTAACACTGGAAAAGGATCAAATTTATCTTGAATTC  1094