BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-122O13
Chromosome2 (Build37)
Map Location 22,094,114 - 22,195,863
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMyo3a
Upstream gene4933434I06Rik, Thnsl1, Gpr158, LOC637235
Downstream geneLOC100041703, Myo3a, Gad2, Apbb1ip, Pdss1, Abi1, 1200016E24Rik, Acbd5, Mastl, Yme1l1, 4931423N10Rik, LOC664835, Nxph2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-122O13.bB6Ng01-122O13.g
ACCDH926216DH926217
length9081,109
definitionDH926216|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-122O13, 5' end.DH926217|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-122O13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,094,114 - 22,095,021)(22,194,748 - 22,195,863)
sequence
gaattctttagtagtcacctaaaccaaacctcttggattggaggatcctc
tttttgagatgccaggatattgtgggagagagatgcattgttcaaggtca
tgggttagcctaagaaatggtcttcatttgttgttggtgttggctgtgag
tagatatggaggtctagccctcttattaagtgaggaggttggagagagtt
ctaagggtttattctagctcatggctgttttgggataacacagtagcctg
agtttgtacctcaacctttgttcaattgacattggccacattgagtttag
ctgttccttctgccccaacacttcttcgtctatttcctactcttatttat
cctgaaaacatatttcccaacccttctcattgtttttctcaagaagaact
cctctgggctagagatatggctcaatgattaaaagcagggactgctcttc
cagaggactccagttccattcccagcacctacagagtaactgacaatcat
atgcagctccatttacaagggatccagtgctctcttctgccctccttggg
cactttacatagacatatgtgtaaataaaacactcatacacataaaataa
aattaaaattaaaacaccaaaatgaattcctatgggaaaagagtggatag
agtgtctatggcacaattctttctcaggaatgtgttgaagctgatggcaa
attatgctgcccggtctctgcatgatccactgccaaatgtaagcacaatc
cagtatctttctctatgtcagtgtctctccagtacagagaataatgtaag
agggactactcagtaactattaattcatgagactaactgcaaataatata
caaattaacaggatctctcctctctctctctctctctctctctctctctc
tctctctc
gaattctactattcaagaatcctatatctgctaaattatcctccttaaat
aaggaagatattcaaatattcccaggtcatggagaactggaagtgcttga
tacactagagtcttcctggtaggaagctgaaggagttctgtttattgtaa
agaccatgaggatgacgaggagtagcatggtcaaaaaacgcacagcctga
aaggagggtgctctcaatctgttctttgtagttgctgttgttgttatttt
agagacagggtcttactgtcaagccttggctagcctgaaagtgagagaga
gagagagagagagagagagagagagagagagagagagagacctggcctta
catttttattttgacccagagttacttaaaatttaccaaaagagatacaa
aatcttcatttcattttgttttttaatgtctgcctcatttggtagtagat
gaccccaaacaatgccttttccatccccaaacagtttgtaattaactact
aacaaggatactcttacttcagaatcatcaaaattttaattcatatattt
ctgttcaagtttcaataatagtatcaaagttctccattacaacaatctca
aaatgcacccaagataatgttctctctttgtcttgctctgtctctatgat
ctgcagtctgaccaacaatgcctctatcattcctctaaacctagggattt
ttcaaatgttaggcctgttagttcatggactactccttagtttgaagtgg
taggcatcacctcatgatctgagctttgataggaatacaacaggctggtc
ctgccaggtcaactgattttcattattcttgtgaccagctatggtcactc
tgaccacttgattgacacttgtctgtggacttctccctcatgaagtttct
ctttttcctttgtgtctaacagacattttgtgataggtatttcaagtcta
cgagagagctctattttctataaacattgacccattagcatagtcatcta
ttggaaaaattaatatactatggtgacagataaatgatgacttggaattc
catattcttctcctctttattgggagataaggcattctctttcttattta
ccatgtgca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_22094114_22095021
seq2: B6Ng01-122O13.b_48_955

seq1  GAATTCTTTAGTAGTCACCTAAACCAAACCTCTTGGATTGGAGGATCCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTAGTAGTCACCTAAACCAAACCTCTTGGATTGGAGGATCCTC  50

seq1  TTTTTGAGATGCCAGGATATTGTGGGAGAGAGATGCATTGTTCAAGGTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGAGATGCCAGGATATTGTGGGAGAGAGATGCATTGTTCAAGGTCA  100

