BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-131B15
Chromosome2 (Build37)
Map Location 73,138,360 - 73,281,977
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1700023B02Rik, Scrn3, Gpr155, Wipf1
Upstream geneB230120H23Rik, Cdca7, LOC383712, LOC635960, LOC100039928, 6430710C18Rik, Sp3, Hspe1-ps5, Gtpbp9, LOC620110, Sp9
Downstream geneChrna1, Chn1, Atf2, Atp5g3, LOC667729, LOC100040172
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-131B15.bB6Ng01-131B15.g
ACCDH932246DH932247
length1,1741,096
definitionDH932246|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-131B15, 5' end.DH932247|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-131B15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,280,785 - 73,281,977)(73,138,360 - 73,139,460)
sequence
gaattctagagaaagatgtgattcctgggagcttgaagacaggaaacgag
atcacaagtttgtttatctgtacatatgagtctgagaagcctcctgcagt
aacacaggatctctataaacaagcaagtaggcacaatgtaagcttcctcg
tcggcatttatgaagtgaaaaagtccttgattggatccacatcttgacac
cgtcctttctgtctcaccagatttatcatagcctcagctctcatttagac
tcaggaaatgggatgacatgacagtcaccaaacacagctccgcaggcagg
tgaataaacattcaggatttaggaagcttcgaggtaggtaggagatcact
gggggaatgaagctaacaggtagagaaggaagaagtggcaggggctgggg
gagtcagagttggaagagaaatgtcaggtgcatatgggaatgaatgcaca
gcactcggagaggaactgtgggttctcagtacgtgactagcagtctgatc
tctagatcagaacaccacacagtatttctgtctgggttctgtctgggaag
ctttggttcaacaaccatatctgaactgtgatctctgctgttgactagcg
aagctaccaagtctcagagagaggatgcctgctctctttactataagaat
ccggagccctggcggagtgagtggcaagatccttgccaactttgaaggaa
actagacagtctgggcttcctgactctctagtggaaactcctcagagtct
tccaggcccatcttccattgtgtggaaataatgctagcctttcctctcca
gcagctcagtggtgctgaggagtgagtatctgtcagaagcaaatgtaatc
cactgtatgcttggttgccctgtgctgaactggatacctatactgctgtc
caggctcttgcaaataacagattcagcctgttttgaatttgatggcaggc
aaacctccctagtgctctatcaaagcttatgaacgatagctttataactt
agccctgtctgctgtatataccaaatgacctaaagcagtcagctatctca
atttcaggtgttttcctctagctgtttcttttttgtggtttaatttttta
gagatttatttttagcgaatgagtacacctgtcactgtcttcgacacaca
tagaaggcttctgatcccattata
gaattcagtctgttagctatttctgattatgaacacagcctttacagcac
actagtaactgagctcctataattttgaaagtaagtttaatatgggaata
taagggaaaatattactgttctgaacaccatcataggacattcaacgctg
agaggatcaaattttagttttcttttccaattttaattaatcatacattt
aatataaaatagaaatcacctgtaatcttaccaaattaacatattgacta
ttttcactatgtatactttcagttctaacagacatatatgtggttttata
ttagactcacagtccagattaaatcagtgaaccttagctcacccaatgta
ctcaaagtttatctagcctatttccctaccattaaattatgtggcaaggg
aaaatgagaaatgttgaaaatacaacccctcttaaaaagctatttcagta
tatcttttattttcctccaaactactccccttcccacagaacgcagatac
actacgctgagacgtcaattctccccataacagctttcccaaagccacac
cacagcatcgttgggctggtagagaggacttccctctgcacgctctgatt
tacgaacattctctgatggcgcttggaagctaaaactaaaacaaatactt
acaaattcatctctgtgtgcatgtgtgcatgggcctcagtgtagtctctt
tgcaggcaatgtgttatatgcagtgaccatggactgtgagccactacctg
ggtgctgggaactcaacccatgccttctgtaagagcggtaagtgctctaa
ctgctgagccacctctccagctccaggaagttagtatttagacaaatacc
taagtgcttccttagaccagtggtgctcaagcttcctaacactttgagcg
ttaatacagcacctcatgtgtggggaccccaaccataaaattatgttcat
tgctacttcataaatgtaatttgctactgctatgaatcataatgtaaata
tctgtgtttccaatggatttaggtctctcctgtgaagaagtcatcacttc
caaaggaggtcaccgcacctggaccccagattgaagatggctgctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_73280785_73281977
seq2: B6Ng01-131B15.b_45_1218 (reverse)

