BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-129J14
Chromosome2 (Build37)
Map Location 122,845,371 - 122,992,123
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEif3s1, 4930424G05Rik, B2m, Trim69, 4933406J08Rik, LOC433468, LOC670832, Sord, Duox2, Duoxa2, Duoxa1, Duox1, Shf, Slc28a2, Bambi-ps1, Rp23-357i14.1, Gatm, Spata5l1, AA467197, Slc30a4, Pldn, Sqrdl
Downstream gene4930517E11Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-129J14.bB6Ng01-129J14.g
ACCDH931140DH931141
length1,153697
definitionDH931140|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-129J14, 5' end.DH931141|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-129J14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(122,990,960 - 122,992,123)(122,845,371 - 122,846,067)
sequence
gaattctatactgtatatagtggagaaagcaaactaaatgctgctgtgct
tacatttactattatgactagctgtttcaggcttctgctgacttaatttt
ctcgccatgatggactgtatcttgaactgtgagataaaaataaacacttg
agttgctttgtcatggtatttttattacagcaacacaaagaaacagcact
cacctacttgaatcttcatatttataatacaatatagcacaataataatc
ctaaacattaatattatcccatgataacattaacaaccatatttgttatt
cctgttaagatgtcataacaaatagactaaattcctcatatagctgttac
ccacaaacagagtctcatttggaaattcaaatatgtaagtgttactactt
taacttcatgaaagtaaacctggcatactatctgaagggaatggttattt
agtagttttattccctttatatttctggataaatgttctagataagaaaa
tgcataaagttcttatgagaataagttctatggcctagtaagcatcagct
ttcaacttggcaagacccaaaatttctgagagtgtctaatttgaagattg
tttcagtcacattggcctgtgggcatgtctgtgaggcagtgtcttaattg
ctaatgatatagcaatgggcctggcccattgtaggtaggattaaacctag
tcaagtagacctggactatttaaaaaacagtatctgagcaagccaggcta
agcaagctaggaagcagcatttctctgtggtttcttcttctagttcttat
cttgagttcttgctctgagttccctcaatgaaagactatgtaaaacagat
aagccctttccccactaaaattcttttaatcatgatgtttatcccagcaa
cagaaattaagctagaacaccctagtagggaaaacaattactttaataac
taattattataattacatttaaaattacatacattggagataaagacact
cattaataaatgcatatagttcttcttcaactagccacattcctcagtaa
taaactacagtttcaaagtctctcctgcacatgcctggctattactcgtt
tatatcttgataaagggtcattacaagttacttcaaatagtcaaggaatc
tac
gaattctatggaattcttgcctttggtgtgattggtcaaacctaggtcac
ctgaccatgcccaaaccagtcattatttttggataagtgttactgtacaa
actgtcggacatttgtctggatttcagaaaacagagagggtacctctgaa
aaactgggactctcttaggaagcatctaaggagagatgcatgctggataa
gaactagatgatctactaaagaggagcattcttctttactcttaggaaac
ctggaactaaaatcattaattcagctttacatacgtgctttccttcccat
tccagcccttctcttaccctcttgtggaaactgttactgctctgagggct
caataatggcccatgtatcctgtaagtgacaggttatagaagaagcactt
ttaacatgtggtgcccagtgaccctcaaaaaaagtagtcttaatgtttgc
ttgtattagatccacatgagacttaattctttgaataatatcaaattgga
aacaaattaagaaatagttttattcttttgtcataaggtttgtgtttggg
gaaattaattgaaatagaatactctcaaaaaataatttgtgtttatttat
aatgcctgctgtttacatggaccaaaattatacattttcatttgccgttc
ctctgtacttgtgtatgtgtgtgtaaatgtggtgtaggtgtgtgtat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_122990960_122992123
seq2: B6Ng01-129J14.b_50_1202 (reverse)

seq1  GTAGTATTCCTTGACTATTTTGGAGTAACTTGTTAATGA-CCTTTATCAA  49
      |||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||
seq2  GTAG-ATTCCTTGACTA-TTTGAAGTAACTTG-TAATGACCCTTTATCAA  47

seq1  GATATAAAGGGAGTAATAGCCAGGGCATGTGCAGGAGAGAACTTTGAAAA  99
      ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| 
seq2  GATATAAA-CGAGTAATAGCCA-GGCATGTGCAGGAGAG-ACTTTGAAA-  93

