BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-121I19
Chromosome2 (Build37)
Map Location 124,204,267 - 124,366,138
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene4930517E11Rik, LOC100043360
Downstream geneSema6d, LOC100043367, LOC100043369, Slc24a5, Myef2, LOC100043375, Slc12a1, Dut, A530010F05Rik, LOC100043698, Fbn1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-121I19.bB6Ng01-121I19.g
ACCDH925204DH925205
length3951,123
definitionDH925204|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-121I19, 5' end.DH925205|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-121I19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(124,204,267 - 124,204,668)(124,364,996 - 124,366,138)
sequence
tgggttctcttgagagggtataaatttgaaagcacccagaggggctgtgt
tggctgccgctcctcttgttgcttccccctctgatgctggtccttgctgc
tgtgtttgctattgctggatttctgtttgaaaatatcctaatgacaaaag
atgcccccaaggaacttaacaccctaatcagcagtaagtagtctaaaaga
ggtctataccacactttccctctaaccttgtttccctcctaccaagtgtt
gtgggggttgtggggagcactgggatggaataaggggtagaagggtggta
gataatagaacactccacgaaagtacaccaacaaacaatagatatgatct
tcacatagttcattacatgaaaagtacaaaaatggggaggggagg
gaattctcaatttcacatcccatgttgcacaggaaaagctacagcataat
ggagctttaaattgtgagcttcaagaatacatgaataatttgcagtttga
gtttaacttatgcccttcccataagtgtcccaaatattaataatgaacat
ataagttgccttctttaaaggagttgaatataaatgcaatatttaaaaga
caggcatgctcacactaaaacaggatattgatctgtggaatcgattttct
cggacttttttcagtcttatttaagacgtttgttaagtatttatggcaac
aacatgcattcacattttactttctctcaggttaatgactctgttcaaaa
agaataagggaaatgcaaagaggtgagaattcttaactctgcctctcaca
tcagaataacccgactggttacaatagaaggtagaacacccagactctca
ctttggctaacaaatcagaaactttgtggccaaggtcaaggcttctgtca
cagtctttatctaagctcatgttattgattgtgcagcaaggttcaactcc
actgggctgcatgttgaggaagccagtcatgacacagcactcagtttata
taagaaatcaagacaactatggtttctttagcatgataaagatgatcatg
catgtgcaaaactggttggtgagtcatgtaaataattttgtaaggtccgg
tattaagctgaaataggaaaaagaaccttgaattttggggtggaacctca
tcgctatgttcgcttccttccttcatcataaacctatagataccagaaga
cttgtaattatatccacatgctcgatgagagtccatgttaccctaaatcc
tgaagggcaaaagtggcttctattttgcctttattaaaaaaaatattatt
tattttatttcttgaatatatagattattttctccttccctccttccctc
tactgttccacatcacccttctgctctaaaatcatagcactttttcatag
ggctgttatatgaaatatggtctatgcatgtatgcatgttatacatgtgg
ctccacccgaaatgataagtcctcatccttcacttaggcagcttctcttg
caacgtggaaccattatgagaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_124204267_124204668
seq2: B6Ng01-121I19.b_49_449

seq1  GAATTCTGGGTTCTCTTGAGAGGGTATAAATTTGAAAGCACCCAGAGGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGGTTCTCTTGAGAGGGTATAAATTTGAAAGCACCCAGAGGGG  50

seq1  CTGTGTTGGCTGCCGCTCCTCTTGTTGCTTCCCCCTCTGATGCTGGTCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTTGGCTGCCGCTCCTCTTGTTGCTTCCCCCTCTGATGCTGGTCCT  100

seq1  TGCTGCTGTGTTTGCTATTGCTGGATTTCTGTTTGAAAATATCCTAATGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCTGTGTTTGCTATTGCTGGATTTCTGTTTGAAAATATCCTAATGA  150

seq1  CAAAAGATGCCCCCAAGGAACTTAACACCCTAATCAGCAGTAAGTAGTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAGATGCCCCCAAGGAACTTAACACCCTAATCAGCAGTAAGTAGTCT  200

seq1  AAAAGAGGTCTATACCACACTTTCCCTCTAACCTTGTTTCCCTCCTACCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAGGTCTATACCACACTTTCCCTCTAACCTTGTTTCCCTCCTACCA  250

seq1  AGTGTTGTGGGGGTTGTGGGGAGCACTGGGATGGAATAAGGGGTAGAAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTGTGGGGGTTGTGGGGAGCACTGGGATGGAATAAGGGGTAGAAGG  300

seq1  GTGGTAGATAATAGAACACAACACAAAAAGTACACCAACAAACAATAGAT  350
      |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTAGATAATAGAACACTCCAC-GAAAGTACACCAACAAACAATAGAT  349

seq1  ATGATCTTCACATAGTTCATTAGATGAAAAGTACAAAAAGGGGGAGGGGA  400
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||
seq2  ATGATCTTCACATAGTTCATTACATGAAAAGTACAAAAATGGGGAGGGGA  399

seq1  GG  402
      ||
seq2  GG  401

seq1: chr2_124364996_124366138
seq2: B6Ng01-121I19.g_66_1188 (reverse)

seq1  TTTCT-ATAATGGTCTCCAACGGTTGCAAAGAGAAGCTGCCCTAGTGAAG  49
      ||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||||||  |||||||
seq2  TTTCTCATAATGGT-TCCA--CGTTGC-AAGAGAAGCTGCCTAAGTGAAG  46