seq1  TATAATGGGATCTGATGCCCTCTTTTGGTGTGTCTGAAGACAGTGACA-G  49
      |||||||||||| || ||| ||| |  ||||||| ||||||||||||| |
seq2  TATAATGGGATCAGAAGCCTTCTAT--GTGTGTC-GAAGACAGTGACAGG  47

seq1  TGTACTCATCTGCATAAAAAAATAAATCTTAAAAAAATTAAAACAAACAA  99
      |||||||||  ||    ||||||||||||  ||||||||||| |  ||||
seq2  TGTACTCATTCGC---TAAAAATAAATCTCTAAAAAATTAAACC--ACAA  92

seq1  AAAAAAGAAAACAGACTAAGAGAAAACAACTGAAATTGAGGATAGCTGAC  149
      ||||    |||||| |||   ||||||| |||||||||| ||||||||||
seq2  AAAA---GAAACAG-CTAGAGGAAAACACCTGAAATTGA-GATAGCTGAC  137

seq1  TGGCTTTAGGTCATTTGGTATATACAGCAGGACAGGGCTAAGTTATAAAG  199
      | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  T-GCTTTAGGTCATTTGGTATATACAGCA-GACAGGGCTAAGTTATAAAG  185

seq1  CTATCGTTCATAAGCCTTTGATAGAGCACCTAGGGAGGTTTTGCCTGCCA  249
      |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
seq2  CTATCGTTCATAAG-CTTTGATAGAGCA-CTAGGGAGG-TTTGCCTGCCA  232

seq1  TCAAATTCAAAACAGGCTGAATTCTGTTATTTGCAAGAGCCTGGACAGCA  299
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATTCAAAACAGGCTGAA-TCTGTTATTTGCAAGAGCCTGGACAGCA  281

seq1  GTATAGGTATCCAGTTCAGCACAGGGCAACCAAGCATACAGTGGATTACA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATAGGTATCCAGTTCAGCACAGGGCAACCAAGCATACAGTGGATTACA  331

seq1  TTTTGCTTCTGACAGATACTCACTCCTCAGCACCACTGAGCTGCTGGAGA  399
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -TTTGCTTCTGACAGATACTCACTCCTCAGCACCACTGAGCTGCTGGAGA  380

seq1  GGAAAGGCTAGCATTATTTCCACACAATGGAAGATGGGCCTGGAAGACTC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGGCTAGCATTATTTCCACACAATGGAAGATGGGCCTGGAAGACTC  430

seq1  TGAGGAGTTTCCACTAGAGAGTCAGGAAGCCCAGACTGTCTAGTTTCCTT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGAGTTTCCACTAGAGAGTCAGGAAGCCCAGACTGTCTAGTTTCCTT  480

seq1  CAAAGTTGGCAAGGATCTTGCCACTCACTCCGCCAGGGCTCCGGATTCTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTTGGCAAGGATCTTGCCACTCACTCCGCCAGGGCTCCGGATTCTT  530

seq1  ATAGTAAAGAGAGCAGGCATCCTCTCTCTGAGACTTGGTAGCTTCGCTAG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTAAAGAGAGCAGGCATCCTCTCTCTGAGACTTGGTAGCTTCGCTAG  580

seq1  TCAACAGCAGAGATCACAGTTCAGATATGGTTGTTGAACCAAAGCTTCCC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACAGCAGAGATCACAGTTCAGATATGGTTGTTGAACCAAAGCTTCCC  630

