BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-113O23
Chromosome2 (Build37)
Map Location 168,672,012 - 168,776,107
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp64
Upstream geneLOC100043728, Ptpn1, 2310033K02Rik, Pard6b, Adnp, Dpm1, Mocs3, LOC100043908, Kcng1, LOC668952, Nfatc2, Atp9a, Sall4
Downstream geneLOC100043909, EG668954, Tshz2, LOC100043737
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-113O23.bB6Ng01-113O23.g
ACCDH919596DH919597
length785683
definitionDH919596|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113O23, 5' end.DH919597|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113O23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(168,672,012 - 168,672,794)(168,775,426 - 168,776,107)
sequence
gaattccaggcatgcacccagctggctctctgtaccttggagaaagcttc
cctcaggctacttccttctacttgattgaggttgagattgtgataaggaa
tggaggaaggatggggttgaggccagcgaaggttaacgctgtgctacagt
tgctacaagccacgcatcatggaaggcaccttcttgcataaagtgcgttt
catacttggttgtggtggggcacccctgtcaccccagtactcgaggggtg
taagcaggaggatcaggagttcaagaccagtctcagctgtatggagacac
ttcctcaaaagcagtgggctgagagatgcctctgtggacagaggactttc
tgtcaagcacaaggacttgagtttgaagggccagtacccacatgaggaga
agctaagtgtgacagtgtgtcttccccctgctgctggaggcttggagaca
gatggatgccagggactctctggccaggcaattcagtcaaaaagaactcc
aggctaagtgagaggccctgtcgccaaaagcataagtggaagatgtttaa
agaaagacaccaaccggcaggctctggcctccatactgcgcatgctggtg
aactggtgagctagctcatgcacacacacatattcaaatacacatacgtg
tgagcacacacacacatgtatcaaatacacaagtgctttgcacacacgta
cacatacacacatccaaatacatatacacatacacacacgttaacacata
cagtcgtgcacacacacatattcaaatacacacat
gaattcagggccagcctgggggggaaattaattaagaaaaaaatgtacag
aatgaaaccatgaagagtttggggtctggggctgaagcgatgcctcagtg
cttagaagtggtagatgctcctacagagcgcccactatgggctgtttaca
aatgcctgtaattccagctcctggggatccaatcccctctcctagccgtt
gagggcatctgcacacacgtgtgcatacacacacattgacacacatgtat
ttgtaaataataaagtaagtctgttatgttctagagtgcatgttatccac
atagtgacagatacacacctatctacacacacttaacacatctataacct
tcataaagtgaacagacagcagctttataaatgtatagatctccaatatg
gcgggtgctgtcggaattggatggtacaatccttcctgactggcctaccc
tccccagaggaagaaaatcagaagtggactgcaactgaggtttctttctc
tccagaaaaataaaagtctaaagatgagcatgttaagaaaaagttggccg
ctcacagctctaagcattcttcctatataaagaccatctaaaaaccaaca
aaagtggcagaaaagaagcaagtggaagagtcaatacaagatagcagatg
gctttataagggtgtactgagcacatggggggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_168672012_168672794
seq2: B6Ng01-113O23.b_47_831

seq1  GAATTCCAGGCATGCACCCAGCTGGCTCTCTGTACCTTGGAGAAAGCTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGCATGCACCCAGCTGGCTCTCTGTACCTTGGAGAAAGCTTC  50

seq1  CCTCAGGCTACTTCCTTCTACTTGATTGAGGTTGAGATTGTGATAAGGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAGGCTACTTCCTTCTACTTGATTGAGGTTGAGATTGTGATAAGGAA  100

seq1  TGGAGGAAGGATGGGGTTGAGGCCAGCGAAGGTTAACGCTGTGCTACAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGAAGGATGGGGTTGAGGCCAGCGAAGGTTAACGCTGTGCTACAGT  150

seq1  TGCTACAAGCCACGCATCATGGAAGGCACCTTCTTGCATAAAGTGCGTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTACAAGCCACGCATCATGGAAGGCACCTTCTTGCATAAAGTGCGTTT  200

seq1  CATACTTGGTTGTGGTGGGGCACCCCTGTCACCCCAGTACTCGAGGGGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACTTGGTTGTGGTGGGGCACCCCTGTCACCCCAGTACTCGAGGGGTG  250

seq1  TAAGCAGGAGGATCAGGAGTTCAAGACCAGTCTCAGCTGTATGGAGACAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCAGGAGGATCAGGAGTTCAAGACCAGTCTCAGCTGTATGGAGACAC  300

seq1  TTCCTCAAAAGCAGTGGGCTGAGAGATGCCTCTGTGGACAGAGGACTTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCAAAAGCAGTGGGCTGAGAGATGCCTCTGTGGACAGAGGACTTTC  350

seq1  TGTCAAGCACAAGGACTTGAGTTTGAAGGGCCAGTACCCACATGAGGAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAAGCACAAGGACTTGAGTTTGAAGGGCCAGTACCCACATGAGGAGA  400