seq1  CTTGTAGTTTTATTTACTGAGGAATGT-GCTAGTGTGGAAGAAGAAACTA  148
        ||||||||   |||||||||||||| ||||  || ||||||| |||||
seq2  -CTGTAGTTT--ATTACTGAGGAATGTGGCTA--GTTGAAGAAG-AACTA  137

seq1  TATGCATTTATTAATGAGTGTCTTTATCTCCAATGTATGTAATTTTAAAT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCATTTATTAATGAGTGTCTTTATCTCCAATGTATGTAATTTTAAAT  187

seq1  GTAATTATTAATAATTAGTTATTAAAGTAATTGTTTTCCCTACTAGGGTG  248
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATTA-TAATAATTAGTTATTAAAGTAATTGTTTTCCCTACTAGGGTG  236

seq1  TTCTAGCTTAATTTCTGTTGCTGGGATAAACATCATGATTAAAAGAA-TT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TTCTAGCTTAATTTCTGTTGCTGGGATAAACATCATGATTAAAAGAATTT  286

seq1  TAGTGGGGGAAGGGCTTATCTGTTTTACATAGTCTTTCATTGAGGGAACT  347
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGGGGAAAGGGCTTATCTGTTTTACATAGTCTTTCATTGAGGGAACT  336

seq1  CAGAGCAAGAACTCAAGATAAGAACTAGAAGAAGAAACCACAGAGAAATG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCAAGAACTCAAGATAAGAACTAGAAGAAGAAACCACAGAGAAATG  386

seq1  CTGCTTCCTAGCTTGCTTAGCCTGGCTTGCTCAGATACTGTTTTTTAAAT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTCCTAGCTTGCTTAGCCTGGCTTGCTCAGATACTGTTTTTTAAAT  436

seq1  AGTCCAGGTCTACTTGACTAGGTTTAATCCTACCTACAATGGGCCAGGCC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCAGGTCTACTTGACTAGGTTTAATCCTACCTACAATGGGCCAGGCC  486

seq1  CATTGCTATATCATTAGCAATTAAGACACTGCCTCACAGACATGCCCACA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGCTATATCATTAGCAATTAAGACACTGCCTCACAGACATGCCCACA  536

seq1  GGCCAATGTGACTGAAACAATCTTCAAATTAGACACTCTCAGAAATTTTG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAATGTGACTGAAACAATCTTCAAATTAGACACTCTCAGAAATTTTG  586

seq1  GGTCTTGCCAAGTTGAAAGCTGATGCTTACTAGGCCATAGAACTTATTCT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTTGCCAAGTTGAAAGCTGATGCTTACTAGGCCATAGAACTTATTCT  636

seq1  CATAAGAACTTTATGCATTTTCTTATCTAGAACATTTATCCAGAAATATA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAGAACTTTATGCATTTTCTTATCTAGAACATTTATCCAGAAATATA  686

seq1  AAGGGAATAAAACTACTAAATAACCATTCCCTTCAGATAGTATGCCAGGT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGAATAAAACTACTAAATAACCATTCCCTTCAGATAGTATGCCAGGT  736

seq1  TTACTTTCATGAAGTTAAAGTAGTAACACTTACATATTTGAATTTCCAAA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTTTCATGAAGTTAAAGTAGTAACACTTACATATTTGAATTTCCAAA  786

seq1  TGAGACTCTGTTTGTGGGTAACAGCTATATGAGGAATTTAGTCTATTTGT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACTCTGTTTGTGGGTAACAGCTATATGAGGAATTTAGTCTATTTGT  836

seq1  TATGACATCTTAACAGGAATAACAAATATGGTTGTTAATGTTATCATGGG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGACATCTTAACAGGAATAACAAATATGGTTGTTAATGTTATCATGGG  886

seq1  ATAATATTAATGTTTAGGATTATTATTGTGCTATATTGTATTATAAATAT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATATTAATGTTTAGGATTATTATTGTGCTATATTGTATTATAAATAT  936

seq1  GAAGATTCAAGTAGGTGAGTGCTGTTTCTTTGTGTTGCTGTAATAAAAAT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATTCAAGTAGGTGAGTGCTGTTTCTTTGTGTTGCTGTAATAAAAAT  986