seq1  GATGAGGACTATACATATCTGTGGGTGTGAG-CACATGTATATACATGCA  98
      ||||||||||   ||| ||   ||||| ||| |||||||||| |||||||
seq2  GATGAGGACTTATCATTTC---GGGTG-GAGCCACATGTATA-ACATGCA  91

seq1  TACATGCATAGA-CATATATTCATATAACAGCACTTAATGAAAAAGTGGC  147
      |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| ||
seq2  TACATGCATAGACCATAT-TTCATATAACAGCCCT--ATGAAAAAGT-GC  137

seq1  TATGAATTTTAGAGCAAGAAGGGTGATGTGGAAACAGTTAGAGGGAAGGG  197
      |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||
seq2  TATG-ATTTTAGAGC-AGAAGGGTGATGTGG-AACAG-TAGAGGGAA-GG  182

seq1  AGGGAAGGAGAAAATAATCTAATATTATTTCAAGAAATAAAATAAATAAA  247
      |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||
seq2  AGGGAAGGAGAAAATAATCT-ATAT--ATTCAAGAAATAAAATAAAT-AA  228

seq1  TATTTTTTTTAATAAAGGCAAAATAGAAGCCACCTTTGCCCTTCAGGATT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TATTTTTTTTAATAAAGGCAAAATAGAAGCCACTTTTGCCCTTCAGGATT  278

seq1  TAGGGTAACATGGACTCTCATCGAGCATGTGGATATAATTACAAGTCTTC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGTAACATGGACTCTCATCGAGCATGTGGATATAATTACAAGTCTTC  328

seq1  TGGTATCTATAGGTTTATGATGAAGGAAGGAAGCGAACATAGCGATGAGG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTATCTATAGGTTTATGATGAAGGAAGGAAGCGAACATAGCGATGAGG  378

seq1  TTCCACCCCAAAATTCAAGGTTCTTTTTCCTATTTCAGCTTAATTACCGG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TTCCACCCCAAAATTCAAGGTTCTTTTTCCTATTTCAGCTTAA-TACCGG  427

seq1  ACCTTACAAAATTATTTACATGACTCACCAACCAGTTTTGCACATGCATG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTACAAAATTATTTACATGACTCACCAACCAGTTTTGCACATGCATG  477

seq1  ATCATCTTTATCATGCTAAAGAAACCATAGTTGTCTTGATTTCTTATATA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATCTTTATCATGCTAAAGAAACCATAGTTGTCTTGATTTCTTATATA  527

seq1  AACTGAGTGCTGTGTCATGACTGGCTTCCTCAACATGCAGCCCAGTGGAG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGAGTGCTGTGTCATGACTGGCTTCCTCAACATGCAGCCCAGTGGAG  577

seq1  TTGAACCTTGCTGCACAATCAATAACATGAGCTTAGATAAAGACTGTGAC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACCTTGCTGCACAATCAATAACATGAGCTTAGATAAAGACTGTGAC  627

seq1  AGAAGCCTTGACCTTGGCCACAAAGTTTCTGATTTGTTAGCCAAAGTGAG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCCTTGACCTTGGCCACAAAGTTTCTGATTTGTTAGCCAAAGTGAG  677

seq1  AGTCTGGGTGTTCTACCTTCTATTGTAACCAGTCGGGTTATTCTGATGTG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTGGGTGTTCTACCTTCTATTGTAACCAGTCGGGTTATTCTGATGTG  727

seq1  AGAGGCAGAGTTAAGAATTCTCACCTCTTTGCATTTCCCTTATTCTTTTT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCAGAGTTAAGAATTCTCACCTCTTTGCATTTCCCTTATTCTTTTT  777

seq1  GAACAGAGTCATTAACCTGAGAGAAAGTAAAATGTGAATGCATGTTGTTG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGAGTCATTAACCTGAGAGAAAGTAAAATGTGAATGCATGTTGTTG  827

seq1  CCATAAATACTTAACAAACGTCTTAAATAAGACTGAAAAAAGTCCGAGAA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAAATACTTAACAAACGTCTTAAATAAGACTGAAAAAAGTCCGAGAA  877

seq1  AATCGATTCCACAGATCAATATCCTGTTTTAGTGTGAGCATGCCTGTCTT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCGATTCCACAGATCAATATCCTGTTTTAGTGTGAGCATGCCTGTCTT  927

seq1  TTAAATATTGCATTTATATTCAACTCCTTTAAAGAAGGCAACTTATATGT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATATTGCATTTATATTCAACTCCTTTAAAGAAGGCAACTTATATGT  977

seq1  TCATTATTAATATTTGGGACACTTATGGGAAGGGCATAAGTTAAACTCAA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTATTAATATTTGGGACACTTATGGGAAGGGCATAAGTTAAACTCAA  1027

seq1  ACTGCAAATTATTCATGTATTCTTGAAGCTCACAATTTAAAGCTCCATTA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCAAATTATTCATGTATTCTTGAAGCTCACAATTTAAAGCTCCATTA  1077

seq1  TGCTGTAGCTTTTCCTGTGCAACATGGGATGTGAAATTGAGAATTC  1143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTAGCTTTTCCTGTGCAACATGGGATGTGAAATTGAGAATTC  1123