seq1  AGCTAAGTGTGACAGTGTGTCTTCCCCCTGCTGCTGGAGGCTTGGAGACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAAGTGTGACAGTGTGTCTTCCCCCTGCTGCTGGAGGCTTGGAGACA  450

seq1  GATGGATGCCAGGGACTCTCTGGCCAGGCAATTCAGTCAAAAAGAACTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGATGCCAGGGACTCTCTGGCCAGGCAATTCAGTCAAAAAGAACTCC  500

seq1  AGGCTAAGTGAGAGGCCCTGTCGCCAAAAGCATAAGTGGAAGATGTTTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTAAGTGAGAGGCCCTGTCGCCAAAAGCATAAGTGGAAGATGTTTAA  550

seq1  AGAAAGACACCAACCGGCAGGCTCTGGCCTCCATACTGCGCATGCTGGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGACACCAACCGGCAGGCTCTGGCCTCCATACTGCGCATGCTGGTG  600

seq1  AACTGGTGAGCTAGCTCATGCACACACACATATTCAAATACACATACGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGGTGAGCTAGCTCATGCACACACACATATTCAAATACACATACGTG  650

seq1  TGAGCACACACACACATGTATCAAATACACAAGTGC-TTGCACACACGTA  699
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TGAGCACACACACACATGTATCAAATACACAAGTGCTTTGCACACACGTA  700

seq1  CACATACACACATCCAAATACATATACACATACACACACG-TAACACATA  748
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CACATACACACATCCAAATACATATACACATACACACACGTTAACACATA  750

seq1  CAGTCGTGCACACACACATATTCAAATACACACAT  783
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCGTGCACACACACATATTCAAATACACACAT  785

seq1: chr2_168775426_168776107
seq2: B6Ng01-113O23.g_70_752 (reverse)

seq1  CCCCCCCATGTGCTCAGTACACCCTTAT-AAGCCATCTGCTATCTTGTAT  49
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCCATGTGCTCAGTACACCCTTATAAAGCCATCTGCTATCTTGTAT  50

seq1  TGACTCTTCCACTTGCTTCTTTTCTGCCACTTTTGTTGGTTTTTAGATGG  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTCTTCCACTTGCTTCTTTTCTGCCACTTTTGTTGGTTTTTAGATGG  100

seq1  TCTTTATATAGGAAGAATGCTTAGAGCTGTGAGCGGCCAACTTTTTCTTA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTATATAGGAAGAATGCTTAGAGCTGTGAGCGGCCAACTTTTTCTTA  150

seq1  ACATGCTCATCTTTAGACTTTTATTTTTCTGGAGAGAAAGAAACCTCAGT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCTCATCTTTAGACTTTTATTTTTCTGGAGAGAAAGAAACCTCAGT  200

seq1  TGCAGTCCACTTCTGATTTTCTTCCTCTGGGGAGGGTAGGCCAGTCAGGA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGTCCACTTCTGATTTTCTTCCTCTGGGGAGGGTAGGCCAGTCAGGA  250

seq1  AGGATTGTACCATCCAATTCCGACAGCACCCGCCATATTGGAGATCTATA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATTGTACCATCCAATTCCGACAGCACCCGCCATATTGGAGATCTATA  300

seq1  CATTTATAAAGCTGCTGTCTGTTCACTTTATGAAGGTTATAGATGTGTTA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTATAAAGCTGCTGTCTGTTCACTTTATGAAGGTTATAGATGTGTTA  350

seq1  AGTGTGTGTAGATAGGTGTGTATCTGTCACTATGTGGATAACATGCACTC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTGTGTAGATAGGTGTGTATCTGTCACTATGTGGATAACATGCACTC  400

seq1  TAGAACATAACAGACTTACTTTATTATTTACAAATACATGTGTGTCAATG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAACATAACAGACTTACTTTATTATTTACAAATACATGTGTGTCAATG  450

seq1  TGTGTGTATGCACACGTGTGTGCAGATGCCCTCAACGGCTAGGAGAGGGG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTATGCACACGTGTGTGCAGATGCCCTCAACGGCTAGGAGAGGGG  500

seq1  ATTGGATCCCCAGGAGCTGGAATTACAGGCATTTGTAAACAGCCCATAGT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGATCCCCAGGAGCTGGAATTACAGGCATTTGTAAACAGCCCATAGT  550

seq1  GGGCGCTCTGTAGGAGCATCTACCACTTCTAAGCACTGAGGCATCGCTTC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCGCTCTGTAGGAGCATCTACCACTTCTAAGCACTGAGGCATCGCTTC  600

seq1  AGCCCCAGACCCCAAACTCTTCATGGTTTCATTCTGTACATTTTTTTCTT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCCAGACCCCAAACTCTTCATGGTTTCATTCTGTACATTTTTTTCTT  650

seq1  AATTAATTTCCCCCCCAGGCTGGCCCTGAATTC  682
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAATTTCCCCCCCAGGCTGGCCCTGAATTC  683