BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-128G14
Chromosome2 (Build37)
Map Location 82,163,080 - 82,293,513
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100041308, A130030D18Rik, EG624362
Upstream geneLOC100040704, Zfp804a
Downstream geneLOC433550, LOC269292, LOC433440, Fsip2, LOC545429, Ppia-ps2_981.1, LOC100040818, LOC668077
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-128G14.bB6Ng01-128G14.g
ACCDH930269DH930270
length1,1801,237
definitionDH930269|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128G14, 5' end.DH930270|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128G14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(82,163,080 - 82,164,275)(82,292,242 - 82,293,513)
sequence
gaattctatatatgatttatcatttagggaaggaagtatgttatatacaa
acattgtgtcatttttattgagtctaaatgcttttaaatagatgttggaa
atcctggtgtgggggatatagaaggagaatattctagaaacaatatccta
caaacaactgtggcaaaaaattgtaacctgtaacgaattgttatgttaat
aatcaatcattcttcaaatagaaatagacacaatcagtgaaacactctta
gggagaaaaagaacttcacttcatctccgtcaagacacaaggactaattg
acagagatactggtacagggaagaataggctcaggaaagcatctacattt
aatcaatgaagcctaaacactgtcttttaagtgagtaagtttttgattct
agctgcacatggaagaaagtatagaggtcatgggaatctaaaagacaaaa
gaaatctgtgacctaaaaccaatcagacatgcccaacttatggacaggcc
ctttgtagctgaggatagctgtgaatgtgcccaaatgtactgacaacact
gtgagattttttttattgtgttgttgttgtttaggtcttaagtgtctttt
gcagatagtgttgtgttacaatatcaaaagtttagacaagccagtggaca
gacatcactagattctgagtagaataaagaatgtatacaaccaattaaac
caataagaccactccagcccacacaggtgagacaactgtagggaacttag
atcatggtgagactatagaaggtgcttggtggtaatattctgaatatgat
ggagttggattgtggtataaagagaatcctgaaaagcatacaaaaatatt
tacaaaaaaaaaaatgattccagctacttgcttcatcaaattgcacttgg
tcagttcaatggtggttaggtatgaaatgttcacatgagagtcattgaag
ctgggtaaggacatgaattttgtaccgtttctacatttgttgtacaactt
aaatgtctataaaaactgctgaatggaaaaaagaaaaacatttttcttac
atcatctacaattgagaagtagctggagtatgtgtcctatggcaacattt
cagtagctccaaatacatatgaatggtagaaataaagaacattcaaagac
actctcattacaacatctcactcctgtaga
gaattcttggtgattaagaaggcatgcatctcttgggagatatcctgaag
ataacaggaatgttagttctgcaaagtgaatgagccattagaccaatatg
gttcaaagaataagaacattaaaaatacttcttttaagttttaatttgtc
tctcactaattttatataaagacaaatatattctgaaaataaattgaatt
ctcactttatattttgggttgtgagcctagccttttgtgacgaaaccatc
tttcagacctggattctgagtttaaggaatgacaatgaaatctgaggaat
tcgtttggatctggagttctctgtttttgtctatacctgcaaaactaatt
acattgtgatggctaagttttagaattatgactttggatttgattacaat
ctataaatttataaagtgacatggttacacagaagtcatatttttgtggt
tgattcctgagtctatgaattttatccattgtgttgagttggttagctgt
acataatttattaatccctgacaatttgctgtatcttatactatattaac
tacttactagttaatatactaacttaactacttatagttgttcctcaaaa
tatacacccaagcaattactctatggagcagtactatttgtgttgtatta
taattagcctccaccatctttccagagtgacaatttgcaaggctaactgc
acataaaggaaacgtctatctcatggtgtcacacagcacttagctgcaga
ccttgtaagttattcttctgtaactattccagagcacagacttctggaat
gaatagatacaatagtttttcttataaatatattttagccctgttagctt
ttcgtgaatataattcctaagtttcttcattcacccattaatgcatgctg
agaagtaaagtatgacaaacaaatcagtctgaggtgcagagaaggagaat
gacatctggatggtatgggattttctttgcagtagacaattttgtatgag
tcccactgacatgggccaattgcccgtagtagtgtggagtcccgctgtca
gctgaccaatcctatgcaggaatactgttatggctaaccacatatttacc
ccccctctcatctaggtttaagattacctacaagccaatattgactgctg
tgcagtgcatgtgacggaggacttcatgtcatgggtgacttgattgccat
aggacacacttctctagactcttcctgagaagatgat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_82163080_82164275
seq2: B6Ng01-128G14.b_47_1226

