BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-132G08
Chromosome2 (Build37)
Map Location 115,031,045 - 115,131,977
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneAtpbd4, LOC100043219, LOC100043222
Downstream geneLOC100043232, LOC100043236, BC052040, Mrg1, G630016G05Rik, 2810405F15Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-132G08.bB6Ng01-132G08.g
ACCDH933208DH933209
length1,0811,072
definitionDH933208|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132G08, 5' end.DH933209|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132G08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(115,031,045 - 115,032,134)(115,130,894 - 115,131,977)
sequence
gaattcagtgggttaatgttcatagagttagttttcagagccaggaacaa
aacaagcaaccagaaagtgttctattacaattattatacttggaggaaac
cgtacctaaaatatctacttacaagaaaacatggcaagcttctctttgtt
aatattgaggcatgctcagtttaattatttattactctaaggaatatttg
gaaagtgcagcagtattttaggaaacaaaagggtactttaaaacaccacg
ttctcacctgttgatgcttaccttcaataatttaaagtatgtattattta
aaaatgctgctcatgtagtaagccatactatgataaatttgggtattagc
tgcttgtgaacttttgaacctgttgtgggattgaatccacaaccaatacc
gaaatgtttcttgtcattttataattcatgaagttaaatatcttctgcgt
gctatggttattgagggaaacgtattgaacttgtggggttgagctccaaa
tggatctttcagttagctacaaaatgttgatgtgtgaaagcagtgttgta
tatcttcttgggtttatcacctagtaagatttatattgtggcaaaacttt
caatgtagcctggctttgccctctgattctgaggctccaactgtttgcta
aagccatttttcttattattatttctttttttttctagtgatctctttct
cctttaattaaggtaacacattcacagcaaaatcctcgcgcctagcactg
tcttctatttttgtgcttccttgtagaaagttttcttttgttgagacttt
accaaaccatctattgcattgatttatttgatactttacactaagtatag
tgctccatgataaaaacataaacgcaacaacagcatggccttcaatttta
aggctatatttttctgtttcatggaatcagaaagacaaattttatgaaag
agctaactgttgcagtccagacatggactattcttgaagagagccagagc
ctccttgagatgtaccttgagccgtgtgtgagacatgcatgtaagactgt
gtctgagatggatggtgacatcaaatacact
gaattctctttaaaaagcactgaaattctagaagcagacatggtttgctt
cagtaaccattttgaactggaaacaagttctagaggtgactgaacccaaa
gtctcacctatgaacagagttaaggggattctcctaggaaaagtcttctg
agaaaagacttcaatctcttggttttaaagaagctagcacaatggtaaaa
caaatgaagacagggtttcatatccctcaccctagccagggtatctgctc
tgctgtggaacctcaggccagagggtagggattggtggtttgtgcctagc
agcaagacccatcattgtgatgacagcatactctgatttcatgtgagcta
gaatggaagcttagctagactatttgctaaaaacttaaccacaaatgttt
aaacaactctaagagtttccccccatcatttggagctgaaacaagtgtca
ttgttagaactgtacataatctccacataacacagattatatgtttaaca
aataagagatatgagatgataccaggtggactcactaactccatgtgtct
tatgatagtgaaagtgacaacctttggagatggctgaagagggcatcatc
acagggaggatggaagcatgagacactgcctgaaaatatcacagcaattt
acagcaggaagcttaaacagtgagaggtgaagaagtgctttaagtccaat
tagcaaattaattgtaatagttctgcttttaattgaacgtgggctgtggg
agacttcctgccttggctaatgtggggagtttctatagctctttcaggtg
cacggactattatgagccaagattttagtgtagcaacataattatttttt
ctgacattacagttatcctttgtatttgttgacaggtgttttacttgagg
aatatttatttccctcatctctctggaagtagatccttaggcagtaggct
agagagatggctcagaagttgatagcactggtgcttcttcagggactagg
ttgtatctagcaccaataaagcagctcacagctgtctgctagggaattct
atgcctccttctacttggtggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_115031045_115032134
seq2: B6Ng01-132G08.b_49_1120

seq1  GAATTCAGTGGGTTAATGTTCATAGAGTTAGTTTTCAGAGCCAGGAACAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTGGGTTAATGTTCATAGAGTTAGTTTTCAGAGCCAGGAACAA  50

seq1  AACAAGCAACCAGAAAGTGTTCTATTACAATTATTATACTTGGAGGAAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAGCAACCAGAAAGTGTTCTATTACAATTATTATACTTGGAGGAAAC  100

seq1  CGTACCTAAAATATCTACTTACAAGAAAACATGGCAAGCTTCTCTTTGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTACCTAAAATATCTACTTACAAGAAAACATGGCAAGCTTCTCTTTGTT  150

