BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-119P21
Chromosome2 (Build37)
Map Location 125,688,697 - 125,840,624
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGalk2
Upstream geneSlc24a5, Myef2, LOC100043375, Slc12a1, Dut, A530010F05Rik, LOC100043698, Fbn1, Cep152, Shc4, Eid1, 3110001I20Rik, Cops2
Downstream geneFgf7, Dtwd1, Atp8b4, Slc27a2, Hdc, Gabpb1, Usp8, LOC100043714, Usp50, Trpm7, 2010106G01Rik, Ap4e1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-119P21.bB6Ng01-119P21.g
ACCDH924058DH924059
length1,1951,071
definitionDH924058|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119P21, 5' end.DH924059|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119P21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(125,839,420 - 125,840,624)(125,688,697 - 125,689,765)
sequence
gaattcaatgcattatttcctgacacattttaaaaatcttctgacactag
cccaaccactcgcattaatgttctttgctcttctttttcttcacatcctt
aaagacattaccaaaggaacccttggctacatccagggtggtcttacact
cctggtcaaatgcctgatcaccctgcctcgctcctatataaactcctctg
acttaattgtttccatgtctgaacccttgaaagtctaaccaaatcgttaa
gtgaaatttctctaattaccgcatcctacaaatatccatcccctttctca
tcttaaaaattcatttctgatgcaaccaacttattcttttatgtcttgtt
aattttgaagtaaaggctgaatttctcacaagtataacctgtatgagtgt
caatagtagctgaccactaaaatttatatactttttcctgagtgcagtcc
caaaaagagatgaacatgtttatgtctttttgaaatgtcaggatttattg
aataaataaatatatttgtatgtggtttatgttaggtctcaaaacctggg
attgaggtacctattaacataaaggttttcccagcatccctgagtcccta
cctgtttcagggtcctcctgacagacataccccgccccataccctaaaca
tttcaaccctgtgggctgacctgggctctccttcccagctgcattcctgt
atataacacagccattttggctatgccagccctttttccttttggtctgc
tgactttcttctggcttcttgactcttggctctctcctcttcccaacccc
tatactcacatagtctggctcattcatgtctactctagacccttccagat
gcttctggctatattctccctcctatctacaataaacctcctccttcacc
atacctaggagcagttacgtcctctttttattctttttattgtctagttt
acagtcaaataactatagtgaacagacgtcttctattccattgagctagt
acatgccagctttgtcacctgctcgtgatgcctttaaatcagtgatgtga
tacctctagtagtagtttctggcctagatctttggtacaacatagtgttt
ttgtggcttcaaacatttctgttgaagatggcaatagatccgatgaggat
gcattggatctataggcggtttgctcggtatagaaaccatttttt
gaattctttccaaaatcccttgatgatctgtattttcctcctcttagatt
tttttaggacactattggtctattatttgacattgtagttgactttacaa
tttaagcatccttctatgtaaattaaaataaacacaatgcattctcactt
atctggcctttattcatgttgttccttgcttcagttggttgtttgaattt
attgctgtgcatttatataaataaaactgttatgaacatttatgtacaag
ctgtgtgaacatgtttaatttttgagtaatgtggtagactgattccaaga
tggcctgtcacccatgtcatttgataactgtttatcctttaagtgtgggt
aggctgtgactcactcctaagcaagatgatggagaggagttgatttatgt
aattgcatatacattattgaccagatcaagtctatcttagtctcagacat
tgtgtcctttgctgtcctcaagaagcaaaagtgctgatgtttgtgtgata
gttatgcctcatccgcagcttgtttgtttatttgtttttcaagacagggt
ttctctgtgtagctctgctgtcctggaccttgttctggagatcaggctgc
ctctgtctcctgagtgctggaattgaaagcctgctccaccactgcccaac
tggttaggcttcattgtcaattggacagaatctggaatcacctaggaggc
aagcatctgggtgtgcctgtgagtggctatttaaattagctaccatgtgc
tctgcagtgtgtccttccacagatgagcctctttaaaatagaaaagccat
ctaaggcataccctcatttttaagtgatagaaattgtgagataataagtg
tgaattgttacatattacttatctatgataatgatgttatgaagcagtga
atacaacatatctacagtgatggttgggttataccagagtatatattcag
cttgtaagacactctcaaactgttttaccatttagcctattctattctgc
agtgtgcaagagttcttagttgcctctttatcttggagctaccctatttc
aggtctttagctaccctatca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_125839420_125840624
seq2: B6Ng01-119P21.b_49_1243 (reverse)