seq1  GAATTCTATATATGATTTATCATTTAGGGAAGGAAGTATGTTATATACAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATATATGATTTATCATTTAGGGAAGGAAGTATGTTATATACAA  50

seq1  ACATTGTGTCATTTTTATTGAGTCTAAATGCTTTTAAATAGATGTTGGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGTGTCATTTTTATTGAGTCTAAATGCTTTTAAATAGATGTTGGAA  100

seq1  ATCCTGGTGTGGGGGATATAGAAGGAGAATATTCTAGAAACAATATCCTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGGTGTGGGGGATATAGAAGGAGAATATTCTAGAAACAATATCCTA  150

seq1  CAAACAACTGTGGCAAAAAATTGTAACCTGTAACGAATTGTTATGTTAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACAACTGTGGCAAAAAATTGTAACCTGTAACGAATTGTTATGTTAAT  200

seq1  AATCAATCATTCTTCAAATAGAAATAGACACAATCAGTGAAACACTCTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAATCATTCTTCAAATAGAAATAGACACAATCAGTGAAACACTCTTA  250

seq1  GGGAGAAAAAGAACTTCACTTCATCTCCGTCAAGACACAAGGACTAATTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGAAAAAGAACTTCACTTCATCTCCGTCAAGACACAAGGACTAATTG  300

seq1  ACAGAGATACTGGTACAGGGAAGAATAGGCTCAGGAAAGCATCTACATTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGATACTGGTACAGGGAAGAATAGGCTCAGGAAAGCATCTACATTT  350

seq1  AATCAATGAAGCCTAAACACTGTCTTTTAAGTGAGTAAGTTTTTGATTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAATGAAGCCTAAACACTGTCTTTTAAGTGAGTAAGTTTTTGATTCT  400

seq1  AGCTGCACATGGAAGAAAGTATAGAGGTCATGGGAATCTAAAAGACAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGCACATGGAAGAAAGTATAGAGGTCATGGGAATCTAAAAGACAAAA  450

seq1  GAAATCTGTGACCTAAAACCAATCAGACATGCCCAACTTATGGACAGGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATCTGTGACCTAAAACCAATCAGACATGCCCAACTTATGGACAGGCC  500

seq1  CTTTGTAGCTGAGGATAGCTGTGAATGTGCCCAAATGTACTGACAACACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTAGCTGAGGATAGCTGTGAATGTGCCCAAATGTACTGACAACACT  550

seq1  GTGAGATTTTTTTTATTGTGTTGTTGTTGTTTAGGTCTTAAGTGTCTTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGATTTTTTTTATTGTGTTGTTGTTGTTTAGGTCTTAAGTGTCTTTT  600

seq1  GCAGATAGTGTTGTGTTACAATATCAAAAGTTTAGACAAGCCAGTGGACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGATAGTGTTGTGTTACAATATCAAAAGTTTAGACAAGCCAGTGGACA  650

seq1  GACATCACTAGATTCTGAGTAGAATAAAGAATGTATACAACCAATTAAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATCACTAGATTCTGAGTAGAATAAAGAATGTATACAACCAATTAAAC  700

seq1  CAATAAGACCACTCCAGCCCACACAGGTGAGACAACTGTAGGGAACTTAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAAGACCACTCCAGCCCACACAGGTGAGACAACTGTAGGGAACTTAG  750

seq1  ATCATGGTGAGACTATAGAAGGTGCTTGGTGGTAATATTCTGAATATGAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATGGTGAGACTATAGAAGGTGCTTGGTGGTAATATTCTGAATATGAT  800

seq1  GGAGTTGGATTGTGGTATAAAGAGAATCCTGAAAAGCATACAAAAATATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTTGGATTGTGGTATAAAGAGAATCCTGAAAAGCATACAAAAATATT  850