seq1  TGGGTTAGCCTAAGAAATGGTCTTCATTTGTTGTTGGTGTTGGCTGTGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTTAGCCTAAGAAATGGTCTTCATTTGTTGTTGGTGTTGGCTGTGAG  150

seq1  TAGATATGGAGGTCTAGCCCTCTTATTAAGTGAGGAGGTTGGAGAGAGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATATGGAGGTCTAGCCCTCTTATTAAGTGAGGAGGTTGGAGAGAGTT  200

seq1  CTAAGGGTTTATTCTAGCTCATGGCTGTTTTGGGATAACACAGTAGCCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGGGTTTATTCTAGCTCATGGCTGTTTTGGGATAACACAGTAGCCTG  250

seq1  AGTTTGTACCTCAACCTTTGTTCAATTGACATTGGCCACATTGAGTTTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGTACCTCAACCTTTGTTCAATTGACATTGGCCACATTGAGTTTAG  300

seq1  CTGTTCCTTCTGCCCCAACACTTCTTCGTCTATTTCCTACTCTTATTTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCCTTCTGCCCCAACACTTCTTCGTCTATTTCCTACTCTTATTTAT  350

seq1  CCTGAAAACATATTTCCCAACCCTTCTCATTGTTTTTCTCAAGAAGAACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAAAACATATTTCCCAACCCTTCTCATTGTTTTTCTCAAGAAGAACT  400

seq1  CCTCTGGGCTAGAGATATGGCTCAATGATTAAAAGCAGGGACTGCTCTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGGGCTAGAGATATGGCTCAATGATTAAAAGCAGGGACTGCTCTTC  450

seq1  CAGAGGACTCCAGTTCCATTCCCAGCACCTACAGAGTAACTGACAATCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGACTCCAGTTCCATTCCCAGCACCTACAGAGTAACTGACAATCAT  500

seq1  ATGCAGCTCCATTTACAAGGGATCCAGTGCTCTCTTCTGCCCTCCTTGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAGCTCCATTTACAAGGGATCCAGTGCTCTCTTCTGCCCTCCTTGGG  550

seq1  CACTTTACATAGACATATGTGTAAATAAAACACTCATACACATAAAATAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTACATAGACATATGTGTAAATAAAACACTCATACACATAAAATAA  600

seq1  AATTAAAATTAAAACACCAAAATGAATTCCTATGGGAAAAGAGTGGATAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAAATTAAAACACCAAAATGAATTCCTATGGGAAAAGAGTGGATAG  650

seq1  AGTGTCTATGGCACAATTCTTTCTCAGGAATGTGTTGAAGCTGATGGCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTCTATGGCACAATTCTTTCTCAGGAATGTGTTGAAGCTGATGGCAA  700

seq1  ATTATGCTGCCCGGTCTCTGCATGATCCACTGCCAAATGTAAGCACAATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGCTGCCCGGTCTCTGCATGATCCACTGCCAAATGTAAGCACAATC  750

seq1  CAGTATCTTTCTCTATGTCAGTGTCTCTCCAGTACAGAGAATAATGTAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTATCTTTCTCTATGTCAGTGTCTCTCCAGTACAGAGAATAATGTAAG  800

seq1  AGGGACTACTCAGTAACTATTAATTCATGAGACTAACTGCAAATAATATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGACTACTCAGTAACTATTAATTCATGAGACTAACTGCAAATAATATA  850

seq1  CAAATTAACAGGATCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTAACAGGATCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  900

seq1  TCTCTCTC  908
      ||||||||
seq2  TCTCTCTC  908

seq1: chr2_22194748_22195863
seq2: B6Ng01-122O13.g_68_1176 (reverse)

seq1  TGCACATGGGTAAATGAGGAAAGAGAATGCCTTTTATCTCAAATAAAGA-  49
      ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | || | |||||||| 
seq2  TGCACAT-GGTAAAT-AAGAAAGAGAATGCCTTATCTC-CCAATAAAGAG  47

seq1  GAGAAGGAATATGGAATTTCAAGTCATCATTTATCTGTCACCATAGTAAT  99
      ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  
seq2  GAGAA-GAATATGGAATTCCAAGTCATCATTTATCTGTCACCATAGTA--  94

seq1  AATTTATTTATCCAATAGATGACTATGCTAATGGGTCAAATGTTTAATAG  149
       ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
seq2  TATTAATTTTTCCAATAGATGACTATGCTAATGGGTC-AATGTTT-ATAG  142