seq1  AAAAAATGG-TTCT-TACCGA--AAACAGCCTATAGATTCAATGCAATCC  46
      ||||||||| |||| ||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||
seq2  AAAAAATGGTTTCTATACCGAGCAAACCGCCTATAGATCCAATGC-ATCC  49

seq1  TCATCGAAATTCTAATGCCATTCTTC-ACAGAAATTGTTTGGAAGCAC-A  94
      |||||| |  |||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |  ||| |
seq2  TCATCGGA--TCTATTGCCA-TCTTCAACAGAAA-TGTTTGAAGCCACAA  95

seq1  AAACACTATGTGTAACCAAAGAATCCTAAGCCAGAAACTACTACTAGAGG  144
      |||||||||||   ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||
seq2  AAACACTATGTTGTACCAAAGA--TCTAGGCCAGAAACTACTACTAGAGG  143

seq1  TATCACCATCACTGATTTAAAGGCATCACGGAGCCAGGTTGACAAAGCTG  194
      ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||
seq2  TATCA-CATCACTGATTTAAAGGCATCAC-GAG-CAGG-TGACAAAGCTG  189

seq1  GCATGTTACTAGCCTCAAATGGAATAGAAGACGTCTGTTCACCTATAGTT  244
      ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GCATG-TACTAG-CTC-AATGGAATAGAAGACGTCTGTTCA-CTATAGTT  235

seq1  ATTTGACTGTAAACTAGACAATAAAAAGAAATAAAAAGAGGACGTAACTG  294
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGACTGTAAACTAGACAATAAAAAG-AATAAAAAGAGGACGTAACTG  284

seq1  CTCCTAGGTATGGTGAAGGAGGAGGTTTATTGTAGATAGGAGGGAGAATA  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTAGGTATGGTGAAGGAGGAGGTTTATTGTAGATAGGAGGGAGAATA  334

seq1  TAGCCAGAAGCATCTGGAAGGGTCTAGAGTAGACATGAATGAGCCAGACT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCAGAAGCATCTGGAAGGGTCTAGAGTAGACATGAATGAGCCAGACT  384

seq1  ATGTGAGTATAGGGGTTGGGAAGAGGAGAGAGCCAAGAGTCAAGAAGCCA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGAGTATAGGGGTTGGGAAGAGGAGAGAGCCAAGAGTCAAGAAGCCA  434

seq1  GAAGAAAGTCAGCAGACCAAAAGGAAAAAGGGCTGGCATAGCCAAAATGG  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAAAGTCAGCAGACCAAAAGGAAAAAGGGCTGGCATAGCCAAAATGG  484

seq1  CTGTGTTATATACAGGAATGCAGCTGGGAAGGAGAGCCCAGGTCAGCCCA  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTTATATACAGGAATGCAGCTGGGAAGGAGAGCCCAGGTCAGCCCA  534

seq1  CAGGGTTGAAATGTTTAGGGTATGGGGCGGGGTATGTCTGTCAGGAGGAC  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGTTGAAATGTTTAGGGTATGGGGCGGGGTATGTCTGTCAGGAGGAC  584

seq1  CCTGAAACAGGTAGGGACTCAGGGATGCTGGGAAAACCTTTATGTTAATA  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAAACAGGTAGGGACTCAGGGATGCTGGGAAAACCTTTATGTTAATA  634