seq1  TACAAAAAAAAAAATGATTCCAGCTACTTGCTTCATCAAATTGCACTTGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAAAAAAAAAATGATTCCAGCTACTTGCTTCATCAAATTGCACTTGG  900

seq1  TCAGTTCAATGGTGGTTAGGTATGAAATGTTCCACATGAGAGTCATTGAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTCAATGGTGGTTAGGTATGAAATGTT-CACATGAGAGTCATTGAA  949

seq1  GCTGGGTAAGGACATGAATTTTGTTACCGTTTCTACATTTG-TGTACAAC  999
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GCTGGGTAAGGACATGAATTTTG-TACCGTTTCTACATTTGTTGTACAAC  998

seq1  TTAAATGTTCTATTAAAAAACTTGCTGAATGG-AAAAAGAAAAACATTTT  1048
      ||||||| |||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTAAATG-TCTAT--AAAAAC-TGCTGAATGGAAAAAAGAAAAACATTTT  1044

seq1  CTTTACATCATCTACAATTTGAGAAAGTAGTCTGGAGTATGTG-CCTATG  1097
        ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||
seq2  TCTTACATCATCTACAA-TTGAG-AAGTAG-CTGGAGTATGTGTCCTATG  1091

seq1  GCAACATTTTTCAGTAGCTCCACATACATATGATGGGTAGAATAAAAGAA  1147
      ||||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||||
seq2  GCAACA--TTTCAGTAGCTCCAAATACATATGAATGGTAGAAATAAAGAA  1139

seq1  CAATTTCAAAAGCACTCTCCATTACAACACATTCTCACTTCACTGTAGA  1196
      ||  ||||||  |||||| ||||||||||   |||||||   |||||||
seq2  CA--TTCAAAGACACTCT-CATTACAACA---TCTCACT--CCTGTAGA  1180

seq1: chr2_82292242_82293513
seq2: B6Ng01-128G14.g_71_1307 (reverse)

seq1  ATCATCTTAGCAAACATTCTCTCA-GAAAAGTCT--AGAAGTGTGTCACA  47
      |||||||            ||||| ||| |||||  ||||||||||  | 
seq2  ATCATCT------------TCTCAGGAAGAGTCTAGAGAAGTGTGT--CC  36

seq1  TAGGGGAATCTAAGTTCAACCAAACTGACAATGAAGATCATCCGTCACAT  97
      || || |||| ||| ||| |||   |||| |||||| || ||||||||||
seq2  TATGGCAATC-AAG-TCACCCA---TGAC-ATGAAG-TCCTCCGTCACAT  79

seq1  GCACATGCACAGCAGTCAATTATTGGCTGTGATGTTAATCCTAAAACATG  147
      |||| |||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| |||| |  |
seq2  GCAC-TGCACAGCAGTCAA-TATTGGCT-TGTAGGTAATCTTAAACCTAG  126

seq1  ATTGAAAGAGGGGGAGTAAATATGTGG-TAGCATTAACAGTATTCCTGCA  196
      ||    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||
seq2  AT---GAGAGGGGGGGTAAATATGTGGTTAGCCATAACAGTATTCCTGCA  173

seq1  TAGGATTTGCTCAGCTGGACAAGCGGGACTCCAACACTACTTACGGGCAA  246
      ||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||
seq2  TAGGA-TTGGTCAGCT-GAC-AGCGGGACTCC-ACACTAC-TACGGGCAA  218

seq1  TTGGCCCATGTCAGTGGGACTTCATTACAAAATTGTTCTACTGCAAAGAA  296
      |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||
seq2  TTGGCCCATGTCAGTGGGAC-TCA-TACAAAATTG-TCTACTGCAAAGAA  265

seq1  AATCCCAATACCATCAAGATGTCATTTCTCCTTCTCTGCACCTCAGACCT  346
      |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||
seq2  AATCCC-ATACCATCCAGATGTCA-TTCTCCTTCTCTGCACCTCAGA-CT  312