seq1  AGACAGAACCCAGACAGAAATACTGTGTGGTGTTCTGATCTAGAGATCAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGAACCCAGACAGAAATACTGTGTGGTGTTCTGATCTAGAGATCAG  680

seq1  ACTGCTAGTCACGTACTGAGAACCCACAGTTCCTCTCCGAGTGCTGTGCA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTAGTCACGTACTGAGAACCCACAGTTCCTCTCCGAGTGCTGTGCA  730

seq1  TTCATTCCCATATGCACCTGACATTTCTCTTCCAACTCTGACTCCCCCAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTCCCATATGCACCTGACATTTCTCTTCCAACTCTGACTCCCCCAG  780

seq1  CCCCTGCCACTTCTTCCTTCTCTACCTGTTAGCTTCATTCCCCCAGTGAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTGCCACTTCTTCCTTCTCTACCTGTTAGCTTCATTCCCCCAGTGAT  830

seq1  CTCCTACCTACCTCGAAGCTTCCTAAATCCTGAATGTTTATTCACCTGCC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTACCTACCTCGAAGCTTCCTAAATCCTGAATGTTTATTCACCTGCC  880

seq1  TGCGGAGCTGTGTTTGGTGACTGTCATGTCATCCCATTTCCTGAGTCTAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGGAGCTGTGTTTGGTGACTGTCATGTCATCCCATTTCCTGAGTCTAA  930

seq1  ATGAGAGCTGAGGCTATGATAAATCTGGTGAGACAGAAAGGACGGTGTCA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGAGCTGAGGCTATGATAAATCTGGTGAGACAGAAAGGACGGTGTCA  980

seq1  AGATGTGGATCCAATCAAGGACTTTTTCACTTCATAAATGCCGACGAGGA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTGGATCCAATCAAGGACTTTTTCACTTCATAAATGCCGACGAGGA  1030

seq1  AGCTTACATTGTGCCTACTTGCTTGTTTATAGAGATCCTGTGTTACTGCA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTACATTGTGCCTACTTGCTTGTTTATAGAGATCCTGTGTTACTGCA  1080

seq1  GGAGGCTTCTCAGACTCATATGTACAGATAAACAAACTTGTGATCTCGTT  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGCTTCTCAGACTCATATGTACAGATAAACAAACTTGTGATCTCGTT  1130

seq1  TCCTGTCTTCAAGCTCCCAGGAATCACATCTTTCTCTAGAATTC  1193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTCTTCAAGCTCCCAGGAATCACATCTTTCTCTAGAATTC  1174

seq1: chr2_73138360_73139460
seq2: B6Ng01-131B15.g_68_1163

seq1  GAATTCAGTCTGTTAGCTATTTCTGATTATGAACACAGCCTTTACAGCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTCTGTTAGCTATTTCTGATTATGAACACAGCCTTTACAGCAC  50

seq1  ACTAGTAACTGAGCTCCTATAATTTTGAAAGTAAGTTTAATATGGGAATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGTAACTGAGCTCCTATAATTTTGAAAGTAAGTTTAATATGGGAATA  100

seq1  TAAGGGAAAATATTACTGTTCTGAACACCATCATAGGACATTCAACGCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGGAAAATATTACTGTTCTGAACACCATCATAGGACATTCAACGCTG  150

seq1  AGAGGATCAAATTTTAGTTTTCTTTTCCAATTTTAATTAATCATACATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGATCAAATTTTAGTTTTCTTTTCCAATTTTAATTAATCATACATTT  200

seq1  AATATAAAATAGAAATCACCTGTAATCTTACCAAATTAACATATTGACTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATAAAATAGAAATCACCTGTAATCTTACCAAATTAACATATTGACTA  250

seq1  TTTTCACTATGTATACTTTCAGTTCTAACAGACATATATGTGGTTTTATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCACTATGTATACTTTCAGTTCTAACAGACATATATGTGGTTTTATA  300