seq1  AATATTGAGGCATGCTCAGTTTAATTATTTATTACTCTAAGGAATATTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTGAGGCATGCTCAGTTTAATTATTTATTACTCTAAGGAATATTTG  200

seq1  GAAAGTGCAGCAGTATTTTAGGAAACAAAAGGGTACTTTAAAACACCACG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTGCAGCAGTATTTTAGGAAACAAAAGGGTACTTTAAAACACCACG  250

seq1  TTCTCACCTGTTGATGCTTACCTTCAATAATTTAAAGTATGTATTATTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCACCTGTTGATGCTTACCTTCAATAATTTAAAGTATGTATTATTTA  300

seq1  AAAATGCTGCTCATGTAGTAAGCCATACTATGATAAATTTGGGTATTAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGCTGCTCATGTAGTAAGCCATACTATGATAAATTTGGGTATTAGC  350

seq1  TGCTTGTGAACTTTTGAACCTGTTGTGGGATTGAATCCACAACCAATACC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGTGAACTTTTGAACCTGTTGTGGGATTGAATCCACAACCAATACC  400

seq1  GAAATGTTTCTTGTCATTTTATAATTCATGAAGTTAAATATCTTCTGCGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGTTTCTTGTCATTTTATAATTCATGAAGTTAAATATCTTCTGCGT  450

seq1  GCTATGGTTATTGAGGGAAACGTATTGAACTTGTGGGGTTGAGCTCCAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATGGTTATTGAGGGAAACGTATTGAACTTGTGGGGTTGAGCTCCAAA  500

seq1  TGGATCTTTCAGTTAGCTACAAAATGTTGATGTGTGAAAGCAGTGTTGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATCTTTCAGTTAGCTACAAAATGTTGATGTGTGAAAGCAGTGTTGTA  550

seq1  TATCTTCTTGGGTTTATCACCTAGTAAGATTTATATTGTGGCAAAACTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTCTTGGGTTTATCACCTAGTAAGATTTATATTGTGGCAAAACTTT  600

seq1  CAATGTAGCCTGGCTTTGCCCTCTGATTCTGAGGCTCCAACTGTTTGCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGTAGCCTGGCTTTGCCCTCTGATTCTGAGGCTCCAACTGTTTGCTA  650

seq1  AAGCCATTTTTCTTATTATTATTTCTTTTTTTTTCTAGTGATCTCTTTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCATTTTTCTTATTATTATTTCTTTTTTTTTCTAGTGATCTCTTTCT  700

seq1  CCTTTAATTAAGGTAACACATTCACAGCAAAATCCTCGCGCCTAGCACTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTAATTAAGGTAACACATTCACAGCAAAATCCTCGCGCCTAGCACTG  750

seq1  TCTTCTATTTTTGTGCTTCCTTGTAGAAAGTTTTCTTTTGTTGAGACTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTATTTTTGTGCTTCCTTGTAGAAAGTTTTCTTTTGTTGAGACTTT  800

seq1  ACCAAACCATCTATTGCATTGATTTATTTGATACTTTACACTAAGTATAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAACCATCTATTGCATTGATTTATTTGATACTTTACACTAAGTATAG  850

seq1  TGCTCCATGATAAAAACATAAACGCAACAACAGCATGGCCTTCAATTTTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCCATGATAAAAACATAAACGCAACAACAGCATGGCCTTCAATTTTA  900

seq1  AGGCTATATTTTTCTGTTTCATGGAATCAGAAGGACAAATTTTATGAAAG  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AGGCTATATTTTTCTGTTTCATGGAATCAGAAAGACAAATTTTATGAAAG  950

seq1  AGCTAACTGTTGCAGTCCAGACATTGGAACTATTCTTGAAAGGAGAGCCA  1000
      ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||
seq2  AGCTAACTGTTGCAGTCCAGACAT--GGACTATTCTTGAA--GAGAGCCA  996

seq1  GAAGCCTCCTTGAGGATGTAACCTTGAGCCGGTGGTGTGAGACAATGCAG  1050
      | ||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||| ||||| 
seq2  G-AGCCTCCTTGA-GATGT-ACCTTGAGCCG--TGTGTGAGAC-ATGCA-  1039

seq1  TGTAGAGAACTTGTGTCTGGGAGGATGGGATGGTGACATC  1090
      |||| |||   |||||||| ||     |||||||||||||
seq2  TGTA-AGA--CTGTGTCTGAGA----TGGATGGTGACATC  1072

seq1: chr2_115130894_115131977
seq2: B6Ng01-132G08.g_67_1138 (reverse)

seq1  CCCACCAAGGTAGGAAGAGAGCATAGAATCCCCTAGACAGACAGCTGTGA  50
      |||||||| |||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||
seq2  CCCACCAA-GTAGAAGGAG-GCATAGAATTCCCTAG-CAGACAGCTGTGA  47

