BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-119H04
Chromosome2 (Build37)
Map Location 50,618,657 - 50,730,142
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneKif5c, 2310010M24Rik, Lypd6, 2010311D03Rik, LOC666781
Downstream geneLOC227885, Rnd3, LOC666802, LOC666810, LOC100041614, Tas2r134, LOC433426, Ppia-ps2_635.1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-119H04.bB6Ng01-119H04.g
ACCDH923658DH923659
length1,217955
definitionDH923658|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119H04, 5' end.DH923659|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119H04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(50,728,913 - 50,730,142)(50,618,657 - 50,619,616)
sequence
gaattctcaactgaggaataccaccatatggctgagaagcacctaaaaaa
atgttcaacatccttaatcatcagggaaatgcaaatcaaaacaaccctga
gattccacctcacaccagtcagaatggctaagatcaaaaactcaggtgac
agcagatgctggcgaggatgtggagaaagaggaacactcctccatggctg
gtaggactgcaagttggtacaaccactctggaaatcagtcttacagttcc
tcagaaaattggacatagttctaccagaagatcctgcaatacctctcctg
agcatttacccaggagaggctccaacttgtaataaggacacctgctctac
tgtgttcatagcagccatatttataatagccagaagctggaaagaagtca
gatgtccctcaacagaggaatggctacagaaaatgtggtacatttacaca
atggagtaccactcagctattaaaaacccagggttagcctctataccaca
gtgttaaaaactgccatgtcatagtagttatttgttaactgtttaaacat
ctttccatgagagctaaaacaagccatttttaaagttccaagagaaatga
ttttttttttttaaatctgggctgtcaaaaacaagtccttaagataaaga
aaaggccacagagatcatgtgaaattaaaccaggcctatactatattctg
gcaccgtactttggacatgatgacattagcaaatgtaaaactccagctac
aatgtattatcctcctaaaaggacacataaacaatggtatgggcttgact
caaactcaatcactccataaaccaataagcccatgcaggcttcttgtaca
gcaatagggaaaaatattgtggtcttttctctattttagaaatagaagtt
aatttgttgcgatgctagtttctttcacattcttgctaggaatgcaaaga
tccaaagccgccatttttattctccagaactcacaggtgataggagagaa
acctcactgatggtaattgcacagcttaggaactgcctgatatcatgaag
ctacagcagaacacactggatcttgtgagaactttgtggtagataaggcg
gtcacgagtaatacctggggctagtcatcactggatgcctcagcagtctg
gaaggtaacaagtcatgaaggagaatgaatgcaggttggagagaagatac
aaggctaatatagaaac
gaattcattagttctgatgatatgtgtttaccataaaagccacatttaag
actaattccactctagttttcacaaaaattagtctggggattatgagaag
gaagattaatctaggtgttaaatacaccattaagatagagtgggctgagt
gaaccatctgtgttgtagagtacagataaacccatagcttccttcactag
agatctcagtgtgcataaggtgaagatttcaaaaaaaaggaatgaagaag
aaccttccaaaatgcagacctgggcttgagaccttcttggtctgtaacac
tacttggttgttctgtgagaatgggaccctcctccagtaactacaaggga
aatgcaagttaagacccacaatgagataggacagcgatagtaacaaaaca
caagagacaataaatatcaagaatgtgcagactgtgtgggattcttgaaa
acctaagcactatgcagtgctatgcaaaacattgctaagatacaggatca
actaacatgtcaccagtggagaaatggataaagaaaatgtggtagactgt
gcataaaacaatacaattctgcctttaaaaaaataaaacatcagtcagct
acagcaaggccgatgaacctgggccacttgccacagtccagagctaagct
gaggacaagcactgaaggtgagctccttacactggtagtgagcagaatgg
gcaccagagccatgagagagctggtgggactgaaacgacttttgatcaag
gacaaaacgtttcatctggacaacaggaaataatttaagttcctattgta
taaaataggtgactgtgggtagctaatcacttagtctattcttgaaatgc
tgagatttcatttgaaggtctcattacaaaacaaaaacaaacaaacacct
ctaagtatgtgaggccaacattaattggtactatttatccagtctgcatg
tgtac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_50728913_50730142
seq2: B6Ng01-119H04.b_47_1263 (reverse)

seq1  GTTTCTATATT-GCC-TGTGCTCTCTCTCCTATCCCTGCCATCCTATTCT  48
      ||||||||||| ||| |||    ||||||| |  |||||  ||  |||||
seq2  GTTTCTATATTAGCCTTGTATCTTCTCTCCAA--CCTGCATTC--ATTCT  46

seq1  CCTTCATGACCTTGTTAACCTTCTCAGAACTGCTGAGGCATCCAGTGATG  98
      ||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCATGA-CTTGTT-ACCTTC-CAG-ACTGCTGAGGCATCCAGTGATG  92