seq1  ACCATGACAAAGCAACTCAAGTGTTTATTTTTATCTCACAGTTCAAGATA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGACAAAGCAACTCAAGTGTTTATTTTTATCTCACAGTTCAAGATA  1036

seq1  CAGTCCATCATGGCGAGAAAATTAAGTCAGCAGAAGCCTGAAACAGCTAG  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCCATCATGGCGAGAAAATTAAGTCAGCAGAAGCCTGAAACAGCTAG  1086

seq1  TCATAATAGTAAATGTAAGCACAGCAGCATTTAGTTTGCTTTCTCCACTA  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAATAGTAAATGTAAGCACAGCAGCATTTAGTTTGCTTTCTCCACTA  1136

seq1  TATACAGTATAGAATTC  1164
      |||||||||||||||||
seq2  TATACAGTATAGAATTC  1153

seq1: chr2_122845371_122846067
seq2: B6Ng01-129J14.g_69_765

seq1  GAATTCTATGGAATTCTTGCCTTTGGTGTGATTGGTCAAACCTAGGTCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATGGAATTCTTGCCTTTGGTGTGATTGGTCAAACCTAGGTCAC  50

seq1  CTGACCATGCCCAAACCAGTCATTATTTTTGGATAAGTGTTACTGTACAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACCATGCCCAAACCAGTCATTATTTTTGGATAAGTGTTACTGTACAA  100

seq1  ACTGTCGGACATTTGTCTGGATTTCAGAAAACAGAGAGGGTACCTCTGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTCGGACATTTGTCTGGATTTCAGAAAACAGAGAGGGTACCTCTGAA  150

seq1  AAACTGGGACTCTCTTAGGAAGCATCTAAGGAGAGATGCATGCTGGATAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGGGACTCTCTTAGGAAGCATCTAAGGAGAGATGCATGCTGGATAA  200

seq1  GAACTAGATGATCTACTAAAGAGGAGCATTCTTCTTTACTCTTAGGAAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTAGATGATCTACTAAAGAGGAGCATTCTTCTTTACTCTTAGGAAAC  250

seq1  CTGGAACTAAAATCATTAATTCAGCTTTACATACGTGCTTTCCTTCCCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAACTAAAATCATTAATTCAGCTTTACATACGTGCTTTCCTTCCCAT  300

seq1  TCCAGCCCTTCTCTTACCCTCTTGTGGAAACTGTTACTGCTCTGAGGGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCCCTTCTCTTACCCTCTTGTGGAAACTGTTACTGCTCTGAGGGCT  350

seq1  CAATAATGGCCCATGTATCCTGTAAGTGACAGGTTATAGAAGAAGCACTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAATGGCCCATGTATCCTGTAAGTGACAGGTTATAGAAGAAGCACTT  400

seq1  TTAACATGTGGTGCCCAGTGACCCTCAAAAAAAGTAGTCTTAATGTTTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACATGTGGTGCCCAGTGACCCTCAAAAAAAGTAGTCTTAATGTTTGC  450

seq1  TTGTATTAGATCCACATGAGACTTAATTCTTTGAATAATATCAAATTGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATTAGATCCACATGAGACTTAATTCTTTGAATAATATCAAATTGGA  500

seq1  AACAAATTAAGAAATAGTTTTATTCTTTTGTCATAAGGTTTGTGTTTGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAATTAAGAAATAGTTTTATTCTTTTGTCATAAGGTTTGTGTTTGGG  550

seq1  GAAATTAATTGAAATAGAATACTCTCAAAAAATAATTTGTGTTTATTTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATTAATTGAAATAGAATACTCTCAAAAAATAATTTGTGTTTATTTAT  600

seq1  AATGCCTGCTGTTTACATGGACCAAAATTATACATTTTCATTTGCCGTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCCTGCTGTTTACATGGACCAAAATTATACATTTTCATTTGCCGTTC  650

seq1  CTCTGTACTTGTGTATGTGTGTGTAAATGTGGTGTAGGTGTGTGTAT  697
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTACTTGTGTATGTGTGTGTAAATGTGGTGTAGGTGTGTGTAT  697