seq1  GCTGCTATATGGGTGCTAGGAATACAACCTAAGTCCCCTGGAAGAGCAAC  100
      |||||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||   |||||   ||
seq2  GCTGCTTTATTGGTGCTAG--ATACAACCT-AGTCCC--TGAAGAAGCAC  92

seq1  CAGTGCTATCAACTTCTGAGCCATCTCTCTAGCCCCTACTGCCTAAGGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||
seq2  CAGTGCTATCAACTTCTGAGCCATCTCTCTAG--CCTACTGCCTAAGGAT  140

seq1  CTACTTCCAGAAGAGATGAGGGAAATAAATATTCCTCAAGTAAAAACACC  200
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CTACTTCCAG-AGAGATGAGGGAAATAAATATTCCTCAAGT-AAAACACC  188

seq1  TGTCAACAAATACAAAGGATAACTGTAATGTCAGAAAAAATAATTATGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAACAAATACAAAGGATAACTGTAATGTCAGAAAAAATAATTATGTT  238

seq1  GCTACACTAAAATCTTGGCTCATAATAGTCCGTGCACCTGAAAGAGCTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACACTAAAATCTTGGCTCATAATAGTCCGTGCACCTGAAAGAGCTAT  288

seq1  AGAAACTCCCCACATTAGCCAAGGCAGGAAGTCTCCCACAGCCCACGTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACTCCCCACATTAGCCAAGGCAGGAAGTCTCCCACAGCCCACGTTC  338

seq1  AATTAAAAGCAGAACTATTACAATTAATTTGCTAATTGGACTTAAAGCAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAAAGCAGAACTATTACAATTAATTTGCTAATTGGACTTAAAGCAC  388

seq1  TTCTTCACCTCTCACTGTTTAAGCTTCCTGCTGTAAATTGCTGTGATATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCACCTCTCACTGTTTAAGCTTCCTGCTGTAAATTGCTGTGATATT  438

seq1  TTCAGGCAGTGTCTCATGCTTCCATCCTCCCTGTGATGATGCCCTCTTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGGCAGTGTCTCATGCTTCCATCCTCCCTGTGATGATGCCCTCTTCA  488

seq1  GCCATCTCCAAAGGTTGTCACTTTCACTATCATAAGACACATGGAGTTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATCTCCAAAGGTTGTCACTTTCACTATCATAAGACACATGGAGTTAG  538

seq1  TGAGTCCACCTGGTATCATCTCATATCTCTTATTTGTTAAACATATAATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTCCACCTGGTATCATCTCATATCTCTTATTTGTTAAACATATAATC  588

seq1  TGTGTTATGTGGAGATTATGTACAGTTCTAACAATGACACTTGTTTCAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTATGTGGAGATTATGTACAGTTCTAACAATGACACTTGTTTCAGC  638

seq1  TCCAAATGATGGGGGGAAACTCTTAGAGTTGTTTAAACATTTGTGGTTAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAATGATGGGGGGAAACTCTTAGAGTTGTTTAAACATTTGTGGTTAA  688

seq1  GTTTTTAGCAAATAGTCTAGCTAAGCTTCCATTCTAGCTCACATGAAATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTAGCAAATAGTCTAGCTAAGCTTCCATTCTAGCTCACATGAAATC  738

seq1  AGAGTATGCTGTCATCACAATGATGGGTCTTGCTGCTAGGCACAAACCAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTATGCTGTCATCACAATGATGGGTCTTGCTGCTAGGCACAAACCAC  788

seq1  CAATCCCTACCCTCTGGCCTGAGGTTCCACAGCAGAGCAGATACCCTGGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCCCTACCCTCTGGCCTGAGGTTCCACAGCAGAGCAGATACCCTGGC  838

seq1  TAGGGTGAGGGATATGAAACCCTGTCTTCATTTGTTTTACCATTGTGCTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGTGAGGGATATGAAACCCTGTCTTCATTTGTTTTACCATTGTGCTA  888

seq1  GCTTCTTTAAAACCAAGAGATTGAAGTCTTTTCTCAGAAGACTTTTCCTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTTTAAAACCAAGAGATTGAAGTCTTTTCTCAGAAGACTTTTCCTA  938

seq1  GGAGAATCCCCTTAACTCTGTTCATAGGTGAGACTTTGGGTTCAGTCACC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAATCCCCTTAACTCTGTTCATAGGTGAGACTTTGGGTTCAGTCACC  988

seq1  TCTAGAACTTGTTTCCAGTTCAAAATGGTTACTGAAGCAAACCATGTCTG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGAACTTGTTTCCAGTTCAAAATGGTTACTGAAGCAAACCATGTCTG  1038

seq1  CTTCTAGAATTTCAGTGCTTTTTAAAGAGAATTC  1084
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTAGAATTTCAGTGCTTTTTAAAGAGAATTC  1072