seq1  GGTACCTCAATCCCAGGTTTTGAGACCTAACATAAACCACATACAAATAT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACCTCAATCCCAGGTTTTGAGACCTAACATAAACCACATACAAATAT  684

seq1  ATTTATTTATTCAATAAATCCTGACATTTCAAAAAGACATAAACATGTTC  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATTTATTCAATAAATCCTGACATTTCAAAAAGACATAAACATGTTC  734

seq1  ATCTCTTTTTGGGACTGCACTCAGGAAAAAGTATATAAATTTTAGTGGTC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCTTTTTGGGACTGCACTCAGGAAAAAGTATATAAATTTTAGTGGTC  784

seq1  AGCTACTATTGACACTCATACAGGTTATACTTGTGAGAAATTCAGCCTTT  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTACTATTGACACTCATACAGGTTATACTTGTGAGAAATTCAGCCTTT  834

seq1  ACTTCAAAATTAACAAGACATAAAAGAATAAGTTGGTTGCATCAGAAATG  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCAAAATTAACAAGACATAAAAGAATAAGTTGGTTGCATCAGAAATG  884

seq1  AATTTTTAAGATGAGAAAGGGGATGGATATTTGTAGGATGCGGTAATTAG  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTTAAGATGAGAAAGGGGATGGATATTTGTAGGATGCGGTAATTAG  934

seq1  AGAAATTTCACTTAACGATTTGGTTAGACTTTCAAGGGTTCAGACATGGA  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATTTCACTTAACGATTTGGTTAGACTTTCAAGGGTTCAGACATGGA  984

seq1  AACAATTAAGTCAGAGGAGTTTATATAGGAGCGAGGCAGGGTGATCAGGC  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATTAAGTCAGAGGAGTTTATATAGGAGCGAGGCAGGGTGATCAGGC  1034

seq1  ATTTGACCAGGAGTGTAAGACCACCCTGGATGTAGCCAAGGGTTCCTTTG  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGACCAGGAGTGTAAGACCACCCTGGATGTAGCCAAGGGTTCCTTTG  1084

seq1  GTAATGTCTTTAAGGATGTGAAGAAAAAGAAGAGCAAAGAACATTAATGC  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATGTCTTTAAGGATGTGAAGAAAAAGAAGAGCAAAGAACATTAATGC  1134

seq1  GAGTGGTTGGGCTAGTGTCAGAAGATTTTTAAAATGTGTCAGGAAATAAT  1194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGTTGGGCTAGTGTCAGAAGATTTTTAAAATGTGTCAGGAAATAAT  1184

seq1  GCATTGAATTC  1205
      |||||||||||
seq2  GCATTGAATTC  1195

seq1: chr2_125688697_125689765
seq2: B6Ng01-119P21.g_69_1139

seq1  GAATTCTTTCCAAAATCCCTTGATGATCTGTATTTTCCTCCTCTTAGATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCCAAAATCCCTTGATGATCTGTATTTTCCTCCTCTTAGATT  50

seq1  TTTTTAGGACACTATTGGTCTATTATTTGACATTGTAGTTGACTTTACAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAGGACACTATTGGTCTATTATTTGACATTGTAGTTGACTTTACAA  100

seq1  TTTAAGCATCCTTCTATGTAAATTAAAATAAACACAATGCATTCTCACTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGCATCCTTCTATGTAAATTAAAATAAACACAATGCATTCTCACTT  150

seq1  ATCTGGCCTTTATTCATGTTGTTCCTTGCTTCAGTTGGTTGTTTGAATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGGCCTTTATTCATGTTGTTCCTTGCTTCAGTTGGTTGTTTGAATTT  200

seq1  ATTGCTGTGCATTTATATAAATAAAACTGTTATGAACATTTATGTACAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCTGTGCATTTATATAAATAAAACTGTTATGAACATTTATGTACAAG  250