seq1  TTAGACTCACAGTCCAGATTAAATCAGTGAACCTTAGCTCACCCAATGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGACTCACAGTCCAGATTAAATCAGTGAACCTTAGCTCACCCAATGTA  350

seq1  CTCAAAGTTTATCTAGCCTATTTCCCTACCATTAAATTATGTGGCAAGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAAGTTTATCTAGCCTATTTCCCTACCATTAAATTATGTGGCAAGGG  400

seq1  AAAATGAGAAATGTTGAAAATACAACCCCTCTTAAAAAGCTATTTCAGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGAGAAATGTTGAAAATACAACCCCTCTTAAAAAGCTATTTCAGTA  450

seq1  TATCTTTTATTTTCCTCCAAACTACTCCCCTTCCCACAGAACGCAGATAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTTTATTTTCCTCCAAACTACTCCCCTTCCCACAGAACGCAGATAC  500

seq1  ACTACGCTGAGACGTCAATTCTCCCCATAACAGCTTTCCCAAAGCCACAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACGCTGAGACGTCAATTCTCCCCATAACAGCTTTCCCAAAGCCACAC  550

seq1  CACAGCATCGTTGGGCTGGTAGAGAGGACTTCCCTCTGCACGCTCTGATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCATCGTTGGGCTGGTAGAGAGGACTTCCCTCTGCACGCTCTGATT  600

seq1  TACGAACATTCTCTGATGGCGCTTGGAAGCTAAAACTAAAACAAATACTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACGAACATTCTCTGATGGCGCTTGGAAGCTAAAACTAAAACAAATACTT  650

seq1  ACAAATTCATCTCTGTGTGCATGTGTGCATGGGCCTCAGTGTAGTCTCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATTCATCTCTGTGTGCATGTGTGCATGGGCCTCAGTGTAGTCTCTT  700

seq1  TGCAGGCAATGTGTTATATGCAGTGACCATGGACTGTGAGCCACTACCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGGCAATGTGTTATATGCAGTGACCATGGACTGTGAGCCACTACCTG  750

seq1  GGTGCTGGGAACTCAACCCATGCCTTCTGTAAGAGCGGTAAGTGCTCTAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCTGGGAACTCAACCCATGCCTTCTGTAAGAGCGGTAAGTGCTCTAA  800

seq1  CTGCTGAGCCACCTCTCCAGCTCCAGGAAGTTAGTATTTAGACAAATACC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGAGCCACCTCTCCAGCTCCAGGAAGTTAGTATTTAGACAAATACC  850

seq1  TAAGTGCTTCCTTAGACCAGTGGTGCTCAAGCTTCCTAACACTTTGAGCG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTGCTTCCTTAGACCAGTGGTGCTCAAGCTTCCTAACACTTTGAGCG  900

seq1  TTAATACAGCACCTCATGTTGTGGGGACCCCAACCATAAAATTATGTTCA  950
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATACAGCACCTCATG-TGTGGGGACCCCAACCATAAAATTATGTTCA  949

seq1  TTGCTACTTCATAAATGTAATTTTGCTACTGCTATGAATCATAATGTAAA  1000
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTACTTCATAAATGTAA-TTTGCTACTGCTATGAATCATAATGTAAA  998

seq1  TATCTGTGTTTTCCAATGGATCTAGGTCTCTCCTGTGAAAGAGTCATTCA  1050
      |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||   
seq2  TATCTGTG-TTTCCAATGGATTTAGGTCTCTCCTGTGAAGAAGTCAT--C  1045

seq1  ACTCCCAAAGGA-GTCACCGCACCCTTGACCCCCAGTTGAGAATGGCTGC  1099
      ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||   ||||  ||||||||
seq2  ACTTCCAAAGGAGGTCACCGCA-CCTGGACCCCAGATTGAAGATGGCTGC  1094

seq1  TT  1101
      ||
seq2  TT  1096