seq1  ACTTAGGCCCCAGGGTATTACTCGTGA-CGCCTTATCCTACCACAAAAGT  147
      |||   |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |
seq2  ACT--AGCCCCA-GGTATTACTCGTGACCGCCTTAT-CTACCACAAAGTT  138

seq1  CTCAC-AGATTCCCAGTGTGTTCTGCCTGTAGCTTCATGATATCAGGCAG  196
      ||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAAGAT--CCAGTGTGTTCTG-CTGTAGCTTCATGATATCAGGCAG  185

seq1  TTCCTAAGCTGTGCAATTACCCATCAGTGAGGTTTCTCTCCTATCACCCT  246
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TTCCTAAGCTGTGCAATTA-CCATCAGTGAGGTTTCTCTCCTATCA-CCT  233

seq1  GTGAGTTCTGGAGAATAAAAATGGCGGCTTTGGATCTTTGCATTCCTAGC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGTTCTGGAGAATAAAAATGGCGGCTTTGGATCTTTGCATTCCTAGC  283

seq1  AAGAATGTGAAAGAAACTAGCATCGCAACAAATTAACTTCTATTTCTAAA  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATGTGAAAGAAACTAGCATCGCAACAAATTAACTTCTATTTCTAAA  333

seq1  ATAGAGAAAAGACCACAATATTTTTCCCTATTGCTGTACAAGAAGCCTGC  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGAAAAGACCACAATATTTTTCCCTATTGCTGTACAAGAAGCCTGC  383

seq1  ATGGGCTTATTGGTTTATGGAGTGATTGAGTTTGAGTCAAGCCCATACCA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGCTTATTGGTTTATGGAGTGATTGAGTTTGAGTCAAGCCCATACCA  433

seq1  TTGTTTATGTGTCCTTTTAGGAGGATAATACATTGTAGCTGGAGTTTTAC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTATGTGTCCTTTTAGGAGGATAATACATTGTAGCTGGAGTTTTAC  483

seq1  ATTTGCTAATGTCATCATGTCCAAAGTACGGTGCCAGAATATAGTATAGG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGCTAATGTCATCATGTCCAAAGTACGGTGCCAGAATATAGTATAGG  533

seq1  CCTGGTTTAATTTCACATGATCTCTGTGGCCTTTTCTTTATCTTAAGGAC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTTTAATTTCACATGATCTCTGTGGCCTTTTCTTTATCTTAAGGAC  583

seq1  TTGTTTTTGACAGCCCAGATTTAAAAAAAAAAAATCATTTCTCTTGGAAC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTTTGACAGCCCAGATTTAAAAAAAAAAAATCATTTCTCTTGGAAC  633

seq1  TTTAAAAATGGCTTGTTTTAGCTCTCATGGAAAGATGTTTAAACAGTTAA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAAATGGCTTGTTTTAGCTCTCATGGAAAGATGTTTAAACAGTTAA  683

seq1  CAAATAACTACTATGACATGGCAGTTTTTAACACTGTGGTATAGAGGCTA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAACTACTATGACATGGCAGTTTTTAACACTGTGGTATAGAGGCTA  733

seq1  ACCCTGGGTTTTTAATAGCTGAGTGGTACTCCATTGTGTAAATGTACCAC  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGGGTTTTTAATAGCTGAGTGGTACTCCATTGTGTAAATGTACCAC  783

seq1  ATTTTCTGTAGCCATTCCTCTGTTGAGGGACATCTGACTTCTTTCCAGCT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCTGTAGCCATTCCTCTGTTGAGGGACATCTGACTTCTTTCCAGCT  833

seq1  TCTGGCTATTATAAATATGGCTGCTATGAACACAGTAGAGCAGGTGTCCT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGCTATTATAAATATGGCTGCTATGAACACAGTAGAGCAGGTGTCCT  883

seq1  TATTACAAGTTGGAGCCTCTCCTGGGTAAATGCTCAGGAGAGGTATTGCA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTACAAGTTGGAGCCTCTCCTGGGTAAATGCTCAGGAGAGGTATTGCA  933

seq1  GGATCTTCTGGTAGAACTATGTCCAATTTTCTGAGGAACTGTAAGACTGA  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCTTCTGGTAGAACTATGTCCAATTTTCTGAGGAACTGTAAGACTGA  983

seq1  TTTCCAGAGTGGTTGTACCAACTTGCAGTCCTACCAGCCATGGAGGAGTG  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCAGAGTGGTTGTACCAACTTGCAGTCCTACCAGCCATGGAGGAGTG  1033

seq1  TTCCTCTTTCTCCACATCCTCGCCAGCATCTGCTGTCACCTGAGTTTTTG  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCTTTCTCCACATCCTCGCCAGCATCTGCTGTCACCTGAGTTTTTG  1083

seq1  ATCTTAGCCATTCTGACTGGTGTGAGGTGGAATCTCAGGGTTGTTTTGAT  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTAGCCATTCTGACTGGTGTGAGGTGGAATCTCAGGGTTGTTTTGAT  1133