seq1  GATTTGTTTGTCATACTTTACTTCTCAGCATGCATTAATGGGTGAATGAA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTGTTTGTCATACTTTACTTCTCAGCATGCATTAATGGGTGAATGAA  362

seq1  GAAAACTTAGGAATTATATTCACGAAAAGCTAACAGGGCTAAAATATATT  446
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  G-AAACTTAGGAATTATATTCACGAAAAGCTAACAGGGCTAAAATATATT  411

seq1  TATAAGAAAAACTATTGTATCTATTCATTCCAGAAGTCTGTGCTCTGGAA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAGAAAAACTATTGTATCTATTCATTCCAGAAGTCTGTGCTCTGGAA  461

seq1  TAGTTACAGAAGAATAACTTACAAGGTCTGCAGCTAAGTGCTGTGTGACA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTACAGAAGAATAACTTACAAGGTCTGCAGCTAAGTGCTGTGTGACA  511

seq1  CCATGAGATAGACGTTTCCTTTATGTGCAGTTAGCCTTGCAAATTGTCAC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGAGATAGACGTTTCCTTTATGTGCAGTTAGCCTTGCAAATTGTCAC  561

seq1  TCTGGAAAGATGGTGGAGGCTAATTATAATACAACACAAATAGTACTGCT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGAAAGATGGTGGAGGCTAATTATAATACAACACAAATAGTACTGCT  611

seq1  CCATAGAGTAATTGCTTGGGTGTATATTTTGAGGAACAACTATAAGTAGT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAGAGTAATTGCTTGGGTGTATATTTTGAGGAACAACTATAAGTAGT  661

seq1  TAAGTTAGTATATTAACTAGTAAGTAGTTAATATAGTATAAGATACAGCA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTTAGTATATTAACTAGTAAGTAGTTAATATAGTATAAGATACAGCA  711

seq1  AATTGTCAGGGATTAATAAATTATGTACAGCTAACCAACTCAACACAATG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGTCAGGGATTAATAAATTATGTACAGCTAACCAACTCAACACAATG  761

seq1  GATAAAATTCATAGACTCAGGAATCAACCACAAAAATATGACTTCTGTGT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAAATTCATAGACTCAGGAATCAACCACAAAAATATGACTTCTGTGT  811

seq1  AACCATGTCACTTTATAAATTTATAGATTGTAATCAAATCCAAAGTCATA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATGTCACTTTATAAATTTATAGATTGTAATCAAATCCAAAGTCATA  861

seq1  ATTCTAAAACTTAGCCATCACAATGTAATTAGTTTTGCAGGTATAGACAA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTAAAACTTAGCCATCACAATGTAATTAGTTTTGCAGGTATAGACAA  911

seq1  AAACAGAGAACTCCAGATCCAAACGAATTCCTCAGATTTCATTGTCATTC  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGAGAACTCCAGATCCAAACGAATTCCTCAGATTTCATTGTCATTC  961

seq1  CTTAAACTCAGAATCCAGGTCTGAAAGATGGTTTCGTCACAAAAGGCTAG  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAACTCAGAATCCAGGTCTGAAAGATGGTTTCGTCACAAAAGGCTAG  1011

seq1  GCTCACAACCCAAAATATAAAGTGAGAATTCAATTTATTTTCAGAATATA  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCACAACCCAAAATATAAAGTGAGAATTCAATTTATTTTCAGAATATA  1061

seq1  TTTGTCTTTATATAAAATTAGTGAGAGACAAATTAAAACTTAAAAGAAGT  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTCTTTATATAAAATTAGTGAGAGACAAATTAAAACTTAAAAGAAGT  1111

seq1  ATTTTTAATGTTCTTATTCTTTGAACCATATTGGTCTAATGGCTCATTCA  1196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTAATGTTCTTATTCTTTGAACCATATTGGTCTAATGGCTCATTCA  1161

seq1  CTTTGCAGAACTAACATTCCTGTTATCTTCAGGATATCTCCCAAGAGATG  1246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCAGAACTAACATTCCTGTTATCTTCAGGATATCTCCCAAGAGATG  1211

seq1  CATGCCTTCTTAATCACCAAGAATTC  1272
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCCTTCTTAATCACCAAGAATTC  1237