seq1  -AAATAGAGCTCTCTCGTAGACTTGAAATACCTATCCACAAAATGTCTGT  198
       |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AAAATAGAGCTCTCTCGTAGACTTGAAATACCTAT-CACAAAATGTCTGT  191

seq1  TAGACACAAAGGAAAAAGAGAAACTTCATGAGGGAGAAGTCCACAGACAA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACACAAAGGAAAAAGAGAAACTTCATGAGGGAGAAGTCCACAGACAA  241

seq1  GTGTCAATCAAGTGGTCAGAGTGACCATAGCTGGTCACAAGAATAATGAA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCAATCAAGTGGTCAGAGTGACCATAGCTGGTCACAAGAATAATGAA  291

seq1  AATCAGTTGACCTGGCAGGACCAGCCTGTTGTATTCCTATCAAAGCTCAG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAGTTGACCTGGCAGGACCAGCCTGTTGTATTCCTATCAAAGCTCAG  341

seq1  ATCATGAGGTGATGCCTACCACTTCAAACTAAGGAGTAGTCCATGAACTA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATGAGGTGATGCCTACCACTTCAAACTAAGGAGTAGTCCATGAACTA  391

seq1  ACAGGCCTAACATTTGAAAAATCCCTAGGTTTAGAGGAATGATAGAGGCA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGCCTAACATTTGAAAAATCCCTAGGTTTAGAGGAATGATAGAGGCA  441

seq1  TTGTTGGTCAGACTGCAGATCATAGAGACAGAGCAAGACAAAGAGAGAAC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGGTCAGACTGCAGATCATAGAGACAGAGCAAGACAAAGAGAGAAC  491

seq1  ATTATCTTGGGTGCATTTTGAGATTGTTGTAATGGAGAACTTTGATACTA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATCTTGGGTGCATTTTGAGATTGTTGTAATGGAGAACTTTGATACTA  541

seq1  TTATTGAAACTTGAACAGAAATATATGAATTAAAATTTTGATGATTCTGA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTGAAACTTGAACAGAAATATATGAATTAAAATTTTGATGATTCTGA  591

seq1  AGTAAGAGTATCCTTGTTAGTAGTTAATTACAAACTGTTTGGGGATGGAA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAGAGTATCCTTGTTAGTAGTTAATTACAAACTGTTTGGGGATGGAA  641

seq1  AAGGCATTGTTTGGGGTCATCTACTACCAAATGAGGCAGACATTAAAAAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCATTGTTTGGGGTCATCTACTACCAAATGAGGCAGACATTAAAAAA  691

seq1  CAAAATGAAATGAAGATTTTGTATCTCTTTTGGTAAATTTTAAGTAACTC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATGAAATGAAGATTTTGTATCTCTTTTGGTAAATTTTAAGTAACTC  741

seq1  TGGGTCAAAATAAAAATGTAAGGCCAGGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTCAAAATAAAAATGTAAGGCCAGGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  791

seq1  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTTTCAGGCTAGCCAAGGCTTGA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTTTCAGGCTAGCCAAGGCTTGA  841

seq1  CAGTAAGACCCTGTCTCTAAAATAACAACAACAGCAACTACAAAGAACAG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAAGACCCTGTCTCTAAAATAACAACAACAGCAACTACAAAGAACAG  891

seq1  ATTGAGAGCACCCTCCTTTCAGGCTGTGCGTTTTTTGACCATGCTACTCC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAGAGCACCCTCCTTTCAGGCTGTGCGTTTTTTGACCATGCTACTCC  941

seq1  TCGTCATCCTCATGGTCTTTACAATAAACAGAACTCCTTCAGCTTCCTAC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTCATCCTCATGGTCTTTACAATAAACAGAACTCCTTCAGCTTCCTAC  991

seq1  CAGGAAGACTCTAGTGTATCAAGCACTTCCAGTTCTCCATGACCTGGGAA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAAGACTCTAGTGTATCAAGCACTTCCAGTTCTCCATGACCTGGGAA  1041

seq1  TATTTGAATATCTTCCTTATTTAAGGAGGATAATTTAGCAGATATAGGAT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTGAATATCTTCCTTATTTAAGGAGGATAATTTAGCAGATATAGGAT  1091

seq1  TCTTGAATAGTAGAATTC  1116
      ||||||||||||||||||
seq2  TCTTGAATAGTAGAATTC  1109