seq1  TTGCATTTCCCTGATGATTAAGGATGTTGAACATTTTTTTAGGTGCTTCT  1196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCATTTCCCTGATGATTAAGGATGTTGAACATTTTTTTAGGTGCTTCT  1183

seq1  CAGCCATATGGTGGTATTCCTCAGTTGAGAATTC  1230
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCATATGGTGGTATTCCTCAGTTGAGAATTC  1217

seq1: chr2_50618657_50619616
seq2: B6Ng01-119H04.g_67_1021

seq1  GAATTCATTAGTTCTGATGATATGTGTTTACCATAAAAGCCACATTTAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTAGTTCTGATGATATGTGTTTACCATAAAAGCCACATTTAAG  50

seq1  ACTAATTCCACTCTAGTTTTCACAAAAATTAGTCTGGGGATTATGAGAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAATTCCACTCTAGTTTTCACAAAAATTAGTCTGGGGATTATGAGAAG  100

seq1  GAAGATTAATCTAGGTGTTAAATACACCATTAAGATAGAGTGGGCTGAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATTAATCTAGGTGTTAAATACACCATTAAGATAGAGTGGGCTGAGT  150

seq1  GAACCATCTGTGTTGTAGAGTACAGATAAACCCATAGCTTCCTTCACTAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCATCTGTGTTGTAGAGTACAGATAAACCCATAGCTTCCTTCACTAG  200

seq1  AGATCTCAGTGTGCATAAGGTGAAGATTTCAAAAAAAAGGAATGAAGAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCTCAGTGTGCATAAGGTGAAGATTTCAAAAAAAAGGAATGAAGAAG  250

seq1  AACCTTCCAAAATGCAGACCTGGGCTTGAGACCTTCTTGGTCTGTAACAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTTCCAAAATGCAGACCTGGGCTTGAGACCTTCTTGGTCTGTAACAC  300

seq1  TACTTGGTTGTTCTGTGAGAATGGGACCCTCCTCCAGTAACTACAAGGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTGGTTGTTCTGTGAGAATGGGACCCTCCTCCAGTAACTACAAGGGA  350

seq1  AATGCAAGTTAAGACCCACAATGAGATAGGACAGCGATAGTAACAAAACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCAAGTTAAGACCCACAATGAGATAGGACAGCGATAGTAACAAAACA  400

seq1  CAAGAGACAATAAATATCAAGAATGTGCAGACTGTGTGGGATTCTTGAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAGACAATAAATATCAAGAATGTGCAGACTGTGTGGGATTCTTGAAA  450

seq1  ACCTAAGCACTATGCAGTGCTATGCAAAACATTGCTAAGATACAGGATCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTAAGCACTATGCAGTGCTATGCAAAACATTGCTAAGATACAGGATCA  500

seq1  ACTAACATGTCACCAGTGGAGAAATGGATAAAGAAAATGTGGTAGACTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAACATGTCACCAGTGGAGAAATGGATAAAGAAAATGTGGTAGACTGT  550

seq1  GCATAAAACAATACAATTCTGCCTTTAAAAAAATAAAACATCAGTCAGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAAAACAATACAATTCTGCCTTTAAAAAAATAAAACATCAGTCAGCT  600

seq1  ACAGCAAGGCCGATGAACCTGGGCCACTTGCCACAGTCCAGAGCTAAGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCAAGGCCGATGAACCTGGGCCACTTGCCACAGTCCAGAGCTAAGCT  650

seq1  GAGGACAAGCACTGAAGGTGAGCTCCTTACACTGGTAGTGAGCAGAATGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGACAAGCACTGAAGGTGAGCTCCTTACACTGGTAGTGAGCAGAATGG  700

seq1  GCACCAGAGCCATGAGAGAGCTGGTGGGACTGAAACGACTTTTGATCAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCAGAGCCATGAGAGAGCTGGTGGGACTGAAACGACTTTTGATCAAG  750

seq1  GACAAAACGTTTCATCTGGACAACAGGAAATAATTTAAGTTCCTATTGTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAAACGTTTCATCTGGACAACAGGAAATAATTTAAGTTCCTATTGTA  800

seq1  TAAAATAGGTGACTGTGGGTAGCTAATCACTTAGTCTATTCTTGAAATGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATAGGTGACTGTGGGTAGCTAATCACTTAGTCTATTCTTGAAATGC  850

seq1  TGAGATTTCATTTGAAGGTTCTCATTACAAAACAAAAACAAAACAAAACA  900
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||
seq2  TGAGATTTCATTTGAAGG-TCTCATTACAAAACAAAAACAAA--CAAACA  897

seq1  CCTCTAAGTATGTGAGGCCAAACATTAATTGGTACTATTTATCCAGTCTG  950
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTAAGTATGTGAGGCC-AACATTAATTGGTACTATTTATCCAGTCTG  946

seq1  CATTGTGTAC  960
      || |||||||
seq2  CA-TGTGTAC  955