seq1  CTGTGTGAACATGTTTAATTTTTGAGTAATGTGGTAGACTGATTCCAAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTGAACATGTTTAATTTTTGAGTAATGTGGTAGACTGATTCCAAGA  300

seq1  TGGCCTGTCACCCATGTCATTTGATAACTGTTTATCCTTTAAGTGTGGGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTGTCACCCATGTCATTTGATAACTGTTTATCCTTTAAGTGTGGGT  350

seq1  AGGCTGTGACTCACTCCTAAGCAAGATGATGGAGAGGAGTTGATTTATGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGTGACTCACTCCTAAGCAAGATGATGGAGAGGAGTTGATTTATGT  400

seq1  AATTGCATATACATTATTGACCAGATCAAGTCTATCTTAGTCTCAGACAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGCATATACATTATTGACCAGATCAAGTCTATCTTAGTCTCAGACAT  450

seq1  TGTGTCCTTTGCTGTCCTCAAGAAGCAAAAGTGCTGATGTTTGTGTGATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCCTTTGCTGTCCTCAAGAAGCAAAAGTGCTGATGTTTGTGTGATA  500

seq1  GTTATGCCTCATCCGCAGCTTGTTTGTTTATTTGTTTTTCAAGACAGGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATGCCTCATCCGCAGCTTGTTTGTTTATTTGTTTTTCAAGACAGGGT  550

seq1  TTCTCTGTGTAGCTCTGCTGTCCTGGACCTTGTTCTGGAGATCAGGCTGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTGTGTAGCTCTGCTGTCCTGGACCTTGTTCTGGAGATCAGGCTGC  600

seq1  CTCTGTCTCCTGAGTGCTGGAATTGAAAGCCTGCTCCACCACTGCCCAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTCTCCTGAGTGCTGGAATTGAAAGCCTGCTCCACCACTGCCCAAC  650

seq1  TGGTTAGGCTTCATTGTCAATTGGACAGAATCTGGAATCACCTAGGAGGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTAGGCTTCATTGTCAATTGGACAGAATCTGGAATCACCTAGGAGGC  700

seq1  AAGCATCTGGGTGTGCCTGTGAGTGGCTATTTAAATTAGCTACCATGTGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCATCTGGGTGTGCCTGTGAGTGGCTATTTAAATTAGCTACCATGTGC  750

seq1  TCTGCAGTGTGTCCTTCCACAGATGAGCCTCTTTAAAATAGAAAAGCCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAGTGTGTCCTTCCACAGATGAGCCTCTTTAAAATAGAAAAGCCAT  800

seq1  CTAAGGCATACCCTCATTTTTAAGTGATAGAAATTGTGAGATAATAAGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGGCATACCCTCATTTTTAAGTGATAGAAATTGTGAGATAATAAGTG  850

seq1  TGAATTGTTACATATTACTTATCTATGATAATGATGTTATGAAGCAGTGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTGTTACATATTACTTATCTATGATAATGATGTTATGAAGCAGTGA  900

seq1  ATACAAACATATCTACAAGTGATGGTTGGGTTATACCAGAGGTATATATT  950
      |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  ATAC-AACATATCTAC-AGTGATGGTTGGGTTATACCAGA-GTATATATT  947

seq1  CAGCTTTGTAAGACACTCTCAAACTGTTTTACCATTTAGCCTA-TCTA-T  998
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
seq2  CAGC-TTGTAAGACACTCTCAAACTGTTTTACCATTTAGCCTATTCTATT  996

seq1  CTGCAGTGTGCAAGAG-TCTTAGTTGCCTCTTTATCTT-GAGCTACCCTA  1046
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CTGCAGTGTGCAAGAGTTCTTAGTTGCCTCTTTATCTTGGAGCTACCCTA  1046

seq1  TTTCA-GTC-TTAGCTACTCTATCA  1069
      ||||| ||| |||||||| ||||||
seq2  TTTCAGGTCTTTAGCTACCCTATCA  1071